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润滑障碍中的lncRNA-mRNA共表达网络的构建及功能预测
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作者 刘天娇 张晶晶 +2 位作者 马洁桦 潘连军 阮红杰 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期1585-1591,共7页
目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-cod... 目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)以及mRNA的表达谱,利用Cytoscape软件构建差异表达lncRNA及差异表达mRNA网络,采用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway分析共表达网络中mRNA的生物学功能。结果:通过下一代测序技术,根据|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05标准筛选出LD组和正常对照组中共计499条上调表达的lncRNA、337条下调表达的lncRNA,以及1582条上调表达mRNA、633条下调表达的mRNA。随后,通过其中100个lncRNA与311个mRNA构建了基于差异表达的lncRNA和mRNA的共表达网络。最后,共表达网络的功能富集分析表明mRNA主要与心肌相关的疾病和功能有关。结论:LD的发病机制可能与血液循环功能障碍、局部肌肉功能障碍以及cGMP通路等有关,需要相关研究来进一步证实。 展开更多
关键词 阴道润滑障碍 长链非编码RNA 共表达网络
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润滑障碍女性阴道组织的差异表达miRNA表达谱分析
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作者 张晶 潘连军 马洁桦 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期1074-1082,共9页
目的:阴道润滑障碍(LD)是女性性功能障碍(FSD)中最常见的一种,显著影响女性的生理健康与受孕。探明LD的发病机制,寻找治疗靶标,对于预防和治疗LD十分必要。方法:选取南京市妇幼保健院收治的符合筛选标准的健康对照组和LD组女性各3例,提... 目的:阴道润滑障碍(LD)是女性性功能障碍(FSD)中最常见的一种,显著影响女性的生理健康与受孕。探明LD的发病机制,寻找治疗靶标,对于预防和治疗LD十分必要。方法:选取南京市妇幼保健院收治的符合筛选标准的健康对照组和LD组女性各3例,提取阴道上皮组织RNA进行高通量miRNA测序,筛选差异miRNA并进行聚类分析、靶基因预测、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书通路(KEGG pathway)显著性富集分析。最后,通过实时荧光定量PCR对测序结果进行了验证。结果:本次高通量测序共测到1673个miRNA。并筛选到64个有望成为LD治疗靶标的miRNA,其中25个miRNA在LD患者较对照组上调4倍以上;39个miRNA在LD患者较对照组下调4倍以上。神经元投射形态发生和AMPK信号通路是最显著富集的GO词条(term)和KEGG pathway。结论:miRNA在LD患者中存在差异性表达,这些miRNA及靶基因可能与LD的发生有关,有望成为LD治疗靶标的miRNA,具有重要理论意义以及潜在应用价值。 展开更多
关键词 女性性功能障碍 润滑障碍 阴道上皮 MIRNA 高通量测序
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