通过病例-父母对照研究对基因环境交互作用进行估计

目的介绍基于似然比检验(LRT)的对数线性模型在病例-父母对照研究中分析基因环境交互作用的应用。方法以新生儿肺不张(NPA)病例中新生儿肺泡表面活性物质相关蛋白A(SPA)基因A186G多态性与新生儿出生1周内呼吸道病毒感染的交互作用的拟合数据为例,以LRT为基础,采用对数线性模型,利用LEM软件进行统计分析。结果新生儿SPA基因A186G多态性与NPA发生相关(P<0.01),基因型AG、GG的新生儿发生肺不张的风险较AA基因型的新生儿显著降低;但AG、GG基因型与呼吸道病毒感染的交互作用会增加其发生NPA的风险。结论对数线性模型适用于病例-父母对照研究中基因与环境的交互作用的检验,并且能够估计交互效应以及基因的单独效应;该方法可用于妊娠期疾病与胚胎源性疾病的病因学研究。

对数线性模型在病例-父母对照研究中的应用

介绍应用对数线性模型分析病例一父母对照研究设计的方法。以亚甲基四氢叶酸还原酶基因（MTHFR）c677T与唇腭裂的关联研究为例，应用对数线性模型分析母亲、子代基因及其交互作用与唇腭裂的关系。结果显示变异型纯合子母亲的子代发生唇腭裂的风险低于野生型纯合子母亲的子代，S2=0．43（95％CI：0．19～0．95），未发现唇腭裂与子代基因及母子交互作用相关。应用对数线性模型分析病例一父母对照研究设计的方法尤其适用于妊娠期疾病与源于胚胎时期疾病等的病因学研究。

基于熵理论的病例父母亲对照研究来精细定位(英文)

原始的连锁不平衡熵指数通过比较群体样本中标记熵和条件熵来定位疾病位点或数量性状位点.它可能受群体混杂的影响.而利用病例父母亲对照研究或其他的家系研究可以避免群体混杂的影响.本文拓展了连锁不平衡熵指数到病例父母亲数据,将没有传递给受累子代的父母亲的基因型视为对照样本.随机模拟的结果表明连锁不平衡熵指数适用家系研究.

中国人MTHFR基因多态性与神经管畸形遗传易感性

目的 :应用分子生物学方法进行遗传流行病学研究 ,探讨MTHFR基因多态性在神经管畸形的遗传易感性中的作用。方法 :应用PCR RFLP方法检测MTHFR热敏感性基因型 ;对18个NTD核心家庭进行以父母为对照的病例对照研究,计算TDT和HHRR ;另外对31例NTD胎儿和62例正常成年人进行的成组病例对照研究 ,计算MTHFR纯合突变对NTD的比值比。结果 :核心家庭分析结果 :比值比OR=3 2 ,95 %CI=1 120～11 169 ;TDT( χ2)=5 762 ,P<0 05 ,HHRR(成组χ2)=6 727 ,P<0 05 ;胎儿MTHFR纯合突变对NTD的相对危险度OR=3 21,P<0 05。结论 :研究结果说明 ,突变等位基因在神经管畸形核心家庭中存在突变基因(T)的遗传失衡现象 ,胎儿MTHFR基因第677位核苷酸的多态性是中国人NTD遗传易感性因素之一。

转化生长因子α基因多态性与唇腭裂关联的研究

目的探讨中国部分地区人群非综合征型唇裂伴或不伴腭裂(nsCL/P)与转化生长因子α基因(TGFα)TaqⅠ位点多态性之间的关系。方法采用聚合酶链反应-限制片段长度多态性分析方法,对149个nsCL/P核心家庭成员DNA标本进行TGFαTaqⅠ突变位点的基因型检测。利用传递失衡检验和以家庭为基础的关联研究(FBAT)方法,分析TGFαTaqⅠ突变与nsCL/P发生之间的关系。结果未发现TGFαTaqⅠ突变的致病C2等位基因在nsCL/P核心家庭成员中存在传递不平衡(P>0.05);采用FBAT分析,未发现C2等位基因及C2C1基因型与nsCL/P发病危险之间关联有统计学意义(P>0.05)。结论TGFαTaqⅠ突变可能不是中国部分地区人群nsCL/P发生的易感基因。