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热泉菌Bacillus sp.BI-3产高温脂肪酶的发酵条件优化 被引量:3
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作者 王蕾 张培玉 李江 《中国油脂》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期104-108,共5页
通过平板透明圈从印度尼西亚热泉样品中筛选出一株高产脂肪酶的菌株Bacillus.sp BI-3。首先以培养温度、p H、碳源、氮源、金属离子、氯化钠添加量及接种量作为唯一变量进行单因素实验,筛选出对酶活有显著影响的单因素取值范围,再利用Bo... 通过平板透明圈从印度尼西亚热泉样品中筛选出一株高产脂肪酶的菌株Bacillus.sp BI-3。首先以培养温度、p H、碳源、氮源、金属离子、氯化钠添加量及接种量作为唯一变量进行单因素实验,筛选出对酶活有显著影响的单因素取值范围,再利用Box-Behnken设计及响应面分析法进行回归分析以确定最佳发酵条件。结果表明,优化后的发酵培养条件为培养温度49.1℃、蛋白胨0.78%、氯化锶13 mmol/L、接种量1.5%、初始p H 7.0、酵母粉0.4%,优化后发酵上清液的酶活达到224.63 U/m L。 展开更多
关键词 热泉菌bacillus sp.BI-3 高温脂肪酶 发酵条件 响应面分析
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响应面法优化热泉菌Bacillus sp.Lc50-1的发酵产卡拉胶酶条件 被引量:1
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作者 胡秋实 苏忠亮 +1 位作者 何培青 李江 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期259-267,共9页
采用响应面法对1株高产卡拉胶酶的印度尼西亚热泉菌Bacillus sp.Lc50-1的发酵条件进行优化。分别以培养温度、pH值、C源、N源、金属离子及接种量作为唯一变量进行单因素实验,筛选出对酶活有显著影响的单因素取值范围;参考单因素实验结果... 采用响应面法对1株高产卡拉胶酶的印度尼西亚热泉菌Bacillus sp.Lc50-1的发酵条件进行优化。分别以培养温度、pH值、C源、N源、金属离子及接种量作为唯一变量进行单因素实验,筛选出对酶活有显著影响的单因素取值范围;参考单因素实验结果,再利用Box-Behnken设计及响应面分析法进行回归分析以确定最佳发酵条件。结果表明,培养温度、卡拉胶浓度(C源)、蛋白胨浓度(N源)、KCl浓度(金属离子)与酶活存在着显著的相关性,通过求解回归方程得到Bacillus sp.Lc50-1的最佳发酵条件为:培养温度47.5℃、蛋白胨0.25%、卡拉胶0.3%、KCl 21.55mmol·L-1,优化后发酵上清液的酶活达到8.9U·mL-1,比优化前提高了1.5倍。 展开更多
关键词 热泉菌bacillus sp Lc50-1 卡拉胶酶 响应面法 优化
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西藏东北部热泉水中硫氧化菌的多样性及分布特征
3
作者 寇祝 卿纯 +1 位作者 袁昌果 李平 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期989-1000,共12页
热泉中存在大量的硫氧化菌,而西藏东北部丰富的热泉资源中硫氧化菌的相关研究较少。为探究西藏东北部热泉水中不同类型硫氧化菌(Sulfur-Oxidizing Bacteria,SOB)的多样性、群落结构及其分布特征,采集西藏东北部5个地热区总共13个热泉的... 热泉中存在大量的硫氧化菌,而西藏东北部丰富的热泉资源中硫氧化菌的相关研究较少。为探究西藏东北部热泉水中不同类型硫氧化菌(Sulfur-Oxidizing Bacteria,SOB)的多样性、群落结构及其分布特征,采集西藏东北部5个地热区总共13个热泉的地球化学及微生物样品,构建硫氧化基因dsrA和soxB的功能基因克隆文库、q PCR定量分析dsr A和soxB基因丰度,结合水化参数对比分析热泉水中dsrA型SOB和soxB型SOB的群落结构及其分布特征的差异。结果表明,西藏东北部热泉水中的硫氧化菌主要为β变形菌纲(Betaproteobacteria)、α变形菌纲(Alphaproteobacteria)、γ变形菌纲(Gammaproteobacteria)和嗜氢菌纲(Hydrogenophilalia),其中dsr A型SOB和soxB型SOB的优势类群在纲水平上均为Betaproteobacteria,但目水平上则存在差异,即soxB型SOB优势菌目为亚硝化单胞菌目(Nitrosomonadales)(30.0%-91.7%);dsr A型SOB优势菌目为红环菌目(Rhodocyclales)(33.3%-96.0%)。