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猪细小病毒S-1A株对细胞的适应性及其培养条件的优化
1
作者 朱永军 张婉华 +2 位作者 林鸷 何锡忠 彭丽英 《国外畜牧学(猪与禽)》 2023年第3期41-44,共4页
将猪细小病毒S-1A株在不同的细胞中培养,测定病毒含量,以确定适合猪细小病毒S-1A株增殖的细胞。结果表明:猪细小病毒S-1A株能在猪肾传代细胞系(PK-15)、猪肾原代细胞(PK)、猪睾丸细胞(ST)和仔猪肾细胞(IBRS-2)中生长增殖,不能在幼仓鼠... 将猪细小病毒S-1A株在不同的细胞中培养,测定病毒含量,以确定适合猪细小病毒S-1A株增殖的细胞。结果表明:猪细小病毒S-1A株能在猪肾传代细胞系(PK-15)、猪肾原代细胞(PK)、猪睾丸细胞(ST)和仔猪肾细胞(IBRS-2)中生长增殖,不能在幼仓鼠肾细胞系(BHK-21)、绿猴肾细胞(Vero)和鸡胚成纤维细胞(CEF)中增殖;当ST细胞生长至2/3单层时,将猪细小病毒S-1A株种毒液100倍或1000倍稀释后接种ST细胞,37℃培养96~144 h,获得的病毒载量最高。 展开更多
关键词 猪细小病毒s-1a株 ST细胞 培养条件
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2021-2022年河南省猪细小病毒1~7型检测与分析
2
作者 郭全海 许夕雅 +4 位作者 石蒙蒙 杨寒 高冬生 王永生 陈陆 《动物医学进展》 北大核心 2024年第6期123-129,共7页
旨在了解猪细小病毒1~7型(PPV1~PPV7)在河南省的流行情况。利用PCR检测了2021-2022年河南省猪场送检的748份样品,并对检测数据进行了分析。结果表明,PPV1/2/3/5/6/7在河南省各地区一年四季广泛流行,而秋、冬季节是感染高峰期,PPV2(16.0... 旨在了解猪细小病毒1~7型(PPV1~PPV7)在河南省的流行情况。利用PCR检测了2021-2022年河南省猪场送检的748份样品,并对检测数据进行了分析。结果表明,PPV1/2/3/5/6/7在河南省各地区一年四季广泛流行,而秋、冬季节是感染高峰期,PPV2(16.04%)的感染率最高,PPV7(15.11%)次之。产房仔猪未检出PPV1/3/5,PPV2/6/7在各生长阶段猪群中均有检出,患呼吸系统疾病的保育和育肥猪中PPV各型检出率均较高,尤以PPV2常见。PPV2和PPV7在口腔液、血样、肺脾淋巴结中检出率均较高,血样中较低,PPV3常存在于血清和组织中,PPV5多见于口腔液,PPV6多见于血样。研究证实,除PPV4未检出外,其他6种PPV在河南均存在,并且多与其他病原混合感染,PPV2、PPV7可与多种病原混合感染,PPV7与PCV2混合感染最常见。 展开更多
关键词 细小病毒1~7型 检测 分析
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猪细小病毒1型河南流行毒株的遗传进化分析 被引量:1
3
作者 许夕雅 丁晨梦 +7 位作者 孙亚威 韩紫薇 齐江坤 吕晨哲 石蒙蒙 郭子仪 邓梦梦 陈陆 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第2期288-297,351,共11页
【目的】监测河南省猪细小病毒1型(porcine parvovirus 1,PPV1)的变异情况。【方法】采集自河南省鹤壁市和安阳市初产母猪的流产胎儿阳性样品,利用PCR方法鉴定获得2株PPV1流行毒株,经过全基因组测序,分别命名为CH/HN-H/2021和CH/HN-3/2... 【目的】监测河南省猪细小病毒1型(porcine parvovirus 1,PPV1)的变异情况。【方法】采集自河南省鹤壁市和安阳市初产母猪的流产胎儿阳性样品,利用PCR方法鉴定获得2株PPV1流行毒株,经过全基因组测序,分别命名为CH/HN-H/2021和CH/HN-3/2021。通过分析同源性和构建遗传进化树分析PPV1全基因组、NS1基因、VP2基因的变异情况,并且比对分析NS1蛋白和VP2蛋白的氨基酸变异情况及非编码区基因缺失情况。【结果】2条序列的核苷酸相似性为99.9%;与46株国内外PPV1流行毒株全基因组的核苷酸同源性为93.5%~99.9%;NS1基因核苷酸同源性为98.6%~99.9%,NS1蛋白氨基酸同源性为98.2%~99.9%;VP2基因核苷酸同源性为98.4%~99.9%,VP2蛋白氨基酸同源性为98.3%~99.9%,说明本研究鉴定的毒株呈现遗传进化稳定性。本研究鉴定株与湖南及吉林毒株亲缘关系最近,而与河南原有毒株亲缘关系较远。在对NS1蛋白与VP2蛋白的氨基酸变异分析中发现,NS1蛋白发生6处突变,VP2蛋白发生7处突变,均在经典突变位点范围内,符合PPV1遗传变异的保守性。鉴定株VP2基因后部非编码区基因与NADL-2株相比缺失127 nt。【结论】本研究鉴定的毒株呈现遗传进化稳定性,河南省存在新旧PPV1毒株同时流行的情况。 展开更多
