尿液中环状RNA-0071196表达与膀胱尿路上皮癌患者临床病理特征的关系

目的探讨尿液中环状RNA(circRNA)-0071196的表达与膀胱尿路上皮癌的相关性。方法30例正常样本(对照组)和40例病理诊断为膀胱尿路上皮癌(膀胱癌组)的尿液样品进行circRNA-0071196表达水平的检测。比较两组间circRNA-0071196表达差异,分析circRNA-0071196的表达与膀胱尿路上皮癌临床病理特征的关系。结果膀胱癌组尿液中circRNA-0071196表达量明显高于对照组(P<0.05)。circRNA-0071196表达与膀胱尿路上皮癌患者年龄、性别及是否存在淋巴转移无统计学意义(P>0.05);circRNA-0071196表达与膀胱尿路上皮癌患者的膀胱癌T分期、肌层浸润、病理分级有统计学意义(P<0.05)。受试者工作特征(ROC)曲线结果显示,尿液中circRNA-0071196表达水平对膀胱尿路上皮癌诊断具有较高的预测价值(P<0.05)。结论circRNA-0071196在膀胱尿路上皮癌患者的尿液中高表达,这表明其可能成为一种无创检测的潜在标志物。

环状RNA hsa_circ_0085576调控微小RNA-498/B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1轴对口腔鳞状细胞癌细胞迁移和侵袭的影响

目的探究环状RNA hsa_circ_0085576对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞迁移和侵袭的影响及其分子机制。方法使用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白印迹法检测OSCC细胞中hsa_circ_0085576、微小RNA-498(miR-498)以及B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1(BMI-1)的表达水平。使用CCK-8、划痕实验、Transwell实验以及qRT-PCR、蛋白印迹法分别检测SCC-15细胞增殖活力、迁移及侵袭能力以及相关基因和蛋白的相对表达量。结果OSCC细胞中hsa_circ_0085576与BMI-1表达上调,miR-498表达下调(P<0.05)。下调hsa_circ_0085576表达或过表达miR-498后SCC-15细胞的增殖活性、划痕愈合率、侵袭细胞数目以及细胞周期蛋白D1、波形蛋白表达水平下调,miR-498和E-钙黏蛋白表达水平上调(P<0.05);抑制miR-498表达可减弱下调hsa_circ_0085576表达对OSCC细胞增殖、迁移及侵袭的抑制作用;上调BMI-1表达可减弱过表达miR-498对OSCC细胞增殖、迁移及侵袭的抑制作用。结论下调hsa_circ_0085576表达可通过激活miR-498/BMI-1轴抑制OSCC细胞增殖、迁移及侵袭。

环状RNA同源性蛋白激酶3靶向微RNA-338促进胶质瘤细胞侵袭、迁移的实验研究

目的探讨人血清环状RNA同源性蛋白激酶3(CircHIPK3)靶向微RNA-338(miR-338)对胶质瘤细胞U251细胞侵袭、迁移的影响。方法2021年2-12月,在武汉大学人民医院科研中心将U251细胞分为空白(NG)组、CircHIPK3阴性对照(shcontrol)组、HIPK3敲减(sh-CircHIPK3)组,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测U251细胞中CircHIPK3、miR-338表达水平;Transwell检测细胞迁移与侵袭;划痕法检测细胞迁移;流式细胞术检测细胞周期;通过Circular RNA Interactome、RegRNA2.0、CircBank Database网站预测CircHIPK3(ID:hsa_circ_0000284)的靶向miRNA并用双萤光素酶实验验证,蛋白质印迹法检测基质金属蛋白酶(MMP)-2、MMP-9蛋白表达。结果与NG组、sh-control组比较,sh-CircHIPK3组中CircHIPK3(1.00±0.00、1.06±0.26比0.56±0.06)表达水平显著降低(P<0.05),miR-338(1.00±0.00、1.12±0.19比1.89±0.28)表达、G1期细胞比例[(58.72±0.36)%、(58.45±0.27)%比(64.72±0.47)%]升高(P<0.05),U251细胞侵袭数目[(164.89±12.55)个、(165.77±12.16)个比(80.13±11.37)个]、划痕愈合率[(25.66±2.37)%、(26.38±2.53)%比(10.36±1.53)%]、迁移细胞数目[(196.72±18.75)个、(194.65±17.86)个比(95.58±8.66)个]、S期细胞比例[(26.45±0.39)%、(26.57±0.41)%比(20.72±0.18)%]明显降低(P<0.05);miR-338是CircHIPK3的靶基因。与NG组、sh-control组比较,sh-CircHIPK3组MMP-2(1.31±0.23、1.33±0.20比0.61±0.05)、MMP-9(1.16±0.22、1.15±0.21比0.85±0.19)蛋白表达水平均显著降低(P<0.05)。结论沉默CircHIPK3通过靶向上调miR-338表达能抑制胶质瘤细胞U251细胞迁移和侵袭。