冗余分析(redundancy analysis,RDA)表明,SO_4^(2-)、S^(2-)、HCO_(3)~-、pH、温度等是影响硫氧化菌群落分布的关键环境因子。soxB基因相对丰度主要与SO_4^(2-)浓度、氧化还原电位(Oxidation-Reduction Potential,ORP)以及S^(2-)浓度相关,dsr A基因相对丰度受总砷(As~T)浓度和HCO_(3)~-浓度影响较大。这些结果表明,soxB基因型SOB主要分布于偏氧化环境,而dsr A基因型SOB主要分布于砷浓度、碱度相对偏高的热泉。该研究进一步完善了关于西藏热泉水环境中SOB多样性和分布规律的认识,促进了对热泉硫的生物地球化学循环的理解。 展开更多
关键词 西藏 硫氧化 soxB基因 dsr A基因 群落结构 环境因子
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热稳定k-卡拉胶酶产生菌Bacillus sp.Car19的发酵条件优化
4
作者 谢买胜 李江 +1 位作者 林学政 何培青 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期7-16,共10页
对一株分泌热稳定κ-卡拉胶酶印尼热泉菌进行了种属鉴定,并采用响应面法对该菌发酵产酶条件进行了优化。鉴定结果表明,该菌株属于芽孢杆菌属(Bacillus),命名为Bacillus sp.Car19(Gene Bank:KT865196)。发酵条件优化结果显示,9个环境因... 对一株分泌热稳定κ-卡拉胶酶印尼热泉菌进行了种属鉴定,并采用响应面法对该菌发酵产酶条件进行了优化。鉴定结果表明,该菌株属于芽孢杆菌属(Bacillus),命名为Bacillus sp.Car19(Gene Bank:KT865196)。发酵条件优化结果显示,9个环境因子影响Bacillus sp.Car19产酶量。其中影响Bacillus sp.Car19产酶量的三个主要因素分别为培养温度、培养基中Cu^(2+)浓度和培养基中Na Cl浓度。综合次要因素对Bacillus sp.Car19产酶影响,Bacillus sp.Car19最佳产酶发酵条件为:培养温度52.31℃、Cu^(2+)浓度6.93 mmol/L、Na Cl浓度37.03 g/L,培养基p H为6,接种量1%,培养时间36 h,半乳糖浓度0.3 g/L,硝酸铵浓度7 g/L,卡拉胶浓度0.5 g/L。优化后发酵上清液酶活力达到15.21 U/m L,与优化前相比提高了1.5倍。 展开更多
关键词 卡拉胶酶 优化 响应面
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云南4处酸性热泉中的变形菌门细菌多样性 被引量:30
5
作者 宋兆齐 王莉 +1 位作者 刘秀花 梁峰 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期376-382,共7页
选择云南腾冲和龙陵地区的4处酸性热泉(pH:2.3—6.0,温度:47~96℃),通过Barcoded pyrosequencing技术及统计学分析,详细阐述了这些样点中变形菌门的物种和遗传多样性。本研究共获得了2489条变形菌门16SrRNA基因序列,可划分为... 选择云南腾冲和龙陵地区的4处酸性热泉(pH:2.3—6.0,温度:47~96℃),通过Barcoded pyrosequencing技术及统计学分析,详细阐述了这些样点中变形菌门的物种和遗传多样性。本研究共获得了2489条变形菌门16SrRNA基因序列,可划分为234个可操作分类单元(OTUs)。分类结果显示,热泉内涵盖了大量已知的目、科和属。而41%的OTUs可能代表了变形菌门的未知物种。系统发育分析显示,样点中存在着若干全新遗传类群,这些样点和美国黄石地区的热泉各自呈现不同的变形菌门遗传多样性。此外,本次调查的热泉彼此间存在着变形菌门群落结构的显著差异。 展开更多
关键词 变形 多样性 系统发育分析 酸性 云南
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腾冲两热泉泉古菌多样性及系统发育的初步分析 被引量:8
6
作者 宋兆齐 陈经全 +3 位作者 职晓阳 黄志勇 张传伦 李文均 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期372-377,共6页
