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基于网络药理学技术探讨熟地黄-山茱萸药对在缺血性脑卒中后遗症期的治疗机制研究
被引量:
24
1
作者
王瀚泽
高歌
+4 位作者
杨芊芊
侯晓梦
李冰琪
李强
司银楚
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第24期6020-6027,共8页
在缺血性脑卒中后遗症期,熟地黄-山茱萸药对具有保护已损伤的神经元作用,但其治疗机制仍未阐明。该研究以网络药理学作为研究方法,预测熟地黄和山茱萸在缺血性脑卒中后遗症期对神经保护的作用机制。经数据库查找及文献检索,获得熟地黄...
在缺血性脑卒中后遗症期,熟地黄-山茱萸药对具有保护已损伤的神经元作用,但其治疗机制仍未阐明。该研究以网络药理学作为研究方法,预测熟地黄和山茱萸在缺血性脑卒中后遗症期对神经保护的作用机制。经数据库查找及文献检索,获得熟地黄和山茱萸中40个有效成分,利用STITCH与TCMSP数据库得到有效成分作用靶点,并通过OMIM,GAD,TTD和DrugBank数据库获取缺血性脑卒中后遗症治疗靶点,取二者交集,得到21个潜在作用靶点。利用DAVID数据库对潜在靶点进行GO富集分析及KEGG通路分析。GO富集分析发现,熟地黄与山茱萸通过调节血压、对凋亡信号的负调控、血管生成等来发挥作用。KEGG通路分析发现,熟地黄和山茱萸可调节HIF-VEGFA神经干细胞增殖信号通路、TNF通路和NF-kappaB炎症反应通路、apoptosis凋亡信号通路。采用分子对接技术验证了熟地黄和山茱萸中成分与潜在靶点具有较好的结合活性。该研究结果表明熟地黄-山茱萸药对在缺血性脑卒中后遗症阶段,对神经功能的恢复、促神经干细胞增殖、血管生成、抗神经细胞凋亡和调节炎症因子起到了一定的作用。
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关键词
缺血性脑卒中后遗症期
熟地黄-山茱萸
网络药理学
潜在靶点
KEGG通路分析
原文传递
基于数据挖掘和网络药理学探讨中医药治疗糖尿病牙周炎的组方规律及作用机制
2
作者
李惠菁
郜然然
+3 位作者
刘敏
魏静
何翔
吴也可
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期1600-1610,共11页
目的挖掘中医药治疗糖尿病牙周炎(diabetic periodontitis,DP)的组方规律,并探讨核心药物组合的作用机制。方法以中国知网、万方数据库、维普中文期刊、中国生物医学文献服务系统收录的中医药治疗DP文献为资料来源,建立DP处方信息数据库...
目的挖掘中医药治疗糖尿病牙周炎(diabetic periodontitis,DP)的组方规律,并探讨核心药物组合的作用机制。方法以中国知网、万方数据库、维普中文期刊、中国生物医学文献服务系统收录的中医药治疗DP文献为资料来源,建立DP处方信息数据库,运用Excel 2021、SPSS Modeler 18.0和SPSS Statistics 26.0,对纳入中药进行频次、功效分类、性味归经统计,并进行关联规则分析和聚类分析,筛选出核心药物组合;通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、HERB获取核心药物组合的活性成分,预测药物作用靶点;运用GeneCards预测疾病相关靶点;运用Venny平台得到疾病与药物的交集靶点;运用Cytoscape建立“活性成分-靶点”网络,筛选出关键成分;以STRING平台数据为基础,利用Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选核心靶点;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;采用AutoDockVina对关键成分与核心靶点进行分子对接。结果共纳入中医药治疗DP文献36篇,提取方剂50首,涉及药物100味;最常见的药物有泽泻、熟地黄、黄芪等,使用最多的药物类别为补虚药,药性以寒、温为主,药味以甘、苦味为主,归经以肾、肝经居多,系统聚类分析可归为6大类;筛选出牡丹皮-山茱萸-熟地黄为核心药物组合,涉及18个活性成分、164个作用靶点,与DP有104个交集靶点;槲皮素、豆甾醇、山奈酚、β-谷甾醇、四氢鸭脚木碱、谷甾醇等为核心成分,AKT1、IL-6、TNF、IL-1B、PTGS2、JUN、TP53、ESR1、MMP9等为关键靶点;GO分析得到生物过程3724项、细胞组成228项、分子功能404项;KEGG分析显示主要涉及235条信号通路;分子对接显示关键靶点与核心成分具有良好亲和力。结论DP的中医治法主要以补虚为主,兼以清热利湿、活血化瘀、益气养阴,核心药物组合牡丹皮-山茱萸-熟地黄可通过多成分、多靶点、多通路治疗DP,为临床诊疗提供参考。
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关键词
糖尿病牙周炎
组方规律
补虚
牡丹皮
-
山茱萸
-
熟地黄
作用机制
数据挖掘
网络药理学
分子对接
下载PDF
职称材料
题名
基于网络药理学技术探讨熟地黄-山茱萸药对在缺血性脑卒中后遗症期的治疗机制研究
被引量:
24
1
作者
王瀚泽
高歌
杨芊芊
侯晓梦
李冰琪
李强
司银楚
机构
北京中医药大学中药学院
北京中医药大学中医学院
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第24期6020-6027,共8页
基金
国家自然科学基金项目(81373830)。
文摘
