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一种处理混合患病兄弟对IBD数据连锁分析的方法
1
作者
崔文泉
许晋
《中国科学技术大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期254-260,共7页
患病兄弟对(affected sib-pair,ASP)设计是连锁分析中的重要方法,得到了广泛的研究和应用.然而,实际问题中患病兄弟对中常常会混杂部分半兄弟对,而且由于个人隐私等原因,兄弟对关系的信息往往缺失,我们称这种数据为混合患病兄弟对(mixed...
患病兄弟对(affected sib-pair,ASP)设计是连锁分析中的重要方法,得到了广泛的研究和应用.然而,实际问题中患病兄弟对中常常会混杂部分半兄弟对,而且由于个人隐私等原因,兄弟对关系的信息往往缺失,我们称这种数据为混合患病兄弟对(mixed affected sib-pair,MASP).对混合患病兄弟对的IBD(identical by descent)数据给出了一种进行连锁分析的方法,构造了可识别的统计模型,证明了用于进行连锁分析的似然比检验统计量的渐近零分布服从自由度为3的卡方分布,同时给出了求解参数估计的EM算法.统计模拟表明,该方法在小样本情形下具有良好表现.
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关键词
连锁分析
可识别性
混合患病兄弟对
似然比检验
EM算法
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题名
一种处理混合患病兄弟对IBD数据连锁分析的方法
1
作者
崔文泉
许晋
机构
中国科学技术大学统计与金融系
出处
《中国科学技术大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期254-260,共7页
基金
国家自然科学基金(10471136
10671189)
+1 种基金
教育部博士点基金
中国科学院知识创新工程(KJCX3-SYW-S02)资助
文摘
患病兄弟对(affected sib-pair,ASP)设计是连锁分析中的重要方法,得到了广泛的研究和应用.然而,实际问题中患病兄弟对中常常会混杂部分半兄弟对,而且由于个人隐私等原因,兄弟对关系的信息往往缺失,我们称这种数据为混合患病兄弟对(mixed affected sib-pair,MASP).对混合患病兄弟对的IBD(identical by descent)数据给出了一种进行连锁分析的方法,构造了可识别的统计模型,证明了用于进行连锁分析的似然比检验统计量的渐近零分布服从自由度为3的卡方分布,同时给出了求解参数估计的EM算法.统计模拟表明,该方法在小样本情形下具有良好表现.
关键词
连锁分析
可识别性
混合患病兄弟对
似然比检验
EM算法
Keywords
linkage analysis
identifiability
mixed affected sib-pair
LRT
EM algorithm
分类号
Q348 [生物学—遗传学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种处理混合患病兄弟对IBD数据连锁分析的方法
崔文泉
许晋
《中国科学技术大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
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参考文献
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