环状RNA ACAP2调节微小RNA-421与B细胞易位基因2轴对心肌梗死大鼠心肌损伤的影响

目的探讨环状RNA ACAP2(circACAP2)调节微小RNA(miR)-421/B细胞易位基因2(BTG2)轴对心肌梗死(MI)大鼠心肌损伤的影响。方法构建MI大鼠模型和H9c2细胞模型,将80只大鼠分为假手术组、MI组、小干扰RNA-阴性对照(si-NC)组、si-circACAP2组、pcDNA3.1组、pcDNA3.1-circACAP2组、pcDNA3.1-circACAP2+模拟物(mimic)NC组、pcDNA3.1-circACAP2+miR-421 mimic组,每组各10只。将缺氧H9c2细胞置于24孔板中,瞬时转染细胞,分为缺氧组、缺氧+si-NC组、缺氧+si-circACAP2组、缺氧+pcDNA3.1组、缺氧+pcDNA3.1-circACAP2组、缺氧+pcDNA3.1-circACAP2+mimic NC组、缺氧+pcDNA3.1-circACAP2+miR-421 mimic组,另取正常培养的H9c2细胞作为对照组。检测大鼠左心室射血分数(LVEF)、左心室短轴缩短率(LVFS)、心肌梗死情况、心肌组织病理变化、circACAP2、miR-421、BTG2 mRNA表达情况、乳酸脱氢酶(LDH)、肌酸激酶同工酶(CK-MB)活性、H9c2细胞活力和凋亡、心肌组织BTG2蛋白表达、H9c2细胞BTG2蛋白表达。结果MI组circACAP2、BTG2 mRNA表达高于假手术组(1.84±0.21 vs 1.00±0.10,1.68±0.17 vs 1.00±0.10),miR-421表达低于假手术组(0.49±0.05 vs 1.00±0.11,P<0.05);与假手术组比较,MI组梗死面积、CK-MB、LDH活性升高,LVFS、LVEF降低(P<0.05)。与si-NC组比较,si-circACAP2组心肌损伤减轻,LVFS、LVEF升高,梗死面积、CK-MB、LDH活性降低(P<0.05);与缺氧+si-NC组比较,缺氧+si-circACAP2组细胞活力升高,凋亡率、CK-MB和LDH活性降低(P<0.05)。与pcDNA3.1组比较,pcDNA3.1-circACAP2组心肌损伤加重,LVFS、LVEF降低,梗死面积、CK-MB、LDH活性升高(P<0.05);与缺氧+pcDNA3.1组比较,缺氧+pcDNA3.1-circACAP2组细胞活力降低,凋亡率、CK-MB、LDH活性升高(P<0.05)。结论circACAP2在MI大鼠和H9c2细胞中表达上调,沉默circACAP2可能通过调节miR-421/BTG2轴改善心脏功能,减少心肌损伤,提高心肌细胞活力。

新风胶囊含药血清通过调控环状RNA Cbl原癌基因B(circ-CBLB)影响类风湿关节炎滑膜成纤维细胞增殖和凋亡

目的探讨新风胶囊(XFC)含药血清通过调控环状RNA Cbl原癌基因B(circ-CBLB)对类风湿关节炎成纤维细胞样滑膜细胞(RA-FLS)增殖、凋亡的影响。方法XFC灌胃大鼠,制备含药血清。人RA-FLS来源于RA患者滑膜组织,用100μL的10 ng/mL肿瘤坏死因子α(TNF-α)刺激RA-FLS建立模型。构建pcDNA3.1-circ-CBLB及阴性对照,分别转染至RA-FLS中。实验分为对照组、TNF-α处理的RA-FLS组、XFC处理的RA-FLS组、pcDNA3.1-circ-CBLB-NC转染的RA-FLS组(过表达空转组)、pcDNA3.1-circ-CBLB转染的RA-FLS组(过表达组)、pcDNA3.1-circ-CBLB联合XFC处理的RA-FLS组(过表达给药组)。采用CCK-8法检测细胞活力,采用流式细胞术检测细胞周期与凋亡,采用实时定量PCR检测circ-CBLB表达水平,采用ELISA检测抗炎因子白细胞介素4(IL-4)、IL-10,促炎因子IL-6、TNF-α水平。结果XFC最佳含药血清量为200 mL/L,处理时间为72 h;与同一时间模型组相比,XFC组、过表达组、过表达给药组的细胞活力均下降。与模型组比较,XFC组、过表达组、过表达给药组circ-CBLB表达水平升高、凋亡率升高,S期和G2期细胞比例增加,IL-4、IL-10含量升高,IL-6、TNF-α含量降低。结论XFC处理上调RA-FLS中circ-CBLB表达,提高抗炎因子的水平,降低促炎因子的水平,抑制RA-FLS的细胞活力,提高其凋亡率,延长细胞周期,抑制RA-FLS增殖并促进其凋亡。