环状RNA ACAP2调节微小RNA-421与B细胞易位基因2轴对心肌梗死大鼠心肌损伤的影响

目的探讨环状RNA ACAP2(circACAP2)调节微小RNA(miR)-421/B细胞易位基因2(BTG2)轴对心肌梗死(MI)大鼠心肌损伤的影响。方法构建MI大鼠模型和H9c2细胞模型,将80只大鼠分为假手术组、MI组、小干扰RNA-阴性对照(si-NC)组、si-circACAP2组、pcDNA3.1组、pcDNA3.1-circACAP2组、pcDNA3.1-circACAP2+模拟物(mimic)NC组、pcDNA3.1-circACAP2+miR-421 mimic组,每组各10只。将缺氧H9c2细胞置于24孔板中,瞬时转染细胞,分为缺氧组、缺氧+si-NC组、缺氧+si-circACAP2组、缺氧+pcDNA3.1组、缺氧+pcDNA3.1-circACAP2组、缺氧+pcDNA3.1-circACAP2+mimic NC组、缺氧+pcDNA3.1-circACAP2+miR-421 mimic组,另取正常培养的H9c2细胞作为对照组。检测大鼠左心室射血分数(LVEF)、左心室短轴缩短率(LVFS)、心肌梗死情况、心肌组织病理变化、circACAP2、miR-421、BTG2 mRNA表达情况、乳酸脱氢酶(LDH)、肌酸激酶同工酶(CK-MB)活性、H9c2细胞活力和凋亡、心肌组织BTG2蛋白表达、H9c2细胞BTG2蛋白表达。结果MI组circACAP2、BTG2 mRNA表达高于假手术组(1.84±0.21 vs 1.00±0.10,1.68±0.17 vs 1.00±0.10),miR-421表达低于假手术组(0.49±0.05 vs 1.00±0.11,P<0.05);与假手术组比较,MI组梗死面积、CK-MB、LDH活性升高,LVFS、LVEF降低(P<0.05)。与si-NC组比较,si-circACAP2组心肌损伤减轻,LVFS、LVEF升高,梗死面积、CK-MB、LDH活性降低(P<0.05);与缺氧+si-NC组比较,缺氧+si-circACAP2组细胞活力升高,凋亡率、CK-MB和LDH活性降低(P<0.05)。与pcDNA3.1组比较,pcDNA3.1-circACAP2组心肌损伤加重,LVFS、LVEF降低,梗死面积、CK-MB、LDH活性升高(P<0.05);与缺氧+pcDNA3.1组比较,缺氧+pcDNA3.1-circACAP2组细胞活力降低,凋亡率、CK-MB、LDH活性升高(P<0.05)。结论circACAP2在MI大鼠和H9c2细胞中表达上调,沉默circACAP2可能通过调节miR-421/BTG2轴改善心脏功能,减少心肌损伤,提高心肌细胞活力。

