利用扩增片断长度多态性技术分析长江刀鲚的遗传多样性

利用AFLP技术对我国长江南京潜州江段捕获的野生刀鲚（Coilia nasus）资源的遗传多样性进行了分析．筛选出扩增片段多、条带清晰的3对EcoRI／Mse I引物组合，在34尾个体中共扩增出118条清晰的片段，分子量大小在200～1500bp之间，其中多态位点67个，多态性比例为56．78％．种群Nei基因多样性指数为0．2183，Shannon多样性指数为0．3204；种群内遗传距离在0．1263～O．4012之间，显示目前长江刀鲚野生群体的遗传多样性比较丰富．

羊草种群遗传分化的RAPD分析I:扩增片段频率的变化

松嫩草原上分布着灰绿型和黄绿型两种叶色类型的羊草。为进一步明确这两种叶色类型种群分化的分子基础 ,对其 9个种群 1 0 5个个体进行了RAPD分析。 1 5个随机引物 ( 1 0nt)共扩增出 1 49个多态性片段 ,总的多态位点为 96.1 % ;黄绿型与灰绿型种群间在 1 0 .1 %的多态性片段上明显不同 ;相似生境或同一地域的种群在一些位点上表现出相似或相同的变化 ;

“锦绣”、“丰黄”黄桃变异株的SRAP分析

应用SRAP技术对"锦绣"黄桃、"丰黄"黄桃及其相应变异株系等7个材料进行了分析。从40对引物组合中筛选出2对引物在"丰黄"及变异株"锦黄"之间有明显扩增带差异,表明遗传变异已发生。分别纯化、克隆、测序这些特异条带,分析序列预测所示基因,并设计引物将其转化为稳定SCAR标记。应用特异的SCAR标记可快速检测鉴定相应变异株,进一步验证了变异的存在。试验未筛选到合适引物可区分"锦绣"及其变异株系。

我国引进条斑星鲽群体遗传多样性的AFLP分析

应用AFLP技术对我国条斑星鲽引进群体（烟台、大连和莱州）共63尾个体的遗传多样性及遗传变异进行分析，计算了3个群体间的遗传相似性指数和遗传距离，并构建了UPGMA系统发生树。10个引物组合在3个群体中共扩增到827个位点，大小位于50-700bp。每个引物组合扩增到的多态性条带在8到37条之间不等，平均为17．9个。3个群体的多态性位点比例分别为29．14％、15．60％和20．31％；Shannon多样性指数分别为0．1799、0．0949和0．1231；Nei基因多样性指数分别为0．1225、0．0658和0．0848。3个条斑星鲽引进群体的遗传多样性水平，烟台引进群体最高，莱州引进群体次之，大连引进群体最低，但总体水平均较低。烟台引进群体与大连引进群体间的遗传距离最大为0．0230，莱州引进群体与大连引进群体间的遗传距离最小为0．0129。3个引进群体间的遗传分化系数（Gst）为0．219，表明3个引进群体之间发生了一定程度的分化。

红花檵木的AFLP分析及分类

采用荧光AFLP技术，对所收集的22个红花檵木材料和变异类型进行分类与亲缘关系研究．从64对引物组合中筛选出8对引物组合进行扩增，共扩增出1226条带，多态条带1085条，多态性比率为88．5％．冬艳紫红、大圆叶双面红的多态性比率最高，达100％，其同源性最低．基于AFLP分析的UPGMA聚类分析得到，供试材料的遗传相似系数为0．7442～0．9207．以0．8171的相似系数为阈值，所有供试材料被分为6大组群，第一组群内以0．8484为阈值，又可分为4组．通过AFLP标记发现冬艳红5个类型中冬艳玫红、冬艳亮红、冬艳卷瓣玫聚类在一起，冬艳紫红、冬艳卷瓣红与其他类型存在的遗传差异通过分子标记可以鉴定出来．通过标记发现大圆叶双面红并没有与大叶玫红、大叶红、大叶卷瓣红、大红伏划分在双面红类型中，其外部形态相似，但遗传距离有较大差异．与形态标记相比，基于AFLP标记的红花檵木分类体系更能反映红花橙木品种间的亲缘关系．