灯盏乙素通过环状GMP-AMP合酶-干扰素基因刺激因子通路抑制BV-2小胶质细胞介导的神经炎症

目的探讨灯盏乙素对脂多糖(LPS)诱导的BV-2小胶质细胞神经炎症的影响。方法培养BV-2小胶质细胞系,将BV-2小胶质细胞分为对照组(Ctrl)、环状GMP-AMP合酶(cGAS)抑制剂RU320521(RU.521)组、LPS组、LPS+RU.521组、LPS+灯盏乙素预处理(LPS+S)组、LPS+S+RU.521组,共6组。Western blotting及免疫荧光双标染色法检测并观察BV-2小胶质细胞中cGAS、干扰素基因刺激因子(STING)、核因子κB(NF-κB)、磷酸化NF-κB(p-NF-κB)、PYD结构域蛋白3(NLRP3)和肿瘤坏死因子α(TNF-α)的表达变化(n=3)。结果Western blotting和免疫荧光双标染色均显示,与对照组相比,LPS诱导后,BV-2小胶质细胞中cGAS、STING、p-NF-κB、NLRP3和TNF-α蛋白的表达水平显著升高(P<0.05);与LPS组相比,LPS+S组中cGAS、STING、p-NF-κB、NLRP3和TNF-α蛋白的表达水平显著下降(P<0.05)。使用cGAS通路抑制剂RU.521后显示了与灯盏乙素预处理组相似的作用效果。此外,NF-κB在各组的变化不明显(P>0.05)。结论灯盏乙素干预抑制BV-2小胶质细胞介导的神经炎症反应,可能与cGAS-STING信号通路有关。

环状RNA circZFR基因检测、细针穿刺细胞学检查、弹性超声对甲状腺恶性结节术前诊断价值的研究

目的 探究甲状腺恶性结节术前诊断中环状RNA circZFR基因检测、细针穿刺细胞学检查(FNAC)、弹性超声(UE)的临床效能。方法 收集2020年6月至2021年6月期间在本院就诊行手术切除的疑似甲状腺恶性结节患者中抽取100例的临床资料,进行回顾性分析,以病理检查结果为金标准判定环状RNA circZFR基因检测、细针穿刺细胞学检查(FNAC)、弹性超声(UE)在甲状腺恶性结节术前诊断中临床效能。结果 (1)病理学检查结果显示良性甲状腺结节、恶性甲状腺结节均为50例。相比于良性甲状腺结节,甲状腺恶性结节的circZFR基因表达水平明显升高(P<0.05)。(2)环状RNA circZFR、FNAC、UE检测良恶性结节的检出符合率分别为75%、81%、91%。3种检测方法比较,差异具有统计学意义(P<0.05),环状RNA circZFR检测比FNAC符合率略低。(3)环状RNAcircZFR基因检测对甲状腺恶性结节的术前诊断具有较高的诊断价值(AUC=0.776)。CircZFR基因检测的AUC与UE检测与FNAC检测相比均较低,但circZFR基因检测敏感度比FNAC略高。结论 环状RNA circZFR基因在甲状腺恶性结节中呈高表达。环状RNA circZFR基因检测对甲状腺恶性结节的术前诊断价值虽不及UE检测,但也具有较高的诊断价值,作为分子诊断层面的检测手段可成为甲状腺恶性结节术前辅助诊断的一种敏感、准确的可行性方案。

