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澜沧裂腹鱼4个地理群体遗传多样性分析
被引量:
2
1
作者
金方彭
左鹏翔
+6 位作者
冷云
吴俊颉
熊合勇
高海涛
雷春云
周睿
李光华
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期851-859,共9页
利用简化基因组测序(SLAF-seq)的方法对澜沧江中上游4个地理群体的40尾澜沧裂腹鱼野生样本进行遗传多样性分析,旨在为澜沧裂腹鱼种质资源的保护提供参考。结果显示,平均测序深度29.36×,得到467.67 Mb读长,测序Q30碱基含量平均为94....
利用简化基因组测序(SLAF-seq)的方法对澜沧江中上游4个地理群体的40尾澜沧裂腹鱼野生样本进行遗传多样性分析,旨在为澜沧裂腹鱼种质资源的保护提供参考。结果显示,平均测序深度29.36×,得到467.67 Mb读长,测序Q30碱基含量平均为94.88%,GC含量平均为40.32%,获得498 199个特异位点扩增片段(SLAF)标签,其中多态性SLAF标签共213 644个,得到736 515个群体单核苷酸多态性(SNP)。遗传分析结果显示:在黄登—大华桥、里底、乌弄龙和苗尾—功果桥4个地理群体中,观测等位基因数和期望等位基因数分别为1.90~1.97和1.36~1.57;观测杂合度和期望杂合度的分布分别为0.16~0.50和0.21~0.33;根井正利基因多样性指数和香农—维纳指数分别为0.25~0.34和0.32~0.50;多态信息含量依次为0.2655、0.2499、0.2463、0.1709,处于中低等多态水平;最小等位基因频率依次为0.2653、0.2579、0.2561、0.2724;所有遗传多样性指数中,以黄登—大华桥群体最大且群体间差异显著(P<0.05);群体间变异占2.91%,群体内变异占97.09%,说明变异多发生在群体内;群体间遗传距离为0.0323~0.2588,遗传分化指数为-0.019~0.0817(P>0.05);系统进化树显示,4个地理群体出现交叉聚类的现象。综上,4个地理群体的遗传多样性水平中等,遗传距离与聚类结果和实际情况相符,濒危的原因可能是过度人为干扰,建议澜沧江中上游流域应当加大云南土著鱼类资源监控,加强人工增殖放流的质量和力度。
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关键词
澜沧裂腹鱼
简化基因组测序技术
简化基因组
遗传多样性
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职称材料
澜沧裂腹鱼人工驯养研究
被引量:
2
2
作者
申安华
李光华
+4 位作者
王海龙
吴敬东
李威
谭锋
刘跃天
《现代农业科技》
2015年第2期272-272,278,共2页
用水泥池驯养平均体长22.95 cm、平均体重114.15 g的澜沧裂腹鱼,研究其人工驯养效果,结果表明:经过21-23个月的驯养,平均体长达32.5 cm,增加9.55 cm,增长41.61豫;平均体重达321.27 g,增加207.12 g,增重181.45豫,说明人工驯养...
用水泥池驯养平均体长22.95 cm、平均体重114.15 g的澜沧裂腹鱼,研究其人工驯养效果,结果表明:经过21-23个月的驯养,平均体长达32.5 cm,增加9.55 cm,增长41.61豫;平均体重达321.27 g,增加207.12 g,增重181.45豫,说明人工驯养澜沧裂腹鱼较易,但生长较缓慢。
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关键词
澜沧裂腹鱼
人工驯养
生长量
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职称材料
题名
澜沧裂腹鱼4个地理群体遗传多样性分析
被引量:
2
1
作者
金方彭
左鹏翔
冷云
吴俊颉
熊合勇
高海涛
雷春云
周睿
李光华
机构
云南省渔业科学研究院
华能澜沧江水电股份有限公司
出处
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期851-859,共9页
基金
农业基础性长期性科技工作国家渔业科学数据中心观测监测项目(ZX08S271957)
云南澜沧江鱼类增殖放流效果监测及评估项目(HY2017/S14)。
文摘
利用简化基因组测序(SLAF-seq)的方法对澜沧江中上游4个地理群体的40尾澜沧裂腹鱼野生样本进行遗传多样性分析,旨在为澜沧裂腹鱼种质资源的保护提供参考。结果显示,平均测序深度29.36×,得到467.67 Mb读长,测序Q30碱基含量平均为94.88%,GC含量平均为40.32%,获得498 199个特异位点扩增片段(SLAF)标签,其中多态性SLAF标签共213 644个,得到736 515个群体单核苷酸多态性(SNP)。遗传分析结果显示:在黄登—大华桥、里底、乌弄龙和苗尾—功果桥4个地理群体中,观测等位基因数和期望等位基因数分别为1.90~1.97和1.36~1.57;观测杂合度和期望杂合度的分布分别为0.16~0.50和0.21~0.33;根井正利基因多样性指数和香农—维纳指数分别为0.25~0.34和0.32~0.50;多态信息含量依次为0.2655、0.2499、0.2463、0.1709,处于中低等多态水平;最小等位基因频率依次为0.2653、0.2579、0.2561、0.2724;所有遗传多样性指数中,以黄登—大华桥群体最大且群体间差异显著(P<0.05);群体间变异占2.91%,群体内变异占97.09%,说明变异多发生在群体内;群体间遗传距离为0.0323~0.2588,遗传分化指数为-0.019~0.0817(P>0.05);系统进化树显示,4个地理群体出现交叉聚类的现象。综上,4个地理群体的遗传多样性水平中等,遗传距离与聚类结果和实际情况相符,濒危的原因可能是过度人为干扰,建议澜沧江中上游流域应当加大云南土著鱼类资源监控,加强人工增殖放流的质量和力度。
关键词
澜沧裂腹鱼
简化基因组测序技术
简化基因组
遗传多样性
Keywords
Schizothorax lantsangensis
SLAF-seq technology
simplified genome
genetic diversity
分类号
Q959.4 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
澜沧裂腹鱼人工驯养研究
被引量:
2
2
作者
申安华
李光华
王海龙
吴敬东
李威
谭锋
刘跃天
机构
云南省渔业科学研究院
华能澜沧江苗尾.功果桥水电工程建设管理局
出处
《现代农业科技》
2015年第2期272-272,278,共2页
基金
国家科技支撑计划"重大水电开发工程关键技术与生态环境保护研究及集成示范"(2013BAB06B03)
文摘
用水泥池驯养平均体长22.95 cm、平均体重114.15 g的澜沧裂腹鱼,研究其人工驯养效果,结果表明:经过21-23个月的驯养,平均体长达32.5 cm,增加9.55 cm,增长41.61豫;平均体重达321.27 g,增加207.12 g,增重181.45豫,说明人工驯养澜沧裂腹鱼较易,但生长较缓慢。
关键词
澜沧裂腹鱼
人工驯养
生长量
分类号
S965.199 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
澜沧裂腹鱼4个地理群体遗传多样性分析
金方彭
左鹏翔
冷云
吴俊颉
熊合勇
高海涛
雷春云
周睿
李光华
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
下载PDF
职称材料
2
澜沧裂腹鱼人工驯养研究
申安华
李光华
王海龙
吴敬东
李威
谭锋
刘跃天
《现代农业科技》
2015
2
下载PDF
职称材料
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