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熊蜂生假丝酵母启动子的筛选及强度分析
1
作者
石依博
张利华
+4 位作者
张敏
夏媛媛
杨海泉
沈微
陈献忠
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期3569-3579,共11页
【背景】熊蜂生假丝酵母(Starmerella bombicola)作为一种非常规假丝酵母菌株,因其具备高产槐糖脂生物表面活性剂的能力而受到广泛关注。然而,由于自身的表达系统并不完善,限制了该菌株的代谢工程改造。【目的】克隆、筛选及鉴定新的系...
【背景】熊蜂生假丝酵母(Starmerella bombicola)作为一种非常规假丝酵母菌株,因其具备高产槐糖脂生物表面活性剂的能力而受到广泛关注。然而,由于自身的表达系统并不完善,限制了该菌株的代谢工程改造。【目的】克隆、筛选及鉴定新的系列内源启动子表达元件。【方法】通过对比分析熊蜂生假丝酵母全基因组及9种功能已知目的基因信息,并结合启动子预测网站,筛选获得系列启动子候选序列,以SbGFP (密码子优化后的酵母增强型绿色荧光蛋白)为报告基因进行整合表达,通过绿色荧光蛋白强度及转录水平分析鉴定启动子强度。【结果】在分别以葡萄糖和油酸作为唯一碳源的条件下,启动子PTEF1和PGPD在不同碳源培养条件下均显示出较高的转录水平。启动子PCYP52M1、PUGTA1、PUGTB1及PMOB在以油酸为唯一碳源时具有弱转录活性,而在以葡萄糖为唯一碳源时则未检测到它们具有转录活性,推测它们是油酸诱导型启动子。进一步利用实时荧光定量PCR (RT-qPCR)对SbGFP进行转录水平分析,检测结果与绿色荧光表达水平一致。【结论】获得了系列熊蜂生假丝酵母内源性启动子,进一步丰富了该菌株的表达元件,为菌株的代谢工程改造及基因的表达与调控奠定了理论基础。
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关键词
熊蜂生假丝酵母
启动子
密码子优化
绿色荧光蛋白
基因表达与调控
原文传递
代谢改造熊蜂生假丝酵母提高酸型槐糖脂产量
2
作者
张疆睿
张利华
+3 位作者
石依博
沈微
樊游
陈献忠
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期2094-2106,共13页
【目的】槐糖脂是一类生物表面活性剂,不仅具有常规表面活性剂所具有的增溶、乳化、润湿、发泡、分散、降低表面张力等通用性能,且对环境的耐受性极强。熊蜂生假丝酵母(Starmerella bombicola)能够发酵生产槐糖脂,但槐糖脂具有酸型、内...
【目的】槐糖脂是一类生物表面活性剂,不仅具有常规表面活性剂所具有的增溶、乳化、润湿、发泡、分散、降低表面张力等通用性能,且对环境的耐受性极强。熊蜂生假丝酵母(Starmerella bombicola)能够发酵生产槐糖脂,但槐糖脂具有酸型、内酯型和乙酰化型等不同类型,结构多样,难以分离。本文拟通过代谢工程改造,构建高产酸型槐糖脂的熊蜂生假丝酵母工程菌株。【方法】利用潮霉素抗性基因构建了标记基因重复利用系统Rec-six基因编辑系统,在此基础上将合成内酯型槐糖脂的关键基因--内酯酶基因SBLE敲除获得一株只产酸型槐糖脂的工程菌株Δsble,进一步同源过量表达葡萄糖基转移酶基因UGTB并敲除过氧化物酶体膜转运蛋白编码基因PXA1,构建了高产酸型槐糖脂的酵母工程菌。【结果】与出发菌株相比,重组熊蜂生假丝酵母发酵油酸能够合成单一的酸型槐糖脂,而不再合成内酯型槐糖脂,同时酸型槐糖脂的产量由20 g/L提高到44 g/L,提高了2.1倍。【结论】通过敲除PXA1、SBLE和过表达UGTB来改造熊蜂生假丝酵母,能够有效提高重组菌的酸型槐糖脂产量,为发酵法生产酸型槐糖脂奠定了基础。
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关键词
熊蜂生假丝酵母
酸型槐糖脂
内酯酶
代谢工程
Rec-six
原文传递
题名
熊蜂生假丝酵母启动子的筛选及强度分析
1
作者
石依博
张利华
张敏
夏媛媛
杨海泉
沈微
陈献忠
机构
江南大学生物工程学院工业生物技术教育部重点实验室
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期3569-3579,共11页
基金
