滇杨优树遗传多样性的AFLP分析

以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条带174条,多态带百分率为64.52%,检测到有效等位基因数(Ne)为1.184,基因多样度(H)为0.121,Shannon信息指数为0.201,平均遗传相似系数为0.877;对56份杨树样本共扩增出325条带,其中多态性条带共247条,多态带百分率为75.21%,检测出有效等位基因数(Ne)为1.185,基因多样度(H)为0.122,Shannon信息指数为0.209,平均遗传相似系数为0.876。UPGMA聚类分析结果显示,除滇杨优树QXB007与QXJ030外,其余杨树分析样本均能够被鉴别。基于采集地和遗传相似系数的模糊聚类分析表明,52株滇杨优树除开远采集地外,丽江采集地样本与其他采集地样本之间均有交集,说明丽江可能是滇杨的分布中心和起源中心。该研究结果为滇杨人工选择育种、遗传改良、种质资源收集与保存等提供了理论依据。

滇杨优树基因组及其无性系落叶期侧芽cDNA的AFLP分析

本研究采用AFLP分子标记技术,对采集于四川省和云南省的56株滇杨(Populus yunnanensis Dode)优树基因组遗传变异、54个滇杨优树无性系3a苗木落叶期侧芽的基因表达谱进行了分析。DNA-AFLP分析结果表明,筛选出的8对AFLP引物组合共扩增出508条带,平均多态性条带比率为59.25%,观测等位基因数为1.5925,有效等位基因数为1.1581,Nei's基因多样性指数为0.1129,Shannon's信息指数为0.1914;除有效等位基因数相等外,四川滇杨优树群体的4项遗传多样性指标均略高于云南滇杨优树群体,但2个优树群体之间存在着较高的基因流(Nm=21.64)。cDNA-AFLP分析结果显示,筛选出的8对AFLP引物组合共扩增出526条带,其中平均差异性条带百分率为82.70%,观测等位基因数和有效等位基因数分别为1.8270和1.2417,Nei's基因多样性指数为0.1675,Shannon's信息指数为0.2809;四川滇杨优树群体的基因表达差异性指标均略高于云南滇杨优树群体,且二者之间的基因流值较大(Nm=27.00)。分子方差分析(AMOVA)结果表明,滇杨2个优树群体在DNA水平和cDNA水平的遗传差异均极显著。