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具有还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶功能的家蚕l(3)neo18基因的克隆与表达特征
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作者 王更先 鲁延军 +2 位作者 司马杨虎 张升祥 徐世清 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期58-65,共8页
果蝇l(3)neo18基因可以通过P转座子诱发致死突变,编码的蛋白质具有还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶(ND)的功能。利用生物信息学、cDNA末端快速扩增(RACE)和反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)等方法,克隆了家蚕l(3)neo18同源基因,分... 果蝇l(3)neo18基因可以通过P转座子诱发致死突变,编码的蛋白质具有还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶(ND)的功能。利用生物信息学、cDNA末端快速扩增(RACE)和反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)等方法,克隆了家蚕l(3)neo18同源基因,分析了基因结构与表达谱。Bm-l(3)neo18基因(EU826676)的cDNA全长为868 bp,由573 bp的完整开放读码框(ORF)序列、25 bp的5′端非翻译区序列(5′-UTR)和251 bp的3′端非编码区序列(3′-UTR)组成,编码蛋白质为190个氨基酸残基,分子质量22.7 kD,pI 9.60。Bm-l(3)neo18基因由3个外显子和2个内含子组成,定位于家蚕第3染色体,位于nscaf2930的1 203.8-1 205.6 knt。Bm-l(3)neo18蛋白质在1-185氨基酸残基位置为ND的SGDH亚基保守区,在61-83氨基酸残基位置具有一个保守的跨膜区域。采用Clustal W进行多序列比对发现,Bm-l(3)neo18与埃及伊蚊等昆虫ND具有50%以上的蛋白质同源性,ND的保守区域高度一致,NJ法分子进化分析也显示Bm-l(3)neo18与昆虫ND进化上同源。该基因除在家蚕卵期的表达量较低外,在幼虫、蛹和蛾期均有较高表达,且存在组织差异性。 展开更多
关键词 家蚕 l(3)neo18基因 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 基因表达
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四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)的序列分析 被引量:9
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作者 侯万儒 陈瑜 +3 位作者 吴夏 彭正松 周才权 杨军 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期91-96,共6页
以四川境内的四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)为研究对象,根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)序列信息设计引物.运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND1基因序列.采用GenScan、Blast2·1、ORF finder... 以四川境内的四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)为研究对象,根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)序列信息设计引物.运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND1基因序列.采用GenScan、Blast2·1、ORF finder和Clustal W等软件分别对DNA序列进行预测、相似性比较、ORF查找以及多序列比对,并利用PredictProtein软件对蛋白质进行预测和结构分析.结果表明;PCR扩增所得DNA序列长度为957bp,包含了ND1基因,其ORF为957bp,编码317个氨基酸,编码蛋白的分子量为35·6×103Da,pI为7·83.四川黑熊的ND1基因序列及其所编码的氨基酸序列与其它熊、浣熊和小熊猫等动物的ND1基因序列和对应的氨基酸序列具有较高的相似性. 展开更多