关键词 细小病毒1型 全基因组测序 遗传变异分析 NS1基因 VP2基因
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猪细小病毒弱每株(PPVs-1A)对猪的安全性试验 被引量:5
4
作者 叶向阳 张婉华 +3 位作者 潘雪珠 徐平 曹伟明 徐亚芬 《上海畜牧兽医通讯》 北大核心 1995年第6期8-9,共2页
为了证买PPV_(S-1)株的黄全性,以1—4毫升肌注接种5月龄左右阴性猪6只,观察8天,接种猪无明显临床症状,没有发生病毒血症和排毒.以4毫升(TCIDS_(50)10^(7.5)HA:4096)肌注接种孕猪(孕龄38~46天)4只,一头未接种怀孕母猪与接种孕猪同居饲... 为了证买PPV_(S-1)株的黄全性,以1—4毫升肌注接种5月龄左右阴性猪6只,观察8天,接种猪无明显临床症状,没有发生病毒血症和排毒.以4毫升(TCIDS_(50)10^(7.5)HA:4096)肌注接种孕猪(孕龄38~46天)4只,一头未接种怀孕母猪与接种孕猪同居饲养42天.结果5只孕猪都没有发生病毒血症,接种后42天宰杀,共收集到胎猪68只,从68只胎猪中没有分离到PPV. 展开更多
关键词 细小病毒弱毒 疫苗接种 安全性
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猪细小病毒1型突变株分离鉴定及全基因组进化分析
5
作者 于永乐 姚延珠 +4 位作者 张瑞华 陈超 赵婷 单虎 韩先杰 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期232-238,共7页
旨在对猪细小病毒1型(PPV1)突变株生物学特性进行分析。对采自山东不同地区养猪场的67份流产胎儿组织样品进行PPV的分离和培养,经电镜观察和IFA试验进行鉴定,通过Overlap PCR对分离株进行全基因序列扩增,SnapGene V4进行序列拼接和比对... 旨在对猪细小病毒1型(PPV1)突变株生物学特性进行分析。对采自山东不同地区养猪场的67份流产胎儿组织样品进行PPV的分离和培养,经电镜观察和IFA试验进行鉴定,通过Overlap PCR对分离株进行全基因序列扩增,SnapGene V4进行序列拼接和比对,利用DNAMAN V6对基因组末端5′UTR和3′UTR二级结构进行展示和比较,应用MEGA V7进行遗传进化分析,最后利用多步生长曲线绘制对分离株在易感细胞内的增殖能力进行比较。共分离得到3株病毒,均鉴定为PPV1型毒株,分别命名为SDPV1、SDPV2和SDPV3,GenBank登录号分别为ON924737、ON924738和ON924739;3个分离株全基因序列长度基本一致,其中5′-UTR序列高度保守,呈Y型结构;而3′-UTR呈U型结构,个别碱基有所差异;VP2氨基酸序列中有5个非同义突变位点,分别为T20A、R82K、Q226E、D366N和K407N,为国内毒株首次发现。生长曲线显示,突变株生长趋势相对较快,与PPV-QN株相比,最高滴度相差10倍。报道了包含新型变异位点的PPV毒株的基因组特征。 展开更多
关键词 细小病毒1型 突变 全基因组 遗传变异
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不同代次的猪细小病毒(PPV S-1株)NS1基因的克隆与序列分析
6
作者 谢巧 李春华 +3 位作者 张婉华 王英 蒋凤英 张春玲 《上海农业学报》 CSCD 北大核心 2009年第4期57-60,共4页
