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川木通的随机扩增多态性DNA与序列特征性扩增区域标记研究 被引量:1
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作者 国锦琳 唐远 +1 位作者 裴瑾 万德光 《成都医学院学报》 CAS 2011年第4期283-286,共4页
目的采用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)法建立川木通的分子鉴定方法,为川木通的快速鉴定奠定基础。方法从100对随机引物中筛选出5对多态性丰富的RAPD引物进行川木通10个种的扩增分析,最终得到C13为阳性序... 目的采用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)法建立川木通的分子鉴定方法,为川木通的快速鉴定奠定基础。方法从100对随机引物中筛选出5对多态性丰富的RAPD引物进行川木通10个种的扩增分析,最终得到C13为阳性序列特征性扩增区域(sequence characterized amplified regions,SCAR)标记。结果阳性SCAR标记均可以进行川木通原植物与药材的分子鉴定引物,C13可以鉴定上述2种药典品种和商品主流品种(粗齿铁线莲、钝萼铁线莲)。结论 RAPD法简便易行,为亲缘关系较近的多基原药材的鉴定提供了一种新方法。 展开更多
关键词 川木通 随机多态性DNA 序列特征区域
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一株酿酒酵母的特征区域序列扩增标记
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作者 方维明 杨智 +2 位作者 杨振泉 孟庆阳 汪志君 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1-4,共4页
以23株不同来源的酿酒酵母为研究对象,分别提取基因组DNA,试用50条随机引物对其进行随机扩增多态性DNA分析,筛选到两条具有菌株鉴别能力的随机引物。P09可以从2.412,ST—01,SK—26,ZD—01四株酿酒酵母基因组DNA中扩增出长度为433bp的Sc... 以23株不同来源的酿酒酵母为研究对象,分别提取基因组DNA,试用50条随机引物对其进行随机扩增多态性DNA分析,筛选到两条具有菌株鉴别能力的随机引物。P09可以从2.412,ST—01,SK—26,ZD—01四株酿酒酵母基因组DNA中扩增出长度为433bp的Sc—433片断Sc—433;P46可以从2.1882,ST—01,NJ—02三株酿酒酵母基因组DNA中扩增出长度为665bp的Sc—665片断,其中仅有目的菌株ST—01能稳定的扩增出这2个标记。把这2个片断分别克隆到pUCmT质粒载体中,经过酶切鉴定后测序,根据序列设计特异性引物,把RAPD标记转化为特征区域序列扩增标记,为酿酒酵母菌株的分子鉴别提供了新的借鉴。 展开更多
关键词 酿酒酵母 随机多态性DNA分析 特征区域序列 分子标记
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通过改良RAPD技术获得黑毛石斛、蜂腰石斛和石仙桃的3条SCAR新标记
3
作者 梅志强 郭侃 +2 位作者 魏春莉 郑美玲 傅俊江 《西南医科大学学报》 2024年第1期29-33,共5页
目的寻找快速区分黑毛石斛、蜂腰石斛和石仙桃的序列特征扩增区域(sequence characterized amplified regions,SCAR)新标记。方法在改良的随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)的基础上对10个物种进行基因组DNA随... 目的寻找快速区分黑毛石斛、蜂腰石斛和石仙桃的序列特征扩增区域(sequence characterized amplified regions,SCAR)新标记。方法在改良的随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)的基础上对10个物种进行基因组DNA随机扩增、分子克隆和测序,分别设计了可鉴别3个物种的SCAR标记。结果成功筛选出3个SCAR标记,其相应的特异性标记分别为N2-12、A2-17和A6-33;其中SCAR标记N2-12在黑毛种属中扩增出约750 bp的特异性条带,SCAR标记A2-17在蜂腰石斛中扩增出约750 bp的特异性条带,SCAR标记A6-33在石仙桃种属中扩增出约600 bp的特异性条带。结论N2-12、A2-17和A6-33这3对特异性SCAR新标记能快速、准确的区分出黑毛石斛、蜂腰石斛和石仙桃这3个物种,为今后进行该中药道地药材样品的鉴定提供了实验依据。 展开更多
关键词 黑毛石斛 蜂腰石斛 石仙桃 序列特征区域标记 鉴定
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金针菇子实体颜色基因的分子标记 被引量:10
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作者 谢宝贵 刘维侠 +1 位作者 王秀全 江玉姬 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2004年第3期363-368,共6页
用群体分离分析法从200个随机引物中筛选出S375,其扩增片段与金针菇子实体白色基因连锁.对S375扩增片段两端测序,以该序列为依据合成一对特征序列扩增区域(SCAR)引物,它能对带有白色基因的菌株扩增出单一片段,多聚酶链反应(PCR)产物不... 用群体分离分析法从200个随机引物中筛选出S375,其扩增片段与金针菇子实体白色基因连锁.对S375扩增片段两端测序,以该序列为依据合成一对特征序列扩增区域(SCAR)引物,它能对带有白色基因的菌株扩增出单一片段,多聚酶链反应(PCR)产物不需电泳、加EB后可在紫外灯下直接检测. 展开更多
关键词 金针菇 子实体颜色 基因 分子标记 RAPD标记 特征序列扩增区域标记
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双孢蘑菇颜色基因分子标记的初步筛选 被引量:3