通过构建16SrRNA基因片段的克隆文库对腾冲热海两温泉中泉古菌的多样性和系统发育关系进行了初步的研究。一共得到18个泉古菌克隆序列,可分为12个OTUs,两温泉的克隆序列与已知GenBank上关系最近序列的平均相似性较低,无名泉为92.56%,热... 通过构建16SrRNA基因片段的克隆文库对腾冲热海两温泉中泉古菌的多样性和系统发育关系进行了初步的研究。一共得到18个泉古菌克隆序列,可分为12个OTUs,两温泉的克隆序列与已知GenBank上关系最近序列的平均相似性较低,无名泉为92.56%,热爆区为93%。从基于16SrRNA基因片段序列构建的系统发育树来看,74℃的无名泉样点中既有属于超高温环境类群的泉古菌,同时又有属于和常温环境较接近的泉古菌;45℃的热爆区样点的泉古菌,相对来说则更接近于常温类群。本次研究表明,腾冲热泉与世界其它同类热泉之间的泉古菌类群存在着一定的差异;而且两实验样点代表了超高温和高温环境泉古菌逐渐向常温过度的两个重要环境。 展开更多
关键词 多样性 系统发育 16S RRNA基因 克隆文库 腾冲
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腾冲热海眼镜泉粉红色菌藻席的细菌组成分析 被引量:5
7
作者 张东华 李沁元 +1 位作者 刘杨 彭谦 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期820-823,共4页
应用免培养法系统研究眼镜泉粉红色菌藻席的细菌组成。经过克隆筛选 ,测定了 2 3个克隆的 16SrDNA插入片段的近全序列。与GenBank的序列进行比对和相似性分析 ,结果表明 ,组成该菌藻席的细菌分属于Proteobacte ria、Firmicutes、Bactero... 应用免培养法系统研究眼镜泉粉红色菌藻席的细菌组成。经过克隆筛选 ,测定了 2 3个克隆的 16SrDNA插入片段的近全序列。与GenBank的序列进行比对和相似性分析 ,结果表明 ,组成该菌藻席的细菌分属于Proteobacte ria、Firmicutes、Bacteroidetes、Actinobacter、Deinococcus_thermus、Aquificals 6个类群 (phylum) ,表现出了高度的细菌多样性。结合分析温度相近的 5个热泉 :Octopusspring、HaegindiandFluidirspring、Olkelduhals、Grendalurspring中的菌藻席细菌组成 ,表明生态位相近的不同环境中 ,其物种组成相近。 展开更多
关键词 藻席 多样性 生态位 群落结构
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西藏搭格架铯硅华区热泉高温菌株的分离及特征研究 被引量:3
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作者 孔凡晶 王海雷 +1 位作者 郑绵平 郑小娟 《地质学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1750-1753,共4页
从西藏搭格架铯硅华矿床区热泉中分离培养高温菌T4-1,并进行了格兰氏染色、显微镜观察、室内温度实验、16SrRNA基因分析等。结果表明,T4-1为杆状菌,格兰氏染色阳性,其生长范围为45-80℃,最适生长温度70℃。16SrRNA基因分析结果表明,该... 从西藏搭格架铯硅华矿床区热泉中分离培养高温菌T4-1,并进行了格兰氏染色、显微镜观察、室内温度实验、16SrRNA基因分析等。结果表明,T4-1为杆状菌,格兰氏染色阳性,其生长范围为45-80℃,最适生长温度70℃。16SrRNA基因分析结果表明,该菌株属于地芽孢杆菌属(Geobacillus),在发育树上,T4-1菌株与高温烷烃地芽孢杆菌(Geobacillus the rmoleovorans)非常近。本研究为进一步开展西藏高温微生物资源以及微生物参与成矿作用的研究提供了首例。 展开更多
关键词 西藏 高温 地芽孢杆 16SRRNA基因
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关中地区地下热泉普鲁兰酶产生菌的分离及其酶学性质 被引量:2
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作者 常帆 薛文娇 +1 位作者 马赛箭 安超 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1312-1318,共7页
从关中地区的西安市区、临潼区、长安区,以及杨凌周边地区,分别采集地下热泉泉水水样,采用培养法分别得到105株普鲁兰酶产生菌,对其中21株进行16S r DNA基因片段序列分析。比对表明,克雷伯菌属(Klebsiella)和芽孢杆菌属(Bacillus)在热... 从关中地区的西安市区、临潼区、长安区,以及杨凌周边地区,分别采集地下热泉泉水水样,采用培养法分别得到105株普鲁兰酶产生菌,对其中21株进行16S r DNA基因片段序列分析。比对表明,克雷伯菌属(Klebsiella)和芽孢杆菌属(Bacillus)在热泉生态系统中处于优势地位。根据统计结果,所分离的菌株在种间和种内均有显著的酶活力差异。其中GP-1最适温度为50℃,最适p H 4.0,在50℃时有良好的稳定性,保温30 min仍有92%剩余酶活。 展开更多
