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血浆游离DNA全基因组甲基化测序的实用稳定性评估
被引量:
1
1
作者
方欢
钟碧溪
+3 位作者
魏磊
张祥林
张威
汪小我
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期2284-2294,共11页
随着液体活检技术的发展,血浆游离DNA成为当前的研究热点之一。血浆游离DNA的全基因组甲基化测序被认为在癌症检测等医学应用拥有巨大潜力,但目前尚缺乏针对该实验流程的实用稳定性评估。文中利用两名志愿者在不同时间采样的血浆游离DNA...
随着液体活检技术的发展,血浆游离DNA成为当前的研究热点之一。血浆游离DNA的全基因组甲基化测序被认为在癌症检测等医学应用拥有巨大潜力,但目前尚缺乏针对该实验流程的实用稳定性评估。文中利用两名志愿者在不同时间采样的血浆游离DNA,在不同实验平台分别进行DNA甲基化的重亚硫酸盐转化前建库(Pre-BS)、转化后建库(Post-BS)和常规DNA建库,获取多因素影响下的测序数据样本。在此基础上,建立了一套血浆游离DNA测序数据分析的质量控制参考流程,综合评估了血液采集提取、游离DNA建库测序过程的实用稳定性,为血浆游离DNA全基因组甲基化测序应用于临床液体活检提供实用性的基础参考。
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关键词
血浆游离DNA
全基因组
DNA甲基
化
片段化模式
微量DNA建库
原文传递
题名
血浆游离DNA全基因组甲基化测序的实用稳定性评估
被引量:
1
1
作者
方欢
钟碧溪
魏磊
张祥林
张威
汪小我
机构
清华大学自动化系合成与系统生物学研究中心生物信息学教育部重点实验室北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学研究部
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期2284-2294,共11页
基金
国家自然科学基金(No.61721003)资助~~
文摘
随着液体活检技术的发展,血浆游离DNA成为当前的研究热点之一。血浆游离DNA的全基因组甲基化测序被认为在癌症检测等医学应用拥有巨大潜力,但目前尚缺乏针对该实验流程的实用稳定性评估。文中利用两名志愿者在不同时间采样的血浆游离DNA,在不同实验平台分别进行DNA甲基化的重亚硫酸盐转化前建库(Pre-BS)、转化后建库(Post-BS)和常规DNA建库,获取多因素影响下的测序数据样本。在此基础上,建立了一套血浆游离DNA测序数据分析的质量控制参考流程,综合评估了血液采集提取、游离DNA建库测序过程的实用稳定性,为血浆游离DNA全基因组甲基化测序应用于临床液体活检提供实用性的基础参考。
关键词
血浆游离DNA
全基因组
DNA甲基
化
片段化模式
微量DNA建库
Keywords
plasma cell-free DNA
whole genome
DNA methylation
fragmentation pattern
low input library
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
血浆游离DNA全基因组甲基化测序的实用稳定性评估
方欢
钟碧溪
魏磊
张祥林
张威
汪小我
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
原文传递
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参考文献
引证文献
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