关键词 四川黑熊 线粒体 亚基1基因 分析
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亚洲黑熊四川亚种线粒体NADH脱氢酶亚基5和亚基6基因的克隆与初步分析 被引量:1
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作者 杜玉杰 侯怡铃 侯万儒 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第4期1748-1751,共4页
[目的]克隆与分析亚洲黑熊四川亚种线粒体NADH的脱氢酶亚基5和亚基6基因(ND5和ND6)。[方法]根据已报道的部分熊科动物ND5和ND6基因序列的相关信息设计引物,运用PCR技术,首次从亚洲黑熊四川亚种的肌肉组织总DNA中成功克隆了ND5和ND6基因... [目的]克隆与分析亚洲黑熊四川亚种线粒体NADH的脱氢酶亚基5和亚基6基因(ND5和ND6)。[方法]根据已报道的部分熊科动物ND5和ND6基因序列的相关信息设计引物,运用PCR技术,首次从亚洲黑熊四川亚种的肌肉组织总DNA中成功克隆了ND5和ND6基因的编码序列,分析了其序列特征,并与已报道的9种熊科动物进行比较分析。[结果]该克隆片段包括ND5和ND6两个基因共2456bp,共编码781个氨基酸,与9种熊科动物的ND5和ND6具有很高的同源性;该克隆片段ND5和ND6的蛋白分子量分别为68.2621和19.0386kDa,等电点分别为9.19和4.25,与9种熊科动物的均十分接近。[结论]四川黑熊与9种熊科动物的ND5和ND6基因及其编码蛋白具有很高的相似性,在功能上具有一致性,尤其与东北黑熊在功能上具有高度一致性。 展开更多
关键词 亚洲黑熊四川亚种 线粒体NADH亚基5和亚基6基因 克隆 序列分析
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青岛文昌鱼NADH脱氢酶亚基I基因片段的克隆 被引量:1
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作者 梁恺龙 张晓辉 张红卫 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期88-90,94,共4页
NADH脱氢酶亚基I是细胞电子传递链的主要成员之一 .采用简并引物PCR方法获得青岛文昌鱼NADH脱氢酶亚基I基因片段 ,将其氨基酸序列与其他生物如佛罗里达文昌鱼 ,斑马鱼 ,爪蟾等无脊椎和脊椎动物NADH脱氢酶亚基I基因相应片段进行了同源性... NADH脱氢酶亚基I是细胞电子传递链的主要成员之一 .采用简并引物PCR方法获得青岛文昌鱼NADH脱氢酶亚基I基因片段 ,将其氨基酸序列与其他生物如佛罗里达文昌鱼 ,斑马鱼 ,爪蟾等无脊椎和脊椎动物NADH脱氢酶亚基I基因相应片段进行了同源性分析 ,均显示较高的同源性 .研究结果证实青岛文昌鱼作为脊索动物的代表之一 ,与脊椎动物有着较近的亲缘关系 。 展开更多
关键词 青岛文昌鱼 NADH亚基I 基因片段 基因克隆 脊索动物 同源性分析 线粒体
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大肠杆菌酒石酸脱氢酶β亚基的克隆、表达、纯化及包涵体的复性
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作者 徐燕 李永海 +3 位作者 刘凤华 席慧 周霞 高音 《首都师范大学学报(自然科学版)》 2005年第3期68-71,共4页
利用PCR技术从大肠杆菌BL21中获取酒石酸脱氢酶β亚基基因(TtdB),并将之克隆到质粒pUC18上,转化大肠杆菌DH5α细胞.经测序证明序列无误后,将之与表达载体pTrcHisC连接,在大肠杆菌BL21中经IPTG诱导表达,通过SDS-PAGE和双波长扫描分析,确... 利用PCR技术从大肠杆菌BL21中获取酒石酸脱氢酶β亚基基因(TtdB),并将之克隆到质粒pUC18上,转化大肠杆菌DH5α细胞.经测序证明序列无误后,将之与表达载体pTrcHisC连接,在大肠杆菌BL21中经IPTG诱导表达,通过SDS-PAGE和双波长扫描分析,确定酒石酸脱氢酶β亚基在大肠杆菌中表达时以包涵体形式存在.目的蛋白用TALON金属亲和树脂纯化,通过分步透析逐步去除变性剂的方法复性.复性产率可达90%. 展开更多
