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溴代胞嘧啶对三螺旋DNA稳定性的影响
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作者 李清 白春礼 +5 位作者 ImshikLee 杨林静 邓文礼 王琛 王乃新 刘次全 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1999年第1期9-13,共5页
研究了三螺旋DNA中胞嘧啶被5-溴胞嘧啶取代后的稳定性问题。通过建立CGC,CGBrC,BrCGC和BrCGBrC4种模型,并采用InsightⅡ软件包中的Discover程序进行计算模拟,发现用5-溴胞嘧啶取代三螺... 研究了三螺旋DNA中胞嘧啶被5-溴胞嘧啶取代后的稳定性问题。通过建立CGC,CGBrC,BrCGC和BrCGBrC4种模型,并采用InsightⅡ软件包中的Discover程序进行计算模拟,发现用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA分子中的胞嘧啶后,整个分子的稳定性有所降低。同时,当用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA不同链上的胞嘧啶时,被取代链的碱基堆积能显著增高,导致分子链内稳定性降低,但被取代链和相邻链间相互作用能有所降低,使得链间作用趋向稳定。 展开更多
关键词 三螺旋DNA DNA 稳定性 胞嘧啶 溴代胞嘧啶
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溴代胞嘧啶分子内三螺旋DNA的理论研究
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作者 杨林静 刘峁子 +2 位作者 李清 王琛 白春礼 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 1998年第5期385-390,共6页
运用分子力学方法研究了 3个含溴代胞嘧啶的分子内三螺旋及相应的未溴代分子内三螺旋DNA .理论结果表明 :当分子内三螺旋Hoogsteen嘧啶链的胞嘧啶被溴代胞嘧啶取代后其稳定性最强 ;而当分子内三螺旋 2条嘧啶链的胞嘧啶同时被溴代后 ,其... 运用分子力学方法研究了 3个含溴代胞嘧啶的分子内三螺旋及相应的未溴代分子内三螺旋DNA .理论结果表明 :当分子内三螺旋Hoogsteen嘧啶链的胞嘧啶被溴代胞嘧啶取代后其稳定性最强 ;而当分子内三螺旋 2条嘧啶链的胞嘧啶同时被溴代后 ,其稳定性最差 .从分子力学计算得到 ,4种分子内三螺旋的碱基以C3′ endo糖环构象为主 .在三螺旋YTCY( 2条嘧啶链中的胞嘧啶均被溴代胞嘧啶取代 )中 ,也含有一定数量的C2′ endo糖环构象 .因此 ,分子内三螺旋YTCY是A DNA和B DNA的综合体 ,而其他 3种三螺旋则是典型的A DNA . 展开更多
关键词 溴代胞嘧啶 分子内三螺旋 分子力学 核甘酸 DNA
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