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基于图卷积和双线性注意力网络的药物靶标亲和力预测
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作者 程竹平 李建华 《华东理工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期594-601,共8页
药物靶标亲和力预测在药物研发中扮演着重要的角色。针对现有预测方法大多忽略药物分子的二维结构信息、缺乏深层表征融合学习的问题,提出了基于图卷积和双线性注意力网络的药物靶标亲和力预测模型(GBN_DTA)。该模型首先基于多层图卷积... 药物靶标亲和力预测在药物研发中扮演着重要的角色。针对现有预测方法大多忽略药物分子的二维结构信息、缺乏深层表征融合学习的问题,提出了基于图卷积和双线性注意力网络的药物靶标亲和力预测模型(GBN_DTA)。该模型首先基于多层图卷积神经网络编码药物分子图,同时结合1D-CNN和双向长短期记忆网络(BiLSTM)编码靶标序列;然后使用双线性注意力网络融合编码后的药物和靶标特征,最终获得亲和力预测分数。实验结果表明,该模型在DAVIS和KIBA数据集上的性能均优于其他6种主流方法,有效提升了预测准确率。 展开更多
关键词 药物靶标亲和力预测 药物研发 图卷积神经网络 双线性注意力网络 深层表征融合
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