关键词 酒石酸β亚基 基因克隆 诱导表达 包涵体 复性
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小鼠乳酸脱氢酶C亚基在大肠埃希菌中的表达与鉴定
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作者 熊永忠 郑德柱 +2 位作者 谢飞 涂向东 兰风华 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2004年第1期9-11,共3页
目的 :构建小鼠特异性乳酸脱氢酶 (LDH)C亚基的原核重组载体并进行表达和鉴定。 方法 :提取小鼠睾丸总RNA ,逆转录合成cDNA ,自行设计引物 ,PCR扩增小鼠LDH C亚基编码序列 ,PCR产物经BamH Ⅰ/EcoR Ⅰ 双酶切后 ,克隆至谷胱甘肽S转移酶 ... 目的 :构建小鼠特异性乳酸脱氢酶 (LDH)C亚基的原核重组载体并进行表达和鉴定。 方法 :提取小鼠睾丸总RNA ,逆转录合成cDNA ,自行设计引物 ,PCR扩增小鼠LDH C亚基编码序列 ,PCR产物经BamH Ⅰ/EcoR Ⅰ 双酶切后 ,克隆至谷胱甘肽S转移酶 (GST)融合表达载体pGEX 2T中 ,在E .coliBL2 1中诱导GST融合蛋白的表达。 结果 :在异丙基 β 硫代半乳糖苷 (IPTG)的诱导下 ,重组菌高效表达出一个相对分子质量约为6 0 0 0 0的产物。对重组质粒的序列分析表明 ,插入片段的序列与GenBank登录的编码序列完全一致。 结论 :小鼠LDH C亚基的全长编码序列已被克隆至GST融合表达载体pGEX 2T ,并在E .coliBL2 展开更多
关键词 乳酸C亚基 精子 克隆 基因表达 小鼠 PCR LDH同工 避孕疫苗
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不同海拔地区牦牛血浆和组织中乳酸脱氢酶的比较 被引量:5
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作者 史福胜 车发梅 +1 位作者 孙旭红 谭俊 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第2期24-25,共2页
关键词 乳酸 牛血浆 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 组织 海拔地区 基因表达与调控 高原环境 代谢过程
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高浓度氧暴露对早产鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸表达的影响 被引量:1
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作者 黄光焰 常立文 +4 位作者 汪鸿 蔡成 刘伟 李文斌 陈燕 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期516-518,共3页
目的探讨高浓度氧(高氧)暴露对早产鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞(AECⅡ)还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)-脱氢酶亚基4(ND4)表达的影响。方法原代培养早产Sprague-Dawley(SD)大鼠AECⅡ,待其在含50mL/L二氧化碳(CO2)培养箱中生长至接近融合状态... 目的探讨高浓度氧(高氧)暴露对早产鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞(AECⅡ)还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)-脱氢酶亚基4(ND4)表达的影响。方法原代培养早产Sprague-Dawley(SD)大鼠AECⅡ,待其在含50mL/L二氧化碳(CO2)培养箱中生长至接近融合状态时随机分为高氧组和空气组。高氧组持续暴露于常压高浓度氧中,氧体积分数>900mL/L,CO2体积分数为50mL/L;空气组仍置于含50mL/L CO2培养箱中。二组分别于高氧或空气暴露6、12、24h提取细胞RNA,采取半定量反转录聚合酶链反应(RT-PCR)测定ND4 mRNA的表达;采用免疫细胞化学染色法检测细胞爬片ND4蛋白的表达。结果与空气组比较,免疫细胞化学结果显示高氧暴露6、12h ND4的表达无显著性差异(Pa>0.05),高氧暴露24h ND4的表达显著减弱(P<0.05);RT-PCR检测显示高氧暴露6h ND4 mRNA表达无显著性差异(P>0.05),高氧暴露12、24h ND4 mRNA表达显著减弱(Pa<0.05)。结论高氧暴露下调早产SD大鼠AECⅡ ND4 mRNA和蛋白水平的表达,这种改变可能参与高氧肺损伤的发病过程。 展开更多
