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牛乳头瘤病毒基因2型流行株全基因组的克隆及序列分析 被引量:8
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作者 贺志昊 孟庆玲 +5 位作者 乔军 刘昱成 杨海波 王国超 才学鹏 陈创夫 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期183-188,共6页
为了解牛乳头瘤病毒(Bovine Papillomavirus,BPV)新疆流行株基因型及其基因组遗传变异情况,用乳头瘤病毒L1基因简并引物FAP59/FAP64对新疆沙湾县奶牛皮肤肿瘤组织样品进行PCR扩增,测序后确定,BPV基因型;设计6对BPV基因型特异性引物,经... 为了解牛乳头瘤病毒(Bovine Papillomavirus,BPV)新疆流行株基因型及其基因组遗传变异情况,用乳头瘤病毒L1基因简并引物FAP59/FAP64对新疆沙湾县奶牛皮肤肿瘤组织样品进行PCR扩增,测序后确定,BPV基因型;设计6对BPV基因型特异性引物,经扩增、测序、拼接后获得BPV流行株全长基因组序列。L1基因序列分析表明,BPV2-SW01流行株为BPV-2基因型;该毒株基因组全长7 944bp,包括E6、E7、E1、E8、E2、E4、E3、E5、L2和L1 10个开放阅读框(ORF)。遗传进化树分析显示,BPV2-SW01归于Delta乳头瘤病毒属,与BPV-1和BPV-13进化关系最近。 展开更多
关键词 牛乳头瘤病毒基因2型 衣壳蛋白L1基因 基因组序列 遗传进化分析
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牛乳头瘤病毒基因2型新疆南疆Aks-01流行株全基因组序列测定及其特征分析 被引量:9
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作者 张婉琪 胡建军 +8 位作者 闫石磊 黄耀杰 徐建平 黄忠武 郑毛亮 孟子嫣 李元元 王娜 王青青 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期370-378,共9页
为从分子水平了解牛乳头瘤病毒(Bovine papillomavirus,BPV)新疆南疆Aks-01株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况。本研究选取新疆南疆患病牛皮肤肿瘤样物,以乳头瘤病毒L1基因的简并引物FAP59/FAP64进行PCR法基因分型鉴定并确定其基... 为从分子水平了解牛乳头瘤病毒(Bovine papillomavirus,BPV)新疆南疆Aks-01株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况。本研究选取新疆南疆患病牛皮肤肿瘤样物,以乳头瘤病毒L1基因的简并引物FAP59/FAP64进行PCR法基因分型鉴定并确定其基因型,根据GenBank中BPV参考株设计扩增引物和测序引物,对Aks-01株进行全基因组扩增、测序及序列分析。序列分析表明,新疆南疆Aks-01株为BPV-2基因型,其全基因组长为7944bp,具有BPV-2基因型的结构特征,与GenBank收录的BPV-2基因型参考株核苷酸比较,同源性高达98%。与BPV-1、BPV-13的基因型参考株进化关系最近,同属Delta属。该Aks-01株为新疆南疆地区首次检测确认并测定全基因组序列的牛乳头瘤病毒。 展开更多
关键词 牛乳头瘤病毒基因2型 基因组序列 序列分析
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牛乳头瘤病毒基因2型贵州GZ01流行株全基因组序列测定及其特征分析 被引量:3
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作者 张海 张军 +8 位作者 杨忠成 廖梅 周碧君 王开功 文明 程振涛 王伟 王铭 胡兴义 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期5090-5098,共9页