环状RNA SAMD8调控miR-223-3p/RHOB表达抑制胰腺导管腺癌进程的分子机制

目的探讨环状RNA SAMD8(circ-SAMD8)在胰腺导管腺癌(PDAC)进展中的潜在机制。方法基于Microarray数据(GSE79634)分析PDAC组织中circRNAs的表达谱。通过实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证circ-SAMD8(hsa_circ_0006148)在PDAC组织和细胞(CFPAC-1和PANC-1)中的表达。采用生物信息学分析预测circ-SAMD8的靶微小RNA(miRNA)及其下游mRNA,并采用双荧光素酶报告基因实验进行鉴定。采用MTT法和集落形成法检测PDAC细胞的增殖能力。采用免疫印迹法(Western blot)检测抗凋亡蛋白Bcl-2和促凋亡蛋白Bax的表达水平。采用流式细胞术检测凋亡细胞百分比。结果circ-SAMD8在PDAC组织和细胞中的表达水平低于癌旁组织和正常细胞,差异有统计学意义(P<0.05)。过表达circ-SAMD8能有效促进PDAC细胞凋亡,抑制PDAC细胞增殖。双荧光素酶报告基因实验显示,miR-223-3p是circ-SAMD8的一个潜在相互作用分子,miR-223-3p的下游mRNA靶点是RHOB。miR-223-3p在PDAC组织和细胞中异常过表达,并伴有RHOB低表达。在转染miR-223-3p模拟物或sh-circ-SAMD8的PDAC细胞中,RHOB表达显著降低,增殖能力增强,凋亡率降低。结论circ-SAMD8通过海绵化miR-223-3p,调控下游RHOB的表达,有效抑制PDAC的发生发展。

野生大雁新发单链环状DNA病毒基因组鉴定和分析

野鸟作为多种致病性病毒的天然宿主,可通过迁徙活动广泛传播病毒,给人类和其他动物的生命安全带来了严峻挑战。本研究中,我们从青海湿地公园的野生大雁泄殖腔拭子中鉴定出13个新型CRESS-DNA病毒全基因组。此外,基于Rep蛋白的系统发育分析表明,这13株新型CRESS-DNA病毒被划分为CRESS-DNA病毒家族的两个不同进化枝,其中1株隶属于未分类的CRESS-DNA病毒簇的分支,而其余12株则全部归类为类双生病毒科(Genomoviridae)。本研究在野生大雁体内发现13个新型CRESS-DNA病毒,将有助于我们对于CRESS-DNA病毒的多样性以及进化起源的研究。

畜禽肌内脂肪沉积的基因调控及其作用机制

肌内脂肪含量与肉的系水力、嫩度和风味等指标密切相关,是影响肉质的关键因素之一。近年来随着基因测序技术的不断更新发展,调控肌内脂肪沉积的基因被不断挖掘,但其发挥作用的分子机制还需要进一步完善。因此文章主要从影响肌内脂肪沉积的非编码RNA和候选基因两方面进行综述,以期为畜牧生产中提高肌内脂肪的沉积提供一定借鉴和参考。