关键词 高氧症 早产 肺泡Ⅱ型上皮细胞 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸-亚基4
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多头带绦虫甘肃分离株线粒体NADH脱氢酶亚基Ⅰ基因片段差异分析 被引量:3
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作者 李文卉 盖文燕 +5 位作者 姚菊霞 曲自刚 贾万忠 罗建勋 R.Blaga 付宝权 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期663-667,673,共6页
应用线粒体DNA中的NADH脱氢酶亚基Ⅰ(ND1)基因作为分子标记,对我国甘肃省景泰和平凉地区10个绵羊源脑多头蚴进行分析,构建系统进化树,分析其种内变异。结果表明,所有多头带绦虫(T.multiceps)分离株均成功扩增出约0.5 kb的ND1基因片... 应用线粒体DNA中的NADH脱氢酶亚基Ⅰ(ND1)基因作为分子标记,对我国甘肃省景泰和平凉地区10个绵羊源脑多头蚴进行分析,构建系统进化树,分析其种内变异。结果表明,所有多头带绦虫(T.multiceps)分离株均成功扩增出约0.5 kb的ND1基因片段。序列分析显示,去除引物序列后多头带绦虫的ND1基因片段长为488bp,可以分为9类,共有22个核苷酸变异位点,变异率为0.20%~2.66%。基于ND1序列的系统进化树表明所有T.multiceps分离株构成1个分支,可分为3个亚群,国内分离株分别处在不同的亚群中。国内分离株中除了与已知的遗传变异型Tm1(AY669089/Tm-JT081204/Tm-JT090331)和Tm3(DQ077820/Tm-JT080526)相同外,还存在新的遗传变异型(Tm-JT081008/Tm-JT090603/Tm-JT090115-2),独立为一支,与其他分离株亲缘关系较远;表明ND1基因片段适合作为研究T.multiceps分离株种内变异的分子标记。 展开更多
关键词 多头带绦虫 脑多头蚴 NADH亚基I基因 种内变异
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阿拉山口口岸地区多房棘球蚴线粒体NADH脱氢酶亚基1基因序列分析 被引量:2
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作者 尹小平 王安东 +3 位作者 田延河 梁臻 巴特 张江国 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2016年第5期481-483,共3页
目的分析阿拉山口口岸多房棘球蚴线粒体NADH脱氢酶亚基1(ND1)基因序列。方法使用ND1基因Cest引物对2014年捕获鼠类进行多房棘球蚴初筛,对阳性样品扩增ND1基因全长序列,利用Blast分析序列同源性、Mega 6.0软件构建分子遗传进化树,使用DNA... 目的分析阿拉山口口岸多房棘球蚴线粒体NADH脱氢酶亚基1(ND1)基因序列。方法使用ND1基因Cest引物对2014年捕获鼠类进行多房棘球蚴初筛,对阳性样品扩增ND1基因全长序列,利用Blast分析序列同源性、Mega 6.0软件构建分子遗传进化树,使用DNAStar软件分析其跨膜结构、信号肽、B细胞抗原表位等。结果阿拉山口口岸1.57%的野鼠感染多房棘球蚴,其线粒体ND1基因全长894 bp,编码297个氨基酸,与日本的多房棘球蚴AB018440和AB720065同源性最高,为100%。结论阿拉山口口岸地区野鼠存在多房棘球蚴感染,其序列信息为该地区多房棘球蚴的科学监控提供依据。 展开更多
关键词 多房棘球蚴 线粒体 NADH亚基1 基因 阿拉山口口岸
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弓首蛔虫及狮弓蛔虫线粒体基因组nad4基因多态性研究 被引量:6