根据GenBank中猪细小病毒PPV NADL-2株NS1基因序列设计了一对引物,以PPV S-1分离株不同传代代次的DNA为模板,进行PCR扩增,将扩增产物分别克隆到pGEM-T载体中进行测序。结果表明:扩增片段长约2.2 kb,包含完整的NS1基因,共编码662个氨基... 根据GenBank中猪细小病毒PPV NADL-2株NS1基因序列设计了一对引物,以PPV S-1分离株不同传代代次的DNA为模板,进行PCR扩增,将扩增产物分别克隆到pGEM-T载体中进行测序。结果表明:扩增片段长约2.2 kb,包含完整的NS1基因,共编码662个氨基酸。应用DNAStar软件进行序列分析,结果显示:所有代次的NS1核苷酸同源性在99.4%以上,氨基酸同源性在98.5%以上;PPV S-1分离株在传代致弱的过程中,NS1基因出现了一些变异,有4处较为一致的突变,即1 052位C→T、1 636位G→A、1 717位A→G、1732位T→G,对应的氨基酸变化分别为Thr^(351)→Met^(351)、Val^(546)→Met^(546)、Asn^(573)→Asp^(573)、Ser^(578)→Ala^(578),这可能是PPV S-1在ST细胞上传代致弱的分子基础之一。 展开更多
关键词 细小病毒 不同代次 NS1基因 序列分析
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猪细小病毒SY-99株非结构蛋白NS1基因的克隆及序列分析 被引量:16
7
作者 吴丹 仇华吉 +6 位作者 李昌文 薛强 周艳君 李景鹏 韩孝成 刘慧敏 童光志 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期241-244,共4页
猪细小病毒 (Porcineparvovirus,PPV)SY_99株由本室分离 ,提取SY_99株的基因组DNA ,利用PCR扩增出全长NS1基因 ,将该基因克隆到原核表达载体pET2 8a中并测序。结果表明 ,NS1基因全长 1989bp ,编码 6 6 2个氨基酸。氨基酸序列中含有在PP... 猪细小病毒 (Porcineparvovirus,PPV)SY_99株由本室分离 ,提取SY_99株的基因组DNA ,利用PCR扩增出全长NS1基因 ,将该基因克隆到原核表达载体pET2 8a中并测序。结果表明 ,NS1基因全长 1989bp ,编码 6 6 2个氨基酸。氨基酸序列中含有在PPV复制过程中发挥重要作用的保守基序GKRN ,并有 3个潜在的糖基化位点 ,分别位于 35 6~ 35 9、4 4 6~ 4 4 9、5 13~ 5 16位氨基酸处。SY_99株NS1基因与其它PPV毒株NADL2_1、NADL2_2、Kresse株核苷酸同源性分别为 98%、99%、99% ,氨基酸同源性分别为 97%、99%、99%。 展开更多
关键词 细小病毒 NS1基因
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猪细小病毒SC-1株VP2基因的克隆及生物信息学分析 被引量:12
8
作者 罗燕 郭万柱 +1 位作者 刘艳丽 殷华平 《动物医学进展》 CSCD 2005年第8期87-91,共5页
根据PPV NADL-2株基因组序列设计了一对引物,以复制型DNA为模板,通过PCR 扩增出长约2.0 kb的DNA片段,将其插入克隆载体质粒pUC19,构建重组质粒pPVP2,测序显示PPV-SC-1 VP2基因全长1 740 bp,共编码579个氨基酸.多序列比对结果显示,猪细... 根据PPV NADL-2株基因组序列设计了一对引物,以复制型DNA为模板,通过PCR 扩增出长约2.0 kb的DNA片段,将其插入克隆载体质粒pUC19,构建重组质粒pPVP2,测序显示PPV-SC-1 VP2基因全长1 740 bp,共编码579个氨基酸.多序列比对结果显示,猪细小病毒VP2基因保守性强,仅存在个别的差异;密码子偏向性分析结果表明,PPV-SC-1 VP2基因在同一氨基酸的不同密码子的选择上存在一定的偏向性,并且与PPV-SC-1 NS1在密码子的偏向性上具有相同的属性,主要偏向于使用以A结尾的密码子;氨基酸疏水性分析表明,PPV-SC-1 VP2蛋白在77~82、291~304、362~373、400~411、465~477等位点存在较明显的亲水区段;跨膜区结构分析显示该蛋白不存在显著意义的跨膜区;分析该蛋白的抗原位点可能位于60~68、81~88、266~275、351~357、398~404位点处. 展开更多
关键词 细小病毒 细小病毒SC1 VP2基因 克隆 生物信息学
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猪细小病毒弱毒株(PPV_(s-1)A)及其疫苗的免疫效力 被引量:10
9
作者 叶向阳 张婉华 +4 位作者 潘雪珠 徐平 曹伟明 徐亚芬 严贞秀 《上海农业学报》 CSCD 1996年第1期9-13,共5页
