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黄颡鱼溶酪巨型球菌的鉴定与药敏试验
被引量:
5
1
作者
蓝胜华
王利
+3 位作者
邓麟杰
杨启明
李雪峰
段荟芹
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期778-782,共5页
自患病黄颡鱼中分离出一株优势菌HS1,根据细菌形态学观察、生理生化、16SrDNA基因序列分析、动物回感试验及药敏试验等方法对其菌株进行研究。试验结果表明,菌株HS1为动力阳性,革兰氏阴性球菌。扩增的16SrDNA序列大小为1466bp,登录号为K...
自患病黄颡鱼中分离出一株优势菌HS1,根据细菌形态学观察、生理生化、16SrDNA基因序列分析、动物回感试验及药敏试验等方法对其菌株进行研究。试验结果表明,菌株HS1为动力阳性,革兰氏阴性球菌。扩增的16SrDNA序列大小为1466bp,登录号为KP191046,与溶酪巨型球菌同源性超过99%,进化树上与溶酪巨型球菌聚为一支,从而可判定HS1为溶酪巨型球菌。用溶酪巨型球菌HS1感染健康黄颡鱼,发现该菌具有较强的致病性。药敏试验表明,该菌对四环素、米诺环素和强力霉素等11种药物敏感,对复方新诺明、甲氧苄啶和氨磺甲基异恶唑3种药物耐药。这为黄颡鱼巨型球菌病的预防和治疗提供科学参考。
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关键词
黄颡鱼
溶酪巨型球菌
分离鉴定
药敏试验
下载PDF
职称材料
一株牛源溶酪巨型球菌致病性及全基因组特征分析
2
作者
薛嘉熹
范文雨
+7 位作者
曹鑫艳
高之煜
顾兰英
张秦川
李世义
盛金良
孙延鸣
张彦兵
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2024年第4期438-448,共11页
目的本研究旨在研究1株牛源溶酪巨型球菌(Macrococcus caseolyticus,M.caseolyticus)的致病性和全基因组特征,挖掘该菌株的毒力和耐药相关基因。方法在新疆石河子市某牛场中采集1例病死牛肺脏,从牛肺脏灌洗液中分离鉴定了1株牛源溶酪巨...
目的本研究旨在研究1株牛源溶酪巨型球菌(Macrococcus caseolyticus,M.caseolyticus)的致病性和全基因组特征,挖掘该菌株的毒力和耐药相关基因。方法在新疆石河子市某牛场中采集1例病死牛肺脏,从牛肺脏灌洗液中分离鉴定了1株牛源溶酪巨型球菌,在此基础上进行了药敏试验、动物感染试验;并通过Illumina的二代测序技术对该菌株进行全基因组框架图构建,构建多个管家基因同源进化树,对编码基因、重复序列、非编码RNA等进行预测,并在GO、KEGG、COG、NR和CAZy数据库对基因组的基本功能特征进行注释,结合NR数据库的注释和PHI、CARD数据库注释,明确其基因组中毒力因子、耐药性等相关基因。结果从牛肺中成功分离到一株M.caseolyticus,通过感染兔子试验证实该菌株具有较强的致病性,病理切片结果显示兔子肺泡数量减少,大量炎性细胞渗出,肺泡囊增大,肺泡囊中充满渗出物,红细胞渗出,细支气管管壁塌陷。该菌经平均核苷酸相似度分类和系统发育树确定为溶酪巨型球菌,全基因组大小为2209314 bp,CG%含量为37.22%,平均长度为855 bp,编码2304个基因;其中tRNA有58个、rRNA有8个、sRNA有1个;含有3条CRISPRs序列。在GO数据库中有1028个基因得到注释,分别注释到分子功能、细胞组分和生物过程3大类;在KEGG数据库中共有1420个编码基因得到注释;在COG数据库中,共注释有23种功能的1961个基因;同时,在全基因组测序结果中发现51个毒力因子和对氨基糖苷类、β-内酰胺类和多肽类等抗生素的多种耐药基因,药物敏感性试验中菌株对测试的12类抗生素仅对磺胺类(复方新诺明)、林可霉素类(林可霉素)、青霉素类(氨苄西林)耐药。结论本研究从病死牛肺脏中分离得到1株牛源溶酪巨型球菌并命名为SHZXbov7,该菌具有较强的致病性,含有多种毒力因子和耐药基因,菌株SHZXbov7的基因组测序和注释将丰富溶酪巨型球菌的基因数据库,为溶酪巨型球菌相关疾病的防控提供参考。
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关键词
溶酪巨型球菌
耐药基因
毒力基因
基因组草图测序
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职称材料
题名
黄颡鱼溶酪巨型球菌的鉴定与药敏试验
被引量:
5
1
作者
蓝胜华
王利
邓麟杰
杨启明
李雪峰
段荟芹
机构
西南民族大学生命科学与技术学院
出处
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期778-782,共5页
基金
四川省科技支撑项目(2013FZ0014)
国家级卓越农林工程师项目
