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基于网络药理学的2-(2-苯乙基)色酮类成分潜在作用靶点及作用机制预测
被引量:
2
1
作者
肖梦君
高志晖
+1 位作者
王灿红
魏建和
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2021年第7期2170-2180,共11页
目的基于网络药理学方法预测2-(2-苯乙基)色酮类化合物的潜在作用靶点及可能干预疾病的作用机制。方法通过CNKI、Elsevier、Pub Med等数据库检索有生物活性的2-(2-苯乙基)色酮化合物,基于Swiss ADME平台进行ADME筛选;利用Swiss Target P...
目的基于网络药理学方法预测2-(2-苯乙基)色酮类化合物的潜在作用靶点及可能干预疾病的作用机制。方法通过CNKI、Elsevier、Pub Med等数据库检索有生物活性的2-(2-苯乙基)色酮化合物,基于Swiss ADME平台进行ADME筛选;利用Swiss Target Prediction获得化合物的作用靶点;运用Metascape平台分析靶点富集的疾病类型、生物过程及通路;使用Cytoscape 3.8构建"活性化合物-靶点-疾病"网络图;通过Auto Dock进行分子对接验证。结果最终获得72个活性化合物,对应292个靶点,可能作用于抑郁、肿瘤、高血压等多种疾病,主要富集通路有与神经系统相关的神经活性配体-受体互作、5-羟色胺(5-hydroxytryptamine,5-HT)能突触等;与肿瘤相关的癌症通路、细胞周期等;与炎症免疫相关的TRP通道的炎症介质调节、IL-17信号通路等。核心靶点有HTR2B、HTR3A、ABCG2、PTGS2、DRD2、COMT等,分子对接验证显示结合能均小于-7.0 k J·mol^(-1),化合物与靶点的结合活性较好。结论本研究表明2-(2-苯乙基)色酮类化合物可能对神经精神类疾病、肿瘤、炎症等有干预治疗作用,体现了该类化合物多靶点、多通路、多功效的特点,为系统开展其药效及作用机制研究提供了参考。
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关键词
2-(2-苯乙基)色酮类化合物
网络药理学
潜在作用靶点
干预疾病
下载PDF
职称材料
根皮素对人卵巢癌细胞增殖的影响及虚拟筛选研究
被引量:
4
2
作者
单良
肖建英
《中药材》
CAS
北大核心
2018年第6期1479-1485,共7页
目的:探讨根皮素对人卵巢癌CAOV-3细胞增殖能力的影响,并运用网络药理学筛选根皮素发挥生物学效应的作用靶点,探讨其分子机制并进行初步验证。方法:应用MTT法检测根皮素对CAOV-3细胞增殖的影响;利用Pharmmapper及idTarget平台分别预测...
目的:探讨根皮素对人卵巢癌CAOV-3细胞增殖能力的影响,并运用网络药理学筛选根皮素发挥生物学效应的作用靶点,探讨其分子机制并进行初步验证。方法:应用MTT法检测根皮素对CAOV-3细胞增殖的影响;利用Pharmmapper及idTarget平台分别预测根皮素潜在作用靶点;用STRING平台对预测靶点进行蛋白互作分析,获得靶蛋白的注释、蛋白互作信息;通过生物信息注释数据库(DAVID)对预测靶点进行GO及代谢通路富集分析,并挖掘文献针对根皮素的分子机制进一步讨论;Western blotting检测根皮素对通路富集得到的癌症通路中p53、BAX蛋白水平以及ERK、p38磷酸化水平的影响。结果:根皮素能浓度依赖性抑制CAOV-3细胞活力,虚拟筛选提示其可能通过RACK1、ERK、EGFR等靶点发挥抗癌作用,对癌症信号通路具有调控作用,体外实验验证根皮素能激活ERK、p38通路并增加p53、BAX蛋白表达水平,从而发挥抗癌作用。结论:本研究表明根皮素可能通过激活ERK、p38通路诱导CAOV-3细胞凋亡,同时为根皮素发挥抗癌等药理学活性作用机制的深入研究提供重要的理论依据和线索。
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关键词
根皮素
虚拟筛选
潜在作用靶点
抗癌
作用
癌症信号通路
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职称材料
题名
基于网络药理学的2-(2-苯乙基)色酮类成分潜在作用靶点及作用机制预测
被引量:
2
1
作者
肖梦君
高志晖
王灿红
魏建和
机构
中国医学科学院&北京协和医学院药用植物研究所\中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室\濒危药材繁育国家工程实验室
