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溴代胞嘧啶对三螺旋DNA稳定性的影响
1
作者
李清
白春礼
+5 位作者
ImshikLee
杨林静
邓文礼
王琛
王乃新
刘次全
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
1999年第1期9-13,共5页
研究了三螺旋DNA中胞嘧啶被5-溴胞嘧啶取代后的稳定性问题。通过建立CGC,CGBrC,BrCGC和BrCGBrC4种模型,并采用InsightⅡ软件包中的Discover程序进行计算模拟,发现用5-溴胞嘧啶取代三螺...
研究了三螺旋DNA中胞嘧啶被5-溴胞嘧啶取代后的稳定性问题。通过建立CGC,CGBrC,BrCGC和BrCGBrC4种模型,并采用InsightⅡ软件包中的Discover程序进行计算模拟,发现用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA分子中的胞嘧啶后,整个分子的稳定性有所降低。同时,当用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA不同链上的胞嘧啶时,被取代链的碱基堆积能显著增高,导致分子链内稳定性降低,但被取代链和相邻链间相互作用能有所降低,使得链间作用趋向稳定。
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关键词
三螺旋DNA
DNA
稳定性
胞嘧啶
溴代胞嘧啶
原文传递
溴代胞嘧啶分子内三螺旋DNA的理论研究
2
作者
杨林静
刘峁子
+2 位作者
李清
王琛
白春礼
《中国科学(B辑)》
CSCD
北大核心
1998年第5期385-390,共6页
运用分子力学方法研究了 3个含溴代胞嘧啶的分子内三螺旋及相应的未溴代分子内三螺旋DNA .理论结果表明 :当分子内三螺旋Hoogsteen嘧啶链的胞嘧啶被溴代胞嘧啶取代后其稳定性最强 ;而当分子内三螺旋 2条嘧啶链的胞嘧啶同时被溴代后 ,其...
运用分子力学方法研究了 3个含溴代胞嘧啶的分子内三螺旋及相应的未溴代分子内三螺旋DNA .理论结果表明 :当分子内三螺旋Hoogsteen嘧啶链的胞嘧啶被溴代胞嘧啶取代后其稳定性最强 ;而当分子内三螺旋 2条嘧啶链的胞嘧啶同时被溴代后 ,其稳定性最差 .从分子力学计算得到 ,4种分子内三螺旋的碱基以C3′ endo糖环构象为主 .在三螺旋YTCY( 2条嘧啶链中的胞嘧啶均被溴代胞嘧啶取代 )中 ,也含有一定数量的C2′ endo糖环构象 .因此 ,分子内三螺旋YTCY是A DNA和B DNA的综合体 ,而其他 3种三螺旋则是典型的A DNA .
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关键词
溴代胞嘧啶
分子内三螺旋
分子力学
核甘酸
DNA
原文传递
题名
溴代胞嘧啶对三螺旋DNA稳定性的影响
1
作者
李清
白春礼
ImshikLee
杨林静
邓文礼
王琛
王乃新
刘次全
机构
中国科学院化学研究所
中国科学院昆明动物研究所
出处
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
1999年第1期9-13,共5页
基金
中国科学院"九五"重大科研项目
国家自然科学基金
文摘
研究了三螺旋DNA中胞嘧啶被5-溴胞嘧啶取代后的稳定性问题。通过建立CGC,CGBrC,BrCGC和BrCGBrC4种模型,并采用InsightⅡ软件包中的Discover程序进行计算模拟,发现用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA分子中的胞嘧啶后,整个分子的稳定性有所降低。同时,当用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA不同链上的胞嘧啶时,被取代链的碱基堆积能显著增高,导致分子链内稳定性降低,但被取代链和相邻链间相互作用能有所降低,使得链间作用趋向稳定。
关键词
三螺旋DNA
DNA
稳定性
胞嘧啶
溴代胞嘧啶
Keywords
Bromide cytosine, Triplex DNA, Computational simulation
分类号
Q523.02 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
溴代胞嘧啶分子内三螺旋DNA的理论研究
2
作者
杨林静
刘峁子
李清
王琛
白春礼
机构
中国科学院化学研究所
出处
《中国科学(B辑)》
CSCD
北大核心
1998年第5期385-390,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目 !(批准号 :2 95 2 5 30 4)
文摘
运用分子力学方法研究了 3个含溴代胞嘧啶的分子内三螺旋及相应的未溴代分子内三螺旋DNA .理论结果表明 :当分子内三螺旋Hoogsteen嘧啶链的胞嘧啶被溴代胞嘧啶取代后其稳定性最强 ;而当分子内三螺旋 2条嘧啶链的胞嘧啶同时被溴代后 ,其稳定性最差 .从分子力学计算得到 ,4种分子内三螺旋的碱基以C3′ endo糖环构象为主 .在三螺旋YTCY( 2条嘧啶链中的胞嘧啶均被溴代胞嘧啶取代 )中 ,也含有一定数量的C2′ endo糖环构象 .因此 ,分子内三螺旋YTCY是A DNA和B DNA的综合体 ,而其他 3种三螺旋则是典型的A DNA .
关键词
溴代胞嘧啶
分子内三螺旋
分子力学
核甘酸
DNA
分类号
Q524.01 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
溴代胞嘧啶对三螺旋DNA稳定性的影响
李清
白春礼
ImshikLee
杨林静
邓文礼
王琛
王乃新
刘次全
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
1999
0
原文传递
2
溴代胞嘧啶分子内三螺旋DNA的理论研究
杨林静
刘峁子
李清
王琛
白春礼
《中国科学(B辑)》
CSCD
北大核心
1998
0
原文传递
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参考文献
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