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青海省同德牦牛群体的父系遗传多样性及遗传背景探析
被引量:
1
1
作者
李广祯
马志杰
+5 位作者
陈生梅
林元
李瑞哲
刘书杰
杨国太
周桑加
《中国牛业科学》
2021年第6期41-46,共6页
[目的]为从分子水平上揭示青海省同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构和遗传背景。[方法]本研究对32头同德公牦牛使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)进行PCR扩增、测序和分型,使用BioE...
[目的]为从分子水平上揭示青海省同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构和遗传背景。[方法]本研究对32头同德公牦牛使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)进行PCR扩增、测序和分型,使用BioEdit、Arlequin和Network等生物信息学软件综合分析同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[结果]32头同德牦牛5个Y-SNPs标记即SRY4(969 bp)、USP9Y(470 bp)、UTY19(290 bp)、AMELY3(971 bp)和OFD1Y10(763 bp)的PCR扩增产物测序长度与先前研究结果一致,INRA189标记分型分析共检测到155 bp、157 bp和159 bp 3个等位基因;在同德牦牛群体AMELY3标记中检测到一个新的Y-SNP位点(即g.719 C>T);基于5个Y-SNPs标记11个Y-SNPs位点和INRA189标记3个等位基因的联合分型,共确定了6种Y染色体单倍型(即Y1H1、Y1H2、Y1H3、Y1H4、Y1H5和Y2H6),Y染色体单倍型多样度(Hd)为0.714±0.060,表明同德牦牛具有丰富的父系遗传多样性;系统发育分析显示同德牦牛由2个父系支系组成(即Y1和Y2),提示其拥有2个父系起源。[结论]同德牦牛拥有特殊的父系遗传信息,具有丰富的父系遗传多样性,由2个父系支系组成,拥有2个父系起源。
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关键词
牦牛
Y-SNP
Y-STR
父系遗传多样性
群体
遗传
结构
起源
下载PDF
职称材料
互助白牦牛与天祝白牦牛父系遗传差异分析
2
作者
魏旭东
马志杰
+3 位作者
陈生梅
何得仓
赵金财
梁育林
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第13期120-124,共5页
为探究青海省互助白牦牛与甘肃省天祝白牦牛间的父系遗传差异,试验使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)对32头互助白牦牛和34头天祝白牦牛进行PCR扩增、测序和分型分析,使用BioEdit 7.2.5、...
为探究青海省互助白牦牛与甘肃省天祝白牦牛间的父系遗传差异,试验使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)对32头互助白牦牛和34头天祝白牦牛进行PCR扩增、测序和分型分析,使用BioEdit 7.2.5、Arlequin 3.11和Network 10.1等软件综合分析2个白牦牛品种(群体)的父系遗传多样性、群体结构、分化状况及遗传背景。结果表明:在2个白牦牛品种(群体)中共确定了5种Y染色体单倍型。其中,在互助白牦牛中共确定了4种Y染色体单倍型,即H1Y1、H10Y1、H11Y2和H12Y2;在天祝白牦牛中共确定了5种Y染色体单倍型,即H1Y1、H10Y1、H11Y2、H12Y2和H13Y2。互助白牦牛和天祝白牦牛Y染色体单倍型多样度分别为0.7500±0.0349和0.6881±0.0614。2个白牦牛品种(群体)间的固定分化指数值为0.0186,无显著遗传分化(P>0.05)。2个白牦牛品种(群体)均由Y1、Y2两个父系支系(单倍型组)组成,天祝白牦牛以Y1支系(单倍型组,59%)为主,互助白牦牛以Y2支系(单倍型组,56%)为主。说明天祝白牦牛和互助白牦牛都具有丰富的父系遗传多样性,但互助白牦牛的父系遗传多样性水平略高于天祝白牦牛;2个白牦牛品种(群体)间父系遗传分化程度很低;白牦牛有两个父系起源,天祝白牦牛和互助白牦牛均由Y1、Y2两个父系支系(单倍型组)组成,但二者分别以Y1、Y2为优势支系(单倍型组),父系遗传结构存在一定程度的差异。
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关键词
互助白牦牛
天祝白牦牛
父系遗传多样性
群体结构
起源
原文传递
题名
青海省同德牦牛群体的父系遗传多样性及遗传背景探析
被引量:
1
1
作者
李广祯
马志杰
陈生梅
林元
李瑞哲
刘书杰
杨国太
周桑加
机构
青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室
青海省同德县农牧和水利局
出处
《中国牛业科学》
2021年第6期41-46,共6页
基金
中国科学院“西部之光”人才培养引进计划(“西部青年学者”)项目(3-1)
