淮南猪与大白猪背最长肌不同发育阶段的甲基化差异基因筛选

试验旨在研究河南省地方品种淮南猪与引进品种大白猪背最长肌的甲基化,筛选影响背最长肌发育的候选基因。对淮南猪、大白猪胚胎期第38、58、78天和出生后第21天4个发育阶段的肌肉组织开展全基因组甲基化测序,比对不同发育阶段的甲基化差异。结果显示,在胚胎期第78天有2个信号通路CpG甲基化出现极显著差异,分别是黏着斑(ssc04510:Focal Adhesion)信号通路(P=0.004)、Ras相关蛋白1信号通路(ssc04015:Rap1)(P=0.014);胚胎期第58天细胞外基质受体相互作用(ssc04512:ECM-Receptor Interaction)等信号通路也存在CpG甲基化差异,但未达到显著性水平(P=0.088);筛选了黏着斑信号通路的Rap鸟嘌呤核苷酸交换因子1(Rap Guanine Nucleotide Exchange Factor 1,RAPGEF1)、层粘连蛋白γ3亚基(Laminin Subunit Gamma 3,LAMC3)、小鼠胸腺瘤病毒癌基因同源物3 (Murine Thymoma Viral Oncogene,Akt3)作为候选基因。综上,淮南猪与大白猪胚胎期第78天甲基化存在显著性差异,筛选到的3个候选基因分别通过诱导肌细胞的分化、调节肌细胞生长等生物学功能影响肌肉发育。

全基因组关联分析筛选淮南猪繁殖性状候选基因

为了筛选淮南猪产仔数、有效产仔数、窝重等繁殖性状的候选基因及SNP标记,采用GGP porcine 50K芯片对254头淮南母猪开展了基因分型和全基因组关联分析。结果显示:在总产仔数、有效产仔数、窝重3个繁殖性状分别发现了31、17、1个SNP和43、20、1个候选基因,筛选了FBXO5、PRDM9、CDT1和PABPN1等作为总产仔数性状候选基因,为后续通过分子育种手段提升淮南猪繁殖性状奠定了基础。

淮南猪与长白猪脂肪代谢酶及脂联素的发育差异

为探明淮南猪与长白猪脂肪代谢酶及血清中脂联素的发育差异,对45日龄、90日龄、135日龄和180日龄健康长白猪和淮南猪进行血清中脂联素含量、肌内脂肪含量及脂肪代谢酶测定。结果表明:相同品种猪的肌内脂肪含量随着猪日龄的增加而增加;相同日龄不同猪种间肌内脂肪含量淮南猪显著高于长白猪(P<0.05);同一品种猪血清中脂联素的含量随日龄增加而增加,135日龄和180日龄分别与45日龄间差异显著;淮南猪和长白猪脂肪组织中的脂肪酸合成酶(FAS)和激素敏感脂酶(HSL)含量随日龄的增加而增加,均以180日龄最高;脂联素及脂肪代谢酶变化趋势均随日龄的增加而增加,具有强脂肪沉积能力。

淮南猪生长发育与肥育性能的研究

对淮南猪5 4头公猪和30 8头母猪的生长发育进行了测定,并对82头育肥猪进行了屠宰测定和胴体分析。结果表明,淮南猪的体重、体高、体长、胸围等指标在3月龄以前公母猪无明显差异,4月龄以后母猪的体重和体尺逐渐大于公猪。后备猪6月龄体重,公猪(4 1.2 8±3.2 3)kg ,母猪(4 5 0 8±3.86 )kg ;体长,公猪(88.37±4 .2 )cm ,母猪(90 .6 9±4 .36 )cm ;体高,公猪(5 1.73±3.94 )cm ,母猪(5 3.0 4±4 .4 2 )cm。胴体组织的早熟顺位为骨、皮、肉、脂,体躯各段的早熟顺位是蹄、头、腰、腿臀、颈胸。其体型大小在我国地方猪种中居中等。育肥期日增重(375 .182±4 0 .2 6 )g ,屠宰率为70 738% ,瘦肉率为4 9.0 75 % ,眼肌面积(2 3.32 8±3.75 2 )cm2 ,含脂率为33.5 % ,与多数地方猪种含脂率相当。育肥猪适宜屠宰体重90kg左右,适宜屠宰期8月龄,饲料转化率3.84∶1。淮南猪肉质优良,肉色3.5 ,为正常鲜红色,大理石纹3.5 ,肌肉脂肪分布为理想分布,pH值6 .3～6 .5 ,属正常范围。

