水稻溶血磷脂酸酰基转移酶基因(LPAT)家族生物信息学分析及在籽粒油脂合成中的作用

【目的】挖掘水稻溶血磷脂酸酰基转移酶(Lysophosphatidic acid acyltransferase,LPAT)基因家族成员信息,分析其生物信息学特征及在水稻籽粒油脂合成中的作用。【方法】通过生物信息学分析,对OsLPAT基因家族进行基因结构、系统进化树、组织表达谱以及激素和逆境表达谱等分析。利用比较代谢组和转录组学的方法,分析OsLPAT家族各成员在水稻籽粒油脂合成中的作用。【结果】水稻基因组中LPAT家族包含5个成员,分别命名为OsLPAT1~OsLPAT5。除OsLPAT1外,其他成员均含有4~6个外显子,且各成员均包含Acyltransferase C-terminus(PF01553)结构域;进化分析显示,LPAT基因在单子叶植物中较为保守;OsLPAT2的表达受多种逆境条件及激素诱导,OsLPAT3和OsLPAT5的表达受到脱落酸(Abscisic acid,ABA)的强烈诱导,而OsLPAT4则特异性地受到渗透胁迫的诱导;比较代谢组和转录组学分析显示,OsLPAT家族各成员分别在籽粒发育的不同阶段发挥功能,从而促进油脂(Triacylglycerol,TAG)合成。【结论】水稻基因组中存在5个LPAT基因,其表达受到不同激素的诱导,可能在水稻激素响应过程中发挥作用。该家族成员参与了不同发育阶段籽粒中的油脂前体磷脂酸(Phosphatidic acid,PA)的合成,从而正调控籽粒中的油脂合成。

溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1在肿瘤中作用的研究进展

溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1作为磷脂胆碱代谢途径中的关键代谢酶,可通过脱酰基-再酰化来介导磷脂酰胆碱的合成,使细胞膜磷脂组成成分发生改变,导致细胞膜骨架发生重塑。溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1可通过加速肿瘤细胞膜磷脂成分的改变、或与表皮生长因子受体、细胞周期相关等肿瘤驱动基因相互作用影响肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭,以及肿瘤细胞的耐药性,促进肿瘤的发展。

溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶3调控内皮细胞激活

目的探究溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶3(Lyso-PL Acyltransferases 3,LPCAT3)在湍流(Oscillatory Flow,OSS)介导的内皮细胞激活中的作用。方法于2020年11月—2023年6月济宁市第一人民医院分离5只C57BL/6雄性小鼠的主动脉弓(AorticArch,AA)及胸主动脉(ThoracicAorta,TA),用于提取mRNA检测LPCAT3的表达。将原代内皮细胞随机分为对照组(Static)和研究组(OSS),检测LPCAT3的mRNA水平。同时,敲减LPCAT3,验证血管细胞黏附因子-1(Vascular Cell Adhesion Molecule 1,VCAM-1)、细胞间黏附因子-1(Intercellular Adhesion Molecule 1,ICAM-1)的mRNA表达。结果与胸主动脉(1±0.42)相比,小鼠主动脉弓LPCAT3的mRNA相对表达水平(2.03±0.5)明显上调,差异有统计学意义(P<0.05)。与研究组mRNA的相对表达水平(2.72±0.72)(3.04±0.56)相比,OSS+siLPCAT3组其VCAM-1及ICAM-1表达明显降低为(1.31±0.4)(1.81±0.51),差异有统计学意义(P均<0.05),这意味着抑制内皮细胞LPCAT3能够明显减少湍流介导的炎症因子的表达。结论LPCAT3能够调控湍流介导的内皮细胞激活。

溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1在宫颈癌中的表达及临床意义

目的探讨溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1(LPCAT1)在宫颈癌中的表达及其临床意义。方法选取2012年1月1日—2022年12月31日海南医学院第一附属医院妇科手术治疗宫颈癌患者163例作为观察组,另选取同期因患子宫平滑肌瘤施行全子宫切除术患者77例作为对照组。采用免疫组织化学法检测LPCAT1蛋白在宫颈癌组织和正常宫颈组织中的表达水平,比较LPCAT1蛋白水平在不同宫颈癌患者临床病理特征中的差异,运用Kaplan-Meier法分析LPCAT1蛋白表达与宫颈癌患者术后预后的关系,Cox回归模型分析宫颈癌术后预后的影响因素。结果宫颈癌组织中LPCAT1蛋白高表达率显著高于正常宫颈组织(χ^(2)=18.509,P<0.001);FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期、浸润深度>1/2肌层、淋巴结转移、中高分化宫颈癌患者LPCAT1蛋白高表达率高于FIGO分期Ⅰ~Ⅱ期、浸润深度≤1/2肌层、无淋巴结转移、低分化者(χ^(2)/P=5.501/0.019,20.463/<0.001,5.979/0.014,21.675/<0.001);LPCAT1蛋白高表达者总生存率显著低于低表达者(χ^(2)=4.791,P=0.029);FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期、肿瘤浸润深度>1/2肌层、淋巴结转移、中高分化和LPCAT1蛋白高表达均为宫颈癌患者术后预后的独立危险因素[HR(95%CI)=1.564(1.284~2.122),1.376(1.069~1.972),2.439(1.300~3.950),2.690(2.049~3.699),1.302(1.068~1.590)]。结论LPCAT1蛋白在宫颈癌组织中呈现高表达,且其高表达可提示宫颈癌患者术后预后不良。LPCAT1蛋白可能具有作为宫颈癌早期诊断和预后预测生物标志物的潜能。

花生溶血磷脂酸酰基转移酶基因的克隆与表达分析

溶血磷脂酰基转移酶(LPAT)是植物油脂合成途径的一个关键酶,在植物油脂品质改良和提高种子含油量方面具有重要的应用价值。本研究通过构建花生种子全长cDNA文库,结合大规模EST测序和功能注释,从花生中克隆了溶血磷脂酸酰基转移酶基因,命名为AhLPAT。该基因cDNA全长1629bp,对应的基因组序列5531bp,由11个外显子和10个内含子组成,内含子剪接方式符合GT-AG剪接规则。根据编码区预测AhLPAT编码一条387个氨基酸组成的多肽,预测分子量为43.2kD,等电点为9.42。AhLPAT蛋白含有一个典型的酰基转移酶保守功能结构域以及溶血磷脂酰基转移酶相似的保守区域。该蛋白的氨基酸序列与已报道的其他物种LPAT蛋白序列有较高的一致性。AhLPAT与旱金莲、油菜、海甘蓝、蓖麻和拟南芥的LPAT蛋白氨基酸相似性依次为90%、89%、89%、88%和87%。系统进化分析表明,AhLPAT与拟南芥AtLPAT2亲缘关系较近,且同属于内质网型LPAT蛋白。RT-PCR分析表明,AhLPAT基因在花生根、茎、叶、花、果针和种子中均有表达,在花生开花后50～60d,果针和种子中的表达量最高,且AhLPAT的表达量与花生种子含油量积累速率变化一致,二者显著相关(r=0.63,P<0.05)。推测AhLPAT基因在花生种子油脂合成中起重要作用。

溶血磷脂酸酰基转移酶β与肿瘤关系研究进展

磷脂酸(PA)是一种多功能的生物活性磷脂。研究证实:溶血磷脂酸酰基转移酶β(lysophosphatidic acidacyltransferaseβ,LPAATβ)催化溶血磷脂酸(LPA)产生的PA与肿瘤细胞内多种信号途径的活化有关,参与了肿瘤细胞的增殖、凋亡、迁移、侵袭、呼吸爆发及细胞因子表达释放。LPAATβ在肿瘤组织中的表达显著增加以及抑制LPAATβ表达在体内外抗肿瘤(实体瘤和血液肿瘤)的作用研究取得的效果,提示以LPAATβ为靶点对肿瘤进行干预将成为重要的抗肿瘤治疗策略之一。本文就溶血磷脂酸酰基转移酶β与肿瘤治疗的相关基础及临床前研究进行综述。