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作者 蔡志欣 陈美元 +4 位作者 廖剑华 李洪荣 郭仲杰 蔡丹凤 王泽生 《食用菌学报》 北大核心 2014年第3期1-5,共5页
以4个白色和4个棕色双孢蘑菇(Agaricus bisporus )菌株,对其500个随机扩增多态性 DNA (random amplified polymorphic DNA,RAPD)随机引物进行筛选,筛选出的 S33、S438、S4853个引物在棕色菌株组能扩增出4个特异条带(大小300~2000 b... 以4个白色和4个棕色双孢蘑菇(Agaricus bisporus )菌株,对其500个随机扩增多态性 DNA (random amplified polymorphic DNA,RAPD)随机引物进行筛选,筛选出的 S33、S438、S4853个引物在棕色菌株组能扩增出4个特异条带(大小300~2000 bp),将特异片段回收,克隆测序,将合成的4对特征序列扩增区域(sequence characterized amplified regions,SCAR)标记引物对48 个 菌株进 行 验 证,结果表明:仅SCAR41200在24个棕色菌株的22个中能扩增出特异条带,而所有白色菌株中都没有此条带,表明该标记与棕色菌株的棕色基因相关。 展开更多
关键词 双孢蘑菇 子实体颜色基因 随机多态性DNA 特征序列扩增区域
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烟草SCAR标记技术的建立 被引量:2
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作者 罗华元 罗昭标 +5 位作者 王绍坤 常寿荣 饶智 董石飞 王广超 马林 《生物技术通讯》 CAS 2012年第5期709-712,共4页
目的:通过烟草随机扩增多态性DNA(RAPD)标记技术建立烟草特征序列扩增区域(SCAR)标记技术,用于烟草品种鉴定。方法:对12个烟草品种的复烤叶片DNA进行RAPD分析,得到2个RAPD特异片段S1和S2,通过切胶回收,连接pUCm-T载体克隆转化,片段测序... 目的:通过烟草随机扩增多态性DNA(RAPD)标记技术建立烟草特征序列扩增区域(SCAR)标记技术,用于烟草品种鉴定。方法:对12个烟草品种的复烤叶片DNA进行RAPD分析,得到2个RAPD特异片段S1和S2,通过切胶回收,连接pUCm-T载体克隆转化,片段测序,设计特异性引物S1-1/S1-2和S2-1/S2-2,对SCAR-PCR扩增退火温度进行优化。结果:2个RAPD标记成功地转化为稳定快捷的SCAR标记,可将红花大金元和NC102等2个品种从12个烟草品种中快捷准确地鉴别出来。结论:SCAR标记可作为准确稳定的DNA水平的烟草品种鉴定方法,可对种植、复烤和配方品种的烟叶或叶片进行鉴别。 展开更多
关键词 随机多态性DNA 特征序列扩增区域 烟草 品种鉴定
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一种新型的分子标记—SCARs验证王浆高产蜜蜂的RAPD分子标记—W316bp的研究 被引量:3
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作者 戴英 徐霞 +1 位作者 汪成富 蒋滢 《中国养蜂》 2003年第3期7-8,共2页
为了验证王浆高产蜜蜂的RAPD分子标记—W 316bp正确性 ,采用了新型分子标记—SCARs ,研究结果获得的SCARs分子标记与原来RAPD分子标记有一致的显性行为 。
关键词 分子标记 蜜蜂 特征序列扩增区域 随机引物多态性DNA
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与瓠瓜品系‘J083’白粉病抗性基因连锁的SCAR分子标记 被引量:10
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作者 王玲平 吴晓花 +2 位作者 汪宝根 徐沛 李国景 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期119-124,共6页
以瓠瓜抗白粉病品系‘J083’和感病品系‘J73’及它们的F1代和F2代分离群体为试验材料,经接种鉴定和抗性遗传规律分析表明:瓠瓜品系‘J083’对白粉病的抗性受单隐性基因控制;从100对扩增片段长度多态性(AFLP)引物组合中获得稳定的多态... 以瓠瓜抗白粉病品系‘J083’和感病品系‘J73’及它们的F1代和F2代分离群体为试验材料,经接种鉴定和抗性遗传规律分析表明:瓠瓜品系‘J083’对白粉病的抗性受单隐性基因控制;从100对扩增片段长度多态性(AFLP)引物组合中获得稳定的多态性引物组合1对,即E-ATG/M-CTC;经回收、测序,特异片段全长为105 bp,并成功将其转化为序列特征性扩增区域(SCAR)标记;经连锁分析,该SCAR标记与白粉病抗性基因的连锁距离为9.6 cM,将其命名为GPDSATG/CTC75.此标记可用于瓠瓜抗白粉病品种的辅助选育. 展开更多
关键词 瓠瓜 白粉病 序列特征区域 分子标记
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航天诱变番茄无限生长突变体RAPD及SCAR分子标记研究 被引量:6
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作者 王艳芳 王世恒 +2 位作者 赵彦宏 郑积荣 祝水金 《航天医学与医学工程》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期407-410,共4页
