广西地区犬、猫细环病毒的全基因组序列分析

为了解细环病毒(Torque teno virus, TTV)在广西地区犬、猫中的流行情况,试验利用PCR方法对采集自广西地区的58份犬、猫腹泻样品进行检测,并对阳性样品进行全基因组序列扩增、测定及遗传进化分析。结果表明:犬细环病毒(TTCaV)阳性率为8.57%(3/35),猫细环病毒(TTFeV)阳性率为8.70%(2/23)。成功获得2株TTCaV(GXNN32和GXNN34)和2株TTFeV(GX26和GX27)的全长基因组序列。2株TTCaV全基因组序列与TTCaV参考株cf-TTV10(日本)、GX206(中国)同源性为96.2%~98.5%,与猪源、人和非人灵长类TTV同源性为18.0%~50.8%;2株TTFeV的全基因组序列与TTFeV参考毒株Fc-TTV4(日本)、PRA4(法国)、SH-F1(中国)、TTFeV278(捷克共和国)同源性为92.3%~96.7%,与猪、人和非人灵长类TTV同源性18.3%~52.8%。本研究获得的2株TTCaV和2株TTFeV之间的同源性为33.9%~34.0%。说明本研究获得的TTCaV和TTFeV分别属于辛型细环病毒属(Thetatorquevirus)和庚型细环病毒属(Etatorquevirus),2株TTCaV和2株TTFeV之间的同源性为33.9%~34.0%。犬、猫可感染特定物种TTV,并且基因组大小存在差异。