关键词 可培养 普鲁兰酶 筛选 多样性
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印度尼西亚Padang Cermin热泉古菌多样性分析 被引量:1
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作者 沈继红 宋维志 +2 位作者 林学政 王帅 Dewi Seswita Zilda 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期534-540,共7页
通过印度尼西亚苏门答腊岛Padang Cermin热泉环境基因组DNA构建古菌16SrRNA基因文库,并利用PCR-RFLP技术对其古菌多样性和系统发育分析进行了研究。根据限制性内切酶AluⅠ和MspⅠ的特征性酶切图谱,将62个阳性克隆归类为14个分类操作单位... 通过印度尼西亚苏门答腊岛Padang Cermin热泉环境基因组DNA构建古菌16SrRNA基因文库,并利用PCR-RFLP技术对其古菌多样性和系统发育分析进行了研究。根据限制性内切酶AluⅠ和MspⅠ的特征性酶切图谱,将62个阳性克隆归类为14个分类操作单位(operational taxonomic unit,OTU),文库的覆盖度达90.32%。克隆文库的优势类群为OTU2和OTU1,分别占克隆文库的27.42%和20.96%。从每个OUT中选取一个代表性克隆进行16SrRNA基因的序列测定与系统发育分析,结果表明,测定的Padang Cermin热泉中的古菌均属于泉古菌门,包括热变形菌目(Thermoproteales)、硫还原球菌目(Desulfurococcales)、杂色泉古菌(miscellaneous crenar-chaeotic group,MCG)和未培养泉古菌(uncultured Crenarchaeota,UC),该热泉代表性克隆与GenBank数据库已有16SrRNA序列的相似性为91.9%~97.8%,而且与其相似性最高的序列均来自未培养的古菌克隆,由结果可见,Padang Cermin热泉古菌群落与已报道的其他热泉古菌群落的相似性较低,表明该热泉可能具有某些独特的特征,存在着特殊的古菌生态类群。 展开更多
关键词 多样性 系统发育分析
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狮子头热泉菌席样品环境总DNA提取方法的比较研究 被引量:1
11
作者 任禛 王治刚 +4 位作者 尹敏 刘继辉 李沁元 王永霞 崔晓龙 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2009年第5期1-7,共7页
通过对狮子头热泉7个环境菌席样品所提取的总DNA进行纯度检测、提取得率计算和DGGE分析,比较了3种直接和1种间接DNA提取方法。结果表明:综合利用多种裂解方式比单一裂解方式更能充分释放环境DNA;其中3种方法获得的DNA片段能够进行后续16... 通过对狮子头热泉7个环境菌席样品所提取的总DNA进行纯度检测、提取得率计算和DGGE分析,比较了3种直接和1种间接DNA提取方法。结果表明:综合利用多种裂解方式比单一裂解方式更能充分释放环境DNA;其中3种方法获得的DNA片段能够进行后续16S rDNA扩增;针对同一样品,不同方法提取的环境DNA,可获得不同DGGE群落指纹图谱;间接提取法提取的总DNA,能更好地反映狮子头热采菌席的微生物多样性。 展开更多
关键词 环境 微生物 环境DNA DNA提取方法
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临沧地区热泉栖热菌属细菌菌种保藏研究
12
作者 李易 《曲靖师专学报》 2000年第6期43-43,48,共2页
关键词 水栖 保藏 临沧地区
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印尼热泉菌产热稳定褐藻胶裂解酶的酶学性质研究 被引量:2
13
作者 高杨 李江 宋益民 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期577-585,共9页