以PPVs-1A株弱毒肌肉接种后备母猪2头,每头注射1mL。接种后第8天的HI价为128~256。以后抗体上升,攻毒前HI价平均为1280。对照母猪2头HI抗体均为阴性。4头母猪配种后,怀孕至38~40d时攻毒,结果... 以PPVs-1A株弱毒肌肉接种后备母猪2头,每头注射1mL。接种后第8天的HI价为128~256。以后抗体上升,攻毒前HI价平均为1280。对照母猪2头HI抗体均为阴性。4头母猪配种后,怀孕至38~40d时攻毒,结果从接种母猪的血浆中没有分离到病毒,而对照母猪的血浆中则分离到病毒。攻毒40d后宰杀,接种母猪共怀25头胎猪,从它们的脏器中均没有分离到病毒,而对照母猪共怀23头胎猪,其中有10头的脏器分离到病毒。4批弱毒苗免疫11头5.5月龄阴性猪,1周内全部产生抗体反应,1个月时平均HI价为599,免疫后1~7个月攻毒,结果免疫猪的血浆和内脏均未分离到病毒,相反,8头对照猪在攻毒前HI价保持阴性,攻毒后1周HI1024~4096,从血浆和内脏都分离到病毒。试验证明,弱毒苗免疫持续期至少为7个月;保存期11个月。 展开更多
关键词 细小病毒 弱毒 疫苗 免疫性
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猪细小病毒自然弱毒N株非结构蛋白NS1基因原核表达 被引量:4
10
作者 苏乾莲 李斌 +5 位作者 赵武 梁家幸 梁保忠 何颖 秦毅斌 何苹萍 《广西农业科学》 CAS CSCD 2010年第7期710-713,共4页
为进一步探讨猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)的分子病原学机理,根据GenBank上已发表的PPV全基因组序列(登录号NC_001718)设计1对引物,通过PCR方法扩增获得PPV-N株NS1全长基因,将其克隆到pMD18-T载体上,进而构建原核表达重组质粒pET32a-... 为进一步探讨猪细小病毒自然弱毒N株(PPV-N株)的分子病原学机理,根据GenBank上已发表的PPV全基因组序列(登录号NC_001718)设计1对引物,通过PCR方法扩增获得PPV-N株NS1全长基因,将其克隆到pMD18-T载体上,进而构建原核表达重组质粒pET32a-NS1,并在BL21(DE3)pLysS中进行IPTG诱导表达。SDS-PAGE电泳显示NS1在大肠杆菌中得到成功表达,重组蛋白大小约为90.0 kDa;Western blotting分析表明,该蛋白能与PPV阳性血清发生特异性反应,证明该蛋白具有良好生物学活性。NS1在大肠杆菌中成功表达,且具有免疫原性,可作为PPV临床鉴别诊断抗原。 展开更多
关键词 细小病毒 自然弱毒N NS1 原核表达
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猪细小病毒(PPV)SC1株非结构蛋白NS_1基因的克隆和序列分析 被引量:7
11
作者 殷华平 郭万柱 +1 位作者 徐志文 罗燕 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期504-508,共5页
本文根据GenBank中PPV NADL-2株病毒基因组序列用Oligo6.0设计了一对引物,以抽提的PPV-SC1 RF-DNA为模板,通过PCR扩增出长约2.2kb的片段,将其插入克隆载体质粒pMD 18-T的EcoRV酶切位点处,构建了重组质粒pPNS1并测序.密码子偏向性分析结... 本文根据GenBank中PPV NADL-2株病毒基因组序列用Oligo6.0设计了一对引物,以抽提的PPV-SC1 RF-DNA为模板,通过PCR扩增出长约2.2kb的片段,将其插入克隆载体质粒pMD 18-T的EcoRV酶切位点处,构建了重组质粒pPNS1并测序.密码子偏向性分析结果表明PPV-SC1 NS1基因在同一氨基酸的不同密码子的选择上存在一定的偏向性,主要是以A结尾的密码子;用Bioedit和swiss TMPRED软件预测PPV-SC1 NS1的跨膜区,并没有得到有显著意义的跨膜区的存在;根据基于motif数据库的结构域预测,PPV-SC1 NS1的第393~415位氨基酸残基存在潜在的ATP/GTP结合位点,该蛋白还存在16个蛋白激酶磷酸化位点,21个酪蛋白激酶2磷酸化位点,3个cAMP-/cGMP依赖蛋白激酶磷酸化位点,PPV-SC1 NS1蛋白与POX-D5(痘病毒D5蛋白)具有一致的保守结构域,推测NS1可能与POX-D5有类似的功能. 展开更多
关键词 细小病毒 非结构蛋白 NS1基因 生物信息学
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猪细小病毒GZ株NS1基因主要抗原区的克隆与序列分析 被引量:3