为从分子水平了解牛乳头瘤病毒(bovine papillomavirus,BPV)贵州镇宁GZ01流行株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况,本研究选取贵州镇宁患病牛皮肤肿瘤样物,以乳头瘤病毒L1基因的简并引物MY11/MY09进行PCR扩增,测序后并确定其基因型... 为从分子水平了解牛乳头瘤病毒(bovine papillomavirus,BPV)贵州镇宁GZ01流行株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况,本研究选取贵州镇宁患病牛皮肤肿瘤样物,以乳头瘤病毒L1基因的简并引物MY11/MY09进行PCR扩增,测序后并确定其基因型。根据Gen Bank中BPV参考株设计6对特异性引物,经扩增、测序和拼接后获得BPV流行株全基因组序列。结果序列分析表明,GZ01流行株全基因组长为7 944 bp,具有BPV2基因型的结构特征,与Gen Bank收录的牛乳头状瘤病毒2型基因型参考株BPV2、BPV2-SW01和BPV2-AKS01的核苷酸同源性高达98.8%、99.7%和99.4%,同时与BPV13、BPV1和BPV14的基因型参考株进化关系也比较最近,同属Dalte属。因此,贵州镇宁GZ01株为BPV2基因型,GZ01株为贵州地区首次检测确认并测定了全基因组序列的牛乳头瘤病毒。本研究为贵州地区的牛乳头状瘤的病原鉴定、流行规律、遗传变异以及科学的防控提供了理论依据。 展开更多
关键词 牛乳头瘤病毒基因2型 基因组序列 序列分析
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牛乳头瘤病毒基因1型贵州GZLZ流行株全基因组序列测定及分析 被引量:4
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作者 张海 张军 +7 位作者 杨忠成 廖梅 周碧君 王开功 文明 程振涛 王伟 胡兴义 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期755-757,共3页
为了解牛乳头瘤病毒(BPV)GZLZ流行株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况,本研究首先提取贵州六枝患病牛皮肤肿瘤样品DNA,以BPV L1基因的简并引物对其进行PCR扩增,测序并构建BPVL1基因进化树确定其为BPV1基因型。根据GenBank中BPV1参... 为了解牛乳头瘤病毒(BPV)GZLZ流行株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况,本研究首先提取贵州六枝患病牛皮肤肿瘤样品DNA,以BPV L1基因的简并引物对其进行PCR扩增,测序并构建BPVL1基因进化树确定其为BPV1基因型。根据GenBank中BPV1参考株设计7对特异性引物,经扩增、测序、拼接后获得BPV流行株全基因组序列。序列分析显示,贵州六枝GZLZ流行株基因组全长为7 946 bp,具有BPV1基因型的结构特征。本研究为贵州地区的牛乳头状瘤的病原鉴定、流行规律以及科学的防控提供依据。 展开更多
关键词 牛乳病毒基因1 基因组序列 序列分析
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牛乳头瘤病毒2型L1基因的克隆及原核表达 被引量:2
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作者 贺志昊 刘昱成 +5 位作者 杨海波 王国超 孟庆玲 乔军 才学鹏 陈创夫 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期27-30,共4页
为表达牛乳头瘤病毒2型(BPV2)衣壳蛋白L1基因,本研究采用PCR方法从奶牛皮肤肿瘤病料样品中扩增BPV2沙湾分离株L1基因,克隆至pMD18-T载体中,测序后进行分析。将BPV2沙湾株L1基因亚克隆于原核表达质粒pGEX4T-1中,经IPTG诱导L1蛋白表达,并... 为表达牛乳头瘤病毒2型(BPV2)衣壳蛋白L1基因,本研究采用PCR方法从奶牛皮肤肿瘤病料样品中扩增BPV2沙湾分离株L1基因,克隆至pMD18-T载体中,测序后进行分析。将BPV2沙湾株L1基因亚克隆于原核表达质粒pGEX4T-1中,经IPTG诱导L1蛋白表达,并对重组蛋白进行SDS-PAGE和western blot分析。SDS-PAGE分析显示,诱导后能够表达分子量80 ku的重组蛋白;western blot显示该蛋白可以与抗BPV2多克隆抗体发生反应。小鼠免疫试验表明,BPV2 L1重组蛋白可以诱导小鼠产生抗BPV2 L1特异性抗体;琼脂扩散试验显示,重组L1蛋白具有良好的免疫原性。本研究原核表达BPV2 L1蛋白,并证明其具有良好的反应原性及免疫原性,为牛乳头瘤病的疫苗和诊断试剂研发奠定了基础。 展开更多
关键词 牛乳病毒2 衣壳蛋白 L1基因 原核表达
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牛乳头瘤病毒2型L1基因真核表达载体的构建及真核表达
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作者 贺志昊 乔军 +6 位作者 孟庆玲 杨海波 刘昱成 王国超 才学鹏 陈创夫 都曼.努尔坎杰 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期18-21,共4页