以印尼热泉菌为材料,采用以褐藻酸钠为唯一碳源的培养基筛选产褐藻胶裂解酶的菌株,通过16S rDNA序列对产酶菌株进行种属鉴定,并通过硫酸铵沉淀、离子交换层析和凝胶过滤层析从高产酶菌株Aly-B5发酵液上清中纯化获得褐藻胶裂解酶,并对该... 以印尼热泉菌为材料,采用以褐藻酸钠为唯一碳源的培养基筛选产褐藻胶裂解酶的菌株,通过16S rDNA序列对产酶菌株进行种属鉴定,并通过硫酸铵沉淀、离子交换层析和凝胶过滤层析从高产酶菌株Aly-B5发酵液上清中纯化获得褐藻胶裂解酶,并对该酶的酶学性质进行了研究。结果表明:高产酶菌株经鉴定为Bacillus属;聚丙烯酰胺凝胶电泳(Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)显示纯化的褐藻胶裂解酶Aly-B5分子量为45kDa,该酶最适作用温度为65°C,75°C时的半衰期为110min,最适pH为7.0;Zn^(2+)、Mg^(2+)、Fe^(2+)对酶活具有明显的抑制作用,但该酶对乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA)并不敏感;同时,底物特异性实验表明Aly-B5是一种偏好降解聚古罗糖醛酸(poly G)的双功能裂解酶,降解产物主要是二糖。该酶优良的耐热性使其在海藻高值化利用领域具有潜在的应用前景。 展开更多
关键词 印尼 褐藻胶裂解酶 酶学性质 稳定性
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Screening and Characterization of the Alkaline Protease Isolated from PLI-1, a Strain of Brevibacillus sp. Collected from Indonesia's Hot Springs 被引量:3
14
作者 WANG Shuai LIN Xuezheng +2 位作者 HUANG Xiaohang ZHENG Li Dewi Seswita Zilda 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2012年第2期213-218,共6页
A total of 69 strains of thermophilic bacteria were isolated from water, soil and sediment samples from three Indonesia's hot spring areas (Pantai cermin, Kalianda and Banyu wedang) by using Minimal Synthetic Medi... A total of 69 strains of thermophilic bacteria were isolated from water, soil and sediment samples from three Indonesia's hot spring areas (Pantai cermin, Kalianda and Banyu wedang) by using Minimal Synthetic Medium (MSM). The extreme thermophile Brevibacillus sp. PLI-1 was found to produce extracellular thermophilic alkaline protease with optimal activity at 70℃ and pH 8.0-9.0. The molecular weight of the protease was estimated to be around 56 kD by SDS-PAGE. The maximum activity of the protease was 26.54 U mL-1. The protease activity did not decrease after 30 min and still retained more than 70% of relative activity after 60 min at 70℃ and pH 8.0. The ion Mg2+ was found to promote protease activity at both low and high concentrations, whereas Cu2+ and Zn2+ could almost completely inhibit the activity. Divalent cation chelator EDTA inhibited the enzyme activity by 55.06% ± 0.27%, while the inhibition caused by PMSF, Leupeptin, Pepstain A and Benzamidine were 66.78% ± 3.25%, 52.37% ± 0.25%, 62.47% ± 2.96% and 50.99% ± 0.24%, respectively. Based on these observations, the enzyme activity was conspicuously sensitive to the serine and cysteine protease inhibitors. All these results indicated that the protease isolated from the strain PLI-1 was a thermophilic protease and had a high-temperature stability and a pH stability. 展开更多