去势对淮南猪皮下脂肪PPAR信号通路基因表达量的影响

为了研究PPAR信号通路在猪去势诱导的脂肪沉积中的作用,采集去势和非去势淮南猪(共6头,每组各3头)的皮下脂肪组织,提取总RNA后构建文库,利用高通量测序技术检测PPAR通路相关基因表达量,表达差异基因的筛选阈值为P<0.05且|log2差异倍数|>1。基于mRNA的差异分析以及KEGG富集分析发现,PPAR信号通路中17个基因表达差异达到显著水平,其中14个基因表达量上调、3个基因表达量下调。脑型脂肪酸结合蛋白基因(FABP7)、甘油水孔蛋白基因(AQP7)、视黄素X受体γ基因(RXRγ)等基因上调,而磷酸烯醇丙酮酸羧激酶1基因(PCK1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1α基因(PPARGC1α)、胆固醇7α-羟化酶1基因(CYP7A1)参与分解代谢的基因显著下调。

淮南猪种质资源的亲缘关系研究

为更有效地保护和高效利用现有地方良种资源,充分挖掘其优异基因为育种和生产服务,利用微卫星标记技术,对现有淮南公猪的基因组DNA进行了检测,通过计算等位基因数量、基因频率、亲缘关系、遗传距离等参数,对其遗传多样性的现状进行了初步分析。结果表明：在21个微卫星基因座上共检测到93个等位基因,21个位点的等位基因数为3~8个,平均等位基因数为4.43个;公猪个体间的亲缘关系清晰可见,在系数为0.748水平上可聚为7类。

不同养殖模式对淮南猪屠宰和肉质性状的影响

为探索散养和圈养养殖模式对淮南猪屠宰和肉质性状的影响,选择发育正常、出生体质量相似的淮南仔猪20头,随机分为散养组和圈养组。在供试猪只体质量达100 kg左右时,每组随机选择5头猪进行屠宰试验,测定屠宰性状、肉质性状以及背最长肌氨基酸、脂肪、维生素、矿物元素含量。结果显示,与圈养组相比,散养组背膘厚(三点均值)和肌内脂肪含量分别降低33.74%(P<0.05)和53.25%(P<0.05),单个肾质量升高18.85%(P<0.05),散养组眼肌面积和后腿比例分别提高2.45%和23.37%,但滴水损失降低45.83%。散养组鲜味氨基酸含量更高,而圈养组必需氨基酸含量更高。散养组维生素B1含量比圈养组高24.24%(P<0.05)。散养组钙和钾含量分别比圈养组高44.94%(P<0.05)和5.54%(P>0.05)。综上所述,散养模式显著减少脂肪沉积,提高眼肌面积和后腿比例,同时散养模式可促进维生素B1、钙、钾和鲜味氨基酸的沉积,提高鲜味和嫩度,有助于提高淮南猪肉质性状。

淮南猪新品系初产母猪泌乳性能的研究

选择淮南猪新品系初产母猪17头对其泌乳性能进行研究。结果表明:在35d泌乳期内,平均泌乳量(249.55±1.25)kg,日平均泌乳次数(27.10±1.98)次,日平均泌乳量(7.13±0.68)kg,仔猪每完成1次正常吮乳总时间平均为209.27s,其中吮乳前按摩时间平均为71.83s,母猪放乳时间平均为23.40s,吮乳后的后按摩时间平均为114.04s。全期泌乳量呈正态分布,泌乳高峰出现在产后25d,结果显示,淮南猪新品系初产母猪具有较强的泌乳性能和良好的哺乳能力。

淮南猪新品系繁殖性能的选育及分析

经过多次杂交筛选 ,在淮南猪中引入一定比例的杜洛克猪外血组建基础群 ,开展群体继代选育工作。对五个世代母猪繁殖性能的分析表明 ,培育的新品系基本保持了淮南猪繁殖力高的特性 ,母猪初生窝重增大 ,仔猪哺乳期生长速度加快 ,主选性状进展显著。与零世代相比 ,五世代总产仔数增加 2 .92头 (P <0 .0 1) ,产活仔数增加 2 .83头 (P <0 .0 1) ,初生窝重增加 5 .72kg(P <0 .0 1) ,2 0日龄头数增加 2 .31头 (P <0 .0 5 ) ,2 0日龄窝重增加 19.73kg(P <0 .0 1) ,断奶头数增加 1.2 6头 (P >0 .0 5 ) ,断奶窝重增加 18.2 7kg(P <0 .0 5 )

淮南猪新品系适应性研究

选择受气候因素影响较大的母猪繁殖性能指标,对2002～2004年新品系母猪的繁殖性能与淮南猪母猪的繁殖性能进行同期比较。新品系在主要繁殖性状受气候生态因子的影响上与淮南猪一致,表现出与淮南猪相似的适应性。

淮南猪肥育与胴体性状的聚类分析

应用聚类分析法将淮南猪的肥育与胴体性状分成肥育期日增重、宰前活重、胴体重、胴体长；板油比例、花油比例、肥肉率；屠宰率、背膘厚、皮厚；后腿比例、瘦肉率四类。并分别以肥育期平均日增重、肥肉率、屠宰率、瘦肉率和后腿比例为典型性状。这与采用其它方法分析的结论是一致的。