西南民族大学研究生学位点建设项目(2015XWDS071007)
文摘
自患病黄颡鱼中分离出一株优势菌HS1,根据细菌形态学观察、生理生化、16SrDNA基因序列分析、动物回感试验及药敏试验等方法对其菌株进行研究。试验结果表明,菌株HS1为动力阳性,革兰氏阴性球菌。扩增的16SrDNA序列大小为1466bp,登录号为KP191046,与溶酪巨型球菌同源性超过99%,进化树上与溶酪巨型球菌聚为一支,从而可判定HS1为溶酪巨型球菌。用溶酪巨型球菌HS1感染健康黄颡鱼,发现该菌具有较强的致病性。药敏试验表明,该菌对四环素、米诺环素和强力霉素等11种药物敏感,对复方新诺明、甲氧苄啶和氨磺甲基异恶唑3种药物耐药。这为黄颡鱼巨型球菌病的预防和治疗提供科学参考。
关键词
黄颡鱼
溶酪巨型球菌
分离鉴定
药敏试验
Keywords
Pelteobagrus fulvidraco
megasphaera
identification
drug sensitive test
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
一株牛源溶酪巨型球菌致病性及全基因组特征分析
2
作者
薛嘉熹
范文雨
曹鑫艳
高之煜
顾兰英
张秦川
李世义
盛金良
孙延鸣
张彦兵
机构
石河子大学动物科技学院新疆
出处
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2024年第4期438-448,共11页
基金
国家自然科学基金项目(32360901)
新疆维吾尔自治区青年科学基金项目(2022D01B197)
+1 种基金
石河子大学青年创新培育人才项目(CXPY202211)
石河子大学高层次人才科研启动项目(RCZK202043)。
文摘
目的本研究旨在研究1株牛源溶酪巨型球菌(Macrococcus caseolyticus,M.caseolyticus)的致病性和全基因组特征,挖掘该菌株的毒力和耐药相关基因。方法在新疆石河子市某牛场中采集1例病死牛肺脏,从牛肺脏灌洗液中分离鉴定了1株牛源溶酪巨型球菌,在此基础上进行了药敏试验、动物感染试验;并通过Illumina的二代测序技术对该菌株进行全基因组框架图构建,构建多个管家基因同源进化树,对编码基因、重复序列、非编码RNA等进行预测,并在GO、KEGG、COG、NR和CAZy数据库对基因组的基本功能特征进行注释,结合NR数据库的注释和PHI、CARD数据库注释,明确其基因组中毒力因子、耐药性等相关基因。结果从牛肺中成功分离到一株M.caseolyticus,通过感染兔子试验证实该菌株具有较强的致病性,病理切片结果显示兔子肺泡数量减少,大量炎性细胞渗出,肺泡囊增大,肺泡囊中充满渗出物,红细胞渗出,细支气管管壁塌陷。该菌经平均核苷酸相似度分类和系统发育树确定为溶酪巨型球菌,全基因组大小为2209314 bp,CG%含量为37.22%,平均长度为855 bp,编码2304个基因;其中tRNA有58个、rRNA有8个、sRNA有1个;含有3条CRISPRs序列。在GO数据库中有1028个基因得到注释,分别注释到分子功能、细胞组分和生物过程3大类;在KEGG数据库中共有1420个编码基因得到注释;在COG数据库中,共注释有23种功能的1961个基因;同时,在全基因组测序结果中发现51个毒力因子和对氨基糖苷类、β-内酰胺类和多肽类等抗生素的多种耐药基因,药物敏感性试验中菌株对测试的12类抗生素仅对磺胺类(复方新诺明)、林可霉素类(林可霉素)、青霉素类(氨苄西林)耐药。结论本研究从病死牛肺脏中分离得到1株牛源溶酪巨型球菌并命名为SHZXbov7,该菌具有较强的致病性,含有多种毒力因子和耐药基因,菌株SHZXbov7的基因组测序和注释将丰富溶酪巨型球菌的基因数据库,为溶酪巨型球菌相关疾病的防控提供参考。
关键词
溶酪巨型球菌
耐药基因
毒力基因
基因组草图测序
Keywords
Macrococcus caseolyticus
resistant gene
virulence factors
draft genome sequencing
分类号
R943 [医药卫生—药剂学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄颡鱼溶酪巨型球菌的鉴定与药敏试验
蓝胜华
王利
邓麟杰
杨启明
李雪峰
段荟芹
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
5
下载PDF
职称材料
2
一株牛源溶酪巨型球菌致病性及全基因组特征分析
薛嘉熹
范文雨
曹鑫艳
高之煜
顾兰英
张秦川
李世义
盛金良
孙延鸣
张彦兵
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2024
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职称材料
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