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题名小蛋白质富集法鉴定酿酒酵母“漏检蛋白”
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作者
何崔同
张瑶
姜颖
徐平
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机构
安徽医科大学
军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所、蛋白质组学国家重点实验室
中山大学生命科学学院
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出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1860-1869,共10页
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基金
国家重大研发计划精准医学重大专项(No.2017YFC0906600)
国家自然科学基金(No.31670834)
北京市百名领军人才计划(No.Z161100004916024)资助
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文摘
小蛋白质(Smallproteins,SPs)是由小开放阅读框(Shortopenreadingframes,sORFs)编码长度小于100个氨基酸的多肽。研究发现小蛋白质参与了基因表达调控、细胞信号转导和代谢等重要生物学过程。然而,生命体中大多数的已注释小蛋白质尚缺少蛋白水平存在的实验证据,被称为漏检蛋白(Missing proteins,MPs)。小蛋白质的高效鉴定是其功能研究的前提,也有助于挖掘"漏检蛋白"。文中采用小蛋白质富集策略鉴定到72个酵母小蛋白质,验证9个"漏检蛋白",发现低分子量、高疏水性、膜结合、弱密码子使用偏性及不稳定性是蛋白漏检的主要原因,对进一步的技术优化具有指导意义。
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关键词
蛋白质组学
小蛋白质
富集
漏检蛋白
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Keywords
proteomics
small protein
enrichment
missing protein
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分类号
Q936
[生物学—微生物学]
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