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作者 李明伟 林瑞庆 +4 位作者 曹湛 魏冬霞 邹丰才 宋慧群 朱兴全 《热带医学杂志》 CAS 2006年第3期236-239,250,共5页
目的比较犬、猫常见蛔虫的线粒体DNA(mtDNA)中烟酰胺脱氢酶亚基Ⅳ基因(nad4)部分序列(pnad4),以期找出它们之间的序列差异和种群遗传关系。方法抽提61个弓首属蛔虫(包括犬弓首蛔虫、猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫和犊弓首蛔虫)和狮弓蛔... 目的比较犬、猫常见蛔虫的线粒体DNA(mtDNA)中烟酰胺脱氢酶亚基Ⅳ基因(nad4)部分序列(pnad4),以期找出它们之间的序列差异和种群遗传关系。方法抽提61个弓首属蛔虫(包括犬弓首蛔虫、猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫和犊弓首蛔虫)和狮弓蛔虫虫体的总DNA,用PCR方法扩增mtDNApnad4,然后用SSCP技术和DNA测序对序列进行分析研究。结果犬弓首蛔虫种群内pnad4的序列差异为1.17%,与猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫、牛弓首蛔虫和狮弓蛔虫种间的平均序列差异分别为13.92%、16.48%、15.12%和20.32%。猫弓首蛔虫种群内pnad4的序列差异为1.00%,与马来西亚弓首蛔虫、牛弓首蛔虫、狮弓蛔虫平均序列差异分别是17.90%、13.55%和18.50%。马来西亚弓首蛔虫种群内pnad4序列差异为0.13%,与牛弓首蛔虫、狮弓蛔虫序列差异分别为13.50%和20.60%。结论犬弓首蛔虫不同地方虫株的pnad4有一定差异,猫弓首蛔虫种群内差异较小,马来西亚弓首蛔虫种群内差异很小。弓首属各虫种之间的差异以及与狮弓蛔虫的差异都较大。马来西亚弓首蛔虫pnad4序列与其它虫种差异都较大,证明它确为一独立种。pnad4序列是弓首蛔虫和狮弓蛔虫理想的种特异的遗传标记。 展开更多
关键词 犬弓首蛔虫 猫弓首蛔虫 马来西亚弓首蛔虫 牛弓首蛔虫 狮弓蛔虫 线粒体DNA 烟酰胺脱氢酶亚基ⅳ基因 PCR-SSCP
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西方蜜蜂采集蜂咽下腺中高表达基因的筛选及表达分析
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作者 张娟 高艳 +6 位作者 王若虹 李秋方 杨尚宁 周诗文 石丹丹 苏松坤 聂红毅 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期896-908,共13页
【目的】本研究旨在筛选西方蜜蜂Apis mellifera采集蜂咽下腺中高表达的基因,为进一步筛选和研究蜜蜂采集行为相关基因提供依据。【方法】基于前期已获得西方蜜蜂3日龄工蜂(3 d_W)、10日龄哺育蜂(10 d_N)、10日龄采集蜂(10 d_F)、21日... 【目的】本研究旨在筛选西方蜜蜂Apis mellifera采集蜂咽下腺中高表达的基因,为进一步筛选和研究蜜蜂采集行为相关基因提供依据。【方法】基于前期已获得西方蜜蜂3日龄工蜂(3 d_W)、10日龄哺育蜂(10 d_N)、10日龄采集蜂(10 d_F)、21日龄哺育蜂(21 d_N)和21日龄采集蜂(21 d_F)的咽下腺转录组数据,筛选咽下腺差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对10日龄和21日龄采集蜂咽下腺中高表达的DEGs进行GO和KEGG富集分析;利用qPCR检测西方蜜蜂采集蜂咽下腺中高表达的4个DEGs(LOC409889,LOC406114,LOC408453和LOC100578735)在不同发育时期(卵、幼虫、蛹、刚出房工蜂、10日龄哺育蜂和21日龄采集蜂)和21日龄采集蜂组织(腹、胸、触角、上颚腺、咽下腺、蛰针、足、肠道、翅和脑)中的表达量。【结果】比较转录组结果表明,164个上调表达的DEGs在21日龄采集蜂咽下腺中的表达量明显高于在3日龄工蜂、10日龄哺育蜂和21日龄哺育蜂咽下腺中的表达量,且在10日龄采集蜂咽下腺中的表达量也高于在10日龄哺育蜂咽下腺中的表达量;105个下调表达的DEGs的表达趋势与上述164个DEGs的相反。GO分析结果表明,10日龄和21日龄采集蜂咽下腺中高表达的164个DEGs显著富集于硫酸盐跨膜转运蛋白活性、硫化合物跨膜转运蛋白活性、铁离子结合和氧化还原酶活性;下调表达的105个DEGs显著富集于核糖体、细胞内核糖核蛋白复合物和核糖核蛋白复合物;KEGG通路分析结果表明,105个下调表达的DEGs显著富集于核糖体以及淀粉和蔗糖代谢两个通路。qPCR检测结果显示,LOC409889,LOC406114,LOC408453和LOC100578735均在21日龄采集蜂中表达量最高;LOC406114和LOC100578735在21日龄采集蜂咽下腺中的表达量最高,而在其他组织中表达量较低或不表达。【结论】本研究通过比较转录组筛选鉴定了西方蜜蜂采集蜂咽下腺中高表达的DEGs,为深入研究采集蜂咽下腺的功能提供了数据,同时也为研究西方蜜蜂的采集行为及采集力强蜂种的分子选育提供新的视角。 展开更多