环状RNA参与自身免疫性肝炎小鼠肝损伤的相关性分析

背景:自身免疫性肝炎的发病机制尚未明确阐明,环状RNA(CircRNAs)是RNA领域的一个研究热点,参与了许多自身免疫性疾病的发病,但CircRNAs在自身免疫性肝炎中的作用尚不清楚。目的:探讨CircRNAs与刀豆蛋白A诱导自身免疫性肝炎小鼠肝损伤的关系。方法:对前期微阵列技术筛选出差异表达的CircRNAs谱进行生物信息学分析,包括基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,探讨上述差异表达基因潜在的生物学功能。采用随机数字表法将12只C57BL/6小鼠分为正常组和模型组,每组6只,模型组通过尾静脉注射刀豆蛋白A建立自身免疫性肝炎模型,造模12 h后处死小鼠,提取小鼠肝脏及外周血,利用qRT-PCR技术验证部分CircRNAs的表达水平,通过比色法检测小鼠血清中肝损伤指标谷丙转氨酶和谷草转氨酶的水平,通过微孔板法检测小鼠肝脏中氧化应激指标丙二醛和NO的水平,并将肝损伤指标和氧化应激水平的相关性进行分析。结果与结论:①GO分析结果显示,表达上调CircRNAs的靶基因参与的生物过程主要为“SNARE复合装配的调节”(P=0.004)等,分子功能主要为“金属离子结合”(P=0.00029)等,主要富集在“CORVET复合体”(P=0.075)等细胞组分;表达下调circRNAs的靶基因参与的生物过程主要为“胰液分泌的负调节”(P=0.00042)等,分子功能主要为“转录激活因子活性”(P=0.025)等,主要富集在“膜外组分”(P=0.006)等细胞组分;②KEGG富集分析结果显示,表达上调CircRNAs的靶基因主要富集于“碱基切除修复”(P=0.026)等信号通路;③与正常组比较,模型组小鼠血清谷丙转氨酶和谷草转氨酶及肝组织中丙二醛和NO的水平升高(P<0.01),mmu-circ-0001520和mmu-circ-0001577的表达升高(P<0.05);④Spearman相关分析显示,mmu-circ-0001520和mmu-circ-0001577的表达与谷丙转氨酶、谷草转氨酶、丙二醛、NO存在正相关关系;⑤结果显示,CircRNAs的差异表达与自身免疫性肝炎小鼠肝损伤过程具有相关性,其中mmu-circ-0001520和mmu-circ-0001577有望成为自身免疫性肝炎诊断的生物标志物及治疗靶点。

针灸调控结肠炎相关性结肠癌大鼠结肠肿瘤增殖相关的circRNA表达谱的研究

目的探索针灸对结肠炎相关性结肠癌(colitis-associated colorectal cancer,CAC)大鼠结肠环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱的影响,阐释针灸调控CAC肿瘤细胞增殖相关的circRNA的可能机制。方法将SD雄性大鼠随机分为正常组、模型组、隔药灸组和电针组,采用氧化偶氮甲烷和葡聚糖硫酸钠溶液诱导CAC大鼠模型,造模成功后,隔药灸组和电针组在天枢和气海穴分别进行相应干预,每连续6次治疗间隔1次,持续4周。观察大鼠结肠肿瘤负荷情况,采用HE染色法观察大鼠结肠组织病理学变化并评分,采用circRNA-seq高通量测序检测大鼠结肠组织circRNA表达谱,筛选出针灸调控与CAC肿瘤增殖相关的circRNAs并采用qRT-PCR法进行验证,通过生物信息学分析,对CAC肿瘤增殖相关性circRNAs进行功能分析。结果与正常组比较,模型组大鼠肿瘤数量、肿瘤直径、肿瘤负荷量显著增加(P<0.01),结肠组织损伤严重,可见不同程度的异型增生且组织病理学评分升高(P<0.01);与模型组比较,隔药灸组、电针组大鼠肿瘤数量、肿瘤直径、肿瘤负荷量显著降低(P<0.01),大鼠结肠黏膜可见炎症性改变,组织结构基本清晰,组织病理学评分显著降低(P<0.01)。与正常组比较,模型组大鼠结肠组织有158个可能与肿瘤增殖相关的差异表达circRNAs,隔药灸干预CAC肿瘤增殖相关的关键circRNAs有23个,电针干预CAC肿瘤增殖相关的关键circRNAs有30个,隔药灸与电针共同干预的CAC肿瘤增殖相关circRNAs有10个,其中rno_circ:chr10:3301041-3304937和rno_circ:chr6:93404013-93407172的表达经验证符合测序结果(P<0.05)。结论CAC大鼠结肠组织circRNA表达谱异常,隔药灸和电针均能抑制AOM-DSS诱导的CAC大鼠结肠肿瘤增殖,影响与CAC大鼠肿瘤增殖相关性circRNA表达谱,而上调rno_circ:chr10:3301041-3304937并下调rno_circ:chr6:93404013-93407172可能是抑制CAC大鼠结肠肿瘤增殖的关键机制之一。