为在真核细胞中表达牛乳头瘤病毒2型(BPV2)衣壳蛋白L1基因。采用PCR方法从奶牛皮肤肿瘤病料中扩增BPV2沙湾分离株L1基因,克隆入pMD18-T载体中,测序后进行序列分析。以pcDNA 3.1(+)为真核表达载体构建重组表达质粒,转染入BHK-21细胞,通... 为在真核细胞中表达牛乳头瘤病毒2型(BPV2)衣壳蛋白L1基因。采用PCR方法从奶牛皮肤肿瘤病料中扩增BPV2沙湾分离株L1基因,克隆入pMD18-T载体中,测序后进行序列分析。以pcDNA 3.1(+)为真核表达载体构建重组表达质粒,转染入BHK-21细胞,通过间接荧光免疫试验检测BPV2-L1蛋白的表达。本研究成功构建pcDNA3.1(+)-BPV2-L1重组真核表达质粒,证实能表达出BPV2-L1蛋白,为BPV2DNA疫苗的研发提供了前期基础。 展开更多
关键词 牛乳病毒2 衣壳蛋白 L1基因 克隆 真核表达
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牛乳头状瘤病毒2型贵州株L2基因克隆及生物信息学分析
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作者 张海 杨丽彦 +7 位作者 张军 冯旭芳 周碧君 王开功 文明 程振涛 王伟 胡兴义 《中国兽药杂志》 北大核心 2017年第8期14-22,共9页
为分析牛乳头状瘤病毒2型贵州株(BPV2-GZ01株)L2基因的分子特征,预测编码蛋白的生物学功能,对BPV2-GZ01株L2基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,应用生物信息学相关软件及方法,对BPV2-GZ01株L2基因进行序列分析并对其编码蛋白进行二级结... 为分析牛乳头状瘤病毒2型贵州株(BPV2-GZ01株)L2基因的分子特征,预测编码蛋白的生物学功能,对BPV2-GZ01株L2基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,应用生物信息学相关软件及方法,对BPV2-GZ01株L2基因进行序列分析并对其编码蛋白进行二级结构、三级结构、B细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽预测。结果显示,L2基因PCR扩增产物大小为1404 bp,编码467个氨基酸;与参考株BPV2株、BPV2-SW01株、BPV2-AKS01株、BPV13株、BPV1株相应序列核苷酸同源性分别为99.0%、99.7%、99.3%、83.9%和75.1%,氨基酸的同源性分别为98.9%、99.6%、99.4%、89.5%和82.7%;系统进化显示,BPV2-GZ01株L2基因与BPV2-SW01株亲缘关系最近;二级结构以无规则卷曲、β-折叠和α-螺旋区域所占比例较大,预测此蛋白可能存在B细胞优势抗原表位,无跨膜区域,无信号肽区域。本研究结果将为贵州省BPV核酸疫苗研究提供理论依据。 展开更多
关键词 牛乳病毒2 贵州株 L2基因 生物信息学分析
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牛乳头瘤病毒基因1型广西GX01流行株全基因组克隆及序列分析 被引量:4
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作者 易驰喆 孙文超 +9 位作者 郑敏 涂悦进 张红云 闭璟珊 梁晟 韦显凯 苏姣秀 鲁会军 李文杰 罗廷荣 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第7期1731-1739,共9页
为了解牛乳头瘤病毒1型(bovine papillomavirus genotype 1,BPV-1)广西GX01株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况,同时了解该毒株引起宿主产生的病理组织学变化情况,本研究选取广西贺州市患病牛皮肤肿瘤样物制作石蜡切片后镜检观察,... 为了解牛乳头瘤病毒1型(bovine papillomavirus genotype 1,BPV-1)广西GX01株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况,同时了解该毒株引起宿主产生的病理组织学变化情况,本研究选取广西贺州市患病牛皮肤肿瘤样物制作石蜡切片后镜检观察,提取病料DNA,以乳头瘤病毒L1基因的简并引物FAP59/FAP64进行PCR扩增以确定此病毒的基因型,根据GenBank中BPV参考株设计嵌套引物,对GX01株进行全基因组扩增、克隆测序及序列分析。病理组织学检查结果显示,可在病变部位发现表皮细胞增生、肿胀,角质过度及挖空细胞等乳头瘤病毒感染的特征性病变。序列分析结果表明,GX01株为BPV-1,其全基因组长为7 945bp,包含E1、E2、E4、E5、E6、E7、L1、L2 8个开放阅读框,符合BPV-1型基因组的结构特征;GX01与BPV-1参考株全基因组核苷酸序列同源性为98.6%~99.6%,与BPV-2型参考株(M20219.1)、BPV-13型参考株(JQ798171.1)同源性分别为86.9%和87.2%。GX01株为广西地区首次经检测确认并测定全基因组序列的牛乳头瘤病毒。本研究为广西地区乃至全国的牛乳头状瘤的病原鉴定、流行规律、遗传变异、疫源追溯及科学防控提供了基础数据。 展开更多