汤洪敏云南野生大白口蘑遗传多样性研究

应用DALP技术对云南野生大白口蘑遗传多样性进行分析.筛选的5组引物在大白口蘑6个菌塘的56朵子实体中检测到202个位点,其中多态位点151个,多态位点百分比PPB为74.75%.6个菌塘总的观察等位基因数Na为1.7475;总的有效等位基因数Ne为1.4659;Nei＇s基因多样性指数H为0.2722;总的Shannon多样性指数I为0.4053;菌塘总的基因多样度Ht为0.2705,菌塘内基因多样性度Hs 为0.012,菌塘间基因分化系数 Gst 为0.9556,菌塘的遗传一致度在0.60～0.80之间.结果表明大白口蘑遗传变异有95.56%存在菌塘间,4.44%存在菌塘内,即大白口蘑遗传变异绝大多数存在于菌塘之间.

基于PCR技术的中药指纹图谱研究

指纹图谱技术已经应用于中药研究的许多领域.这类技术可以分为两大类,一类为基于光谱和色谱技术的化学指纹,从某种意义上讲,中药的指纹图谱可以被定义为中药经适当处理后通过光谱、色谱以及分子标记技术等现代分析方法得到的图谱或数据.在一定程度上,化学指纹图谱可以表明中药的质量,进而保证中药的疗效[1].……

中药紫菀AFLP技术参数的优化与分析

目的：探讨影响紫菀扩增片断长度多态性（Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP）的各种因素,建立并优化紫菀AFLP反应体系,为研究紫菀分子品质性状的技术平台奠定基础。方法：CTAB法提取紫菀基因组DNA,分别用一步法和两步法进行酶切与连接,分别进行预扩增、选扩后,聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染检测。结果：本研究建立了适用于紫菀的AFLP体系：用乙醇沉淀DNA,建立的模板不含PCR反应抑制剂及其他酶反应抑制剂,可被限制性内切酶MseI和EcoRI完全酶切;确定两步法进行酶切、连接,酶切时间为37℃3h,连接时间为16℃过夜,缓冲液选用NEB公司Buffer2;选择性扩增后的银染显色在10℃以下。结论：本研究建立的反应体系适用于紫菀基因组DNA的AFLP研究。

RFLP和AFLP分析白菜型油菜和甘蓝型油菜遗传多样性及其在油菜改良中的应用价值(英文)

采用RFLP和AFLP标记对来自中国和欧美的7份甘蓝型油菜和22份白菜型油菜进行了遗传多样性分析。在这29份材料中,166个酶-探针组合和2对AFLP引物共检测到1477个RFLP标记和183个AFLP标记。RFLP数据显示以拟南芥EST克隆作探针比用油菜基因组克隆做探针能检测到更多的多态性位点,且采用EcoRⅠ或BamHⅠ酶切比HindⅢ酶切多态性好,白菜型油菜和甘蓝型油菜中基因的拷贝数平均都为3个左右。UPGMA聚类分析表明中国白菜型油菜的遗传多样性比甘蓝型油菜和欧美白菜型油菜丰富,欧美甘蓝型油菜与欧美白菜型油菜聚为一类,而与中国甘蓝型油菜差异更大。中国白菜型油菜丰富的遗传多样性为中国甘蓝型油菜的改良提供了宝贵的资源,揭示了利用白菜型油菜A基因组和甘蓝型油菜A基因组间亚基因组杂种优势的可能性。

