ALKBH5在肾透明细胞癌中的表达水平及临床意义

目的采用生物信息学方法探讨肾透明细胞癌(KIRC)组织中烷烃羟化酶同源5基因(ALKBH5)mRNA和蛋白的表达及临床意义。方法下载UCSC Xena数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中KIRC、乳头状肾细胞癌(KIRP)、嫌色细胞癌(KICH)的转录组测序(RNAseq)数据、临床病理参数和总生存期数据,并下载基因型和基因表达量关联数据库(GTEx)中对应的正常组织数据。比较KIRC组织及癌旁组织中ALKBH5 mRNA表达水平,分析ALKBH5 mRNA表达水平与不同临床病理学指标的关系;绘制ROC曲线分析ALKBH5 mRNA表达水平对KIRC的诊断价值;利用阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析数据库(UALCAN)分析ALKBH5蛋白表达水平与不同临床病理学指标的关系,比较ALKBH5 m RNA表达水平对患者预后的影响;利用LinkedOmics数据库行基因富集分析ALKBH5在KIRC中可能参与的信号通路。结果与癌旁组织相比,KIRC组织中ALKBH5 mRNA和蛋白均显著高表达(均P<0.05)。不同年龄、种族、病理分期、组织学分级、肿瘤发生部位KIRC患者组织中ALKBH5 mRNA表达水平比较,差异均无统计学意义(均P>0.05)。女性KIRC患者组织中ALKBH5mRNA和蛋白表达水平均显著高于男性患者(均P<0.05),A亚型KIRC患者组织中ALKBH5 mRNA表达水平显著高于B亚型患者(P<0.01)。酵母交换型转换/蔗糖不发酵(SWI/SNF)染色质重塑复合物突变组患者ALKBH5蛋白表达水平显著高于SWI/SNF复合物未突变组患者(P<0.01)。ROC曲线分析显示,ALKBH5 mRNA表达水平诊断KIRC的AUC为0.813,显著高于KIRP(AUC=0.605)和KICH(AUC=0.707)(均P<0.05)。相较ALKBH5 mRNA低表达组,ALKBH5 m RNA高表达组总生存率显著升高(P<0.01);男性KIRC患者ALKBH5 mRNA表达水平与预后无关(P>0.05),而女性KIRC患者ALKBH5 m RNA高表达组总生存率显著高于低表达组(P<0.05)。富集分析显示,ALKBH5 mRNA表达相关的基因可能参与糖酵解、果糖和甘露糖代谢、氨基酸生物合成等信号通路。结论ALKBH5 mRNA和蛋白表达水平在KIRC中具有较高的诊断、预后评估价值,可能通过糖酵解信号通路发挥作用。ALKBH5 mRNA可能成为判定KIRC患者预后的分子标志物和新的治疗靶点。