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淀粉蔗糖酶AcAS的工作机理研究与稳定性改造
被引量:
1
1
作者
刘明
孙巍
+1 位作者
岳俊杰
苏计国
《生物技术通讯》
CAS
2013年第3期308-313,共6页
目的:对新发现的一种新型淀粉蔗糖酶AcAS的结构功能进行深入讨论。方法:用同源模建方法构建AcAS的三维结构;用高斯网络模型和各项异性网络模型,对其功能型运动和工作机理进行预测;利用迭代高斯网络模型方法对其去折叠路径进行预测;根据...
目的:对新发现的一种新型淀粉蔗糖酶AcAS的结构功能进行深入讨论。方法:用同源模建方法构建AcAS的三维结构;用高斯网络模型和各项异性网络模型,对其功能型运动和工作机理进行预测;利用迭代高斯网络模型方法对其去折叠路径进行预测;根据去折叠路径预测及折叠自由能计算结果设计突变体。结果:模建结果表明,AcAS结构与淀粉蔗糖酶NpAS的结构更相似;AcAS有扭转运动的趋势,其中AcAS的N/C结构域运动性较强,而催化核心的运动性较弱;根据去折叠路径预测,发现N、B和C结构域较易去折叠;通过自由能计算,针对上述3个结构域设计了5株突变体。结论:构建了AcAS的三维结构模型并根据模型探讨了其工作机理;根据去折叠路径预测及折叠自由能计算结果,对AcAS的稳定性改造提出了有益的建议。
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关键词
淀粉蔗糖酶acas
同源模建
高斯网络模型
去折叠
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职称材料
题名
淀粉蔗糖酶AcAS的工作机理研究与稳定性改造
被引量:
1
1
作者
刘明
孙巍
岳俊杰
苏计国
机构
中国医学科学院北京协和医学院药物研究所
军事医学科学院生物工程研究所
燕山大学理学院
出处
《生物技术通讯》
CAS
2013年第3期308-313,共6页
基金
国家自然科学基金(11204267)
文摘
目的:对新发现的一种新型淀粉蔗糖酶AcAS的结构功能进行深入讨论。方法:用同源模建方法构建AcAS的三维结构;用高斯网络模型和各项异性网络模型,对其功能型运动和工作机理进行预测;利用迭代高斯网络模型方法对其去折叠路径进行预测;根据去折叠路径预测及折叠自由能计算结果设计突变体。结果:模建结果表明,AcAS结构与淀粉蔗糖酶NpAS的结构更相似;AcAS有扭转运动的趋势,其中AcAS的N/C结构域运动性较强,而催化核心的运动性较弱;根据去折叠路径预测,发现N、B和C结构域较易去折叠;通过自由能计算,针对上述3个结构域设计了5株突变体。结论:构建了AcAS的三维结构模型并根据模型探讨了其工作机理;根据去折叠路径预测及折叠自由能计算结果,对AcAS的稳定性改造提出了有益的建议。
关键词
淀粉蔗糖酶acas
同源模建
高斯网络模型
去折叠
Keywords
Arthrobacter chlorophenolicus amylosuerase
homology modeling
Gaussian network model
untolding
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
Q811.4 [生物学—生物工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
淀粉蔗糖酶AcAS的工作机理研究与稳定性改造
刘明
孙巍
岳俊杰
苏计国
《生物技术通讯》
CAS
2013
1
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