在缺血性脑卒中后遗症期,熟地黄-山茱萸药对具有保护已损伤的神经元作用,但其治疗机制仍未阐明。该研究以网络药理学作为研究方法,预测熟地黄和山茱萸在缺血性脑卒中后遗症期对神经保护的作用机制。经数据库查找及文献检索,获得熟地黄和山茱萸中40个有效成分,利用STITCH与TCMSP数据库得到有效成分作用靶点,并通过OMIM,GAD,TTD和DrugBank数据库获取缺血性脑卒中后遗症治疗靶点,取二者交集,得到21个潜在作用靶点。利用DAVID数据库对潜在靶点进行GO富集分析及KEGG通路分析。GO富集分析发现,熟地黄与山茱萸通过调节血压、对凋亡信号的负调控、血管生成等来发挥作用。KEGG通路分析发现,熟地黄和山茱萸可调节HIF-VEGFA神经干细胞增殖信号通路、TNF通路和NF-kappaB炎症反应通路、apoptosis凋亡信号通路。采用分子对接技术验证了熟地黄和山茱萸中成分与潜在靶点具有较好的结合活性。该研究结果表明熟地黄-山茱萸药对在缺血性脑卒中后遗症阶段,对神经功能的恢复、促神经干细胞增殖、血管生成、抗神经细胞凋亡和调节炎症因子起到了一定的作用。
关键词
缺血性脑卒中后遗症期
熟地黄-山茱萸
网络药理学
潜在靶点
KEGG通路分析
Keywords
ischemic stroke sequela phase
Rehmanniae Radix Praeparata
-
Corni Fructus
network pharmacology
potential targets
KEGG pathway analysis
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
基于数据挖掘和网络药理学探讨中医药治疗糖尿病牙周炎的组方规律及作用机制
2
作者
李惠菁
郜然然
刘敏
魏静
何翔
吴也可
机构
成都中医药大学临床医学院
河南省人民医院妇科
成都中医药大学附属医院妇科
成都中医药大学附属医院口腔科
出处
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期1600-1610,共11页
基金
国家自然科学基金项目(81973684)
四川省自然科学基金项目(23NSFSC2574)
成都中医药大学杏林学者青年进阶人才专项(QJJJ2023005)。
文摘
目的挖掘中医药治疗糖尿病牙周炎(diabetic periodontitis,DP)的组方规律,并探讨核心药物组合的作用机制。方法以中国知网、万方数据库、维普中文期刊、中国生物医学文献服务系统收录的中医药治疗DP文献为资料来源,建立DP处方信息数据库,运用Excel 2021、SPSS Modeler 18.0和SPSS Statistics 26.0,对纳入中药进行频次、功效分类、性味归经统计,并进行关联规则分析和聚类分析,筛选出核心药物组合;通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、HERB获取核心药物组合的活性成分,预测药物作用靶点;运用GeneCards预测疾病相关靶点;运用Venny平台得到疾病与药物的交集靶点;运用Cytoscape建立“活性成分-靶点”网络,筛选出关键成分;以STRING平台数据为基础,利用Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选核心靶点;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;采用AutoDockVina对关键成分与核心靶点进行分子对接。结果共纳入中医药治疗DP文献36篇,提取方剂50首,涉及药物100味;最常见的药物有泽泻、熟地黄、黄芪等,使用最多的药物类别为补虚药,药性以寒、温为主,药味以甘、苦味为主,归经以肾、肝经居多,系统聚类分析可归为6大类;筛选出牡丹皮-山茱萸-熟地黄为核心药物组合,涉及18个活性成分、164个作用靶点,与DP有104个交集靶点;槲皮素、豆甾醇、山奈酚、β-谷甾醇、四氢鸭脚木碱、谷甾醇等为核心成分,AKT1、IL-6、TNF、IL-1B、PTGS2、JUN、TP53、ESR1、MMP9等为关键靶点;GO分析得到生物过程3724项、细胞组成228项、分子功能404项;KEGG分析显示主要涉及235条信号通路;分子对接显示关键靶点与核心成分具有良好亲和力。结论DP的中医治法主要以补虚为主,兼以清热利湿、活血化瘀、益气养阴,核心药物组合牡丹皮-山茱萸-熟地黄可通过多成分、多靶点、多通路治疗DP,为临床诊疗提供参考。
关键词
糖尿病牙周炎
组方规律
补虚
牡丹皮
-
山茱萸
-
熟地黄
作用机制
数据挖掘
网络药理学
分子对接
Keywords
Diabetic periodontitis
prescription rule
tonifying deficiency
Moutan Cortes
-
Corni Fructus
-
Rehmanniae Radix Praeparata
mechanism of action
data mining
network pharmacology
molecular docking
分类号
R285.6 [医药卫生—中药学]
R285.5 [医药卫生—中药学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学技术探讨熟地黄-山茱萸药对在缺血性脑卒中后遗症期的治疗机制研究
王瀚泽
高歌
杨芊芊
侯晓梦
李冰琪
李强
司银楚
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
24
原文传递
2
基于数据挖掘和网络药理学探讨中医药治疗糖尿病牙周炎的组方规律及作用机制
李惠菁
郜然然
刘敏
魏静
何翔
吴也可
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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