基因序列分析鉴定犬冠状病毒分离株

采用双脱氧末端终止法测定了克隆于重组质粒YS1pUC、CI1pUC上的2株国分离病毒CCV YS1、CI1部分纤突蛋白基因序列,以计算机软件推导氨基酸序列,进行核苷酸和氨基酸序列的多重比校,绘制系统进化树,分析重要抗原位点氨基酸残基的变化情况,预测蛋白质疏水性和二级结构。结果表明:重组质粒中含有571bp的外源基因,核苷酸和氨基酸序列与国外发表的K378等5株CCV相应序列的同源性分别为91.7％～99.4％和92.0％～99.4％,而与猪传染性胃肠炎病毒PUR46株和猫传染性腹膜炎病毒1146株的同源性为90.2％和88.0％～90.0％。A抗原的Ab亚位点上的氨基酸残基与各株CCV相同,不同于其他冠状病毒。由此进一步证明,2株国内分离病毒CCV YS1、CI1为犬冠状病毒。

浒苔多糖体外抗犬冠状病毒临床分离株的作用研究

利用A72细胞(犬纤维肉瘤细胞系)从山东某宠物医院临床上表现为急性胃肠炎症状的幼犬腹泻粪便中分离到1株病毒,通过间接免疫荧光(IFA)和RT-PCR进行鉴定,确定为犬冠状病毒,命名为CCoV-SW1。为探讨浒苔多糖(EPS)体外抗CCoV-SW1毒株的作用效果,以A72细胞为细胞模型,通过直接杀灭、抑制复制及阻断吸附3个方面进行研究。结果表明,EPS对A72细胞最大安全浓度为62.5mg/L;EPS对CCoV感染A72细胞抑制率与EPS质量浓度有一定量效关系;EPS对CCoV具有直接杀灭和阻断吸附的作用,并且与EPS浓度具有量效关系;EPS抑制CCoV复制效果不明显,但仍有一定效果,当EPS浓度为62.5mg/L时,细胞存活率为37.2%。EPS在体外对CCoV具有直接杀灭和阻断吸附的作用,为CCoV的预防和治疗提供依据。

混合感染病例中犬冠状病毒变异株的分离鉴定

某犬群发生具有呼吸道和消化道症状的传染病,86只幼犬发病,治愈65只,死亡21只。为确诊病原,用MD-CK细胞,从死亡犬肠道病料中分离到2株病毒,经理化学鉴定、动物复归试验、电镜检查、PCR检测证明为犬冠状病毒和犬腺病毒2型,定名为CCV-KM和CAV2-KM,确认此次犬群发病由CCV和CAV2混合感染所致。其中对CCV的分离采用含CCV和CAV2的混合感染病料攻击耐过CAV2的幼犬,导致幼犬单纯感染CCV发病后采集的病料。动物试验表明,CCV-KM株可以导致幼犬发病,具有较强的毒力;CCV-KM能被较高浓度的抗CCV1-71参考毒株的血清中和,而抗CCV-KM的血清却不能中和CCV1-71毒株,说明两者在抗原性和致病性上存在差异;基因测序结果表明,CCV-KM的M基因212 bp序列同其他已知CCV的基因序列差异较大,在进化树的位置上介于CCVⅠ型和CCVⅡ型之间,较偏向CCVⅠ型。提示CCV-KM株可能是一个新的变异株。

上海株犬冠状病毒的分离鉴定及S基因的遗传进化分析

利用A72细胞(犬纤维肉瘤细胞系)从上海市某宠物医院临床表现为急性胃肠炎症状的幼犬腹泻粪便中分离到1株病毒,通过噬斑纯化、病毒理化特性检测以及动物回归实验和RT-PCR鉴定,证明所分离到的病毒为犬冠状病毒(Canine coronavirus,CCV),将其命名为CCV-SHdc株。根据Gen Bank公布的CCV S基因序列,设计合成4对特异性引物,利用RT-PCR成功扩增获得CCV-SHdc株S基因序列,同时进行序列测定和核苷酸系统发育进化树绘制。结果显示,CCV-SHdc株的S基因序列全长4 364 bp;该毒株与日本分离的CCV 5821株亲缘关系最近,处于同一分支,与意大利分离的CCV 23/03和CCV Elmo/02株亲缘关系较远。核苷酸与氨基酸同源性分析表明,CCV-SHdc株与CCV 23/03和CCV Elmo/02株可能属于不同基因型,已有很多点发生突变,这种突变的累积有可能引起病毒毒力的变化。

