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润滑障碍中的lncRNA-mRNA共表达网络的构建及功能预测
1
作者
刘天娇
张晶晶
+2 位作者
马洁桦
潘连军
阮红杰
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1585-1591,共7页
目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-cod...
目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)以及mRNA的表达谱,利用Cytoscape软件构建差异表达lncRNA及差异表达mRNA网络,采用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway分析共表达网络中mRNA的生物学功能。结果:通过下一代测序技术,根据|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05标准筛选出LD组和正常对照组中共计499条上调表达的lncRNA、337条下调表达的lncRNA,以及1582条上调表达mRNA、633条下调表达的mRNA。随后,通过其中100个lncRNA与311个mRNA构建了基于差异表达的lncRNA和mRNA的共表达网络。最后,共表达网络的功能富集分析表明mRNA主要与心肌相关的疾病和功能有关。结论:LD的发病机制可能与血液循环功能障碍、局部肌肉功能障碍以及cGMP通路等有关,需要相关研究来进一步证实。
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关键词
阴道
润滑障碍
长链非编码RNA
共表达网络
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职称材料
润滑障碍女性阴道组织的差异表达miRNA表达谱分析
2
作者
张晶
潘连军
马洁桦
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1074-1082,共9页
目的:阴道润滑障碍(LD)是女性性功能障碍(FSD)中最常见的一种,显著影响女性的生理健康与受孕。探明LD的发病机制,寻找治疗靶标,对于预防和治疗LD十分必要。方法:选取南京市妇幼保健院收治的符合筛选标准的健康对照组和LD组女性各3例,提...
目的:阴道润滑障碍(LD)是女性性功能障碍(FSD)中最常见的一种,显著影响女性的生理健康与受孕。探明LD的发病机制,寻找治疗靶标,对于预防和治疗LD十分必要。方法:选取南京市妇幼保健院收治的符合筛选标准的健康对照组和LD组女性各3例,提取阴道上皮组织RNA进行高通量miRNA测序,筛选差异miRNA并进行聚类分析、靶基因预测、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书通路(KEGG pathway)显著性富集分析。最后,通过实时荧光定量PCR对测序结果进行了验证。结果:本次高通量测序共测到1673个miRNA。并筛选到64个有望成为LD治疗靶标的miRNA,其中25个miRNA在LD患者较对照组上调4倍以上;39个miRNA在LD患者较对照组下调4倍以上。神经元投射形态发生和AMPK信号通路是最显著富集的GO词条(term)和KEGG pathway。结论:miRNA在LD患者中存在差异性表达,这些miRNA及靶基因可能与LD的发生有关,有望成为LD治疗靶标的miRNA,具有重要理论意义以及潜在应用价值。
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关键词
女性性功能
障碍
润滑障碍
阴道上皮
MIRNA
高通量测序
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职称材料
题名
润滑障碍中的lncRNA-mRNA共表达网络的构建及功能预测
1
作者
刘天娇
张晶晶
马洁桦
潘连军
阮红杰
机构
南京医科大学附属妇产医院妇女保健科
南京医科大学附属妇产医院产科
南京医科大学附属妇产医院医学研究中心
南京医科大学附属妇产医院泌尿外科
南京医科大学附属妇产医院急诊医学科
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1585-1591,共7页
基金
国家自然科学基金项目(81771572)。
文摘
目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA-mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)以及mRNA的表达谱,利用Cytoscape软件构建差异表达lncRNA及差异表达mRNA网络,采用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway分析共表达网络中mRNA的生物学功能。结果:通过下一代测序技术,根据|Log_(2)FC|≥2且校正后P值<0.05标准筛选出LD组和正常对照组中共计499条上调表达的lncRNA、337条下调表达的lncRNA,以及1582条上调表达mRNA、633条下调表达的mRNA。随后,通过其中100个lncRNA与311个mRNA构建了基于差异表达的lncRNA和mRNA的共表达网络。最后,共表达网络的功能富集分析表明mRNA主要与心肌相关的疾病和功能有关。结论:LD的发病机制可能与血液循环功能障碍、局部肌肉功能障碍以及cGMP通路等有关,需要相关研究来进一步证实。
关键词
阴道
润滑障碍
长链非编码RNA
共表达网络
Keywords
vaginal lubrication disorder
long non-coding RNA
co-expression network
分类号
R711.73 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
润滑障碍女性阴道组织的差异表达miRNA表达谱分析
2
作者
张晶
潘连军
马洁桦
机构
江苏卫生健康职业学院药学院
南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)泌尿男科
出处
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1074-1082,共9页
基金
南京市医学科技发展资金(QRX17158)
国家自然科学基金(81771572)
+2 种基金
江苏省高等学校自然科学研究面上项目(18KJB320002)
2019江苏高校‘青蓝工程’资助
江苏卫生健康职业学院校级科研项目(JKB201912)
文摘
目的:阴道润滑障碍(LD)是女性性功能障碍(FSD)中最常见的一种,显著影响女性的生理健康与受孕。探明LD的发病机制,寻找治疗靶标,对于预防和治疗LD十分必要。方法:选取南京市妇幼保健院收治的符合筛选标准的健康对照组和LD组女性各3例,提取阴道上皮组织RNA进行高通量miRNA测序,筛选差异miRNA并进行聚类分析、靶基因预测、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书通路(KEGG pathway)显著性富集分析。最后,通过实时荧光定量PCR对测序结果进行了验证。结果:本次高通量测序共测到1673个miRNA。并筛选到64个有望成为LD治疗靶标的miRNA,其中25个miRNA在LD患者较对照组上调4倍以上;39个miRNA在LD患者较对照组下调4倍以上。神经元投射形态发生和AMPK信号通路是最显著富集的GO词条(term)和KEGG pathway。结论:miRNA在LD患者中存在差异性表达,这些miRNA及靶基因可能与LD的发生有关,有望成为LD治疗靶标的miRNA,具有重要理论意义以及潜在应用价值。
关键词
女性性功能
障碍
润滑障碍
阴道上皮
MIRNA
高通量测序
Keywords
female sexual dysfunction
lubrication disorder
vaginal epithelium
miRNA
high-throughput sequencing
分类号
R711.59 [医药卫生—妇产科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
润滑障碍中的lncRNA-mRNA共表达网络的构建及功能预测
刘天娇
张晶晶
马洁桦
潘连军
阮红杰
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
下载PDF
职称材料
2
润滑障碍女性阴道组织的差异表达miRNA表达谱分析
张晶
潘连军
马洁桦
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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职称材料
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