目的通过对航天诱变所获得的番茄无限生长习性突变体进行分子水平的鉴定,为番茄生长习性分子标记选育提供依据。方法用50个10-mer随机护增多态性DNA(randomly amplified polymorphic DNA,RAPD)RAPD引物检测M1和10-3-2基因组序列多态性,... 目的通过对航天诱变所获得的番茄无限生长习性突变体进行分子水平的鉴定,为番茄生长习性分子标记选育提供依据。方法用50个10-mer随机护增多态性DNA(randomly amplified polymorphic DNA,RAPD)RAPD引物检测M1和10-3-2基因组序列多态性,对多态性片断回收克隆后转化成序列特征性扩增区域(sequence characterized amplified region,SCAR)标记。结果50个RAPD引物中有44个引物扩增出产物,其中2个引物(S165和S168)扩增出稳定的重复性好的多态性条带,均表现为M1缺失条带。其特异扩增产物分子量分别为300bp和1500bp,暂命名为TRS165300和TRS1681500,其中TRS1681500标记已经转换成了稳定的SCAR标记,并可作为该突变体的特异遗传标记。结论航天诱变可以从DNA水平对搭载材料进行诱变,通过航天诱变获得的番茄无限生长习性突变体,为研究番茄生长习性调控提供了宝贵的材料。 展开更多
关键词 航天诱变 番茄 无限生长突变 随机多态性DNA 序列特征区域
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SRAP和SCAR分子标记应用于中药材研究进展 被引量:9
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作者 曹亮 魏宝阳 李顺祥 《科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期104-109,共6页
分子标记技术是基于生物体基因组的遗传分析方法,在动植物的品种鉴定、亲缘关系分析、遗传多样性分析、遗传图谱构建和分子辅助育种等研究中有着广泛的应用。其中相关序列扩增的态性(Sequence-Related Amplified Polymorphism,SRAP)是... 分子标记技术是基于生物体基因组的遗传分析方法,在动植物的品种鉴定、亲缘关系分析、遗传多样性分析、遗传图谱构建和分子辅助育种等研究中有着广泛的应用。其中相关序列扩增的态性(Sequence-Related Amplified Polymorphism,SRAP)是开发较晚、应用较广的分子标记技术,以其简单、高效、重复性良好的优点,在药用植物的遗传学研究中表现出很大的优势。利用分子标记技术构建药材系统发生树,明晰遗传背景和药材品质的关系,辅助中药材品种选育,研究药材道地性成因是近几年的研究热点。本文介绍了SRAP和序列特征性扩增区域(Sequence Characterined Amplified Regions,SCAR)的技术基础,并总结了SRAP常用引物,比较分析了一些中药材的优化反应体系;综述SRAP在中药材的遗传多样性研究、道地性分析、遗传图谱构建等方面的应用情况;SCAR技术的应用特点和在中药材鉴定中的作用;阐述二者结合在中药材研究中的现状及其应用前景。 展开更多
关键词 相关序列的态性 序列特征区域 中药材 道地性 遗传多样性
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马铃薯晚疫病菌抗甲霜灵的SCAR标记 被引量:1
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作者 杜洪忠 侯淑英 +2 位作者 朱杰华 杨志辉 赵秀娟 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期199-203,共5页
建立马铃薯晚疫病菌抗甲霜灵SCAR(sequenced characterized amplified region,序列特征扩增区域)标记,以马铃薯晚疫病菌对甲霜灵高抗菌株HD01-3和对甲霜灵高感菌株DK98-1为亲本,通过无性单游动孢子分离和有性杂交获得菌株HD01-3无性后... 建立马铃薯晚疫病菌抗甲霜灵SCAR(sequenced characterized amplified region,序列特征扩增区域)标记,以马铃薯晚疫病菌对甲霜灵高抗菌株HD01-3和对甲霜灵高感菌株DK98-1为亲本,通过无性单游动孢子分离和有性杂交获得菌株HD01-3无性后代群体、菌株DK98-1无性后代群体以及F1代分离群体,以此为试验材料,利用BSA法(bulked segregant analysis,分离群体分组分析法)构建抗感基因池对后代菌系的甲霜灵抗性进行RAPD(random amplified polymorphic DNA,随机扩增多态性DNA)分析。从178条RAPD随机引物中找到一条特异性引物S2054,其可以扩增出一个与晚疫病菌对甲霜灵抗性相关的遗传标记,将该特异条带回收、克隆、测序,发现此标记大小为457bp,根据测序结果设计特异PCR引物,用于扩增抗感基因池,成功地将特异RAPD标记转化为SCAR标记。初步建立了马铃薯晚疫病菌抗甲霜灵SCAR标记,辅助监测晚疫病菌对甲霜灵的抗性。 展开更多
关键词 致病疫霉 随机多态性DNA 序列特征区域 甲霜灵抗性
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玉米螟赤眼蜂种群特异分子标记构建及其应用 被引量:1
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作者 董贝 王素琴 李正西 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期1210-1218,共9页
赤眼蜂是我国乃至世界范围内应用最广的卵寄生蜂,其中玉米螟赤眼蜂Trichogramma ostriniae Pang et Chen是我国玉米种植区重要的天敌昆虫,但其不同的地理种群在生物防治效果上存在较大差异。为了有效利用玉米螟赤眼蜂的优势种群,有必要... 赤眼蜂是我国乃至世界范围内应用最广的卵寄生蜂,其中玉米螟赤眼蜂Trichogramma ostriniae Pang et Chen是我国玉米种植区重要的天敌昆虫,但其不同的地理种群在生物防治效果上存在较大差异。为了有效利用玉米螟赤眼蜂的优势种群,有必要对其进行准确的鉴别。然而,采用传统形态学方法对同一种赤眼蜂的不同种群进行鉴别是非常困难的。本研究首先采用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记对采自我国北京农科院、山东日照和山西太原的3个玉米螟赤眼蜂种群,进行了遗传差异分析,然后筛选了种群特异性位点,并通过克隆测序和引物设计构建了种群特异性分子标记,即序列特征性扩增区域(SCAR)标记。最后,利用SCAR标记对混合蜂群竞争试验结果进行了分子检测。该研究方法有助于玉米螟赤眼蜂优势种群的筛选,对于赤眼蜂的有效利用具有重要的意义。 展开更多