基于转录组测序筛选疆南绒山羊次级毛囊周期发育相关的circRNA

【目的】探讨疆南绒山羊皮肤毛囊的生长发育机制,加深对次级毛囊发育相关候选基因遗传调控和功能的认识,为指导疆南绒山羊后期培育,改善其绒产量提供参考。【方法】利用高通量测序技术对疆南绒山羊次级毛囊生长期、退行期和休止期皮肤组织中环状RNA(circRNA)进行分析,筛选出不同比较组的差异表达circRNA(DE circRNA),对其宿主基因进行GO功能、KEGG通路及蛋白互作(PPI)分析,并联合前期转录组数据构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。【结果】在9个疆南绒山羊皮肤组织中共鉴定到2482个circRNAs。其中包含138个DE circRNAs,退行期和生长期、退行期和休止期、休止期和生长期比较组中分别存在54、74、65个DEcircRNAs。GO功能和KEGG通路分析揭示,DEcircRNA宿主基因主要富集在细胞黏附、整合素介导信号通路、细胞整合素复合物等功能通路,以及一些与毛囊生理过程有关的信号通路,如MAPK、TGF-beta、Hedgehog等。结合PPI网络推测14个circRNAs可能参与调控疆南绒山羊皮肤次级毛囊生长发育。通过6个DEcircRNAs、20个DE miRNAs、3个DEmRNAs和2个DElncRNAs构建了疆南绒山羊ceRNA网络。【结论】本研究通过转录组测序筛选出与疆南绒山羊次级毛囊周期发育相关的关键circRNAs,包括novel-gene5238-2、novel-gene7855-1、novel-gene4455-1等。研究结果为circRNA在绒山羊次级毛囊发育中的生物学功能和调控特性提供理论依据,也为疆南绒山羊育种提供了新的方向。

基于高通量测序对大鼠骨髓干细胞及诱导后成骨细胞的环状RNA表达差异分析研究

目的:对环状RNA调控大鼠骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)及成骨分化的差异表达进行研究,构建大鼠BMSCs全转组录基因数据库,获得特异性基因表达谱,进行功能注释和信号通路等生物信息学分析。方法:采用高通量测序技术检测大鼠BMSCs的成骨分化过程中环状RNA(circular RNA,circRNA)部分的差异性表达。通过基因本体(gene ontology,GO)注释分析以及京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)进行通路富集分析,对具有差异性表达的环状RNA进行功能注释。结果:在大鼠BMSCs成骨分化过程中,每个样本中预测到的circRNA数量为4230个,每个样本中预测到的特异的circRNA为1820个。高通量测序结果显示,在大鼠BMSCs成骨分化过程中共检测到2822个circRNA;总共检测到29个具有差异性表达的circRNA。结论:发现许多差异表达的circRNA与细胞的成骨分化密切相关。这些差异表达circRNA为潜在调控大鼠BMSCs及成骨分化的分子机制提供线索与依据。

甲型流感病毒A/WSN/1933(H1N1)感染A549细胞的circRNA表达谱分析与鉴定

环状RNA(circRNA)已被证明在众多生物过程中起着重要的调控作用,而circRNA在甲型流感病毒(IAV)复制过程中的功能尚不清楚。本研究旨在利用高通量测序分析IAV感染A549细胞后的circRNA表达谱变化来挖掘能够影响病毒复制的circRNAs并对其进行初步功能鉴定。利用测序结果,对全部circRNAs进行特征分析、差异表达筛选;对差异circRNAs进行GO分析、KEGG分析;对候选circRNAs进行qPCR、RT-PCR验证及Sanger测序鉴定,并通过空斑试验确定影响病毒复制的circRNAs。结果:本试验共筛选到11 630条差异表达circRNAs,对其中6条circRNA进行了鉴定,最终确定novel_circ_007428具有抗病毒作用。本研究对甲型流感病毒感染A549细胞后的circRNA表达谱进行了分析与鉴定,为进一步研究circRNA在流感病毒感染中发挥的调控作用奠定了基础。