椰子溶磷脂酸酰基转移酶基因克隆及农杆菌介导甘蓝型油菜的遗传转化

月桂酸是在清洁用品和医药产品中有重要用途的中链脂肪酸。椰子中富含月桂酸特异的溶磷脂酸酰基转移酶基因,克隆该基因在油菜中表达若可获得含月桂酸的油菜新种质,将具有良好的应用价值。为获得脂肪酸成分改良的油菜种质资源,从椰子胚乳中克隆出该基因并构建35S驱动的植物表达载体,通过农杆菌介导法转化油菜子叶柄,在获得的约20株的转化苗中已鉴定有6株转化植株。

急性髓系白血病患者骨髓溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1的表达分析

目的:探讨急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者骨髓中溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1(lysophosphatidylcholine acyltransferase 1,LPCAT1)的表达和临床意义。方法:应用实时定量PCR技术检测60例不同临床分型的AML患者和27例健康对照骨髓标本LPCAT1 mRNA的表达。结果:与对照组相比,AML患者LPCAT1 mRNA的表达水平显著降低(P<0.001)。60例AML患者中27例(45%)存在LPCAT1 mRNA低表达,而27例对照均未见LPCAT1 mRNA低表达改变,差异有统计学意义(χ^(2)=17.618,P<0.001)。LPCAT1 mRNA低表达与年龄、性别、白细胞计数、血小板计数、血红蛋白、FAB分型及核型危险分级等均无临床相关性(P>0.05)。LPCAT1 mRNA区分AML患者的受试者工作特征(ROC)曲线下面积为0.896(95%CI:0.825~0.967,P<0.001),LPCAT1 mRNA表达的截断值为0.173时,敏感性和特异性分别为88.3%和81.5%。结论:LPCAT1低表达是AML中的常见分子事件,或可用于AML辅助诊断。

溶血卵磷脂胆碱酰基转移酶1与肿瘤关系的研究进展

溶血卵磷脂胆碱酰基转移酶1(lysophosphatidylcholine acyltransferase 1,LPCAT1)是一种磷脂酰基代谢酶,可促进磷脂的合成及重构。近年来研究发现LPCAT1在多种肿瘤组织中表达升高,并与肿瘤的恶性程度、分期、分级呈正相关。LPCAT1在肿瘤组织中过表达与前列腺癌、乳腺癌的早期复发呈正相关,在结直肠癌细胞、肝癌细胞中过表达可促进细胞的增殖、迁移、侵袭,是恶性肿瘤早期诊断潜在的生物学标志物和肿瘤治疗的靶点。现对LPCAT1与肿瘤关系的研究进展进行综述。

缺刻缘绿藻溶血磷脂酰乙醇胺酰基转移酶(LPEAT)的基因克隆与特征分析

缺刻缘绿藻三酰甘油(TAG)中花生四烯酸(Ar A)占其总脂肪酸含量的68.0%。为了弄清Ar A是如何被优先地用于合成TAG,鉴于Lands循环是通过改变膜脂的脂肪酸组成进而影响TAG的脂肪酸组成,本研究选择在Lands循环中起关键作用的溶血磷脂酰乙醇胺酰基转移酶(LPEAT)作为突破口。运用反转录PCR与3′-及5′-c DNA末端快速扩增技术,自缺刻缘绿藻(Myrmecia incisa Reisigl)中克隆到MiLPEAT;它的c DNA序列全长1303 bp,其中,5′-非翻译区(UTR)长129 bp,3′-UTR长193 bp,开放阅读框长981 bp,编码326个氨基酸残基;以缺刻缘绿藻基因组DNA为模板扩增得到该基因长为1871 bp的DNA序列;这两序列的比对结果显示,MiLPEAT含有6个内含子,将其开放阅读框(ORF)分割成7个外显子。通过多序列比对及生物信息学分析,发现MiLPEAT存在一个磷酸酰基转移酶结构域Pls C,并含有LPEAT家族所具有的NH(x)4D、FPEGT等4个特征性模体;Wolfpsort等在线预测结果以及MiLPEAT羧基端存在的双赖氨酸模体"KKxx",暗示它可能位于内质网并参与分泌途径。基于不同植物LPEAT的氨基酸序列所构建的邻接聚类图表明,MiLPEAT因与2型LPEAT有不同的序列特征而形成不同的分支,但却与1型LPEAT聚类在一起,推测它们的功能可能更近似。通过荧光定量PCR检测,发现MiLPEAT的基因转录量在氮饥饿8 h时显著(P<0.05)增加;与其变化相应的溶血磷脂酰乙醇胺(LPE)相对丰度却极显著地(P<0.01)减少49%,但磷脂酰乙醇胺(PE)相对丰度的增加却不显著;推测在氮饥饿过程中增加的磷脂酰乙醇胺(PE)可能被磷脂:二酰甘油酰基转移酶作用以合成为TAG,致使缺刻缘绿藻TAG含量的增加。

