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吸虱亚目trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间独立进化和协同进化的研究 被引量:1
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作者 张艳芳 董文鸽 陈婷 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期920-930,共11页
【目的】吸虱亚目是真兽类动物的永久专性体表寄生虫。吸虱亚目的线粒体基因组发生了剧烈的裂化,形成了不同于以往典型单一大环的多个裂化微环。本文对17种吸虱以及外群尖叫虱Bothriometopus macrocnemis的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa... 【目的】吸虱亚目是真兽类动物的永久专性体表寄生虫。吸虱亚目的线粒体基因组发生了剧烈的裂化,形成了不同于以往典型单一大环的多个裂化微环。本文对17种吸虱以及外群尖叫虱Bothriometopus macrocnemis的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行比较分析,探讨trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间的独立进化和协同进化。【方法】对云南采集到的3科3属4种吸虱(弯多板虱Polyplax reclinata、锯多板虱Polyplax serrata、太平洋甲胁虱Hoplopleura pacifica和麝鼩钩板虱Ancistroplax crocidurae),用IlluminaMiSeq PE250平台高通量测序后与GenBank中查找的其它13种吸虱及尖叫虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行比较,采用最大简约法(Maximumparsimony,MP)分析17种吸虱trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因的进化关系。【结果】17种吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因均形成典型的三叶草结构,trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因在虱属、阴虱属和猴虱属中有较长的等同序列;在甲胁虱属和钩板虱属中有很短的等同序列;在多板虱属、微胸虱属和血虱属中的等同序列介于二者之间。常见典型单一环状线粒体基因组物种的trnL_(1)(tag)和trn L_(2)(taa)基因等同序列的长度在6-10 bp之间。对17种吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行同源性比较分析,发现不同属吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列相似度差异较大,同属内吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列相似度差异较小。基于17种吸虱及尖叫虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因构建系统进化树,结果表明trnL_(1)(tag)、trnL_(2)(taa)及trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间既有协同进化又有独立进化。【结论】trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因等同序列较长的吸虱易发生协同进化,等同序列较短的吸虱易发生独立进化。吸虱亚目的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因协同进化是长期的或发生在远缘物种间,而独立进化是短期(两次重组事件间)的或发生在近缘物种间。吸虱亚目线粒体基因组的裂化模式可能影响trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因等同序列的长短。 展开更多
关键词 吸虱 trnL_(1)(tag) trnL_(2)(tag) 裂化线粒体基因组 协同进化 独立进化
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用个体独立优化进化策略求非线性方程的近似根
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作者 王冬冬 周永权 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2006年第20期3774-3776,共3页
简要介绍进化策略的基本原理和基本技术,在此基础上,提出一种基于(1+1)-ES的新型个体独立优化进化策略算法,并应用于求解非线性方程,利用该算法可获得任意给定所求非线性方程的近似根。相比传统的求解方法,克服了传统方法所存在的误差... 简要介绍进化策略的基本原理和基本技术,在此基础上,提出一种基于(1+1)-ES的新型个体独立优化进化策略算法,并应用于求解非线性方程,利用该算法可获得任意给定所求非线性方程的近似根。相比传统的求解方法,克服了传统方法所存在的误差累积、一次只能求出一个根等缺陷。实验结果表明,该方法是有效可行的,其目的为求非线性方程近似根提供一新方法,由于数学物理中许多问题常常归结为求解非线性方程,因此,该方法将在科学工程计算等领域有着广泛地应用。 展开更多
关键词 个体独立优化进化策略 相距点 记忆性(1+1)-ES 非线性方程 近似根
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Stewart平台的合作型协同进化控制
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作者 孙坚 王强 王仁明 《三峡大学学报(自然科学版)》 CAS 2011年第3期96-99,共4页
针对Stewart平台的非线性和强耦合性,提出合作型协同进化的控制方式,在此控制方式的基础上,根据控制系统的特征引入χ2分布来调节个体产生的概率,来提高进化速度.与传统的遗传算法相比,本文提出的控制方式大大减小了搜索空间.经在Stewar... 针对Stewart平台的非线性和强耦合性,提出合作型协同进化的控制方式,在此控制方式的基础上,根据控制系统的特征引入χ2分布来调节个体产生的概率,来提高进化速度.与传统的遗传算法相比,本文提出的控制方式大大减小了搜索空间.经在Stewart平台上测试,本文提出的控制方式具有响应速度快、超调小和鲁棒性好等优点. 展开更多
关键词 STEWART平台 合作型协同进化 χ2分布函数 独立进化
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QoS组播路由的多种群遗传算法 被引量:11
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作者 许利军 杨棉绒 《科技通报》 北大核心 2012年第5期171-174,共4页