犬细小病毒分离株VP2基因的克隆与序列分析

以犬细小病毒 (Canine parvovirus,CPV)扬州分离株病毒的 DNA为模板 ,根据基因库 CPV-d序列设计合成了VP2基因的 1对特异引物 ,进行聚合酶链式反应 ,扩增出约 1 .7kb的片段 ,按常规方法克隆进 p UC1 8载体 ,经 Eco R 和Sal 双酶切筛选到阳性质粒 ,进一步对该片段进行序列分析。结果表明 :所扩增基因片段长度为 1 740 bp,与美国参考株 CPV-d (type 2 )、CPV-1 5 (type 2 a)、CPV-3 9(type 2 b)相比较 ,核苷酸同源性分别高达 99.5 %、99.7%、99.7%。

大熊猫犬冠状病毒的分离与鉴定

以犬肾传代细胞(MDCK)从1只病死大熊猫肝脏中分离到1株病毒,命名为DXMV。电镜观察磷钨酸负染的病毒细胞培养物,发现冠状病毒样粒子,超薄切片上可见细胞浆内病毒包涵体。理化学和生物学鉴定结果表明,DXMV核酸类型为RNA,对氯仿、乙醚敏感,可耐受1%胰蛋白酶的作用,具有一定的耐酸性和耐热性,可在MDCK、FCWF、F81细胞中增殖,无血凝性和血吸附特性。血清中和试验结果表明,DXMV可被犬冠状病毒阳性血清中和。采用犬冠状病毒间接荧光抗体法染色DXMV细胞飞片,可在细胞浆内见到特异性荧光。以冠状病毒通用引物和犬冠状病毒特异性引物,可从大熊猫肝脏和不同代次的病毒细胞培养物中扩增出与预期值251bp和515bp大小相同的核苷酸片段。由此说明,该病毒为犬冠状病毒,大熊猫可被犬冠状病毒感染。

犬冠状病毒的分离鉴定及其纤突蛋白基因的克隆与序列比较

以犬胎原代细胞，采用同步接种、带毒传代和添加新细胞的方法，从１例腹泻犬脾脏和１例临床健康犬肠内容物中分离出２株犬冠状病毒（ＣＣＶＹＳ１，ＣＣＶＣＩ１）。该２株病毒可使ＣＲＦＫ细胞出现典型的细胞融合病变，与从美国引进的ＣＣＶＮＬ－１８参考株形成的细胞病变相似；电镜负染和超薄切片观察，分离毒株细胞培养物中均含有典型的冠状病毒粒子，并形成胞浆内包涵体；经理化学、生物学鉴定，具有ＣＣＶ的特性；间接免疫荧光试验鉴定，证明为ＣＣＶ；动物回归试验证明，ＣＣＶＹＳ１毒力较强，ＣＣＶＣＩ１毒力较弱。利用ＲＴ－ＰＣＲ技术，分别扩增了ＣＣＶＮＬ－１８、ＣＣＶＹＳ１和ＣＣＶＣＩ１株纤突蛋白（Ｓ）主要功能区基因片段，经克隆、序列测定、计算机比较核苷酸和推导的氨基酸序列，结果为：（１）ＣＣＶＹＳ１和ＣＣＶＣＩ１与国外发表的Ｋ３７８等５株ＣＣＶ和ＣＣＶＭＬ－１８株的同源性为９１．７％～９９．４％和９２．０％～９９．４％，而与ＴＧＥＶ和ＦＩＰＶ的同源性为９０．２％和８８．０％～９０．０％；Ａｂ抗原亚位点与ＣＣＶ相同，不同于ＴＧＥＶ和ＦＩＰＶ，进一步证明本研究分离的病毒为ＣＣＶ；（２）ＣＣＶＹＳ１、ＣＣＶＣＩ１株与Ｋ３７８等ＣＣＶ强毒株同源?

从猝死症犬心肌分离出冠状病毒

应用电镜观察，在猝死犬的心肌中发现典型的冠状病毒粒子。用牛肾传代细胞（ＭＤＢＫ）分离培养该病毒获得成功，电镜负染色法跟踪观察，每一代细胞培养液中均观察到典型的冠状病毒粒子。其病毒形态呈圆形和椭圆形为主的多形性，直径７０～１６０ｎｍ，有囊膜，囊膜表面有间距较宽（长约２０ｎｍ）的突起，突起顶端膨大呈鼓槌样，负染色法观察时呈现花冠样结构。用第５代接毒培养的细胞作电镜超薄切片观察，在细胞质的空泡中发现有数量不等的典型冠状病毒粒子，即病毒包涵体。经鉴定为ＲＮＡ病毒，对乙醚敏感，３７℃７２ｈ可失去活性。在ｐＨ３的条件下。