溶血卵磷脂胆碱酰基转移酶1与非小细胞肺癌患者临床特征及预后的关系

目的分析溶血卵磷脂胆碱酰基转移酶1(LPCAT1)与非小细胞肺癌(NSCLC)患者临床特征及预后的关系。方法收集95例NSCLC患者癌旁组织及肿瘤组织,采用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)法对其癌旁组织及肿瘤组织中的LPCAT1 mRNA相对表达量进行比较,分析LPCAT1 mRNA相对表达量与NSCLC患者临床特征及预后的关系。结果NSCLC患者癌旁组织LPCAT1 mRNA相对表达量为(0.069±0.017),明显低于肿瘤组织的(0.621±0.124),差异有统计学意义(P﹤0.01)。TNM分期为Ⅲ期、有淋巴结转移的NSCLC患者肿瘤组织中LPCAT1 mRNA相对表达量均明显高于TNM分期为Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移者(P﹤0.01);不同年龄、性别、病理类型、肿瘤直径、分化程度及是否吸烟NSCLC患者的肿瘤组织中LPCAT1 mRNA相对表达量比较,差异均无统计学意义(P﹥0.05)。LPCAT1 mRNA相对表达量高水平组患者总生存率为37.50%,低于低水平组的68.09%,差异有统计学意义(P﹤0.05)。结论NSCLC患者肿瘤组织中LPCAT1 mRNA相对表达量高于癌旁组织,且NSCLC患者临床特征及预后与LPCAT1 mRNA相对表达量有关。

溶血磷脂酸酰基转移酶β促进人肺成纤维细胞的增殖、迁移与黏附

目的分析溶血磷脂酸酰基转移酶β(lysophosphatidic acid acyltransferase,LPAATβ)在多种细胞系中的表达情况及其过表达对细胞体外增殖、迁移与黏附的影响。方法通过免疫印迹实验检测LPAATβ在多种细胞中的表达水平;构建pcDNA3.1A(+)/LPAATβ真核表达载体,转染人肺成纤维细胞(human lung fibroblast,HLF)并筛选稳定转染细胞株;通过MTT细胞增殖实验分析过表达LPAATβ对HLF细胞体外增殖的作用,通过划痕修复实验分析稳定株细胞的体外迁移能力,利用细胞黏附实验分析稳定株细胞对细胞外基质成分Matrigel的黏附情况。结果 LPAATβ蛋白在肿瘤细胞中表达水平存在差异。体外生物学实验显示,稳定转染LPAATβ的HLF细胞增殖能力明显增强,细胞迁移能力显著提高,与细胞外基质成分Matrigel的黏附能力显著增强。结论 LPAAT家族成员LPAATβ在人类多种细胞中的表达具有普遍性,其过表达明显促进HLF细胞的增殖、迁移及黏附能力,提示该基因在细胞体外生长过程中具有重要作用。