国家自然科学基金项目(31960656)。
文摘
[目的]为从分子水平上揭示青海省同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构和遗传背景。[方法]本研究对32头同德公牦牛使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)进行PCR扩增、测序和分型,使用BioEdit、Arlequin和Network等生物信息学软件综合分析同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[结果]32头同德牦牛5个Y-SNPs标记即SRY4(969 bp)、USP9Y(470 bp)、UTY19(290 bp)、AMELY3(971 bp)和OFD1Y10(763 bp)的PCR扩增产物测序长度与先前研究结果一致,INRA189标记分型分析共检测到155 bp、157 bp和159 bp 3个等位基因;在同德牦牛群体AMELY3标记中检测到一个新的Y-SNP位点(即g.719 C>T);基于5个Y-SNPs标记11个Y-SNPs位点和INRA189标记3个等位基因的联合分型,共确定了6种Y染色体单倍型(即Y1H1、Y1H2、Y1H3、Y1H4、Y1H5和Y2H6),Y染色体单倍型多样度(Hd)为0.714±0.060,表明同德牦牛具有丰富的父系遗传多样性;系统发育分析显示同德牦牛由2个父系支系组成(即Y1和Y2),提示其拥有2个父系起源。[结论]同德牦牛拥有特殊的父系遗传信息,具有丰富的父系遗传多样性,由2个父系支系组成,拥有2个父系起源。
关键词
牦牛
Y-SNP
Y-STR
父系遗传多样性
群体
遗传
结构
起源
Keywords
yak
Y SNP
Y STR
paternal genetic diversity
population genetic structure
origin
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
互助白牦牛与天祝白牦牛父系遗传差异分析
2
作者
魏旭东
马志杰
陈生梅
何得仓
赵金财
梁育林
机构
青海大学畜牧兽医科学院
青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室
海东市互助县畜牧兽医站
海东市互助县巴扎乡畜牧兽医站
天祝藏族自治县畜牧技术推广站
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第13期120-124,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31960656)
中国科学院“西部之光”人才培养引进计划项目(3-1)。
文摘
为探究青海省互助白牦牛与甘肃省天祝白牦牛间的父系遗传差异,试验使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)对32头互助白牦牛和34头天祝白牦牛进行PCR扩增、测序和分型分析,使用BioEdit 7.2.5、Arlequin 3.11和Network 10.1等软件综合分析2个白牦牛品种(群体)的父系遗传多样性、群体结构、分化状况及遗传背景。结果表明:在2个白牦牛品种(群体)中共确定了5种Y染色体单倍型。其中,在互助白牦牛中共确定了4种Y染色体单倍型,即H1Y1、H10Y1、H11Y2和H12Y2;在天祝白牦牛中共确定了5种Y染色体单倍型,即H1Y1、H10Y1、H11Y2、H12Y2和H13Y2。互助白牦牛和天祝白牦牛Y染色体单倍型多样度分别为0.7500±0.0349和0.6881±0.0614。2个白牦牛品种(群体)间的固定分化指数值为0.0186,无显著遗传分化(P>0.05)。2个白牦牛品种(群体)均由Y1、Y2两个父系支系(单倍型组)组成,天祝白牦牛以Y1支系(单倍型组,59%)为主,互助白牦牛以Y2支系(单倍型组,56%)为主。说明天祝白牦牛和互助白牦牛都具有丰富的父系遗传多样性,但互助白牦牛的父系遗传多样性水平略高于天祝白牦牛;2个白牦牛品种(群体)间父系遗传分化程度很低;白牦牛有两个父系起源,天祝白牦牛和互助白牦牛均由Y1、Y2两个父系支系(单倍型组)组成,但二者分别以Y1、Y2为优势支系(单倍型组),父系遗传结构存在一定程度的差异。
关键词
互助白牦牛
天祝白牦牛
父系遗传多样性
群体结构
起源
Keywords
Huzhu white yaks
Tianzhu white yaks
paternal genetic diversity
population structure
origin
分类号
S813.1 [农业科学—畜牧学]
S823.85 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
青海省同德牦牛群体的父系遗传多样性及遗传背景探析
李广祯
马志杰
陈生梅
林元
李瑞哲
刘书杰
杨国太
周桑加
《中国牛业科学》
2021
1
下载PDF
职称材料
2
互助白牦牛与天祝白牦牛父系遗传差异分析
魏旭东
马志杰
陈生梅
何得仓
赵金财
梁育林
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022
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