环状RNA GRIN2B通过调控微小RNA-135b对食管癌细胞增殖和侵袭的影响实验研究

目的:探讨环状RNA GRIN2B(circ-GRIN2B)对食管癌细胞增殖和侵袭的影响及其分子机制。方法:采用RT-qPCR检测circ-GRIN2B在食管癌细胞株Eca109、TE-13、KYSE30、OE33、EC9706和正常食管上皮细胞HET-1A中的表达,筛选circ-GRIN2B表达最低的细胞株进行后续实验。在食管癌细胞中转染circ-GRIN2B过表达质粒(circ-GRIN2B组)和空载对照质粒(NC组)。采用平板克隆实验和Transwell实验检测circ-GRIN2B对食管癌细胞增殖和侵袭的影响。采用circRNADb软件预测circ-GRIN2B与微小RNA-135b(miR-135b)的结合位点并用双荧光素酶报告基因验证两者的靶向关系。采用RT-qPCR检测两组miR-135b表达。采用Western blot检测细胞增殖相关蛋白[周期蛋白依赖性激酶8(CDK8)、周期素C(Cyclin C)]和侵袭相关蛋白[纤维结合蛋白(FN)、转录因子8(ZLF8)、叉头盒蛋白C2(FOXC2)]表达。结果:与HET-1A细胞比较,circ-GRIN2B在细胞株Eca109、TE-13、KYSE30、OE33、EC9706表达降低,且在EC9706细胞中表达量最低(均P<0.05)。circ-GRIN2B组circ-GR IN2B表达量高于NC组(P<0.01)。circ-GRIN2B组EC9706细胞集落数量少于NC组(P<0.01)。circ-GRIN2B组EC9706细胞侵袭数目小于NC组(P<0.01)。miR-135b是circ-GRIN2B的靶基因。circ-GRIN2B组miR-135b表达量低于NC组(P<0.01)。circ-GRIN2B组EC9706细胞增殖相关蛋白和侵袭相关蛋白表达水平较NC组降低(均P<0.05)。结论:circ-GRIN2B在食管癌细胞中低表达,其可能通过下调miR-135b表达抑制食管癌细胞的增殖和侵袭。

环状RNA_0124644调控微小RNA-136对高糖诱导的肾小管上皮细胞损伤的影响

目的:探讨环状RNA_0124644(circ_0124644)对高糖(HG)诱导的人肾小管上皮细胞(HK-2细胞)损伤的影响。方法:收集29例糖尿病肾病患者及41例健康体检者的血浆,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测circ_0124644和微小RNA(miR)-136的表达;验证circ_0124644和miR-136的靶向关系。将HK-2细胞随机分为正常糖(NG)组、HG组、HG+si-circ_0124644组、HG+si-NC组、HG+si-circ_0124644+anti-miR-136组、HG+si-circ_0124644+anti-miR-NC组。甲基噻唑基四唑(MTT)法检测细胞抑制率;检测细胞凋亡率和活化的半胱氨酸蛋白酶3(Cleaved caspase-3)蛋白水平以及白细胞介素(IL)-6、IL-10、IL-1β、超氧化物歧化酶(SOD)、乳酸脱氢酶(LDH)、丙二醛(MDA)、活性氧(ROS)水平。结果:与健康体检者相比,糖尿病肾病患者血浆中circ_0124644表达升高,miR-136表达降低(P<0.05)。HG可诱导的HK-2细胞中circ_0124644表达升高,miR-136表达降低,细胞抑制率、凋亡率、Cleaved caspase-3蛋白、Cleaved caspase-3平均荧光强度、IL-6、IL-1β、LDH和MDA水平及ROS活性升高,IL-10水平和SOD活性降低(P<0.05)。沉默circ_0124644后,HK-2细胞抑制率、凋亡率和Cleaved caspase-3蛋白表达、Cleaved caspase-3平均荧光强度降低,IL-6、IL-1β水平降低,IL-10水平升高,SOD活性升高,LDH水平和MDA含量及ROS活性降低(P<0.05)。下调miR-136逆减弱了沉默circ_0124644对HG诱导的HK-2细胞的作用。结论:沉默circ_0124644可能通过调控miR-136抑制HG诱导的肾小管上皮细胞损伤。