肺缺血-再灌注核心基因介导的竞争性内源性RNA网络的构建

目的分析肺缺血-再灌注损伤发生的核心基因并构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE145989的原始数据当作训练集,GSE172222和GSE9634数据集作为验证集,并鉴定差异表达基因(DEG)。进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心基因并分析核心基因的诊断价值、免疫细胞的免疫浸润水平。构建并验证ceRNA网络。分析基于ceRNA网络的靶向药物。结果共检测到179个DEG,其中61个下调基因,118个上调基因。GO分析结果显示,DEG与细胞迁移、分化和调节等生物学过程有关;与内吞囊泡膜、浆膜和膜筏等细胞成分有关;与趋化因子受体、G蛋白偶联受体、免疫受体活性和抗原结合等分子功能有关。KEGG分析显示DEG参与肿瘤坏死因子(TNF)、Wnt、白细胞介素(IL)-17和核因子(NF)-κB等信号通路。PPI网络提示CD8A、IL2RG、STAT1、CD3G和SYK是肺缺血-再灌注损伤的核心基因。ceRNA网络提示miR-146a-3p、miR-28-5p和miR-593-3p与CD3G的表达相关;miR-149-3p、miR-342-5p、miR-873-5p和miR-491-5p与IL2RG表达相关;miR-194-3p、miR-512-3p、miR-377-3p和miR-590-3p与SYK表达相关;miR-590-3p和miR-875-3p与CD8A表达相关;miR-143-5p、miR-1231、miR-590-3p、miR-875-3p与STAT1表达相关。CD3G有13种靶向药物,IL2RG有4种靶向药物,SYK有28种靶向药物,lncRNA MUC2有3种靶向药物,未发现CD8A、STAT1和其他ceRNA网络基因的靶向药物。结论CD8A、IL2RG、STAT1、CD3G和SYK是肺缺血-再灌注损伤的核心基因,对核心基因进行研究分析可能有助于肺缺血-再灌注损伤的诊断,并提供新的研究思路和治疗靶点。

携带环状染色体患儿9例细胞遗传学诊断及临床特征分析

目的探讨环状染色体综合征患儿细胞遗传学特点及临床表型特征。方法选取2015年1月至2021年12月在苏州大学附属儿童医院就诊并进行外周血染色核型分析发现的9例环状染色体患儿,收集其基本临床信息及病史资料,并对3例患者染色体微阵列分析(CMA)和2例全外显子测序分析(WES)结果进行分析。结果9例环状染色体患儿中,3例r(X),1例r(5),1例r(6),2例r(14)和2例r(22),其中除了1例r(14)患儿没有发现嵌合现象,其余8例环状染色体患儿均可见染色体嵌合现象。5例环状染色体患儿全基因组相关检测均发现有不同程度的染色体末端缺失。环状染色体综合征常见临床表现包括生长发育迟缓、智力障碍和面容异常等,其中部分环状染色体可导致一些特异性临床表现,如r(X)导致性腺发育不良及甲状腺功能异常,r(5)导致猫叫综合征以及r(22)导致肌张力低下。结论环状染色体的表型与基因型具有相关性和高度异质性,通常存在动态嵌合现象,其染色体末端均存在缺失,环状染色体综合征患儿可出现非特异性和特异性临床表现。

传染性胃肠炎病毒感染PK-15细胞环状RNA表达谱分析

【目的】分析传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus,TGEV)感染对猪肾上皮细胞(PK-15)中环状RNA(circRNA)表达的影响以及差异表达circRNA的潜在调控功能。【方法】利用Illumina HiSeq 4000测序平台对PK-15细胞(对照)和TGEV感染的PK-15细胞进行circRNA转录组测序,筛选差异表达circRNA。对差异表达circRNA来源基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,预测TGEV感染相关circRNA-miRNA-mRNA调控网络。随机挑选12种差异表达circRNAs通过实时荧光定量PCR验证其表达水平。【结果】转录组测序中共发现1029种circRNAs。相较于对照PK-15细胞,TGEV感染的PK-15细胞中共发现128种显著差异表达circRNAs,其中70种上调,58种下调。GO功能分析显示,TGEV感染的PK-15细胞中差异表达circRNAs来源基因主要富集在细胞大分子代谢过程和细胞代谢等生物过程;细胞内部分和胞内膜结合细胞器等细胞成分;有机环化合物结合和核酸结合等分子功能中。KEGG通路富集结果显示,TGEV感染的PK-15细胞中差异表达circRNAs来源基因主要富集在肌动蛋白细胞骨架调控、甲型流感、丙型肝炎、cAMP信号通路和mTOR信号通路等方面。circRNA-miRNA-mRNA调控网络显示,TGEV感染的PK-15细胞中存在庞大复杂的circRNA调控网络,多种circRNAs可通过miRNA靶向基因IFNAR1、IFNAR2和NHE3来调节先天免疫和跨膜离子转运,从而影响TGEV感染和症状。实时荧光定量PCR鉴定结果显示,12种差异表达circRNAs表达水平与测序结果基本趋势一致。【结论】TGEV改变了PK-15细胞中circRNA的表达。差异表达circRNA来源基因广泛参与细胞大分子代谢、病毒感染及cAMP信号通路等过程,与先天性免疫和TGEV发病机制相关的多个靶基因IFNAR1、IFNAR2和NHE3可能被circRNA调控。本研究结果揭示了circRNA在TGEV与宿主相互作用中的潜在功能。