犬细小病毒YZ分离株的鉴定

对 1999年冬季江苏省实验动物Beagle犬基地暴发的以拉稀、便血、高死亡率的病犬作流行病学调查、病理和实验室诊断。粪样血凝价高达 2 14 以上 ,并用HI加以验证 ,初步诊断为犬细小病毒感染引起的出血性肠炎。用FK81细胞 (胎猫肾传代细胞 )分离病毒 ,细胞上清HA试验阳性 ;负染电镜观察到大小为 2 0nm左右的病毒粒子 ;接种病料的细胞IFA检测可见特异性的亮绿色荧光。在小肠的病理切片中见到典型的嗜酸性核内包涵体。以此确诊为犬细小病毒感染引起的出血性肠炎。利用双琼脂空斑技术克隆一株犬细小病毒 ,命名为CPV_YZ株 ,其核酸型是单链DNA ,对甲醛敏感 ,对氯仿、酸、胰蛋白酶不敏感 ,80℃ 6 0分钟失去活力 ,0 .1mlTCID50 是 10 -6.8,SDS_PAGE电泳两条清析的条带分别为 :76kD的VP1,6 4kD的VP2。

H9N2亚型猪流感病毒山东分离株的分离鉴定及其HA、NP、NS基因序列分析

从山东地区疑似流感发病猪分离到 10株流感病毒 ,经国家流感中心鉴定均为 A型流感病毒 H9N2亚型。将其中 1株 Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3(H9N2 )的血凝素基因 (HA)、核蛋白基因 (NP)和非结构蛋白基因 (NS)进行克隆与测序 ,与Gen Bank收录的其他猪流感和禽流感 H9N2亚型的相关基因进行比较 ,推测 Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3(H9N2 )可能源于禽流感病毒 H9N2亚型和 H5 N1亚型的重组病毒 ;Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3的 HA氨基酸裂解位点与其他 H9N2亚型不同 ,Sw/ SD/1/ 2 0 0 3的 HA氨基酸裂解位点是 R- S- L- R- G,而其他猪流感和禽流感 H9N2亚型都是 R- S- S- R- G。

犬细小病毒弱毒株的分离及疫苗应用

目的 从犬四联弱毒样品中分离获得一株细小病毒(CPV)弱毒株 ,用于疫苗制备 .方法 根据犬副流感的血球吸附特性、细胞培养特性以及异种病毒抗血清阻断法分离病毒 .该病毒简称为 CPV- XN1 株 .并对犬细小病毒疫苗的免疫性和动物安全性进行了研究 .结果 病毒分离后其血凝效价(HA)值为 1∶ 10 2 4～ 1∶ 40 96或 10 7.0 TCID5 0 ;在电镜下可见较典型的犬细小病毒形态结构特征 ;免疫电镜下见到抗体分子已被吸附在病毒颗粒表面 ;病毒接种到健康幼犬后 15 d内未发现仔犬死亡 ;实验组犬均未出现临床症状 ;疫苗保存 6mo,其效价只降低一个滴度 .

犬Ⅰ型腺病毒TN株的分离鉴定

应用 MDCK细胞采用单层吸附接毒和带毒传代的方法 ,从新疆阿克苏送检的犬粪便中分离出 1株犬腺病毒 ,并对其进行了形态学、理化学、血清学、动物感染试验、分子生物学鉴定。结果证明所分离的 TN株为 1株CAV-

犬冠状病毒大熊猫株核蛋白基因的克隆、序列分析及其在E.coli中的高效表达

首次对犬冠状病毒大熊猫株(CCVGP)核蛋白(N)基因进行了克隆和序列测定。本实验根据GenBank中报道的CCVlnsavc-1株N蛋白基因序列,设计了一对特异性引物,对分离的CCVGP野毒株进行了RT-PCR扩增。将扩增的PCR产物纯化回收后与pGEM T连接得到重组质粒pTN,进行核苷酸序列测定。结果该基因全长1146bp,编码382个氨基酸;与CCⅤ标准毒株Insavc-lN基因相比,核苷酸的同源性为92 6%,推导的氨基酸的同源性为93 2%。在推导的N蛋白N端156-179位存在一个SRXX富集区,与小鼠肝炎病毒N蛋白相应区域相同,推测可能是RNA结合区。预测的GP株N蛋白疏水性和抗原表位与Insavc-l株N蛋白存在细微的差异。将pTN双酶切,回收目的基因片段克隆到大肠杆菌表达载体pET28a中构建了重组质粒pETN,转化大肠杆茵BL21,用IPTG进行了诱导表达。结果重组菌菌体裂解物经SDS-PAGE电泳可检测到相对分子量为48KD的重组蛋白,免疫印迹法证实该重组蛋白可以与CCV多克隆抗体发生特异性反应。经凝胶薄层扫描分析,重组N蛋白表达量可占菌体蛋白的49 3%,表达的蛋白纯化后可用于建立检测大熊猫CCV抗体间接ELISA用的包被抗原。