关键词 西方蜜蜂 咽下腺 差异表达基因 α-淀粉 丙酮酸α亚基E1组分
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基于线粒体nad4基因探讨土耳其斯坦东毕吸虫的系统发生位置
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作者 王宇 肖景莹 +2 位作者 王春仁 高俊峰 朱兴全 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期218-220,共3页
为探讨土耳其斯坦东毕吸虫在血吸虫中的系统发生位置,本研究设计一对特异性引物,通过PCR方法对土耳其斯坦东毕吸虫(绵羊源)线粒体烟酰胺脱氢酶亚基Ⅳ基因(nad4)进行扩增和测序分析,并与GenBank中相关血吸虫nad4基因进行比对。结果显示,... 为探讨土耳其斯坦东毕吸虫在血吸虫中的系统发生位置,本研究设计一对特异性引物,通过PCR方法对土耳其斯坦东毕吸虫(绵羊源)线粒体烟酰胺脱氢酶亚基Ⅳ基因(nad4)进行扩增和测序分析,并与GenBank中相关血吸虫nad4基因进行比对。结果显示,本研究克隆的该吸虫线粒体nad4基因序列大小约为1030bp,与已发表的其它血吸虫线粒体nad4基因的同源性为51.6%~66.7%,其系统发生位置属于非洲血吸虫种群。 展开更多
关键词 土耳其斯坦东毕吸虫 线粒体DNA 烟酰胺脱氢酶亚基ⅳ基因 系统发生
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基于nad5基因分析白狮蛔虫种系发育关系 被引量:5
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作者 朱琳 王靖怡 +2 位作者 胡辉灿 靳元春 刘伟 《经济动物学报》 CAS 2017年第2期115-118,121,共5页
为分析白狮蛔虫湖南动物园分离株线粒体nad5的遗传差异,并利用nad5序列分析白狮蛔虫与其他蛔虫的种系遗传关系,应用PCR技术对白狮蛔虫线粒体nad5的部分序列进行克隆和序列测定,利用Clustal X2.0程序对测序所得序列进行比对,再运用Mega4.... 为分析白狮蛔虫湖南动物园分离株线粒体nad5的遗传差异,并利用nad5序列分析白狮蛔虫与其他蛔虫的种系遗传关系,应用PCR技术对白狮蛔虫线粒体nad5的部分序列进行克隆和序列测定,利用Clustal X2.0程序对测序所得序列进行比对,再运用Mega4.1程序进行NJ法绘制种系发育树。结果表明:所获得nad5序列长度基本一致,约530 bp,15个样品分离株之间的同源性为97.4%~99.8%,通过构建系统种系发育,结果显示15个白狮蛔虫分离株与狮弓蛔虫位于同一大分支,与其他蛔虫所属分支具有较远的距离,得到较为明显的鉴别。狮弓蛔虫nad5序列种内较为保守,但种间差异明显,nad5基因可以作为理想的分子标记应用于狮弓蛔虫的分子鉴定和种间遗传变异研究,从而为狮弓蛔虫的群体遗传研究奠定基础。 展开更多
关键词 白狮 蛔虫 线粒体烟酰胺亚基基因 序列分析 种系发育关系
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4种终末宿主土耳其斯坦东毕吸虫cox1和nad1基因的序列分析 被引量:2
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作者 李利 邢继兰 +2 位作者 王春仁 翟延庆 何国声 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期303-307,共5页