关键词 牛乳病毒基因1(BPV-1) 基因 序列分析
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新疆南疆地区牛乳头瘤病毒1型L1基因克隆及原核表达
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作者 张婉琪 赵玉宾 +3 位作者 丁繁萍 王青青 王哲红 胡建军 《塔里木大学学报》 2021年第3期16-21,共6页
本研究以构建牛乳头瘤病毒1型L1基因原核表达系统pET32a-L1及表达牛乳头瘤病毒1型L1蛋白为目的,为进一步制备基因工程疫苗奠定基础。从牛体表赘生瘤组织中提取DNA,PCR扩增L1基因片段,克隆至pGM-T载体。测序成功后将目的片段和表达载体... 本研究以构建牛乳头瘤病毒1型L1基因原核表达系统pET32a-L1及表达牛乳头瘤病毒1型L1蛋白为目的,为进一步制备基因工程疫苗奠定基础。从牛体表赘生瘤组织中提取DNA,PCR扩增L1基因片段,克隆至pGM-T载体。测序成功后将目的片段和表达载体经双酶切连接于表达载体pET32a中,并构建重组质粒pET32a-L1。重组质粒经双酶切、测序鉴定后转入表达宿主BL21中,IPTG诱导后表达融合蛋白L1,通过SDS-PAGE电泳和Westernblot进行鉴定。结果显示,pET32a-BPV-1-L1重组质粒构建成功。经SDS-PAGE鉴定,诱导后表达的重组蛋白L1相对分子量约为75 kD,与预期结果大小一致;经Western blot检测牛乳头瘤病毒1型L1蛋白能与Anti-HPVantibody[BPV-1/1H8+CAMVIR]单克隆抗体产生反应。pET32a-BPV-1-L1原核表达系统得以成功构建并能表达牛乳头瘤病毒1型L1蛋白。 展开更多
关键词 牛乳病毒1 L1基因 原核表达
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牛乳头状瘤病的防治 被引量:2
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作者 李月福 闫文军 《中国畜牧业》 2021年第16期66-66,共1页
牛乳头状瘤病是由牛乳头瘤病毒引起牛的一种良性肿瘤,是慢性的皮肤增生性疾病。与其他家畜相比,乳头瘤在牛群中较为常见。不同日龄的牛均会感染,一岁内牛发生频率较高。牛乳头瘤病毒有10种可以鉴别的病毒型,另外还有一些类型已经被建议... 牛乳头状瘤病是由牛乳头瘤病毒引起牛的一种良性肿瘤,是慢性的皮肤增生性疾病。与其他家畜相比,乳头瘤在牛群中较为常见。不同日龄的牛均会感染,一岁内牛发生频率较高。牛乳头瘤病毒有10种可以鉴别的病毒型,另外还有一些类型已经被建议加入其中。牛乳头瘤病毒1型和2型属于δ乳头瘤病毒属,具有较宽的宿主范围和组织嗜性,在牛中可引起纤维乳头状瘤,在马中可引起结节病。牛乳头瘤病毒3、4、6、9和10型属于ξ乳头瘤病毒属,仅可感染牛,并且只感染牛上皮细胞,诱导产生确实的乳头瘤。牛乳头瘤病毒5型和8型是e乳头瘤病毒属成员,可引起纤维乳头状瘤和确实的乳头瘤。目前,牛乳头瘤病毒还没有分类,许多牛乳头瘤病毒的生物学性质,有待进一步补充确定。 展开更多
关键词 牛乳病毒 组织嗜性 牛群 生物学性质 病毒 增生性疾病
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新疆南疆牛乳头状瘤病毒鉴定与基因分型 被引量:7
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作者 王青青 石长青 +7 位作者 胡建军 刘黎 黄耀杰 徐建平 黄忠武 焦海宏 张婉琪 努尔阿丽亚.马木提 《畜牧与兽医》 北大核心 2015年第11期99-103,共5页