花生及其野生种质溶血磷脂酸酰基转移酶基因(LPAAT)的克隆及序列分析

溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAAT)是植物种子油脂合成的关键酶。本研究从花生(Arachis hypogaea L.)栽培品种花育32号和4个花生区组二倍体野生种中克隆得到编码LPAAT的基因序列。从花育32号获得的两条cDNA序列rlpaat-1和rlpaat-2开放阅读框均为1 131 bp,编码376个氨基酸,二者存在11个SNP差异位点,编码的氨基酸序列LPAAT-1和LPAAT-2有1个氨基酸残基的差异。LPAAT蛋白具有典型的酰基转移酶功能结构域以及4个保守氨基酸基序。之后从花育32号得到两条DNA序列,glpaat-1和glpaat-2长度分别为3 729 bp和3 736 bp,均由12个外显子和11个内含子组成,二者共存在37处碱基差异,其中34处为SNP位点。4个花生区组二倍体野生种各获得一条LPAAT序列,A.correntina,A.duranensis,A.batizocoi和A.ipaensis LPAAT的序列长度分别为3 757 bp、3 757 bp、3 742 bp和3 756 bp。核苷酸序列多态性和系统进化树分析表明,栽培品种LPAAT的两条序列glpaat-2与glpaat-1分别来自A、B染色体组。

紫苏溶血磷脂酸酰基转移酶基因的克隆与功能分析

紫苏(Perillafrutescens)是一种重要食药同源油料作物,种子含油量高达46%-58%,其中α-亚麻酸(C18:3)含量占60%以上。溶血磷脂酸酰基转移酶(lysophosphatidicacid acyltransferase, LPAT)是植物种子三酰基甘油组装过程中的一类关键限速酶。本研究从紫苏发育种子中克隆了其编码基因(PfLPAT2),并利用qRT-PCR技术检测PfLPAT2基因在紫苏不同组织及不同发育时期种子的表达特性。构建PfLPAT2/GFP融合表达载体并通过农杆菌介导瞬时侵染本氏烟草叶片,检测PfLPAT2蛋白的亚细胞定位。构建大肠杆菌(Escherichia coli)表达载体、酵母表达载体和组成型植物过表达载体,分别转化大肠杆菌突变株SM2-1、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)野生型菌株INVSc1和普通烟草(Nicotiana tabacum),分析PfLPAT2蛋白的酶活性及生物学功能。结果表明,紫苏PfLPAT2基因ORF为1 155 bp,编码384个氨基酸。功能结构域预测显示PfLPAT2蛋白具有溶血磷脂酸酰基转移酶典型的保守区。PfLPAT2基因在紫苏根、茎、叶、花和开花后10、20、30、40 d的种子中均有表达,且在开花后20 d的种子中高表达。亚细胞定位结果显示PfLPAT2蛋白定位于细胞质。大肠杆菌功能互补测试表明,PfLPAT2可恢复SM2-1细胞膜脂生物合成,具有LPAT酶活性。与非转基因对照相比,转PfLPAT2基因酵母的总油脂含量显著提高,且脂肪酸各组分的含量发生改变,油酸(C18:1)含量增加明显,预示PfLPAT2对C18:1具有较高的底物偏好性。转基因烟草叶片总脂肪酸含量比对照组提高了约0.42倍,C18:1含量增加了约1倍。转基因株系总脂提高和脂肪酸组分的改变表明PfLPAT2异源表达可以促进宿主油脂合成和健康有益型脂肪酸(C18:1和C18:3)的积累。本研究为深入解析紫苏油脂特别是不饱和脂肪酸合成的分子调控机制和改良油料作物油脂品质提供理论依据和基因元件。

