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松材线虫虫体特异表达cDNA文库的构建与分析
1
作者
黄麟
徐旭凌
+2 位作者
李超
叶建仁
吴小芹
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期98-103,共6页
松材线虫取食和致病相关基因的鉴定是揭示松材线虫病致病机制的重要研究内容。以松材线虫混合虫体为测试方,线虫卵为驱动方,构建二者差减cDNA文库。文库测序结果经序列拼接、功能注释,共获得松材线虫虫体特异表达的有效EST序列354个,拼...
松材线虫取食和致病相关基因的鉴定是揭示松材线虫病致病机制的重要研究内容。以松材线虫混合虫体为测试方,线虫卵为驱动方,构建二者差减cDNA文库。文库测序结果经序列拼接、功能注释,共获得松材线虫虫体特异表达的有效EST序列354个,拼接后获得34个重叠群,其中15个重叠群获得明确的功能注释,其中MixC12、MixC25、MixC33分别与过氧化物酶、β-1,4内切葡聚糖酶、锌指家族蛋白有较高的同源性,这些基因被认为与植物线虫的取食和致病性密切相关。RT-PCR分析验证了所获得的差减cDNA的代表性。
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关键词
松材线虫
混合虫体
致病相关基因
抑制差减杂交
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职称材料
题名
松材线虫虫体特异表达cDNA文库的构建与分析
1
作者
黄麟
徐旭凌
李超
叶建仁
吴小芹
机构
南京林业大学江苏省有害生物入侵与控制重点实验室
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期98-103,共6页
基金
国家自然基金项目(31000303)
江苏省自然科学基金项目(BK2010566)
国家重点基础研究发展计划(2009CB119200)
文摘
松材线虫取食和致病相关基因的鉴定是揭示松材线虫病致病机制的重要研究内容。以松材线虫混合虫体为测试方,线虫卵为驱动方,构建二者差减cDNA文库。文库测序结果经序列拼接、功能注释,共获得松材线虫虫体特异表达的有效EST序列354个,拼接后获得34个重叠群,其中15个重叠群获得明确的功能注释,其中MixC12、MixC25、MixC33分别与过氧化物酶、β-1,4内切葡聚糖酶、锌指家族蛋白有较高的同源性,这些基因被认为与植物线虫的取食和致病性密切相关。RT-PCR分析验证了所获得的差减cDNA的代表性。
关键词
松材线虫
混合虫体
致病相关基因
抑制差减杂交
Keywords
Bursaphelenchus xylophilus
mixed stage nematode
pathogenicity-related gene
suppression subtractive hybridization
分类号
S763.1 [农业科学—森林保护学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
松材线虫虫体特异表达cDNA文库的构建与分析
黄麟
徐旭凌
李超
叶建仁
吴小芹
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
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