12
作者 刘建 汤德元 +7 位作者 李春燕 曾智勇 罗险峰 甘振磊 王凤 郝飞 姜德荣 王洪光 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第9期129-132,共4页
为了解猪细小病毒(PPV)的分子流行病学和遗传变异等,对送检的疑似猪细小病毒感染病料进行了病毒分离鉴定,将分离毒株同步接种于ST细胞,并对分离病毒分别进行了血凝试验、中和试验、病毒理化特性和病毒核酸类型检测等鉴定;同时设计... 为了解猪细小病毒(PPV)的分子流行病学和遗传变异等,对送检的疑似猪细小病毒感染病料进行了病毒分离鉴定,将分离毒株同步接种于ST细胞,并对分离病毒分别进行了血凝试验、中和试验、病毒理化特性和病毒核酸类型检测等鉴定;同时设计1对扩增PPVNS1基因主要抗原区的特异性引物,扩增、克隆和分析了分离毒株的NS1基因主要抗原区序列。结果表明:从送检的疑似猪细小病毒感染病料中成功分离出1株PPV贵州毒株,并将其命名为Gz株;扩增的NS1基因主要抗原区序列长度为1131bp;遗传进化分析表明,PPVGZ株与国内分离的GX株、N株、SR-1株、PPV2010株、s-1株和YL株的核苷酸序列同源性达到98.3%以上,推导的氨基酸序列的同源性为97.9%~100%,表明NS1基因序列比较保守,PPV的NS1基因主要抗原区基因克隆测序可以作为诊断猪细小病毒感染的依据。 展开更多
关键词 细小病毒GZ NS1基因 抗原区 克隆
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猪细小病毒(PPV)SD1株NS1基因的克隆与原核表达 被引量:5
13
作者 谢金文 沈志强 +3 位作者 王金良 任艳玲 管宇 苗立中 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第7期2679-2681,共3页
[目的]为建立猪细小病毒的快速诊断方法提供理论依据。[方法]根据GenBank上猪细小病毒基因组序列和原核表达质粒pET30a(+)多克隆位点序列设计1对引物,应用PCR技术扩增出猪细小病毒SD1株NS1基因全序列,对阳性重组质粒进行测序和同源... [目的]为建立猪细小病毒的快速诊断方法提供理论依据。[方法]根据GenBank上猪细小病毒基因组序列和原核表达质粒pET30a(+)多克隆位点序列设计1对引物,应用PCR技术扩增出猪细小病毒SD1株NS1基因全序列,对阳性重组质粒进行测序和同源性比较。构建原核表达重组质粒pET 30a/NS1,并在大肠杆菌中进行诱导表达。[结果]通过PCR扩增获得2 208 bp目的片段。所克隆NS1基因与已报道的PPV相应基因的核苷酸同源性为97.3%-99.4%,表明NS1基因具有高度保守性,但在偏3′端连续缺失12个碱基。所克隆的PPVNS1基因在原核细胞中成功表达,其表达产物主要以包涵体形式存在。[结论]SDS-PAGE检测结果表明PPVNS1蛋白的分子量为86 kD。 展开更多
关键词 细小病毒 NS1基因 克隆 原核表达
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猪细小病毒SC1株非结构蛋白NS1基因的原核表达及PPA-NS1-ELISA的初步建立 被引量:4
14
作者 陈进会 郭万柱 +5 位作者 殷华平 颜其贵 徐志文 王印 罗燕 王小玉 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期13-16,共4页
含有猪细小病毒SC1株非结构蛋白NS1基因的重组质粒pPNS1通过EcoR+Hind双酶切后,回收NS1基因,将其亚克隆进原核表达载体pET30a(+)中,构建了重组表达质粒pET-NS1,转入表达宿主菌BL21中,通过IPTG的诱导表达,SDS-PAGE电泳结果表明,重组NS1... 含有猪细小病毒SC1株非结构蛋白NS1基因的重组质粒pPNS1通过EcoR+Hind双酶切后,回收NS1基因,将其亚克隆进原核表达载体pET30a(+)中,构建了重组表达质粒pET-NS1,转入表达宿主菌BL21中,通过IPTG的诱导表达,SDS-PAGE电泳结果表明,重组NS1蛋白高效表达,以包涵体形式存在,占细菌总蛋白的26.7%。并确定了NS1蛋白的最佳诱导条件:IPTG终浓度为0.6mmol/L,诱导时间为3h。Westernblotting检测表明,表达产物具有良好的免疫原性。重组蛋白经纯化后作为抗原,包被酶标板,以辣根过氧化物酶标记葡萄球菌A蛋白作为二抗,建立了辣根过氧化物酶标记葡萄球菌A蛋白的酶联免疫吸附试验(PPA-NS1-ELISA)。结果表明,抗原最佳包被质量浓度为31.3mg/L,血清最佳稀释度为1∶40。阳性标准初步定为:待检血清D490>0.32,且待检血清D490/阴性血清D490>2.0。 展开更多