关键词 hot spring thermophilic bacterium thermophilic protease identification
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云南和西藏四处热泉中的厚壁菌门多样性 被引量:40
15
作者 宋兆齐 王莉 +1 位作者 刘秀花 梁峰 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期481-486,436,共7页
[目的]厚壁菌门(Firmicutes)在热泉这一极端环境中的多样性目前还缺乏深入细致的研究,故选择国内最具代表性的云南和西藏地区的4处热泉,详细研究其中厚壁菌门的物种和遗传多样性。[方法]采用高通量测序技术、生物统计学和系统发育... [目的]厚壁菌门(Firmicutes)在热泉这一极端环境中的多样性目前还缺乏深入细致的研究,故选择国内最具代表性的云南和西藏地区的4处热泉,详细研究其中厚壁菌门的物种和遗传多样性。[方法]采用高通量测序技术、生物统计学和系统发育分析的手段。[结果]获得的728条厚壁菌门16SrRNA基因序列,可划分为184个可操作分类单元(OTUs)。梭菌纲(Clostridia)在各热泉中都为最优势类群,占到了群落结构的51%~93%;其次是芽孢杆菌纲(Bacilli),它在除洱源2号泉外的其它样点中均存在,群落比例为4%~21%。57%的OTUs与已知序列的最大相似性小于97%,其可能代表了潜在的新物种,而系统发育分析的结果发现了若干全新的高级分类单元。[结论]热泉中蕴含丰富而新颖的厚壁菌门资源。温度是影响研究样点厚壁菌门群落结构的重要因素,温度越低多样性越丰富。 展开更多
关键词 厚壁 多样性 系统发育分析 云南 西藏
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古菌--生命的奥秘(六)--古菌12间
16
作者 郭静 张传伦 《海洋世界》 2021年第12期64-73,共10页
(1)为什么古菌可以在高达100C的陆地热泉和深海热液中生存?嗜热古菌之所以耐高温,原因在于它具有特殊的细胞膜结构、热稳定的蛋白组及受保护的基因组。同时其生活方式多为化能自养,通过摄取无机物等简单物质就可以产生能量。
关键词 深海 细胞膜结构 化能自养 蛋白组 无机物 耐高温
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云南热泉栖热菌属细菌(Thermussp)的质粒研究 被引量:5
17
作者 张加春 张灼 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1996年第2期95-98,共4页
从云南汤池、腾冲热泉(pH7.0~9.0,70~92℃)分离到8株专性嗜热非芽孢杆菌,最适生长温度65~75℃.鉴定为栖热菌属(Thermus),根据生理生化特性测定,8株菌又分为两个群,分离自汤池样点的TA群5株菌... 从云南汤池、腾冲热泉(pH7.0~9.0,70~92℃)分离到8株专性嗜热非芽孢杆菌,最适生长温度65~75℃.鉴定为栖热菌属(Thermus),根据生理生化特性测定,8株菌又分为两个群,分离自汤池样点的TA群5株菌氧化酶阳性,分离自腾冲样点的TB群3株菌,氧化酶阴性.通过质粒快速抽提,琼脂糖凝腋电脉发现,8株菌都含有一个质粒,大小略大于8.5kb. 展开更多
关键词 专性嗜 质粒
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俄罗斯堪察加地区热泉及其周边生境的泉古菌多样性 被引量:2
18
作者 宋兆齐 王莉 +3 位作者 陈金全 周恩民 张传伦 李文均 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期569-576,共8页
【目的】泉古菌为陆地热泉系统的主要古菌类群,可能在自然界生源元素的地球化学循环中发挥着重要作用。本研究旨在揭示俄罗斯堪察加地区热泉以及热泉周边区域的泉古菌多样性,同时基于之前已获得的我国云南地区热泉数据,比较两地区泉古... 【目的】泉古菌为陆地热泉系统的主要古菌类群,可能在自然界生源元素的地球化学循环中发挥着重要作用。本研究旨在揭示俄罗斯堪察加地区热泉以及热泉周边区域的泉古菌多样性,同时基于之前已获得的我国云南地区热泉数据,比较两地区泉古菌群落差异。【方法】通过构建16S rRNA基因片段克隆文库获得序列信息和丰度,随后进行物种多样性、系统发育和群落结构差异分析。【结果】高温热泉Burlyashi Liza(BSL,89℃)中的泉古菌全部属于热变形菌纲(Thermoprotei)内的物种。中温热泉TF Vent 2(TFV,49℃)的群落结构主要由不确定的热变形菌纲类群、不确定的泉古菌类群、高温水环境泉古菌类群Ⅱ(HWCG-Ⅱ)和奇古菌下的Group1.1b类群组成。热泉周边常温环境的主要物种与热泉环境的代表性克隆pJP41一起聚成一个较大的遗传分枝。Jackknife聚类树和主坐标分析(Principal coordinates analysis,PCoA)的结果显示:温度相似的样点,其泉古菌群落结构相对来说更为相似。【结论】俄罗斯堪察加地区与我国云南地区热泉中的泉古菌存在着一定程度上的不同。陆地热泉系统影响着其周边环境的泉古菌类群。热泉中泉古菌群落结构受温度的明显影响。 展开更多