LPCAT1在FAB-M2亚型成人急性髓系白血病患者中的预后意义

目的:研究溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1(LPCAT1)在急性髓系白血病(AML)中的预后价值。方法:使用基于Taq Man的逆转录-实时荧光定量聚合酶链反应检测214例初治成人AML患者和24例健康对照者LPCAT1的相对表达量。使用Kaplan-Meier方法进行生存分析,Cox比例风险回归模型用于确定预后因素。结果:LPCAT1在成人AML中的表达水平为34.37%(1.83%-392.63%),显著低于健康对照者的92.81%(2.60%-325.84%)(P<0.001)。本研究在具有完整临床信息和预后数据的171例非急性早幼粒细胞白血病患者中评估了LPCAT1的预后意义。生存分析结果表明,LPCAT1的表达水平对整个队列的预后没有显著影响。然而,在FAB-M2亚型(M2-AML)的AML患者中,低表达LPCAT1患者的2年无复发生存率为35.4%(95%CI:0.107-0.601),显著低于高表达LPCAT1患者的79.2%(95%CI:0.627-0.957)(P=0.012)。多因素分析结果表明,低表达LPCAT1是M2-AML患者无复发生存率的独立危险因素(HR=0.355,95%CI:0.126-0.966,P=0.049)。结论:LPCAT1在成人AML患者中低表达,LPCAT1低表达是M2-AML患者无复发生存率的独立危险因素。

非小细胞肺癌组织中溶血卵磷脂胆碱酰基转移酶1表达与临床病理特征及预后的关系

目的观察非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者癌组织溶血卵磷脂胆碱酰基转移酶1(lysophosphatidylcholine acyltransferase 1,LPCAT1)的表达情况,探讨其与临床病理特征及预后的关系。方法97例NSCLC患者,取手术切除的癌组织和癌旁组织标本,采用实时荧光定量PCR法检测2种组织LPCAT1 mRNA相对表达量,分析LPCAT1表达与NSCLC患者临床病理特征的关系。随访6~36(21.5±8.3)个月,失访11例;根据LPCAT1 mRNA相对表达量中位数,将86例完成随访的NSCLC患者分为高LPCAT1表达组(LPCAT1 mRNA相对表达量≥0.602)41例和低LPCAT1表达组(LPCAT1 mRNA相对表达量<0.602)45例,采用Kaplan-Meier生存曲线分析不同LPCAT1表达患者的总生存率,并进行2组间比较;采用多因素Cox比例风险回归模型分析NSCLC患者预后不良的影响因素。结果NSCLC患者癌组织LPCAT1 mRNA相对表达量(0.604±0.101)高于癌旁组织(0.082±0.023)(P<0.05);有淋巴结转移、TNM分期Ⅲ期的NSCLC患者癌组织LPCAT1 mRNA相对表达量高于无淋巴结转移、TNM分期Ⅰ~Ⅱ期患者(P<0.05),男性与女性、年龄≥60岁与<60岁、有无吸烟史、肿瘤直径≥5 cm与<5 cm、鳞癌与腺癌、低/未分化与中/高分化患者癌组织LPCAT1 mRNA相对表达量比较差异均无统计学意义(P>0.05)。高LPCAT1表达组患者总生存率(53.66%)低于低LPCAT1表达组(75.56%)(P<0.05)。TNM分期(HR=3.578,95%CI:1.184~10.815,P=0.024)和LPCAT1 mRNA相对表达量(HR=8.904,95%CI:1.303~21.304,P=0.036)是NSCLC患者预后不良的影响因素。结论NSCLC患者癌组织LPCAT1呈高表达,LPCAT1表达增高提示NSCLC进展和预后不良。

溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1在疾病中的研究进展

溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1(lysophosphatidylcholine acyltransferase 1,LPCAT1)是一种参与脂质复杂代谢过程的重要酶,其广泛存在于动植物,具有酰基转移酶和乙酰转移酶活性。它由Lpcat1基因编码,蛋白质定位于内质网、高尔基体等细胞器。近年来随着对其结构、功能及表达调控的研究不断深入,发现其参与肺泡表面活性物质合成,并与多种肿瘤、视网膜变性、神经系统疾病等许多疾病相关。本文主要就LPCAT1与疾病的研究进展作一综述。