关键词 细小病毒 NS1基因 原括表达 PPA—NSI—ELISA
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猪细小病毒疫苗株NS1基因克隆及生物信息学分析 被引量:4
15
作者 李兴玉 李金海 +7 位作者 林毅 曹冶 罗丹丹 廖党金 魏甬 李江凌 于吉锋 张先惠 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第7期21-26,共6页
为进一步开展猪细小病毒(porcine parvovirus,PPV)NS1蛋白功能研究,根据GenBank登录的PPV参考株NADL-2(登录号:NC001718)的NS1基因序列设计1对特异性引物,采用PCR技术扩增PPV疫苗株NS1基因,将PCR扩增产物克隆入pTA2载体构建重组质粒pTA2... 为进一步开展猪细小病毒(porcine parvovirus,PPV)NS1蛋白功能研究,根据GenBank登录的PPV参考株NADL-2(登录号:NC001718)的NS1基因序列设计1对特异性引物,采用PCR技术扩增PPV疫苗株NS1基因,将PCR扩增产物克隆入pTA2载体构建重组质粒pTA2-NS1,并进行测序鉴定。测序结果显示,构建的pTA2-NS1质粒含有一个开放阅读框(ORF),全长1989bp,共编码662个氨基酸,与GenBank登录的PPV参考株NADL-2、Kresse株的NS1基因的核苷酸同源性分别为99.85%和99.65%,氨基酸同源性分别为99.70%和99.70%。上述结果表明试验成功构建了含有PPV NS1基因的重组质粒pTA2-NS1。应用DNAStar软件及在线ProtScale、SignalP 4.1、TMHMM、Scansite、PSORTⅡ等生物信息学软件对NS1基因及其编码蛋白进行生物信息学分析,结果显示NS1蛋白分子质量为75.7ku,等电点PI为6.82,是弱酸性蛋白;NS1蛋白不含信号肽序列,无跨膜区,为可溶性蛋白,主要定位于细胞核内,T199、Y309、T338、T512、S631、T635为其潜在磷酸化位点。以上研究为进行PPV NS1蛋白表达,进一步开展NS1蛋白功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 细小病毒 NS1基因 生物信息学分析
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猪细小病毒SY-99株非结构蛋白NS1基因的克隆与原核表达 被引量:2
16
作者 吴丹 童光志 +3 位作者 仇华吉 薛强 周艳君 李景鹏 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1352-1356,共5页
根据猪细小病毒 (porcineparvovirus ,PPV)NADL 2株非结构蛋白基因NS1序列设计引物 ,扩增出了PPVSY 99株的NS1基因 ,将其克隆到原核表达载体pET2 8a中 ,得到重组质粒SYNS1/pET2 8a。将SYNS1/pET2 8a转化到大肠杆菌BL2 1(DE3)中 ,经IPTG... 根据猪细小病毒 (porcineparvovirus ,PPV)NADL 2株非结构蛋白基因NS1序列设计引物 ,扩增出了PPVSY 99株的NS1基因 ,将其克隆到原核表达载体pET2 8a中 ,得到重组质粒SYNS1/pET2 8a。将SYNS1/pET2 8a转化到大肠杆菌BL2 1(DE3)中 ,经IPTG诱导 ,使PPVNS1基因获得了表达 ,运用ELISA和Westernblotting证实了表达产物的特异性。经表达产物细胞定位分析 ,表达的NS1蛋白是以包涵体的形式存在于大肠杆菌中。通过改变诱导时间或诱导剂IPTG的浓度 ,确定了表达NS1蛋白的最佳诱导条件 :IPTG终浓度为 0 .6mmol·L-1,诱导时间为 3h ,在大肠杆菌中最高表达含量为 17.8%。亲和层析后 ,得到了纯化的NS1蛋白 ,在Westernblotting检测中 ,纯化蛋白大大降低了反应背景。表达的NS1蛋白可作为免疫诊断试剂来检测PPV的发生 。 展开更多
