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火龙果溃疡病菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选
1
作者
姚姿婷
曹雪颖
+4 位作者
肖雪
李瑞芳
韦小妹
邹承武
朱桂宁
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期92-102,共11页
火龙果溃疡病是由火龙果溃疡病菌引起的重要真菌病害,近年来在世界火龙果产区的爆发严重影响了火龙果产业的发展。为研究火龙果溃疡病菌响应逆境胁迫的基因表达和功能,需要筛选火龙果溃疡病菌在各种条件下表达稳定的内参基因。以火龙果...
火龙果溃疡病是由火龙果溃疡病菌引起的重要真菌病害,近年来在世界火龙果产区的爆发严重影响了火龙果产业的发展。为研究火龙果溃疡病菌响应逆境胁迫的基因表达和功能,需要筛选火龙果溃疡病菌在各种条件下表达稳定的内参基因。以火龙果溃疡病菌菌株LJ02为研究对象,以在马铃薯葡萄糖液体培养基(PDW)培养的菌丝体为对照组,以在LB培养基培养的菌丝体和分别在添加过氧化氢、吡唑醚菌酯和苯醚甲环唑的PDW培养的菌丝体为处理组。利用实时荧光定量PCR技术以及内参基因稳定性评估软件(geNorm、NormFinder、Bestkeeper和RefFinder),评估18个候选内参基因(CYT1、SDH2_1、TBCC、SUI1、RPL19、PPH、ATP5B、UBE2_16、RPL13、UBE2_2、PRS17、SUCLA2、ATP5A、TUB1_2、ACT1、EFTU、EF1A和GAPDH)的表达稳定性。结果显示,火龙果溃疡病菌的18个候选基因在上述培养条件下的Ct值介于14.80-24.66之间,表达水平适中;稳定性最高的内参基因是CYT1,其次为SUI1,GAPDH和ACT1的稳定性最差;最少使用2个内参基因组合可以提高定量PCR分析结果的准确性,此时SUCLA2和ATP5A是最稳定的内参基因组合。该结果可为研究火龙果溃疡病菌生物学过程中的基因表达提供理论依据。
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关键词
火龙果溃疡病菌
内参基因
实时荧光定量PCR
菌丝生长
表达分析
非生物胁迫
内参基因分析软件
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职称材料
根癌农杆菌介导火龙果溃疡病菌遗传转化体系的构建及转化子筛选
2
作者
王伟伟
安馨媛
陈俊菁
《热带生物学报》
2022年第3期243-248,共6页
为了探究火龙果溃疡病病原菌的致病机理,笔者利用农杆菌介导的遗传转化技术,分析了根癌农杆菌浓度、分生孢子萌发时间以及共培养温度等3个主要因素对遗传转化效率的影响,建立火龙果溃疡病菌的遗传转化技术体系,并对转化子进行筛选。结...