为探究新疆南疆某奶牛场疑似感染牛乳头状瘤病及病毒基因型,本试验采取牛皮肤病变肿瘤样组织,进行组织病理学检查,并提取病料DNA,以乳头状瘤病毒(bovine papillomavirus,BPV)L1基因简并引物和通用引物(FAP59/FAP64和MY11/MY09)进行PCR... 为探究新疆南疆某奶牛场疑似感染牛乳头状瘤病及病毒基因型,本试验采取牛皮肤病变肿瘤样组织,进行组织病理学检查,并提取病料DNA,以乳头状瘤病毒(bovine papillomavirus,BPV)L1基因简并引物和通用引物(FAP59/FAP64和MY11/MY09)进行PCR扩增、测序、序列分析及遗传进化树构建。测序结果表明:新疆南疆Aks-01株与Gen Bank收录的BPV-2基因型参考株核苷酸序列比较,核苷酸同源性可达95%,为BPV-2基因型;与BPV-1、BPV-13基因型参考株遗传进化关系最近,同属Delta属。结合临床症状、组织病理学检查,确定该奶牛场牛乳头瘤由BPV-2基因型感染引起。 展开更多
关键词 牛乳病毒 基因 序列分析
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Cisplatin sensitivity and mechanisms of anti-HPV16 E6-ribozyme on cervical carcinoma CaSKi cell line
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作者 Zhiguo Rao Jianfei Gao +2 位作者 Bicheng Zhang Bo Yang Jiren Zhang 《The Chinese-German Journal of Clinical Oncology》 CAS 2012年第4期237-242,共6页
Objective: The aim of this study was to study the cisplatin sensitizing effect and mechanism of anti-HPV16 E6- ribozyme on cervical carcinoma cell line. Methods: The anti-HPV16E6-ribozyme and empty eucaryotic expres... Objective: The aim of this study was to study the cisplatin sensitizing effect and mechanism of anti-HPV16 E6- ribozyme on cervical carcinoma cell line. Methods: The anti-HPV16E6-ribozyme and empty eucaryotic expressing plasmids were transfected into CaSKi cell, which named as CaSKi-R, CaSKi-P respectively. E6 mRNA, the sensitivity to cisplatin, apoptosis rates, expression of p53, Bcl-2, Bax and C-myc proteins and mRNA were examined by Northem blot, MTT colorimetric assay, PI/Annexin V stained methods, flow cytometry anslysis and RT-PCR, respectively. Results: E6 mRNA was less in CaSKi-R than in CaSKi. The sensitivity of CaSKi-R cells to cisplatin was 2.28 and 2.21 times than that of CaSKi and CaSKi-P cells. The apoptotic rates in CaSKi, CaSKi-P and CaSKi-R cells was (18.9 ± 3.5)%, (19.7 ± 4.8)% and (40.4 ± 4.5)%. The apoptotic rates was increased in CaSKi-R than that of CaSKi cells treated with cisplatin (P = 0.003). Comapred with CaSKi cell, the expression of p53 (P = 0.000), Bax protein (P = 0.002) was significantly higher and the expression of Bcl-2 protein (P = 0.005), C-myc protein (P = 0.005) was significantly lower in CaSKi-R than that of CaSKi cell treated with cisplatin. Comapred with CaSKi cell, the expression of p53, Bax mRNA in CaSKi-R cell treated