关键词 细小病毒 SY-99 非结构蛋白 NSl基因 基因克隆 原核表达
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猪细小病毒SD-68株NS1基因的克隆与序列分析 被引量:6
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作者 刘艳华 范伟兴 +3 位作者 王锡乐 刘文强 许传田 张志 《中国病毒学》 CSCD 2004年第4期353-355,共3页
对猪细小病毒(PPV)SD-68株NS1基因进行了克隆和序列测定,结果表明SD-68株NS1基因全长1989bp,编码662个氨基酸组成的多肽。该序列与PPVSY-99株、Kresse株、NADL-2(5075)和NADL-2(4973)株的NS1基因比较,核苷酸的同源性分别为99.9%、99.9%... 对猪细小病毒(PPV)SD-68株NS1基因进行了克隆和序列测定,结果表明SD-68株NS1基因全长1989bp,编码662个氨基酸组成的多肽。该序列与PPVSY-99株、Kresse株、NADL-2(5075)和NADL-2(4973)株的NS1基因比较,核苷酸的同源性分别为99.9%、99.9%、99.7%、98.1%,氨基酸的同源性分别为99.7%、99.5%、99.5%、96.7%。PPVSD-68株与MVM(i)、MEV(Abashiri)、CPV、FPV、BPV3、GPVNS1的进化树分析表明:PPVSD-68株NS1与MVM(i)NS1亲缘关系最近,与BPV3NS1的亲缘关系最远;在Thr435和Ser473位点PPVSD-68株与MVM(i)完全一致,表明Thr435和Ser473是PPVSD-68株NS1潜在的磷酸化位点。 展开更多
关键词 细小病毒 PPV NS1基因 克隆 序列分析 繁殖障碍
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猪细小病毒HNZM01株NS1基因的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 郭东辉 王超群 +2 位作者 王建辉 陈海宁 魏战勇 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第3期137-141,共5页
为加强猪细小病毒病的监控,对分离的猪细小病毒(PPV)HNZM-01株NS1基因的序列进行了分析。设计一对特异性引物,以抽提的PPV HNZM-01株的DNA为模板,通过PCR反应扩增出大小约2.27kb的目的片段,并将其插入克隆载体pGEM-T Easy上,构建了重组... 为加强猪细小病毒病的监控,对分离的猪细小病毒(PPV)HNZM-01株NS1基因的序列进行了分析。设计一对特异性引物,以抽提的PPV HNZM-01株的DNA为模板,通过PCR反应扩增出大小约2.27kb的目的片段,并将其插入克隆载体pGEM-T Easy上,构建了重组质粒并测序。结果表明,NS1基因全长1 989bp,与预期目的片段大小一致。序列分析结果表明,PPV HNZM-01株的NS1基因与其他PPV毒株同源性在98.2%~99.8%,说明NS1基因具有高度保守性。同时应用ANTHEPROT软件分析了HNZM-01株NS1基因编码蛋白质的氨基酸组成和二级结构的含量、分布。结果表明,由于HNZM-01株中碱基的突变,造成其氨基酸序列与NADL-2株有所不同,形成的二级结构略有差异,但二级结构元件分布大致与NADL-2株相同。 展开更多
关键词 细小病毒 NS1基因 克隆 序列分析
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猪细小病毒(PPV)SD1株NS1基因的克隆与原核表达(英文) 被引量:1
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作者 谢金文 沈志强 +3 位作者 王金良 任艳玲 管宇 苗立中 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2007年第3期59-63,共5页
