鸡传染性支气管炎病毒澳大利亚T株S1全基因的克隆与序列分析

【目的】研究鸡传染性支气管炎病毒（IBV）澳大利亚T株S1基因全序列。【方法】采用RT-PCR技术，对IBVT株S1基因进行扩增、克隆和测序。【结果】测序结果表明，IBVT株S1基因大小为1739bp。与Gen—Bank中的29株IBV S1基因进行比较发现，IBVT株与吉林疫苗株（JAAS）S1基因核苷酸同源性为99．8％，有4个核苷酸的差异，其中有3个碱基发生非同义突变，氨基酸同源性为99．4％；与其余28株IBVs1基因核苷酸同源性为73．8％～84．4％，氨基酸同源性为66．8％～85．9％。进化分析发现T株与JAAS株之间的亲缘关系很近，与其他IBV株的亲缘关系均较远。【结论】JAAS株是T株的变异病毒，IBVT株的变异病毒在我国存在。

鸡传染性支气管炎病毒澳大利亚T株部分基因序列的克隆与分析

澳大利亚T株(IBVT-)是鸡肾型传染性支气管炎病毒(IBV)主要代表毒株之一。目前,在相关生物数据库中IBV-基因序列极少。实验通过对GenBank中已有IBV基因序列比较,在IBV编码蛋白S、N、M和RdRp基因的高度同源区设计了四对引物,并通过反转录聚合酶链式反应R(TP-CR)获得特异性扩增产物。克隆测序结果证明扩增产物确为IBV相应基因片段。所获序列同IBV其它类型相关基因序列比较结果显示,编码蛋白S、N、M和RdRp基因的同源性分别为80.51%～87.22%%,85.83%～91.25%,89.63%～91.01%和85.97%～92.37%。实验丰富了生物数据库中IBVT-基因序列。所设计的引物表现很好的扩增效率和特异性,对于IBV其它毒株的检测和鉴定有一定的借鉴作用。