中国医学科学院&北京协和医学院药用植物研究所海南分所\海南省南药资源保护与开发重点实验室\国家中医药管理局沉香可持续利用重点研究室
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2021年第7期2170-2180,共11页
基金
国家科学技术部国家重点研发计划项目(2018YFC1706401):沉香层持续增厚机制及二代通体结香技术研发,负责人:杨云
国家自然科学基金委员会面上项目(81673545):白木香microRNA在伤害诱导沉香形成中的作用机制研究,负责人:高志晖
中国医学科学院医学与健康科技创新工程(重大协同创新项目)(2016-I2M-2-003):药用植物资源库,负责人:魏建和。
文摘
目的基于网络药理学方法预测2-(2-苯乙基)色酮类化合物的潜在作用靶点及可能干预疾病的作用机制。方法通过CNKI、Elsevier、Pub Med等数据库检索有生物活性的2-(2-苯乙基)色酮化合物,基于Swiss ADME平台进行ADME筛选;利用Swiss Target Prediction获得化合物的作用靶点;运用Metascape平台分析靶点富集的疾病类型、生物过程及通路;使用Cytoscape 3.8构建"活性化合物-靶点-疾病"网络图;通过Auto Dock进行分子对接验证。结果最终获得72个活性化合物,对应292个靶点,可能作用于抑郁、肿瘤、高血压等多种疾病,主要富集通路有与神经系统相关的神经活性配体-受体互作、5-羟色胺(5-hydroxytryptamine,5-HT)能突触等;与肿瘤相关的癌症通路、细胞周期等;与炎症免疫相关的TRP通道的炎症介质调节、IL-17信号通路等。核心靶点有HTR2B、HTR3A、ABCG2、PTGS2、DRD2、COMT等,分子对接验证显示结合能均小于-7.0 k J·mol^(-1),化合物与靶点的结合活性较好。结论本研究表明2-(2-苯乙基)色酮类化合物可能对神经精神类疾病、肿瘤、炎症等有干预治疗作用,体现了该类化合物多靶点、多通路、多功效的特点,为系统开展其药效及作用机制研究提供了参考。
关键词
2-(2-苯乙基)色酮类化合物
网络药理学
潜在作用靶点
干预疾病
Keywords
2-(2-phenylethyl)chromones
Network pharmacology
Potential targets
Intervention diseases
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
根皮素对人卵巢癌细胞增殖的影响及虚拟筛选研究
被引量:
4
2
作者
单良
肖建英
机构
锦州医科大学生物化学与分子生物学教研室
出处
《中药材》
CAS
北大核心
2018年第6期1479-1485,共7页
文摘
目的:探讨根皮素对人卵巢癌CAOV-3细胞增殖能力的影响,并运用网络药理学筛选根皮素发挥生物学效应的作用靶点,探讨其分子机制并进行初步验证。方法:应用MTT法检测根皮素对CAOV-3细胞增殖的影响;利用Pharmmapper及idTarget平台分别预测根皮素潜在作用靶点;用STRING平台对预测靶点进行蛋白互作分析,获得靶蛋白的注释、蛋白互作信息;通过生物信息注释数据库(DAVID)对预测靶点进行GO及代谢通路富集分析,并挖掘文献针对根皮素的分子机制进一步讨论;Western blotting检测根皮素对通路富集得到的癌症通路中p53、BAX蛋白水平以及ERK、p38磷酸化水平的影响。结果:根皮素能浓度依赖性抑制CAOV-3细胞活力,虚拟筛选提示其可能通过RACK1、ERK、EGFR等靶点发挥抗癌作用,对癌症信号通路具有调控作用,体外实验验证根皮素能激活ERK、p38通路并增加p53、BAX蛋白表达水平,从而发挥抗癌作用。结论:本研究表明根皮素可能通过激活ERK、p38通路诱导CAOV-3细胞凋亡,同时为根皮素发挥抗癌等药理学活性作用机制的深入研究提供重要的理论依据和线索。
关键词
根皮素
虚拟筛选
潜在作用靶点
抗癌
作用
癌症信号通路
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学的2-(2-苯乙基)色酮类成分潜在作用靶点及作用机制预测
肖梦君
高志晖
王灿红
魏建和
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2021
2
下载PDF
职称材料
2
根皮素对人卵巢癌细胞增殖的影响及虚拟筛选研究
单良
肖建英
《中药材》
CAS
北大核心
2018
4
下载PDF
职称材料
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统计分析
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