黄颡鱼溶酪巨型球菌的鉴定与药敏试验

自患病黄颡鱼中分离出一株优势菌HS1,根据细菌形态学观察、生理生化、16SrDNA基因序列分析、动物回感试验及药敏试验等方法对其菌株进行研究。试验结果表明,菌株HS1为动力阳性,革兰氏阴性球菌。扩增的16SrDNA序列大小为1466bp,登录号为KP191046,与溶酪巨型球菌同源性超过99%,进化树上与溶酪巨型球菌聚为一支,从而可判定HS1为溶酪巨型球菌。用溶酪巨型球菌HS1感染健康黄颡鱼,发现该菌具有较强的致病性。药敏试验表明,该菌对四环素、米诺环素和强力霉素等11种药物敏感,对复方新诺明、甲氧苄啶和氨磺甲基异恶唑3种药物耐药。这为黄颡鱼巨型球菌病的预防和治疗提供科学参考。

一株牛源溶酪巨型球菌致病性及全基因组特征分析

目的本研究旨在研究1株牛源溶酪巨型球菌(Macrococcus caseolyticus,M.caseolyticus)的致病性和全基因组特征,挖掘该菌株的毒力和耐药相关基因。方法在新疆石河子市某牛场中采集1例病死牛肺脏,从牛肺脏灌洗液中分离鉴定了1株牛源溶酪巨型球菌,在此基础上进行了药敏试验、动物感染试验;并通过Illumina的二代测序技术对该菌株进行全基因组框架图构建,构建多个管家基因同源进化树,对编码基因、重复序列、非编码RNA等进行预测,并在GO、KEGG、COG、NR和CAZy数据库对基因组的基本功能特征进行注释,结合NR数据库的注释和PHI、CARD数据库注释,明确其基因组中毒力因子、耐药性等相关基因。结果从牛肺中成功分离到一株M.caseolyticus,通过感染兔子试验证实该菌株具有较强的致病性,病理切片结果显示兔子肺泡数量减少,大量炎性细胞渗出,肺泡囊增大,肺泡囊中充满渗出物,红细胞渗出,细支气管管壁塌陷。该菌经平均核苷酸相似度分类和系统发育树确定为溶酪巨型球菌,全基因组大小为2209314 bp,CG%含量为37.22%,平均长度为855 bp,编码2304个基因;其中tRNA有58个、rRNA有8个、sRNA有1个;含有3条CRISPRs序列。在GO数据库中有1028个基因得到注释,分别注释到分子功能、细胞组分和生物过程3大类;在KEGG数据库中共有1420个编码基因得到注释;在COG数据库中,共注释有23种功能的1961个基因;同时,在全基因组测序结果中发现51个毒力因子和对氨基糖苷类、β-内酰胺类和多肽类等抗生素的多种耐药基因,药物敏感性试验中菌株对测试的12类抗生素仅对磺胺类(复方新诺明)、林可霉素类(林可霉素)、青霉素类(氨苄西林)耐药。结论本研究从病死牛肺脏中分离得到1株牛源溶酪巨型球菌并命名为SHZXbov7,该菌具有较强的致病性,含有多种毒力因子和耐药基因,菌株SHZXbov7的基因组测序和注释将丰富溶酪巨型球菌的基因数据库,为溶酪巨型球菌相关疾病的防控提供参考。