为了探究火龙果溃疡病病原菌的致病机理,笔者利用农杆菌介导的遗传转化技术,分析了根癌农杆菌浓度、分生孢子萌发时间以及共培养温度等3个主要因素对遗传转化效率的影响,建立火龙果溃疡病菌的遗传转化技术体系,并对转化子进行筛选。结果表明,当农杆菌浓度OD_(600)=0.5、分生孢子萌发时间24 h、共培养温度25℃时遗传转化效率最高(833个转化子/10^(6)分生孢子);随机挑选200个转化子进行筛选,获得3株菌落形态与野生型菌株差异较大的转化子,4株产孢量减少的转化子,5株产孢量增加的转化子,6株致病力下降的转化子。
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关键词
火龙果溃疡病菌
农杆菌介导
遗传转化
筛选
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职称材料
题名
火龙果溃疡病菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选
1
作者
姚姿婷
曹雪颖
肖雪
李瑞芳
韦小妹
邹承武
朱桂宁
机构
广西壮族自治区农业科学院植物保护研究所、广西作物病虫害生物学重点实验室、农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室
广西大学农学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期92-102,共11页
基金
广西农业科学院科技发展基金资助项目(桂农科2021ZX28)
广西农业科学院基本科研业务专项(桂科农2021YT063)。
文摘
火龙果溃疡病是由火龙果溃疡病菌引起的重要真菌病害,近年来在世界火龙果产区的爆发严重影响了火龙果产业的发展。为研究火龙果溃疡病菌响应逆境胁迫的基因表达和功能,需要筛选火龙果溃疡病菌在各种条件下表达稳定的内参基因。以火龙果溃疡病菌菌株LJ02为研究对象,以在马铃薯葡萄糖液体培养基(PDW)培养的菌丝体为对照组,以在LB培养基培养的菌丝体和分别在添加过氧化氢、吡唑醚菌酯和苯醚甲环唑的PDW培养的菌丝体为处理组。利用实时荧光定量PCR技术以及内参基因稳定性评估软件(geNorm、NormFinder、Bestkeeper和RefFinder),评估18个候选内参基因(CYT1、SDH2_1、TBCC、SUI1、RPL19、PPH、ATP5B、UBE2_16、RPL13、UBE2_2、PRS17、SUCLA2、ATP5A、TUB1_2、ACT1、EFTU、EF1A和GAPDH)的表达稳定性。结果显示,火龙果溃疡病菌的18个候选基因在上述培养条件下的Ct值介于14.80-24.66之间,表达水平适中;稳定性最高的内参基因是CYT1,其次为SUI1,GAPDH和ACT1的稳定性最差;最少使用2个内参基因组合可以提高定量PCR分析结果的准确性,此时SUCLA2和ATP5A是最稳定的内参基因组合。该结果可为研究火龙果溃疡病菌生物学过程中的基因表达提供理论依据。
关键词
火龙果溃疡病菌
内参基因
实时荧光定量PCR
菌丝生长
表达分析
非生物胁迫
内参基因分析软件
Keywords
Neoscytalidium dimidiatum
reference gene
real-time quantitative PCR
mycelial growth
expression analysis
abiotic stres
reference gene analysis software
分类号
S66 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
根癌农杆菌介导火龙果溃疡病菌遗传转化体系的构建及转化子筛选
2
作者
王伟伟
安馨媛
陈俊菁
机构
海南大学林学院/海南省热带特色花木资源生物学重点实验室
出处
《热带生物学报》
2022年第3期243-248,共6页
基金
2019年海南省基础与应用基础研究计划(自然科学领域)高层次人才项目(2019RC135)
海南省高等学校科学研究项目(Hnky2018-15)。
文摘
为了探究火龙果溃疡病病原菌的致病机理,笔者利用农杆菌介导的遗传转化技术,分析了根癌农杆菌浓度、分生孢子萌发时间以及共培养温度等3个主要因素对遗传转化效率的影响,建立火龙果溃疡病菌的遗传转化技术体系,并对转化子进行筛选。结果表明,当农杆菌浓度OD_(600)=0.5、分生孢子萌发时间24 h、共培养温度25℃时遗传转化效率最高(833个转化子/10^(6)分生孢子);随机挑选200个转化子进行筛选,获得3株菌落形态与野生型菌株差异较大的转化子,4株产孢量减少的转化子,5株产孢量增加的转化子,6株致病力下降的转化子。
关键词
火龙果溃疡病菌
农杆菌介导
遗传转化
筛选
Keywords
pitaya stem canker
Agrobacterium tumefaciens-mediation
genetic transformation
screening
分类号
S436.67 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
S667.9 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
火龙果溃疡病菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选
姚姿婷
曹雪颖
肖雪
李瑞芳
韦小妹
邹承武
朱桂宁
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
根癌农杆菌介导火龙果溃疡病菌遗传转化体系的构建及转化子筛选
王伟伟
安馨媛
陈俊菁
《热带生物学报》
2022
0
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职称材料
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