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特色桑品种资源ITS、TrnL-F和rps16序列与亲缘关系分析
被引量:
5
1
作者
刘玲
张佳钰
+7 位作者
范小敏
陈祥平
柯皓天
黄昊翔
贾庭豪
李天星
付乐章
陈仁芳
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期1074-1079,共6页
为了更好地开发利用特色桑树品种,分析了龙桑、龙须桑等12个特色桑资源ITS、TrnL-F、rps16碱基序列的长度、G+C含量、亲缘关系、遗传距离及信息变异位点。结果表明,ITS间隔区(包括5.8S)全长为576-590 bp,G+C含量59.38%-60.17%;TrnL-...
为了更好地开发利用特色桑树品种,分析了龙桑、龙须桑等12个特色桑资源ITS、TrnL-F、rps16碱基序列的长度、G+C含量、亲缘关系、遗传距离及信息变异位点。结果表明,ITS间隔区(包括5.8S)全长为576-590 bp,G+C含量59.38%-60.17%;TrnL-F间隔区(包括TrnL内含子)全长为920-923 bp,G+C含量为34.02%-34.24%;rps16内含子全长为929-947 bp,G+C含量为32.51%-33.26%。亲缘关系分析显示,分支图首先将外类群—构树分出,紧接着分出的是新疆黑桑。再依次为咸丰长穗桑、钦州长果桑、神农华桑、广东大10、雅安白桑、斯里兰卡1号、湖北蒙桑4号、龙桑、和田白桑,龙须桑、剑持、小冠桑在分支树的最顶层。根据外类群确定法,新疆黑桑为原始类型,龙须桑、剑持、小冠桑为最进化类型。遗传距离分析显示,新疆黑桑、剑持、咸丰长穗桑、钦州长果桑、小冠桑与其他桑属材料的遗传距离分别为1.0-1.3、0.2-0.3、0.1-0.4、0.1-0.2、0-0.3,龙桑、斯里兰卡1号、雅安白桑、和田白桑、广东大10、龙须桑、湖北蒙桑4号与其他桑属材料间遗传距离差异不大。信息变异位点分析显示共有14个信息位点,占总位点数的0.5564%。变异主要发生在外类群—构树和新疆黑桑,且变异大多集中在ITS区域。ITS、TrnL-F和rps16三片段分析桑属的亲缘关系,信息位点不足,有待深入研究。
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关键词
特色桑资源
ITS、TrnL-F、rps16序列
遗传距离
亲缘关系
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职称材料
题名
特色桑品种资源ITS、TrnL-F和rps16序列与亲缘关系分析
被引量:
5
1
作者
刘玲
张佳钰
范小敏
陈祥平
柯皓天
黄昊翔
贾庭豪
李天星
付乐章
陈仁芳
机构
西南大学生物技术学院
四川省丝绸工程技术研究中心
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期1074-1079,共6页
基金
四川省科技计划项目(2013NZ0048)
文摘
为了更好地开发利用特色桑树品种,分析了龙桑、龙须桑等12个特色桑资源ITS、TrnL-F、rps16碱基序列的长度、G+C含量、亲缘关系、遗传距离及信息变异位点。结果表明,ITS间隔区(包括5.8S)全长为576-590 bp,G+C含量59.38%-60.17%;TrnL-F间隔区(包括TrnL内含子)全长为920-923 bp,G+C含量为34.02%-34.24%;rps16内含子全长为929-947 bp,G+C含量为32.51%-33.26%。亲缘关系分析显示,分支图首先将外类群—构树分出,紧接着分出的是新疆黑桑。再依次为咸丰长穗桑、钦州长果桑、神农华桑、广东大10、雅安白桑、斯里兰卡1号、湖北蒙桑4号、龙桑、和田白桑,龙须桑、剑持、小冠桑在分支树的最顶层。根据外类群确定法,新疆黑桑为原始类型,龙须桑、剑持、小冠桑为最进化类型。遗传距离分析显示,新疆黑桑、剑持、咸丰长穗桑、钦州长果桑、小冠桑与其他桑属材料的遗传距离分别为1.0-1.3、0.2-0.3、0.1-0.4、0.1-0.2、0-0.3,龙桑、斯里兰卡1号、雅安白桑、和田白桑、广东大10、龙须桑、湖北蒙桑4号与其他桑属材料间遗传距离差异不大。信息变异位点分析显示共有14个信息位点,占总位点数的0.5564%。变异主要发生在外类群—构树和新疆黑桑,且变异大多集中在ITS区域。ITS、TrnL-F和rps16三片段分析桑属的亲缘关系,信息位点不足,有待深入研究。
关键词
特色桑资源
ITS、TrnL-F、rps16序列
遗传距离
亲缘关系
Keywords
characteristic mulberry resources
ITS
TrnL-F
rps16 sequence
genetic distance
genetic relationship
分类号
S888 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
特色桑品种资源ITS、TrnL-F和rps16序列与亲缘关系分析
刘玲
张佳钰
范小敏
陈祥平
柯皓天
黄昊翔
贾庭豪
李天星
付乐章
陈仁芳
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
5
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