收集黑龙江省大庆地区牛源、绵羊源、绒山羊源和山羊源土耳其斯坦东毕吸虫,以SDS-蛋白酶K法抽提其基因组DNA,用特异性引物通过PCR扩增土耳其斯坦东毕吸虫成虫细胞色素C氧化酶亚基1基因(coxl)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基1基因... 收集黑龙江省大庆地区牛源、绵羊源、绒山羊源和山羊源土耳其斯坦东毕吸虫,以SDS-蛋白酶K法抽提其基因组DNA,用特异性引物通过PCR扩增土耳其斯坦东毕吸虫成虫细胞色素C氧化酶亚基1基因(coxl)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基1基因(nad1)并进行测序,应用Chromas和DNAStar软件分析扩增产物的变异情况。结果表明,大庆地区4种终末宿主土耳其斯坦东毕吸虫cox1基因均为1125bp,nad1基因均为518bp;且其线粒体基因存在差异,coxl的同源性为99.0%~99.7%,nad1的同源性为98.3%~99.4%。 展开更多
关键词 土耳其斯坦东毕吸虫 细胞色素C氧化亚基1基因 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸亚基1基因 序列分析
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辣椒3-磷酸甘油醛脱氢酶基因CaGAPB的克隆及表达分析 被引量:1
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作者 李严曼 欧阳孟真 +1 位作者 孙守如 朱磊 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期1382-1389,共8页
本实验采用RT-PCR和RACE的方法,我们从辣椒叶片中克隆到3-磷酸甘油醛脱氢酶β亚基基因(CaGAPB)的全长序列,基因编码区共1 359 bp,编码452个氨基酸。生物信息学分析显示,该基因编码的蛋白分子量为48.2 kD,等电点6.52;进化树分析表明CaGAP... 本实验采用RT-PCR和RACE的方法,我们从辣椒叶片中克隆到3-磷酸甘油醛脱氢酶β亚基基因(CaGAPB)的全长序列,基因编码区共1 359 bp,编码452个氨基酸。生物信息学分析显示,该基因编码的蛋白分子量为48.2 kD,等电点6.52;进化树分析表明CaGAPB与同为茄科的番茄、马铃薯、烟草以及葡萄科的葡萄GAPB处于同一进化枝上,表现出较近的亲缘关系,其氨基酸序列同源性达到95%以上;荧光定量分析发现,CaGAPB基因可以被低温处理显著诱导表达,而其他的一些胁迫(NaCl,机械损伤,PEG,甘露醇)和信号分子(乙烯利,H_2O_2,SA)处理均会抑制其表达,同时非生物胁迫DC3000侵染对其表达无影响。综上所述,CaGAPB可能是同辣椒的低温抗性相关,其具体功能有待于进一步的研究。 展开更多
关键词 3-磷酸甘油醛β亚基 辣椒 基因克隆 荧光定量PCR
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人蛔虫和猪蛔虫线粒体nad5基因的序列分析 被引量:8
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作者 吴昌义 林瑞庆 +1 位作者 朱艳平 刘国华 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期60-63,共4页
以采自中国不同地方的人蛔虫与猪蛔虫为研究对象,PCR扩增其线粒体烟酰胺脱氢酶亚基V基因(nad5)的部分序列](pnad5)并进行序列测定,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对。结果显示:所获得的pnad5序列长度一致,均为556bp;人蛔... 以采自中国不同地方的人蛔虫与猪蛔虫为研究对象,PCR扩增其线粒体烟酰胺脱氢酶亚基V基因(nad5)的部分序列](pnad5)并进行序列测定,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对。结果显示:所获得的pnad5序列长度一致,均为556bp;人蛔虫和猪蛔虫的pnad5序列差异仅为0.0%~2.6%,本研究结果支持人蛔虫与猪蛔虫是同一个种的结论。 展开更多
关键词 人蛔虫 猪蛔虫 线粒体DNA 烟酰胺亚基V基因(nad5) 序列分析
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人LDH-M亚基遗传变异的多态性
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作者 刘泽军 《国外医学(遗传学分册)》 1998年第6期326-327,F004,共3页
本文综述了LDH-M亚基基因变异的不同类型以及对酶蛋白结构和功能的影响。