淮南猪肉食用品质的研究

从河南省信阳市浉河区十三里桥乡养殖场随机选取1龄左右健康无病、发育正常、人工养殖的淮南猪8头和生长健康、发育正常的当地白猪4头为样本(公、母各半),集中屠宰,然后用常规方法对猪肉的食用品质进行比较全面系统的测定研究。结果表明,淮南猪肉大理石纹评分为3.70分,肌纤维直径为14.50μm,剪切力为527kPa,极显著低于当地白猪。其他食用品质指标包括肉色、pH值、失水率、系水能力和熟肉率与当地白猪之间不存在显著性差异。

淮南猪瘦肉型品系应激敏感性的研究

猪氟烷(halothane,HAL)基因n是猪产生猪应激综合症(PSS)的主效基因,采用限制性核酸内切酶HhaI对淮南猪瘦肉型品系共155头的HAL基因进行PCR-RFLP分析,结果表明:淮南猪新品系HAL基因HhaI酶切的优势基因型为显性纯合子NN,频率为0.9739。淮南猪新品系HAL基因HhaI酶切没有产生隐性纯合子基因型nn,新品系猪杂合子基因型Nn和显性纯合子NN不产生应激综合症(PSS)。新品系保持了淮南猪无应激敏感这一优良特性。

淮南猪新品系生长性状的选育进展与相关分析

对淮南猪经过多组合杂交试验,筛选出导入一定比例的杜洛克猪血缘为最佳组合,经扩繁和建立育种核心群,采用群体继代选育法培育淮南猪新品系,历经5年4个世代的选育。结果表明,主选性状进展明显,其中公猪平均日增重由选育初期的481.23g提高到四世代的535.51g,每世代平均改进13.57g,母猪分别为465.15g,535.03g和17.47g;在生长速度改进的同时公母猪的体尺变化也较明显,其中公猪体长增加了10.27cm,母猪体长增加了14.57cm;性状间的相关分析结果表明,公母猪6月龄的体重与体长、平均日增重、胸围呈强的正相关,且达到极显著水平(P<0.01);与体高、臀围呈正相关,达到显著水平(P<0.05)。

淮南猪染色体的研究

采用微量外周血淋巴细胞培养以及核仁组成区银染色(Ag—NORs)技术,对淮南猪体细胞核型以及核仁组成区进行了研究,结果表明,淮南猪二倍体细胞染色体组成为38xy(公)或38xx(母),NF=64;细胞分裂中期银染阳性核仁组成区为1、2、3和4的频率分别为0.3659、0.2683、0.1951和0.1707,平均有2.17条染色体的核仁组成区被正染。

淮南猪品种遗传特异性的AFLP分析

试验利用25对引物对河南省地方品种淮南猪及引入品种杜洛克猪、长白猪、大约克猪4个品种猪进行AFLP分析。电泳检测结果发现,25对引物共检测到317条扩增片段,其中多态性片段79条,占24.92%。多态性统计分析表明,长白猪与大约克猪之间的遗传距离指数为0.0070,遗传关系最近;淮南猪与杜洛克猪、大约克猪遗传距离指数相近,分别为0.0073、0.0075,遗传关系较近;淮南猪与长白猪遗传距离指数为0.0078,遗传关系最远。结果显示,河南省地方品种淮南猪相对于其他引入品种特异性强,具有很高的育种价值,同时也证明了AFLP技术可以很好地检测猪种群内的遗传变异及猪种鉴别。

淮南猪皮下与肌内脂类代谢相关基因表达差异的研究

运用RT-PCR方法对淮南猪背部皮下脂肪与背最长肌肌内脂肪组织中激素敏感脂肪酶(HSL)、脂肪酸合成酶(FAS)、脂蛋白脂酶(LPL)基因表达进行测定.试验结果表明:相关基因与淮南猪肌内脂肪组织相关,皮下脂肪组织中HSL mRNA丰度下降了32.91%(P<0.05);FAS mRNA丰度提高了75%(P<0.05),FAS/HSL比值提高了2.89倍(P<0.01);LPL mRNA丰度提高了51.28%(P<0.05).表明淮南猪皮下与肌内脂类代谢相关基因表达存在显著差异.

淮南猪种质特性的研究与利用(Ⅰ)

本文利用现代育种学、数量遗传学、细胞遗传学、普通畜牧学和家畜行为学的基本原理和方法,对淮南猪的繁殖、生长发育、育肥与胴体、营养需要、肉质、生理常值、经济性状的遗传特性、染色体、杂种优势利用、生活行为等种质特性进行了全面、系统的研究,并对主要经济性状制订了综合选择指数,为淮南猪的保种、选育及进一步的研究利用提供了科学的依据和方法.