冬虫夏草cDNA-AFLP银染法显带研究

目的探讨影响冬虫夏草扩增片断长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)的主要因素,建立并优化冬虫夏草AFLP反应体系。方法变性裂解液法提取冬虫夏草基因组cDNA,分别用一步法和两步法进行酶切与连接,再进行预扩增、选扩后,聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染检测。结果本研究建立适用于冬虫夏草的AFLP体系:用乙醇沉淀cD-NA,建立的模板不含PCR反应抑制剂及其他酶反应抑制剂,可被限制性内切酶MseI和EcoRI完全酶切;确定两步法进行酶切、连接,酶切时间为37℃3h,连接时间为16℃过夜,缓冲液选用NEB公司buffer2;选择性扩增后的银染显色在10℃以下。结论本研究建立的反应体系适用于冬虫夏草基因组cDNA的AFLP银染法显带研究。

Sau-PCR和AILP技术对一起副溶血弧菌引起食物中毒的分型研究

运用Sau-PCR和扩增基因间片断多态性(AILP)两种基因分型技术对副溶血弧菌进行分析。对广州一起由副溶血弧菌引起的食物中毒进行常规鉴定后,应用Sau-PCR和AILP技术对分离到的3株菌株进行分型,结果1株人源分离菌与2株食源分离菌的Sau-PCR型别和AILP型别均相同。表明此次食物中毒爆发为同一株副溶血弧菌引起。Sau-PCR和AILP技术作为两种新的分子分型技术,具有快速、稳定、准确、高分辨力和低成本的优点,可以作为食物中毒中对细菌进行鉴定的分析技术,为流行病学调查和溯源提供可靠依据。

玉米C型细胞质雄性不育特异片段的分离及验证

对一套玉米同核异质不育系及保持系（包括N48-2、T48-2、C48-2、S48-2）的线粒体DNA进行了扩增片断长度多态性（AFLP）分析比较。从选择性扩增产物中筛选到了一条C48-2所特有的差异条带C48-223。对C48-223进行克隆、测序分析表明,它是玉米C型细胞质雄性不育线粒体atp6基因编码序列的一部分。Southern、Northern杂交分析证实了C48-223在C48-2线粒体上的特异性。这说明该差异片段有可能同C型细胞质雄性不育性状的表现有关。

基于AFLP技术的海南三亚野生和养殖牡蛎遗传多样性研究

2008年夏季,从海南三亚分别采集26份养殖牡蛎和32份野生牡蛎样品(1份样品代表1个体),开展扩增片断长度多态性(AFLP)和数量性状分析,采用POPGENE 32软件计算多态性位点百分率、遗传多样性指数、Hardy-Weinberg遗传偏离指数、群体遗传相似度和遗传距离。基于AFLP分析获得的遗传距离和线粒体细胞色素氧化酶I亚基(CO I)基因序列,采用邻接法构建养殖和野生牡蛎的系统发育树。结果表明,选择性引物对牡蛎品种具有较好的鉴别效率;相比养殖牡蛎,野生牡蛎多样性丰富、品种间同源性较低、亲缘关系相差较远、遗传基础较宽;通过CO I基因序列分析可知,养殖牡蛎均为香港巨牡蛎Crassostrea hongkongensis,而野生牡蛎属于囊牡蛎属Saccostrea,主要为僧帽牡蛎Saccostrea cucullata。目前海南三亚牡蛎种质资源多样性相对丰富,引种还未对三亚自然环境的牡蛎资源造成明显影响。

遗传 育种

W970437 大麦中消化和未消化的随机扩增小随体多态性作图[刊,英]/Becker,J.…∥Genome.-1995,38(5).-991～998[WBTA,1996,13(3),2155]W970438 显微解剖法分离的重复 DNA 序列:Ⅰ.大麦的核型[刊,英]/Busch,W.…∥Genome.-1995,38(6).-1082～1090[WBTA,1996,13(3),2159]W970439 大麦 AFLP(扩增片断长度多态性)和RFLP 标记的联合作图[刊,英]/Becker,J.…