关键词 玉米螟赤眼蜂 随机多态性DNA RAPD 序列特征区域标记 SCAR 混合蜂群竞争试验
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Designing a SCAR molecular marker for monitoring Trichoderma cf. harzianum in experimental communities
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作者 Gabriel PéREZ Valentina VERDEJO +2 位作者 Clarissa GONDIM-PORTO Julieta ORLANDO Margarita CARú 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2014年第11期966-978,共13页
Several species of the fungal genus Trichoderma establish biological interactions with various micro- and macro-organisms. Some of these interactions are relevant in ecological terms and in biotechnological applicatio... Several species of the fungal genus Trichoderma establish biological interactions with various micro- and macro-organisms. Some of these interactions are relevant in ecological terms and in biotechnological applications, such as biocontrol, where Trichoderma could be considered as an invasive species that colonizes a recipient community. The success of this invasion depends on multiple factors, which can be assayed using experimental communities as study models. Therefore, the aim of this work is to develop a species-specific sequence-characterized amplified region (SCAR) marker to monitor the colonization and growth of T. cf. harzianum when it invades experi- mental communities. For this study, 16 randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) primers of 10-mer were used to generate polymorphic patterns, one of which generated a band present only in strains of T. cf. harzianum. This band was cloned, sequenced, and five primers of 20-23 mer were designed. Primer pairs 2F2/2R2 and 2F2/2R3 successfully and specifically amplified fragments of 278 and 448 bp from the T. cf. harzianum BpT10a strain DNA, respectively. Both primer pairs were also tested against the DNA from 14 strains of T. cf. harzianum and several strains of different fungal genera as specificity controls. Only the DNA from the strains of T. cf. hat-zianum was successfully amplified. Moreover, primer pair 2F2/2R2 was assessed by quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) using fungal DNA mixtures and DNA extracted from fungal experimental communities as templates. T. cf. harzianum was detectable even when as few as 100 copies of the SCAR marker were available or even when its population represented only 0.1% of the whole community. 展开更多
关键词 Tnchoderma cf. harzianum Sequence-characterized amplified region (SCAR) Molecular marker Experimental fungal communities
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