胶质瘤中溶血卵磷脂胆碱酰基转移酶1的表达及信号通路生物信息学分析

目的 通过生物信息学方法研究溶血卵磷脂胆碱酰基转移酶1(LPCAT1)基因在胶质瘤与瘤旁组织中的差异表达,分析LPCAT1基因不同表达水平与胶质瘤患者生存期及预后的关系,并对相关基因进行信号通路富集分析,从而为研究胶质瘤的发生、发展及预后标志物提供依据。方法 通过生物信息学在线软件UALCAN和GEPIA分析、研究LPCAT1基因在胶质瘤与瘤旁组织中差异表达的倍数,并采用UALCAN软件在线分析与LPCAT1差异表达具有相关性的基因,采用DAVID 6.8软件对与LPCAT1具有相关性的基因进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,采用Human Protein Atlas在线分析软件进行胶质瘤LPCAT1基因不同表达水平患者的生存期分析,采用STRING数据库和Cytoscape 3.8软件对KEGG聚类分析中发现的与肿瘤密切相关的基因进行关键核心基因筛选。结果 LPCAT1是胶质瘤中高表达的癌基因。与LPCAT1基因具有相关性的上调基因共2486个,具有相关性的下调基因共299个,富集在73个信号通路中,富集倍数大于2的信号通路有33个,其中与肿瘤关系密切的有11个,分别为肾细胞癌、急性白血病、子宫内膜癌、ErbB信号通路、Notch信号通路、Hedgehog信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、慢性白血病、结肠癌、m TOR信号通路、甲状腺癌。生存期分析结果显示,与胶质瘤LPCAT1基因低表达组比较,高表达组患者的生存期明显缩短(P <0.05),预后相对较差。GRB2、RPS6、STAT3、NOTCH1、GSK3B、MTOR、PTK2、STAT5B、CCND1、GAB1、VEGFA、NFKB1、TSC2、JUN、RELA、ETS1是参与LPCAT1调控胶质瘤生物表型的关键核心基因。结论 LPCAT1参与了胶质瘤的发生、发展,有望成为判断胶质瘤患者预后的肿瘤标志物;通过生物信息学分析发现的与LPCAT1具有高度相关性的癌基因和信号通路可为探索LPCAT1基因的功能和分子机制提供线索和依据。

甘油-3-磷酸酰基转移酶在植物脂质代谢、生长及逆境反应中的作用

甘油脂质是高等植物中含量最丰富的脂质,其种类包括磷脂、糖脂、油脂及胞外脂质等,广泛参与不同的生物过程。甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)利用各种脂肪族酰基或其衍生物作为底物催化甘油-3-磷酸(G3P)脂酰基化反应形成溶血磷脂酸(LPA),是脂质合成代谢途径中的限速酶。植物GPAT家族含有多个成员,根据其亚细胞定位、酶活性及底物选择性,拟南芥GPAT家族10个成员可分为3类。不同的GPAT具有独特的分子结构、活性调控及时空分布,并参与膜磷脂、甘油三脂、角质及软木脂合成代谢过程。研究表明极具分子异质性的GPAT在植物生长、发育和逆境胁迫反应过程中发挥着重要作用。

非酒精性脂肪性肝病进展中血清溶血卵磷脂水平降低

目的研究血清溶血卵磷脂(LPC)水平在非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)进展中的变化及机制。方法雄性C57/BL6小鼠60只,分为高脂模型组(HFD)和正常对照组,分别给予高脂纯化饲料和低脂纯化饲料。高效液相色谱-蒸发光散射检测法(HPLC-ELSD)于饲养第4、8、12、16、20周分批测定两组小鼠血清中几种LPC的含量变化。Milliplex多因子检测法测定血清白细胞介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平。重组白细胞介素-6(IL-6)体外干预小鼠肝原代细胞,实时荧光定量PCR测溶血卵磷脂酰基转移酶1-4(LPCAT1-4)的基因表达。结果高脂模型组血清LPC16∶0、LPC18∶0和LPC18∶1水平从16周开始出现明显降低,第20周LPC16∶0和LPC18∶1的水平均显著低于正常对照组。高脂模型组血清IL-6水平在第16周和20周显著高于正常对照组;TNF-α水平在第16周显著高于正常对照组。此外,IL-6可诱导LPCAT1-4基因表达升高。结论在NAFLD进展中血清溶血卵磷脂(LPC)水平下降,可能与肝脏内激活的炎症信号通路有关。