雏鸭病毒性肝炎病毒山东株的分离鉴定

自山东地区疑似雏鸭病毒性肝炎的发病或病死肉雏鸭的肝脏中分离到3株病毒,经病毒分离、血清中和试验、单抗Dot-ELISA鉴定、氯仿敏感试验以及动物回归试验,确诊该地区雏鸭所患为Ⅰ型鸭病毒性肝炎。高免卵黄抗体的被动保护试验结果表明,高免卵黄抗体可有效控制Ⅰ型雏鸭病毒性肝炎的发生。

犬细小病毒敦化株的分离与鉴定

为了丰富我国延边地区犬细小病毒流行病学研究资料,为进一步研究有效的疫苗及诊断试剂做前期基础工作。采集延边州敦化市地区疑似犬细小病毒感染病犬的粪便样品,经过预处理后同步接种猫肾细胞(F81),盲传至细胞出现明显病变,经形态学、分子生物学、免疫学等方法进行分析鉴定。结果:分离到的病毒可使F81细胞出现特异性病变、电镜下可见清晰的病毒粒子、其培养物可使红细胞发生凝集且能被特异性阳性血清所抑制、用特异性引物进行PCR检测结果呈阳性、免疫荧光试验可见培养物出现特异性绿色荧光,针对其VP2序列建立的进化树显示其与new CPV-2b型犬细小病毒有较高的同源性。结论:通过上述试验确定分离出1株犬细小病毒,分离的病毒为new CPV-2b型,命名CPV-DH-3株。

犬冠状病毒大熊猫株纤突蛋白全基因的克隆与序列分析(英文)

在国内首次对犬冠状病毒大熊猫野毒株(CCVDXMV)纤突蛋白基因进行了克隆和序列测定。该基因全长4362bp,编码1453个氨基酸,N端前18个氨基酸为推测的信号肽序列,后1435个氨基酸构成成熟蛋白。与GenBank中已发表的11个CCV毒株S基因相比,S基因核苷酸序列同源性在40.2%～99.5%之间;推导的氨基酸序列同源性在15.9%～99.0%之间。DXMV株S基因变异区主要集中在该基因前1/2处,其中350-370、439-478、1718-1818三个区域碱基变异较大,而1060-1700区却十分保守。基于S全基因及其蛋白的聚类分析表明,DXMV株与K378、NVSL和USpatent株亲源关系最近。推导的DXMV株S蛋白氨基酸序列潜在的N-联糖基化位点与CCV强毒V54相同,为34个,比Insavc-1弱毒多一个;其中第566-568位糖基化位点为多数强毒拥有而弱毒没有的。另外,DXMV株S蛋白疏水性及抗原表位与其它毒株有一定的差异,这些差异对DXMV株致病性和免疫原性等影响尚待进一步的研究。

犬冠状病毒YS1株的致弱驯化与免疫试验

应用猫肾传代细胞（ＣＲＦＫ） 单层接毒方法将犬冠状病毒（ＣＣＶ） 强毒ＹＳ１ 株连续传代驯化至６０ 代，经安全性试验和免疫原性测定，该强毒株己驯化至弱毒水平，对犬安全，免度原性良好。

犬冠状病毒V1株纤突蛋白全基因克隆与序列分析

首次对犬冠状病毒(CCV)V1株纤突蛋白(S)基因进行了克隆和测序。根据GenBank中报道的CCVV54株S基因序列,设计了一对特异性引物,对CCVV1野毒株S基因进行了RT-PCR扩增。将扩增得到的PCR产物纯化后克隆到pGEM-T中得到重组质粒pTS,用于序列测定。结果该基因全长4362bp,编码1453个氨基酸,N端前18个氨基酸为推测的信号肽序列,后1435个氨基酸构成成熟蛋白。将V1株S全基因与GenBank中已发表的6个CCV毒株S基因进行了比较,结果核苷酸序列同源性在91.0%～99.0%之间;推导的氨基酸序列同源性在93.0%～99.0%之间;同时发现CCV变异区主要集中在S基因前1/2处,其中350-370、439-478、1718-1818三个区域碱基变异较大,而1060-1700区碱基却十分保守。基于S全基因聚类分析结果表明,S基因分型结果与CCV毒力强弱并不一致;V1野毒株推导的S蛋白潜在的N-联糖基化位点与CCVV54强毒相同,均为34个,比Insavc-1弱毒多一个;其中第566-568位糖基化位点是多数强毒拥有而弱毒Insavc-1没有的。推导的V1株S蛋白疏水性及抗原表位与Insavc-1株有一定的差异,这些差别对病毒致病性和免疫原性等影响需进一步的研究。

犬腺病毒Ⅰ型流行毒株的分离与鉴定

目的 分离、鉴定犬腺病毒 型流行毒株 .方法 将处理过的病犬肝组织悬液 ,感染原代犬胎肾细胞 .用血凝试验、中和试验、回归试验以及电镜观察等方法 ,分离、鉴定 .结果 分离出一株犬腺病毒 型流行毒株 ,命名为 CAV1 -XN3株 .