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多年生黑麦草温度胁迫差异表达转录因子的比较转录组分析
被引量:
5
1
作者
李鑫雨
何媛
+3 位作者
代娅
李彩侠
王艳
马欣荣
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期773-784,共12页
多年生黑麦草是禾本科冷季型草种,温度胁迫严重影响其分布和产量。转录因子调控基因表达在植物响应逆境胁迫中发挥重要作用。该研究以多年生黑麦草品种雅晴为材料,采用高通量RNA-seq技术,对热(40℃)、冷冻(-10℃)和对照(22℃)处理的样...
多年生黑麦草是禾本科冷季型草种,温度胁迫严重影响其分布和产量。转录因子调控基因表达在植物响应逆境胁迫中发挥重要作用。该研究以多年生黑麦草品种雅晴为材料,采用高通量RNA-seq技术,对热(40℃)、冷冻(-10℃)和对照(22℃)处理的样本进行转录因子应答分析,以探索多年生黑麦草转录因子对温度胁迫的响应规律,并筛选抗逆转录因子候选基因。结果显示:(1)共鉴定了694个转录因子unigenes,分属于AP2/ERF、GTF、HSF、MYB、NAC、WRKY、bHLH和bZIP等32个家族。(2)在热和冷冻胁迫下,ERF(AP2/ERF)、MYB、NAC和bZIP家族基因均以上调为主,而WRKY家族则多数下调。HSF、GTF和DREB(AP2/ERF)家族成员大多数受热诱导上调,而多数bHLH家族成员受冷冻胁迫上调。(3)功能富集结果表明,多年生黑麦草差异表达的转录因子基因主要参与植物激素信号转导、昼夜节律和病原体互作等通路。研究表明,多年生黑麦草中与胁迫适应相关的转录因子基因普遍上调表达,而与生长和抗病相关的基因多数下调。该研究筛选到大量抗逆转录因子候选基因,为分子育种提供抗逆基因资源。
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关键词
多年生黑麦草
转录因子
热和冷冻胁迫应答
AP2/ERF
BHLH
BZIP
GTF
HSF
MYB
NAC
WRKY
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题名
多年生黑麦草温度胁迫差异表达转录因子的比较转录组分析
被引量:
5
1
作者
李鑫雨
何媛
代娅
李彩侠
王艳
马欣荣
机构
中国科学院成都生物研究所
中国科学院大学
中国科学院种子创新研究院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期773-784,共12页
基金
国家科技支撑项目(2014BAC05B04-03)
国家自然科学青年基金(31502003)。
文摘
多年生黑麦草是禾本科冷季型草种,温度胁迫严重影响其分布和产量。转录因子调控基因表达在植物响应逆境胁迫中发挥重要作用。该研究以多年生黑麦草品种雅晴为材料,采用高通量RNA-seq技术,对热(40℃)、冷冻(-10℃)和对照(22℃)处理的样本进行转录因子应答分析,以探索多年生黑麦草转录因子对温度胁迫的响应规律,并筛选抗逆转录因子候选基因。结果显示:(1)共鉴定了694个转录因子unigenes,分属于AP2/ERF、GTF、HSF、MYB、NAC、WRKY、bHLH和bZIP等32个家族。(2)在热和冷冻胁迫下,ERF(AP2/ERF)、MYB、NAC和bZIP家族基因均以上调为主,而WRKY家族则多数下调。HSF、GTF和DREB(AP2/ERF)家族成员大多数受热诱导上调,而多数bHLH家族成员受冷冻胁迫上调。(3)功能富集结果表明,多年生黑麦草差异表达的转录因子基因主要参与植物激素信号转导、昼夜节律和病原体互作等通路。研究表明,多年生黑麦草中与胁迫适应相关的转录因子基因普遍上调表达,而与生长和抗病相关的基因多数下调。该研究筛选到大量抗逆转录因子候选基因,为分子育种提供抗逆基因资源。
关键词
多年生黑麦草
转录因子
热和冷冻胁迫应答
AP2/ERF
BHLH
BZIP
GTF
HSF
MYB
NAC
WRKY
Keywords
perennial ryegrass
transcription factor
heat and freeze stress responses
AP2/ERF
bHLH
bZIP
GTF
HSF
MYB
NAC
WRKY
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
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1
多年生黑麦草温度胁迫差异表达转录因子的比较转录组分析
李鑫雨
何媛
代娅
李彩侠
王艳
马欣荣
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
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职称材料
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参考文献
引证文献
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