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题名实时荧光定量PCR法快速检测赤潮环状异帽藻
被引量:4
- 1
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作者
石彦红
张凤英
马凌波
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机构
上海海洋大学生命科学与技术学院
中国水产科学研究院东海水产研究所
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出处
《中国水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期267-273,共7页
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基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(中国水产科学研究院东海水产研究所)资助项目(2007M22)
上海市科学技术委员会科研计划项目(062358101)
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文摘
以环状异帽藻(Heterocapsa circularisquama)ITS1区为靶序列设计了一对特异性引物,运用Real-time PCR方法,对环状异帽藻进行了定性定量检测。以其他9种赤潮微藻为对照验证其特异性。结果表明,仅含环状异帽藻DNA模板的样品有扩增,其他藻没有检测到扩增信号。以超声波破碎得到的藻液为标准品,所得标准曲线具有高度线性相关,相关系数R2为0.989,并且可以在30个循环内检测到0.5个细胞。对在不同培养条件下获得的环状异帽藻DNA样品进行检测,都能获得扩增信号。利用该方法建立的标准曲线对初步模拟现场样品进行定量检测,与显微镜计数结果基本一致。
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关键词
环状异帽藻
Real—time
PCR
ITS1
鉴定
定量检测
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Keywords
Heterocapsa circularisquama
real-time PCR
ITS1
quantitive identification
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分类号
S835
[农业科学—畜牧学]
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题名中华哲水蚤对环状异帽藻生物调控的初步研究
被引量:1
- 2
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作者
闫爱菊
刘艳
吴惠仙
薛俊增
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机构
上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
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出处
《海洋湖沼通报》
CSCD
北大核心
2010年第2期54-60,共7页
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基金
上海市科委"长三角联合攻关"项目(062358101)
上海市教委第五期重点学科海洋生物学(J50701)资助
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文摘
在实验室条件下开展了中华哲水蚤(Calanus sinicus)对海洋赤潮藻环状异帽藻(Heterocapsa circularisquama)的生物滤食及其影响因子研究。结果表明藻浓度、温度、盐度和光周期等对中华哲水蚤的滤食率均有显著的影响(P<0.01)。中华哲水蚤对环状异帽藻的滤食率随藻浓度的增加呈递增趋势;在10~20℃时,中华哲水蚤对环状异帽藻的滤食活动随温度的升高而增强,表现为滤食率G和清滤率F都同时上升,最佳滤食温度是20℃;18~24盐度是中华哲水蚤滤食环状异帽藻的适宜盐度,低于或高于该盐度范围,F和G都降低;中华哲水蚤对环状异帽藻的滤食率和清滤率对光周期的响应完全一致,均在全黑暗条件下为最佳,在全光照条件下达最低。
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关键词
中华哲水蚤
环状异帽藻
环境因子
滤食
种群
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Keywords
C.sinicus
H.circularisquama
environmental factors
grazing
population
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分类号
Q178.1
[生物学—水生生物学]
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题名两种常见外来入侵赤潮藻的PCR鉴定
被引量:3
- 3
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作者
郑俊斌
张凤英
马凌波
陆亚男
马春艳
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机构
上海海洋大学水产与生命学院
中国水产科学研究院东海水产研究所
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出处
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2009年第3期325-329,共5页
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基金
上海市科学技术委员会科研计划项目(062358101)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(中国水产科学研究院东海水产研究所)资助项目(2007M22)
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文摘
米氏凯伦藻与环状异帽藻为日本海域流入我国的两种外来入侵赤潮藻。利用核糖体ITS区分别设计出针对该两种藻的特异性PCR引物。通过prmier5.0软件设计多对引物,经PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳检测、以筛选目标藻的特异性引物,并以链状亚历山大藻、立玛原甲藻、牟氏角毛藻、赤潮异弯藻作为阴性对照,做进一步PCR验证。筛选到米氏凯伦藻最佳引物Ki1F3/Ki1B3和环状异帽藻最佳引物YiF3a/YiB3a。两对特异性引物成功鉴定了两种外来入侵藻,而对其它藻种则是阴性反应,可为赤潮的预测预报提供分子鉴定基础。
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关键词
米氏凯伦藻
环状异帽藻
核糖体ITS区
特异性引物
PCR鉴定
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Keywords
Karenia mikimotoi
Heterocapsa circularisquama
ribosomal internal transcribed space ( ITS )
special primer
PCR identification
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分类号
Q949.24
[生物学—植物学]
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