with cisplatin increased, while Bcl-2, C-myc mRNA decreased. Conclusion: CaSKi-R cells transfected by anti-HPVE6-ribozyme increased the sensitivity to cisplatin. The increase of sensitivity to cisplatin in CaSKi-R cells may be associated with increasing expression of p53, Bax protein, and decreasing expression of C-myc, Bcl-2 proteins. 展开更多
关键词 RIBOZYME human papillomavirus CISPLATIN drug sensitivity cervical cancer
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过表达FOXF2对人宫颈癌SiHa细胞迁移及增殖影响机制探讨
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作者 刘丽敏 黄紫宇 +2 位作者 胡海燕 何芳 刘植华 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2021年第2期117-122,共6页
目的探讨过表达叉头框转录因子F2(FOXF2)调控HPV早期基因区6(early region,E6)和早期基因区7(early region,E7)抑制人宫颈癌SiHa细胞迁移、增殖的影响及其作用机制。方法构建慢病毒转染SiHa细胞,实验分为对照组和实验组,qRT-PCR和蛋白... 目的探讨过表达叉头框转录因子F2(FOXF2)调控HPV早期基因区6(early region,E6)和早期基因区7(early region,E7)抑制人宫颈癌SiHa细胞迁移、增殖的影响及其作用机制。方法构建慢病毒转染SiHa细胞,实验分为对照组和实验组,qRT-PCR和蛋白质印迹法检测过表达慢病毒对照组及实验组中FOXF2、E6、E7、p53、pRB/RB、E2F1mRNA和(或)蛋白表达变化;划痕试验和平板克隆形成试验分别检测细胞迁移和增殖能力。SPSS 20.0对数据进行统计学分析。结果 SiHa细胞内FOXF2过表达后,过表达慢病毒实验组FOXF2mRNA表达水平为20.07±0.63,高于对照组的1.05±0.08,差异有统计学意义,F=272.883,P<0.001;实验组p53mRNA表达水平为1.46±0.07,高于对照组的0.95±0.16,差异有统计学意义,F=25.775,P=0.007;实验组E2F1mRNA表达水平为0.77±0.06,低于对照组的1.00±0.02,差异有统计学意义,F=39.74,P=0.003;实验组RB mRNA表达水平为1.22±0.09,高于对照组的1.00±0.04,差异有统计学意义,F=14.738,P=0.018。过表达慢病毒实验组FOXF2蛋白表达水平为0.41±0.05,高于对照组的0.21±0.06,差异有统计学意义,F=34.192,P<0.001;RB蛋白表达水平为0.68±0.06,高于对照组的0.40±0.03,差异有统计学意义,F=71.468,P=0.001;pRB蛋白表达水平为0.45±0.06,低于对照组的0.75±0.09,差异有统计学意义,F=25.480,P=0.007;E2F1蛋白表达水平为0.32±0.03,低于对照组的0.57±0.06,差异有统计学意义,F=43.872,P=0.003;p53蛋白表达水平为0.22±0.03,高于与对照组的0.11±0.01,差异有统计学意义,F=36.327,P=0.004;E6蛋白表达水平为0.21±0.03,低于对照组的0.40±0.09,差异有统计学意义,F=12.36,P=0.025;E7蛋白表达水平为0.21±0.03,低于对照组的0.36±0.08,差异有统计学意义,F=9.093,P=0.039。实验组细胞迁移率为(0.36±0.06)%,低于对照组的(0.74±0.06)%,差异有统计学意义,F=60.945,P=0.001。实验组细胞克隆形成率为(0.34±0.04)%,低于对照组的(0.67±0.07)%,差异有统计学意义,F=49.751,P=0.002。结论 FOXF2通过调控HPV E6/E7而抑制SiHa细胞的体外迁移及细胞增殖能力,促进p53的表达,抑制pRB及E2F1表达。FOXF2可能通过下调HPV E6/E7抑制宫颈癌的发生发展。 展开更多
关键词 宫颈癌 框转录因子F2 高危人乳病毒 E6基因 E7基因 细胞迁移 细胞增殖
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