浅析溯祖理论

溯祖理论诞生于 2 0世纪 80年代后期。经过十几年的发展日趋完善 ,并成为研究群体遗传及分子演化的有利工具 ,由于理论本身的数学分析严密性 ,对于基因组数据结构的精细处理 ,有着传统的遗传学理论无可比拟的优越性 ,拟就这一理论作一简单介绍。

比较基因组学研究进展

人类基因组计划实施过程中产生了庞大而复杂的基因组数据,单一物种的基因组信息有限,比较不同生物的基因组可揭示基因组中蕴含的丰富信息,在基因组序列比对和功能揭示过程中发展出了比较基因组学。比较基因组学可用于预测基因数目、位置、功能、表达机制,甚或进行生物演化分析,是进行基因组结构与功能注释的有力工具,有助于揭示生命遗传变异、演化发展的奥秘。本文通过学术搜索相关生物技术信息数据库,对比较基因组学的发展历史、研究内容和核心研究方法等方面进行了文献综述,为后续基因组的研究提供指导和帮助。

共演化博弈中的反馈机制

本文研究共演化动力学在合作演化中的作用.系统的状态由个体的策略决定.系统状态与个体的属性共同演化,形成一种反馈机制.特别是当个体能够根据博弈的结果调整社会关系时,这种调整势必影响未来的博弈.这种反馈机制在适当的时间尺度下,总是能够促进合作.首先,分析了个体策略与群组属性共演化的情形,在基于个体选择的层面上,结合溯祖理论和演化集合论,给出了区域性利他行为涌现的条件.其次,给出了结构群体中策略选择的参数判据,将两策略判据和适应动力学结合起来,发现通过调整与收益矩阵无关的参数可以实现性能控制.最后,研究了不同的角色分配方案在最后通牒博弈中对公平行为演化的影响,发现当个体的先行者优势或所配置的资源依赖于先前分配结果时,公平的分配方案及对公平的要求得以建立.共演化这种反馈机制在用博弈论解决编队控制、资源配置方案设计等实际问题时显示出广泛的应用前景.

海洋鱼类分子系统地理学研究进展

简要叙述了分子系统地理学的发展简史、研究内容,重点介绍了Avise的5种物种分布模式及中性溯祖理论。并回顾了近年来分子系统地理学的研究进展及其在海洋鱼类研究中的应用,最后对海洋鱼类分子系统地理学研究进行了展望。

种内谱系地理学及在植物遗传多样性保护中的应用

谱系地理学是一门研究近缘物种间或种内水平的谱系地理分布原理和过程的新兴交叉学科。介绍了谱系地理学基本理论,讨论了用于植物种内谱系地理学研究的常用叶绿体非编码序列标记,包括rpl16、trnK内含子,trnT-trnF、atpB-rbcL、psbA-trnH间隔序列,综述了种内谱系地理学在珍稀植物遗传多样性保护中应用现状,展望植物谱系地理学研究及其应用前景。

系统地理学的研究及其在鱼类上的应用

介绍了系统地理学的研究内容、理论、方法,重点介绍了AVISE的5种物种分布模式、中性溯祖理论、mtDNA多态性分析的优越性以及TEMPLETON的巢式支系法。还从地理隔离、种群扩散、基因交流、区系划分、分子钟估算等方面阐述了系统地理学在鱼类的应用研究现况和应用前景。最后提出了系统地理学在鱼类应用时要注意的事项:1)要选择合适的基因DNA片段进行分析;2)mtDNA标记最好要与核DNA标记及形态学、细胞学、生化学标记结合使用;3)要提高分子钟估算的精确度。

头足类分子系统地理学研究进展

头足类是重要的经济海生动物,不仅为人类提供了优质的动物蛋白,而且在海洋生态系统中扮演着重要的角色。头足类广泛分布在三大洋和极地海域,分布范围广,种类繁多,从分子水平上探讨其空间分布格局及进化历史具有重要的意义。介绍了分子系统地理学的发展史,并阐述了分子系统地理学研究的理论基础和实践基础。回顾了头足类分子系统地理学的研究进展,主要对头足类种群遗传结构、系统地理格局及其影响因素进行概括,并从系统进化的角度探讨头足类的分布格局,最后提出存在的问题并进行展望与分析。

叶绿体DNA标记在谱系地理学中的应用研究进展

谱系地理学研究旨在探究历史上发生的影响目前遗传谱系系统发育和空间分布格局关系的生态与进化过程。叶绿体DNA具有单亲遗传、低突变率、单倍体等特征,其分子标记不同程度地保留着植物长期进化的历史遗传痕迹,有助于深度解析谱系地理变异的形成机制。本文探讨了上述特征是怎样影响分子标记的选择、扩大或缩小群体遗传结构分化、延长或缩短空间基因溯祖时间、促进或阻碍种间基因渐渗及谱系分选(复系、并系和单系形成)进程,重点阐述了这些影响过程的理论基础,并结合实际例子阐述谱系地理研究进展。由于位点间在突变率、选择强度及它们与漂变互作等方面存在异质性,今后一个研究重点就是基于叶绿体全基因组序列分析谱系地理变化格局,包括分析DNA位点间的基因渐渗或基因流动程度差异分布及沿着叶绿体DNA序列上谱系分选差异分布。