江苏省自然科学基金(BK20171138)。
文摘
【背景】熊蜂生假丝酵母(Starmerella bombicola)作为一种非常规假丝酵母菌株,因其具备高产槐糖脂生物表面活性剂的能力而受到广泛关注。然而,由于自身的表达系统并不完善,限制了该菌株的代谢工程改造。【目的】克隆、筛选及鉴定新的系列内源启动子表达元件。【方法】通过对比分析熊蜂生假丝酵母全基因组及9种功能已知目的基因信息,并结合启动子预测网站,筛选获得系列启动子候选序列,以SbGFP (密码子优化后的酵母增强型绿色荧光蛋白)为报告基因进行整合表达,通过绿色荧光蛋白强度及转录水平分析鉴定启动子强度。【结果】在分别以葡萄糖和油酸作为唯一碳源的条件下,启动子PTEF1和PGPD在不同碳源培养条件下均显示出较高的转录水平。启动子PCYP52M1、PUGTA1、PUGTB1及PMOB在以油酸为唯一碳源时具有弱转录活性,而在以葡萄糖为唯一碳源时则未检测到它们具有转录活性,推测它们是油酸诱导型启动子。进一步利用实时荧光定量PCR (RT-qPCR)对SbGFP进行转录水平分析,检测结果与绿色荧光表达水平一致。【结论】获得了系列熊蜂生假丝酵母内源性启动子,进一步丰富了该菌株的表达元件,为菌株的代谢工程改造及基因的表达与调控奠定了理论基础。
关键词
熊蜂生假丝酵母
启动子
密码子优化
绿色荧光蛋白
基因表达与调控
Keywords
Starmerella bombicola
promoter
codon optimization
SbGFP
gene expression and regulation
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
Q939.9 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
代谢改造熊蜂生假丝酵母提高酸型槐糖脂产量
2
作者
张疆睿
张利华
石依博
沈微
樊游
陈献忠
机构
江南大学生物工程学院工业生物技术教育部重点实验室
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期2094-2106,共13页
基金
江苏省自然科学基金(BK20171138)~~
文摘
【目的】槐糖脂是一类生物表面活性剂,不仅具有常规表面活性剂所具有的增溶、乳化、润湿、发泡、分散、降低表面张力等通用性能,且对环境的耐受性极强。熊蜂生假丝酵母(Starmerella bombicola)能够发酵生产槐糖脂,但槐糖脂具有酸型、内酯型和乙酰化型等不同类型,结构多样,难以分离。本文拟通过代谢工程改造,构建高产酸型槐糖脂的熊蜂生假丝酵母工程菌株。【方法】利用潮霉素抗性基因构建了标记基因重复利用系统Rec-six基因编辑系统,在此基础上将合成内酯型槐糖脂的关键基因--内酯酶基因SBLE敲除获得一株只产酸型槐糖脂的工程菌株Δsble,进一步同源过量表达葡萄糖基转移酶基因UGTB并敲除过氧化物酶体膜转运蛋白编码基因PXA1,构建了高产酸型槐糖脂的酵母工程菌。【结果】与出发菌株相比,重组熊蜂生假丝酵母发酵油酸能够合成单一的酸型槐糖脂,而不再合成内酯型槐糖脂,同时酸型槐糖脂的产量由20 g/L提高到44 g/L,提高了2.1倍。【结论】通过敲除PXA1、SBLE和过表达UGTB来改造熊蜂生假丝酵母,能够有效提高重组菌的酸型槐糖脂产量,为发酵法生产酸型槐糖脂奠定了基础。
关键词
熊蜂生假丝酵母
酸型槐糖脂
内酯酶
代谢工程
Rec-six
Keywords
Starmerella bombicola
acid-type sophorolipid
lactone
metabolic engineering
Rec-six
分类号
S89 [农业科学—特种经济动物饲养]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
熊蜂生假丝酵母启动子的筛选及强度分析
石依博
张利华
张敏
夏媛媛
杨海泉
沈微
陈献忠
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
原文传递
2
代谢改造熊蜂生假丝酵母提高酸型槐糖脂产量
张疆睿
张利华
石依博
沈微
樊游
陈献忠
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
原文传递
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