环状RNA在结直肠癌中的潜在价值

在全球范围内,结直肠癌(CRC)是第三大最常见的癌症,也是癌症相关死亡的第二大原因。环状RNA(CircRNAs)是一种具有共价闭合结构的单链RNA,高度稳定、保守,在各种器官和组织中大量表达。本文便通过对环状RNA在结直肠癌中的潜在价值的分析,找出circRNA差异表达。方法 本次论题通过采集鄂尔多斯市中心医院普外科行手术治疗的11对结直肠癌患者癌组织及癌旁组织(距离肿瘤部位约5-10cm处),收集标本来源患者的年龄、性别、病理等相关信息。本研究使用DNBSEQ平台进行二代高通量测序,并对原始测序数据资料进行筛选和质控,鉴定出在癌与癌旁组织中差异表达的circRNA。结果 通过DNBSEQ平台二代高通量测序测序,共识别出138330个circRNAs表达差异基因主要在高CEA组及低CEA组中,在此组中通过测序数据得知在此组中共有表达差异基因12900个,其中表达上调基因8058个,表达下调基因4842,进一步对上述数据按circRNA进行差异分析得出在上述数据中共有两个circRNA表达存在显著差异,分别为:hsa_circ_0051905及hsa_circ_0066423此两个基因表达结果均为表达上调。结论 首先本研究发现基因hsa_circ_0051905及hsa_circ_0066423是之前从未有过报道基因,且两个基因在本次测序主要与CEA关系密切,影响CEA的表达量,在高CEA组中显著表达,其次分析两个基因主要通过胰岛素分泌通路影响CEA表达量,最后此基因潜在价值巨大目前尚未完全被人熟知,有望将来进一步研究成为新的肿瘤标记物协同肿瘤标记物CEA进一步为诊断结直肠癌提供新方向。

铁死亡相关的环状RNA在疾病中的作用及机制

环状RNA(circular RNA,circRNA)是真核生物细胞中一类特殊的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),具有高度稳定性。目前已广泛发现circRNA可作为微RNA(microRNA,miRNA)海绵参与各种疾病发生发展过程。作为近年来研究的热点,circRNA的功能和作用不断被发现和利用,其既可作为蛋白质支架使靶点结合更紧密,也可以调节疾病信号分子的转录表达,还能作为翻译模板,参与蛋白质的表达。此外,研究证实了铁死亡在疾病发展中具有重要作用,而铁死亡相关circRNA的分子机制研究也是医学研究领域的新前沿。最近研究发现,circRNA不仅能作为miRNA和蛋白质支架参与调控铁死亡,还能从转录水平调节铁死亡相关信号分子。目前,人工合成的环状RNA已被设计用于RNA疫苗,各种基因治疗技术、药物递送载体也为靶向circRNA的药物开发提供重要依据。本文阐述了circRNA的功能和作用、铁死亡调控的关键靶点及其在疾病中的作用,并且着重阐释了铁死亡相关circRNA在肿瘤、神经系统疾病及糖尿病并发症等多系统疾病中的作用机制,概述了circRNA相关的药物开发策略,为基于铁死亡相关circRNA的药物开发提供新的思路。

