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鸡爪槭种下分类群的DNA条形码筛选
被引量:
9
1
作者
高健
孟婉姮
+1 位作者
杜芳
李俊清
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期734-743,共10页
槭属鸡爪槭(Acer palmatum Thunb.)是北温带广泛分布的一类园艺观赏树种,由于频繁的种内杂交渐渗导致其种下分类群的形态性状特征趋同,致使传统的形态学分类难以准确鉴定,新兴的DNA条形码技术为快速、准确的鉴定鸡爪槭种下分类群提供...
槭属鸡爪槭(Acer palmatum Thunb.)是北温带广泛分布的一类园艺观赏树种,由于频繁的种内杂交渐渗导致其种下分类群的形态性状特征趋同,致使传统的形态学分类难以准确鉴定,新兴的DNA条形码技术为快速、准确的鉴定鸡爪槭种下分类群提供了新的思路。本研究采用5个叶绿体DNA片段(rpl16、psbA-trnH、trnL-trnF、rbcL、matK)和核基因组ITS片段,运用PWG-distance和Tree-Building两种方法对鸡爪槭的8个分类群共32个个体进行DNA条形码分析。结果显示,单个叶绿体基因组片段(分辨率为0%~25%)或核rDNA ITS片段(12.5%)的分辨率较低,不同组合的叶绿体DNA片段(0%~62.5%)、叶绿体片段与核rDNA ITS片段(12.5%~50%)的分辨率则相对较高。其中,rpl16+psbA-trnH+trnL-trnF片段组合的分辨率最高(62.5%),较为符合DNA条形码快速、准确鉴定的要求,因此建议将其作为鸡爪槭种下分类群鉴定的DNA条形码。
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关键词
鸡爪槭
DNA条形码
叶绿体DNA片段
核基因组ITS片段
物种分辨率
下载PDF
职称材料
DNA条形码在山茶属近缘植物鉴别中的应用(英文)
被引量:
4
2
作者
温贝贝
邓丽
+5 位作者
叶霞
贺巍
刘建军
苏会
李美凤
冯建灿
《广东农业科学》
CAS
2017年第1期55-65,共11页
山茶属(Camellia)是山茶科(Theaceae)中物种丰富、经济效益较高的属。分类学上对山茶属的亚属、组以及种的划分争议较大,著名的3大山茶属植物分类系统分别由Sealy、张宏达和闵天禄提出。DNA条形码技术是指通过对植物基因组中的特定基因...
山茶属(Camellia)是山茶科(Theaceae)中物种丰富、经济效益较高的属。分类学上对山茶属的亚属、组以及种的划分争议较大,著名的3大山茶属植物分类系统分别由Sealy、张宏达和闵天禄提出。DNA条形码技术是指通过对植物基因组中的特定基因进行片段扩增、测序发现其碱基变化规律的技术手段,在分类学研究中显示出巨大的应用潜力。选取trn H-psb A和mat K序列的通用引物,对山茶属不同植物基因组DNA进行扩增和序列测定,分别得到了ttrn H-psb A序列和mat K序列各61条,山茶属mat K序列相似度极高(98.40%),物种分辨率较低。trn H-psb A的属间物种分辨能力达到100%,而在山茶属内物种分辨率仅为13.11%。结果表明:trn H-psb A序列能够有效地区分不同属间的植物,但种间分类能力较弱。
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关键词
山茶属
trn
H-psb
A
MAT
K
DNA条形码
物种分辨率
下载PDF
职称材料
题名
鸡爪槭种下分类群的DNA条形码筛选
被引量:
9
1
作者
高健
孟婉姮
杜芳
李俊清
机构
北京林业大学林学院
北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期734-743,共10页
基金
北京市科技新星(Z151100000315056)
国家环境保护公益性行业科研专项(201509042)
文摘
槭属鸡爪槭(Acer palmatum Thunb.)是北温带广泛分布的一类园艺观赏树种,由于频繁的种内杂交渐渗导致其种下分类群的形态性状特征趋同,致使传统的形态学分类难以准确鉴定,新兴的DNA条形码技术为快速、准确的鉴定鸡爪槭种下分类群提供了新的思路。本研究采用5个叶绿体DNA片段(rpl16、psbA-trnH、trnL-trnF、rbcL、matK)和核基因组ITS片段,运用PWG-distance和Tree-Building两种方法对鸡爪槭的8个分类群共32个个体进行DNA条形码分析。结果显示,单个叶绿体基因组片段(分辨率为0%~25%)或核rDNA ITS片段(12.5%)的分辨率较低,不同组合的叶绿体DNA片段(0%~62.5%)、叶绿体片段与核rDNA ITS片段(12.5%~50%)的分辨率则相对较高。其中,rpl16+psbA-trnH+trnL-trnF片段组合的分辨率最高(62.5%),较为符合DNA条形码快速、准确鉴定的要求,因此建议将其作为鸡爪槭种下分类群鉴定的DNA条形码。
关键词
鸡爪槭
DNA条形码
叶绿体DNA片段
核基因组ITS片段
物种分辨率
Keywords
Acer palmatum
DNA barcoding
Chloroplast DNA fragment
nrDNA ITS region
Discrimination rate
分类号
Q949.755.3 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
DNA条形码在山茶属近缘植物鉴别中的应用(英文)
被引量:
4
2
作者
温贝贝
邓丽
叶霞
贺巍
刘建军
苏会
李美凤
冯建灿
机构
河南农业大学园艺学院
出处
《广东农业科学》
CAS
2017年第1期55-65,共11页
基金
Science and technology innovation team support plan of Henan university(14IRTSTHN011)
文摘
山茶属(Camellia)是山茶科(Theaceae)中物种丰富、经济效益较高的属。分类学上对山茶属的亚属、组以及种的划分争议较大,著名的3大山茶属植物分类系统分别由Sealy、张宏达和闵天禄提出。DNA条形码技术是指通过对植物基因组中的特定基因进行片段扩增、测序发现其碱基变化规律的技术手段,在分类学研究中显示出巨大的应用潜力。选取trn H-psb A和mat K序列的通用引物,对山茶属不同植物基因组DNA进行扩增和序列测定,分别得到了ttrn H-psb A序列和mat K序列各61条,山茶属mat K序列相似度极高(98.40%),物种分辨率较低。trn H-psb A的属间物种分辨能力达到100%,而在山茶属内物种分辨率仅为13.11%。结果表明:trn H-psb A序列能够有效地区分不同属间的植物,但种间分类能力较弱。
关键词
山茶属
trn
H-psb
A
MAT
K
DNA条形码
物种分辨率
Keywords
Camellia
trnH-psbA
matK
DNA barcodes
species identification
分类号
S682.31 [农业科学—观赏园艺]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸡爪槭种下分类群的DNA条形码筛选
高健
孟婉姮
杜芳
李俊清
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
9
下载PDF
职称材料
2
DNA条形码在山茶属近缘植物鉴别中的应用(英文)
温贝贝
邓丽
叶霞
贺巍
刘建军
苏会
李美凤
冯建灿
《广东农业科学》
CAS
2017
4
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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