关键词 M亚基 乳酸 基因结构 多态性 遗传变异
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安徽省不同地区日本血吸虫群体线粒体基因遗传变异研究 被引量:1
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作者 马晓荷 汪敏 +7 位作者 朱磊 郭见多 李清越 刘婷 翟杜娟 孙成松 张世清 汪天平 《热带病与寄生虫学》 CAS 2021年第5期254-258,共5页
目的探讨安徽省不同地区日本血吸虫种群的遗传进化关系。方法分别从安徽省山丘型流行区(池州市石台县)和湖沼型流行区(安庆市大观区、铜陵市枞阳县)采集钉螺,逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(50±3)条尾蚴。35 d后解剖小鼠,门静脉... 目的探讨安徽省不同地区日本血吸虫种群的遗传进化关系。方法分别从安徽省山丘型流行区(池州市石台县)和湖沼型流行区(安庆市大观区、铜陵市枞阳县)采集钉螺,逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(50±3)条尾蚴。35 d后解剖小鼠,门静脉灌注法收集成虫,提取成虫DNA,PCR扩增、克隆和测序成虫的线粒体NADH(还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)脱氢酶1(ND1)和细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因,利用生物信息学软件Dnasp 6.0和Mega X分析所得序列基本特征并构建系统进化树作遗传进化分析。结果安徽省三个地区日本血吸虫样本的ND1基因序列存在15个变异位点,COⅠ序列存在74个变异位点;ND1基因和COⅠ基因的核苷酸多样性(Pi)分别为0.0047、0.0173,样本间COⅠ基因序列差异高于ND1基因;来自湖沼型流行区的样本ND1基因和COⅠ基因的变异位点数、核苷酸多样性(Pi)均高于来自山丘型流行区样本。来自山丘型流行区的样本在ND1系统进化树中与来自湖沼型流行区的样本聚集在一起,而在COⅠ基因系统进化树中单独成簇。结论来自湖沼型流行区的日本血吸虫样本群体的基因多样性高于来自山丘型流行区的样本。安徽省三个地区日本血吸虫群体的COⅠ基因存在遗传分化,而ND1基因尚未产生较明显的遗传分化。 展开更多
关键词 日本血吸虫 遗传分化 NADH1基因 细胞色素C氧化亚基基因 安徽省
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线粒体NADH1基因和微卫星标记在棘球绦虫感染检测中的应用
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作者 吕凤军 王冰洁 +11 位作者 丁伟强 赵莉 班万里 段兰利 穆尼拉·特列吾汗 吴小霞 徐晶 陈云英 郭涛 王方 乌云花 张壮志 《草食家畜》 2020年第4期43-51,共9页
(目的)利用线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(NADH1)和微卫星标记进行棘球绦虫感染的基因型和遗传多样性分析。(方法)对不同地区牛、羊肝/肺包囊(8份)、野生鼠肝包囊(4份)和狐狸肠道寄生棘球绦虫成虫(2份)共14个样本提取DNA后,分别用棘球绦虫... (目的)利用线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(NADH1)和微卫星标记进行棘球绦虫感染的基因型和遗传多样性分析。(方法)对不同地区牛、羊肝/肺包囊(8份)、野生鼠肝包囊(4份)和狐狸肠道寄生棘球绦虫成虫(2份)共14个样本提取DNA后,分别用棘球绦虫线粒体NADH1基因和微卫星标记进行检测。(结果)PCR扩增分别得到大小约为510 bp的NADH1核苷酸片段和200~300 bp不等的微卫星标记片段,产物的长度与引物设计的预期产物长度一致;序列比对发现不同地区、不同宿主来源的样品序列存在碱基的颠/转换和碱基缺失现象;测序发现8份牛、羊肝/肺包囊样本均为细粒棘球蚴G1基因型感染,4份野生鼠肝包囊均为多房棘球蚴感染,2份狐狸肠道寄生棘球绦虫样本为多房棘球绦虫感染。(结论)线粒体NADH1基因和微卫星标记均适用于棘球绦虫种间和种内的鉴别、分类及系统进化分析研究。 展开更多
关键词 棘球绦虫 NADH亚基1基因 微卫星
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