circRNA CPT1A调控PTEN在糖尿病视网膜病变患者神经组织病变中的作用

目的 研究circRNA肉碱棕榈酰转移酶1A(CPT1A)在糖尿病视网膜病变(DR)患者中的表达情况,并探讨其对神经组织病变的作用。方法 选取我院2019年1月至2022年1月收治的2型糖尿病患者80例(102眼),其中无DR(NDR)患者22例(28眼)为NDR组,非增生型DR(NPDR)患者38例(48眼)为NPDR组,增生型DR(PDR)患者20例26眼为PDR组。采用OCTA检查患者视盘周围视网膜神经纤维层(pRNFL)厚度、黄斑神经节细胞复合体(GCC)厚度,采用Western blot检测患者外周血磷酸酶-张力蛋白基因(PTEN),采用荧光定量聚合酶链式反应(PCR)法检测患者外周血circRNA CPT1A。比较3组患者外周血circRNA CPT1A、PTEN以及pRNFL、GCC厚度,并采用Pearson相关分析患者circRNA CPT1A与PTEN、pRNFL厚度、GCC厚度的相关性。结果 PDR组患者外周血circRNA CPT1A均高于NDR组、NPDR组,而PDR组患者外周血PTEN均低于NDR组、NPDR组(均为P<0.05);NDR组与NPDR组患者外周血circ RNA CPT1A、PTEN差异均无统计学意义(均为P>0.05)。Pearson相关性分析结果显示,患者外周血circRNA CPT1A与PTEN呈负相关性(P<0.05)。随着疾病严重程度的增加,pRNFL以及GCC厚度均呈降低趋势,NDR组患者的整体、上半部分、下半部分pRNFL厚度以及GCC厚度均高于NPDR组(均为P<0.05),NPDR组患者以上指标均高于PDR组(均为P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,患者外周血circRNA CPT1A分别与受检眼的整体、上半部分、下半部分pRNFL厚度以及GCC厚度均呈负相关性(均为P<0.05)。结论 随着DR严重程度的增加,DR患者外周血circRNA CPT1A呈增加趋势,且与外周血PTEN、pRNFL厚度以及GCC厚度呈负相关性,其作用机制可能为circRNA CPT1A负性调控PTEN的表达,从而参与DR的发生、发展。

环状RNA在创伤性脑损伤领域的研究进展

环状RNA是一类具有内源性和保守性的非编码RNA,近年来因其在许多疾病的诊断和治疗中的作用而受到广泛关注。大量研究表明,环状RNA在大脑发育中发挥重要作用,并参与许多中枢神经系统疾病的发生发展,特别是急性中枢神经系统损伤。创伤性脑损伤的高致残率和高死亡率不仅给患者带来巨大的身心痛苦,还对家庭和社会造成了沉重的经济负担。环状RNA可通过调控微RNA、Notch1等分子和途径改善大脑认知功能、促进血管生成、抑制细胞凋亡、调节自噬和保护血脑屏障。本文就环状RNA在创伤性脑损伤领域的研究进展作一综述,并展望环状RNA在大脑中的特性和作用的基础上,可能为创伤性脑损伤的治疗提供新的靶点。

circRNA在急性缺血性脑卒中诊疗中的研究进展

缺血性脑卒中是严重危害我国国民健康的重大慢性非传染性疾病。由于缺乏灵敏生物标志物作为急性缺血性脑卒中发病风险的预测,当前脑卒中的防控仍以控制疾病危险因素为主,通过正确积极的宣教引导,提高群众的健康意识,降低发病率。环状RNA(circRNA)是广泛存在于真核细胞中的一种非编码RNA。本文综述了circRNA在急性缺血性脑卒中疾病病理生理学变化的可能原因,总结了其在该疾病中的调控作用。分析circRNA与急性缺血性脑卒中发病、再发和死亡的关系,构建缺血性脑卒中发病风险预测模型。circRNA有望成为急性缺血性脑卒中疾病治疗靶点和临床诊断的生物标志物的潜力,为缺血性脑卒中发病的预警、早期治疗及药物研发提供科学依据。