关键词 陆地 周边生境 群落差异 堪察加地区 云南省
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腾冲热海热泉一株无芽孢好热杆菌的分离 被引量:4
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作者 马波 周斌 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1996年第2期99-102,共4页
从腾冲热海热泉二份水样中分离出10株好热菌,经鉴定9株为芽孢杆菌属(Bacillus),另外1株无芽孢,革兰氏染色阴性,杆状,培养后期能形成丝状和具有少数球形细胞,最低生长温度45℃,最适pH8~9,不产色素,和国外... 从腾冲热海热泉二份水样中分离出10株好热菌,经鉴定9株为芽孢杆菌属(Bacillus),另外1株无芽孢,革兰氏染色阴性,杆状,培养后期能形成丝状和具有少数球形细胞,最低生长温度45℃,最适pH8~9,不产色素,和国外报道的X-1株极为相似,初步鉴定为栖热菌属(Thermus).并对热海的热泉和土壤细菌区系做了初步调查分析,探讨了好热菌培养条件. 展开更多
关键词 分离
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云南热泉中氨氧化古菌的accA基因与amoA基因丰度与环境因子NO_2^-和NO_3^-的相关性 被引量:2
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作者 宋兆齐 王莉 +4 位作者 周恩民 王风平 肖湘 张传伦 李文均 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1462-1470,共9页
【目的】氨氧化古菌(ammonia-oxidizing archaea,AOA)可能通过近期刚发现的3-羟基丙酸盐/4-羟基丁酸盐途径(3-hydroxypropionate/4-hydroxybutyrate cycle,HP/HB)来固定CO2,在海洋和土壤环境下进行化能自养型生长。云南热泉系统已被证... 【目的】氨氧化古菌(ammonia-oxidizing archaea,AOA)可能通过近期刚发现的3-羟基丙酸盐/4-羟基丁酸盐途径(3-hydroxypropionate/4-hydroxybutyrate cycle,HP/HB)来固定CO2,在海洋和土壤环境下进行化能自养型生长。云南热泉系统已被证明具有丰富的AOA多样性。本论文旨在调查云南不同热泉中,这种CO2固定途径的关健酶——乙酰辅酶A羧化酶基因acc A和古菌氨单加氧酶基因amo A,及原核微生物16S rRNA基因的丰度变化,以及它们与环境因子的相关性。【方法】选择20处代表性热泉沉积物样品,通过荧光定量PCR技术,获得各目的基因丰度;利用R软件包对各样点地化参数进行主成分分析(Principal Component Analysis,PCA),并通过Mantel test检验各目的基因和地化参数间的相关性。【结果】细菌和古菌16S rRNA基因的丰度范围分别在6.6×107至4.19×1011和1.27×106至1.51×1011拷贝/g沉积物;古菌acc A和amo A基因的丰度范围为8.89×103至6.49×105和7.64×103至4.36×105拷贝/g沉积物,Mantel test结果显示acc A和amo A基因丰度间具有极显著的相关性(R=0.98,P<0.001),两者又分别都与热泉内的NO2-和NO3-浓度存在显著相关,与p H值等其它环境因子没有明显统计学意义上的相关性。【结论】云南地区热泉间的细菌和古菌丰度,以及两者比例关系都存在较大差异;相关性的统计结果进一步证明了热泉环境下的氨氧化古菌是通过HP/HB途径进行CO2固定;本次研究并未发现氨氧化古菌的丰度与环境p H存在明显统计学意义上的相关性,这与常温土壤环境的相关研究结果存在不同。 展开更多
关键词 云南 原核微生物丰度 氨氧化古 accA基因 AMOA基因 荧光定量PCR
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