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基于图卷积和双线性注意力网络的药物靶标亲和力预测
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作者 程竹平 李建华 《华东理工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期594-601,共8页
药物靶标亲和力预测在药物研发中扮演着重要的角色。针对现有预测方法大多忽略药物分子的二维结构信息、缺乏深层表征融合学习的问题,提出了基于图卷积和双线性注意力网络的药物靶标亲和力预测模型(GBN_DTA)。该模型首先基于多层图卷积... 药物靶标亲和力预测在药物研发中扮演着重要的角色。针对现有预测方法大多忽略药物分子的二维结构信息、缺乏深层表征融合学习的问题,提出了基于图卷积和双线性注意力网络的药物靶标亲和力预测模型(GBN_DTA)。该模型首先基于多层图卷积神经网络编码药物分子图,同时结合1D-CNN和双向长短期记忆网络(BiLSTM)编码靶标序列;然后使用双线性注意力网络融合编码后的药物和靶标特征,最终获得亲和力预测分数。实验结果表明,该模型在DAVIS和KIBA数据集上的性能均优于其他6种主流方法,有效提升了预测准确率。 展开更多
关键词 药物靶标亲和力预测 药物研发 图卷积神经网络 双线性注意力网络 深层表征融合
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高中生“化学问题解决”过程中存在的问题及对策 被引量:4
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作者 张凤桂 杨帆 《化学教育》 CAS 2008年第4期34-35,共2页
分析了诸多研究者所忽视的关于高中生在化学问题解决的各个环节存在的问题和原因,并提出了相应的对策。
关键词 化学问题解决 深层表征 问题解决策略 对策
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级联稀疏卷积与决策树集成的病理图像细胞核分割方法 被引量:5
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作者 宋杰 肖亮 练智超 《自动化学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第2期378-390,共13页
数字病理图像分析对于乳腺癌、肾癌等良恶性分级诊断具有重要意义,其中细胞核的形态测量是病理量化分析的关键.然而,由于病理图像背景复杂,细胞核高密度分布、细胞粘连等,个体细胞核精准分割是一个挑战性问题.本文提出一个级联稀疏卷积... 数字病理图像分析对于乳腺癌、肾癌等良恶性分级诊断具有重要意义,其中细胞核的形态测量是病理量化分析的关键.然而,由于病理图像背景复杂,细胞核高密度分布、细胞粘连等,个体细胞核精准分割是一个挑战性问题.本文提出一个级联稀疏卷积与决策树集成学习的细胞核分割模型.该模型由稀疏可分离卷积模块和集成决策树学习的正则化回归模块堆叠级联组成,其中:前者采取秩-1张量分解学习机制,可分层抽取细胞核的多尺度方向分布式抽象特征;而后者采取随机采样、树剪枝以及正则化回归机制提升逐像素回归分类能力.相比于现有深度学习模型,该模型无需非线性激活和后向传播计算,参数规模较小,可实现端到端的学习.通过乳腺、前列腺、肾脏、胃和膀胱等多组病理图像的分割实验表明:该模型能够实现复杂数字病理图像中的高密度细胞核的快速个体目标检测和分割,在Jaccard相似性系数、F1分数和平均边缘距离三个指标上均优于目前CNN2、CNN3和U-Net等深度学习方法,具有较好应用前景. 展开更多
关键词 数字病理 细胞核分割 级联稀疏可分离卷积 集成决策树 正则化回归 深层表征学习
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Characterization of deep ground geothermal field in Jiahe Coal Mine 被引量:2
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作者 Zhang Yi Guo Dongming +2 位作者 He Manchao Jiang Yaodong Yang Ching 《Mining Science and Technology》 EI CAS 2011年第3期371-374,共4页
Research into the characteristics of geothermal fields is important for the control of heat damage in mines. Based on measured geothermal data of boreholes from 200 m to 1200 m in a Jiahe Coal Mine, we demonstrate non... Research into the characteristics of geothermal fields is important for the control of heat damage in mines. Based on measured geothermal data of boreholes from 200 m to 1200 m in a Jiahe Coal Mine, we demonstrate non-linear but increasing relations of both geo-temperatures and geothermal gradients with increases depth. Numerically, we fitted the relationship between geo-temperatures and depth, a first-order exponential decay curve, formulated as: T(h) = 4.975 + 23.08 exp(h/1736.1). 展开更多
关键词 Deep mine Geothermal field Heat damage Function
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三元空间大数据网络关联表征 被引量:8
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作者 朱文武 王鑫 《中国科学:信息科学》 CSCD 北大核心 2021年第11期1802-1839,共38页
三元空间是由信息空间、物理世界、人类社会所构成,三元空间大数据由信息空间所产生的互联网数据、物理空间所产生的物联网数据和人类社会空间所产生的数据所构成.本文介绍了三元空间大数据的关联复杂性,并针对三元空间大数据关联复杂... 三元空间是由信息空间、物理世界、人类社会所构成,三元空间大数据由信息空间所产生的互联网数据、物理空间所产生的物联网数据和人类社会空间所产生的数据所构成.本文介绍了三元空间大数据的关联复杂性,并针对三元空间大数据关联复杂性这一本质困难,提出解决三元空间异构数据的关联表征这一关键科学问题.传统信息科学往往依据既有的先验信息进行特征表达,并在先验表征空间内分析信息语义及其关联关系.然而,在表征层面所引入的先验偏见,极大限制了信息理解和关联的广度和深度,使得蕴含于三元空间大数据之中的超出人类现有经验的知识难以被发掘.为解决上述难题,本文提出将三元空间数据关联关系通过拓扑图理论表征成网络或图以实现三元空间大数据的关联表征和融合分析.具体地,利用数据驱动的深层网络表征对三元空间异构数据的弱先验关联关系进行深度建模以保持原始数据间的异构关联关系,通过对非线性、非凸异构数据关联表达进行深度解离化计算以提升深层关联表征的鲁棒性与可解释性,借助拓扑图理论挖掘三元空间大数据中蕴含的异构关联关系以达到对三元空间异构关系的精准刻画.最后,本文从知识与数据双驱动、自适应,以及可推理三元空间大数据分析的角度对三元空间大数据关联表征的未来研究方向进行展望. 展开更多
关键词 三元空间 大数据 关联表征 深层表征 网络表征
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