[Objective] The research aimed to provide the theoretical basis for establishing a rapid diagnosis method for porcine parvovirus(PPV).[Method] One pair of primers were designed according to PPV genome sequences on Gen... [Objective] The research aimed to provide the theoretical basis for establishing a rapid diagnosis method for porcine parvovirus(PPV).[Method] One pair of primers were designed according to PPV genome sequences on GenBank website and the sequences of prokaryotic expression vector pET30a(+)with multiple cloning sites.The whole sequence of NS1 gene in PPV SD1 strain was amplified by using PCR technology and the positive recombinant plasmid was analyzed by sequencing and homology comparison.The prokaryotic expression recombinant plasmid PET30a/NS1 was constructed to make its induction expression in Escherichia coli.[Result] The target fragment with the length of 2 208 bp was obtained from PCR amplification.The nucleotide homologies between the cloned NS1 gene and the reported relevant PPV genes were from 97.3 % to 99.4 %,which indicated that NS1 gene had high conservation.But it had a 12-basepair successive deletion near the hydroxyl end.The cloned PPV NS1 gene was successfully expressed in prokaryotic cell,and its expression products existed mostly in inclusion bodies.[Conclusion] The results of SDS-PAGE detection showed that the molecular weight of PPV NS1 protein was 86 KD. 展开更多
关键词 细小病毒 PPV NS1基因 基因克隆 原核表达
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猪细小病毒GZ分离株NS1基因主要抗原表位区原核表达研究 被引量:2
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作者 刘建 汤德元 +2 位作者 姜德荣 王洪光 李达 《山地农业生物学报》 2013年第5期397-402,共6页
根据GenBank登录的猪细小病毒NADL-2株和China株NS1基因序列设计1对特异性引物,对贵州大学动物生物技术实验中心分离的猪细小病毒GZ株接种ST细胞传代培养后,提取病毒DNA,进行PCR扩增PPV NS1基因主要抗原表位区,克隆后测序,随后将该基因... 根据GenBank登录的猪细小病毒NADL-2株和China株NS1基因序列设计1对特异性引物,对贵州大学动物生物技术实验中心分离的猪细小病毒GZ株接种ST细胞传代培养后,提取病毒DNA,进行PCR扩增PPV NS1基因主要抗原表位区,克隆后测序,随后将该基因亚克隆至pET-32a(+)载体,构建pET-32a-NS1重组质粒,转化得到重组菌,经IPTG诱导表达,通过亲和柱纯化并复性,制备重组蛋白。Western-blot检测发现,经诱导表达的NS1基因主要抗原表位区蛋白约为64 ku,与预测的大小一致,而且,重组蛋白在纯化复性后能被PPV阳性血清所识别,具有较好的反应原性。 展开更多
关键词 细小病毒 NS1基因 主要抗原表位区 原核表达
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