干酪乳杆菌Zhang分类学地位及潜在益生相关基因分析

干酪乳杆菌Zhang是本研究团队筛选出的具有优良特性的益生乳酸菌菌株。传统方法难以区分干酪乳杆菌及其近缘物种。因最近乳杆菌的系统分类进行了更新,故导致Zhang的分类地位需重新确认。本研究利用比较基因组学方法分析Zhang的分类学地位、耐药基因、致病性基因和环境抗性基因特征,探究该菌株基因组上携带的细菌素基因簇和潜在益生基因。比较基因组学结果显示Zhang与副干酪乳酪杆菌模式菌株ATCC 25302^(T)的平均核苷酸一致性值是98.49%,通过分类学数据库比对和系统发育分析确认Zhang的分类学地位为副干酪乳酪杆菌。Zhang的基因组不含有耐药基因、致病性基因和环境抗性基因。在其基因组上注释到核心肽、Lan T转运和引导切割及免疫或运输功能等Carnocin细菌素基因簇。此外,Zhang的基因组编码了谷胱甘肽合成、核黄素合成、黏附因子和分泌胞外多糖等潜在益生基因。本研究更新了Zhang的分类学地位为副干酪乳酪杆菌,揭示其不含有耐药基因、致病性基因及环境抗性基因,并注释到多个潜在益生基因,为该菌株进一步开发及产业化提供了数据参考。

27株关中黑猪肠道食淀粉乳杆菌基因组分析

研究从基因组水平解析27株关中黑猪肠道食淀粉乳杆菌的遗传背景和功能基因特征,采用Illumina测序技术完成27株食淀粉乳杆菌的全基因组测序、框架图组装,通过平均核苷酸一致性分析、系统进化分析、泛基因组分析等比较基因组学方法分析菌株间的同源性和分子进化规律,使用eggNOG、CAZy、ResFinder、VFDB等数据库注释功能基因。结果显示,27株食淀粉乳杆菌平均基因组序列大小为1881796 bp,平均GC含量为38.10%,菌株间具有高度同源性和遗传多样性。功能基因注释显示,这些菌株不仅具备良好的生存能力和安全性,还具有环境应激、氧化应激、核黄素合成、胞外多糖分泌和群体感应等潜在益生基因。研究表明,分离自关中黑猪肠道的27株食淀粉乳杆菌适合作为候选益生菌株。