针对单种群遗传算法在求解QoS组播路由问题中存在的容易早熟、收敛性差等缺陷,提出了一种基于多种群遗传算法的QoS组播路由算法。该算法在初始化过程中采用多种初始化算法生成了不同种群,并设计了多种交叉、变异操作,保证了种群间进化... 针对单种群遗传算法在求解QoS组播路由问题中存在的容易早熟、收敛性差等缺陷,提出了一种基于多种群遗传算法的QoS组播路由算法。该算法在初始化过程中采用多种初始化算法生成了不同种群,并设计了多种交叉、变异操作,保证了种群间进化过程的独立性和算法的多样性;增加了种群间协调机制,提高了算法的整体收敛性。仿真结果证明了多种群遗传算法的有效性和优越性。 展开更多
关键词 多种群遗传算法 QOS组播路由 独立进化 初始种群
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北京地区人工引入东方铃蟾种群的遗传变异分析 被引量:2
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作者 朱国芬 史洋 +3 位作者 田恒久 李杨 高福利 鲍伟东 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期27-30,69,共5页
北京地区现有东方铃蟾为1927年由山东烟台人工引进的200余只个体的后代,历经几十年独立进化,无新个体引入,成为研究动物种群独立进化的良好样本。实验基于线粒体及微卫星标记,对取自北京香山人工引进种群和山东烟台源种群栖息地的55只... 北京地区现有东方铃蟾为1927年由山东烟台人工引进的200余只个体的后代,历经几十年独立进化,无新个体引入,成为研究动物种群独立进化的良好样本。实验基于线粒体及微卫星标记,对取自北京香山人工引进种群和山东烟台源种群栖息地的55只东方铃蟾样品进行了种群遗传变异分析。线粒体标记显示,北京及山东种群单倍型多样性分别为0.489和0.950,核苷酸多样性分别为0.0018和0.0033。系统进化树(NJ/ML)及单倍型间的网络图均显示两种群间的单倍型未形成显著的谱系分化。微卫星标记显示,北京及山东种群的观测杂合度分别为0.468和0.631,期望杂合度分别为0.548和0.701。Structure 软件将扩增成功的54只个体归为北京、山东两个遗传聚类簇。总体看来,北京种群显示出较低的遗传多样性,出现隔离进化衰退趋势,但仍处于适中水平,能够维持种群生存。因此,无需引入新个体。 展开更多
关键词 东方铃蟾 线粒体 DNA 标记 微卫星标记 独立进化 遗传变异
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A New General Algebraic Method and Its Application to Shallow Long Wave Approximate Equations
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作者 ZHAO Xue-Qin ZHI Hong-Yan 《Communications in Theoretical Physics》 SCIE CAS CSCD 2007年第5X期781-786,共6页
A new general algebraic method is presented to uniformly construct a series of exact solutions for nonlinear evolution equations (NLEEs). For illustration, we apply the new method to shallow long wave approximate eq... A new general algebraic method is presented to uniformly construct a series of exact solutions for nonlinear evolution equations (NLEEs). For illustration, we apply the new method to shallow long wave approximate equations and successfully obtain abundant new exact solutions, which include rational solitary wave solutions and rational triangular periodic wave solutions. The method is straightforward and concise, and it can also be applied to other nonlinear evolution equations in mathematical physics. 展开更多
关键词 new general algebraic method nonlinear evolution equations solitary wave solutions
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基于线粒体DNA控制区基因讨论雉鸡阿拉善亚种分类地位(英文) 被引量:1
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作者 曲江勇 刘迺发 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2013年第2期215-224,共10页
雉鸡阿拉善亚种的分类地位存在争议。采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序方法讨论雉鸡阿拉善亚种是否确立。共测定了雉鸡12个种群132个样本的线粒体DNA(mtDNA)控制区(control-region)1078个碱基长度的基因序列,61个变异位点产生68个单... 雉鸡阿拉善亚种的分类地位存在争议。采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序方法讨论雉鸡阿拉善亚种是否确立。共测定了雉鸡12个种群132个样本的线粒体DNA(mtDNA)控制区(control-region)1078个碱基长度的基因序列,61个变异位点产生68个单倍型。系统发育树和单倍型网络图结果显示,雉鸡阿拉善亚种是单系枝。雉鸡阿拉善亚种与甘肃亚种的分歧时间(0.15~0.23百万年)发生在晚更新世,中国西部干旱化、腾格里沙漠的形成以及贺兰山的存在导致分歧形成。结合系统发生树、单倍型网络图、Fst值(P<0.001)以及基因流(M_sohokhotensis to strauchi=0.006,M_strauchi to sohokhotensis=0.014),雉鸡阿拉善亚种在其分布区内独立进化。 展开更多
关键词 雉鸡阿拉善亚种 线粒体DNA 控制区基因 独立进化
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黑猩猩 到底有多聪明?
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作者 韩宁 松泽哲郎(图) 《森林与人类》 2021年第1期52-63,共12页
大约500万年前,人类与黑猩猩从共同祖先那里分别走上了独立进化的道路,黑猩猩进入了森林,人类则步入了草原。黑猩猩与人类基因相似度高达98.8%。国际灵长类学会原主席松泽哲郎教授,用40多年研究的实证结果告诉人们:黑猩猩到底有多聪明?
关键词 黑猩猩 人类基因 共同祖先 灵长类 相似度 郎教授 独立进化 聪明
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