环状RNA_0032131靶向微小RNA-145-5p调控类风湿关节炎滑膜成纤维细胞的增殖、迁移和侵袭

目的探讨环状RNA_003213(hsa_circ_003213)靶向微小RNA-145-5p(miR-145-5p)对类风湿关节炎滑膜成纤维细胞(RA-FLSs)增殖、迁移和侵袭的影响。方法检测RA患者和健康体检者外周血、RA-FLSs、人正常滑膜成纤维细胞中hsa_circ_0032131和miR-145-5p的水平。将RA-FLSs分为对照(NC)组、si-NC组、si-hsa_circ_0032131组、miR-NC组、miR-145-5p组、anti-miR-NC+si-hsa_circ_0032131组、anti-miR-145-5p+si-hsa_circ_0032131组、pcDNA组、pcDNA-hsa_circ_0032131组。采用CCK-8和Transwell法检测RA-FLSs活力、迁移和侵袭数。通过双荧光素酶报告实验确定hsa_circ_0032131与miR-145-5p的靶向关系。结果与健康体检者相比,RA患者外周血中hsa_circ_0032131表达增加,miR-145-5p表达降低,差异有统计学意义(P<0.05)。与人正常滑膜成纤维细胞相比,RA-FLSs中hsa_circ_0032131表达增加,miR-145-5p表达降低,差异有统计学意义(P<0.05)。与NC组比较,si-hsa_circ_0032131组RA-FLSs的活力和迁移、侵袭数目降低,差异有统计学意义(P<0.05)。与miR-NC组比较,miR-145-5p组RA-FLSs的活力和迁移、侵袭数目降低,差异有统计学意义(P<0.05)。与anti-miR-NC+si-hsa_circ_0032131组比较,anti-miR-145-5p+si-hsa_circ_0032131组RA-FLSs的活力和迁移、侵袭数目增高,差异有统计学意义(P<0.05)。与pcDNA组比较,pcDNA-hsa_circ_0032131组RA-FLSs中miR-145-5p水平降低,差异有统计学意义(P<0.05)。miR-145-5p是hsa_circ_0032131的直接靶点。结论敲低hsa_circ_0032131通过上调miR-145-5p抑制RA-FLSs的增殖、迁移和侵袭。

环状RNA circ-SLAIN2在急性心肌炎患者血清中表达及对心肌细胞活性的影响

目的:观察环状RNA(circRNA)circ-SLAIN2在急性心肌炎患者血清中的表达,探讨circ-SLAIN2对心肌细胞增殖和凋亡的影响及作用机制。方法:收集35例急性心肌炎患者血清标本,另选取35例体检健康者为对照,采用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测血清中circ-SLAIN2表达量。选取人心肌细胞系HCM,分别感染空载慢病毒(对照组)或载有circ-SLAIN2序列的慢病毒(circ-SLAIN2组)。qRT-PCR检测circ-SLAIN2过表达效率。分别采用脂多糖诱导心肌炎,采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)法和流式细胞术检测过表达circ-SLAIN2对人心肌细胞增殖和凋亡的影响。LncBase v.2、Linc2GO、LNCipedia、miRcode在线数据库和双荧光素酶报告基因实验分析circ-SLAIN2和微小RNA-429(miR-429)的靶向关系。qRT-PCR检测miR-429表达水平。蛋白质印迹(Western blot)法检测丝裂原活化蛋白激酶p38(p38MAPK)/核因子κB(NF-κB)信号通路蛋白和凋亡相关蛋白的表达水平。结果:急性心肌炎患者血清中circ-SLAIN2表达较体检健康者显著降低(P<0.01)。与对照组比较,circ-SLAIN2组HCM细胞中circ-SLAIN2表达显著上升(P<0.01)。经过脂多糖处理36 h后,circ-SLAIN2组HCM细胞增殖吸光度明显高于对照组(P<0.01),circ-SLAIN2组HCM细胞凋亡率明显低于对照组(P<0.01)。circ-SLAIN2能够靶向结合miR-429。与对照组比较,circ-SLAIN2组HCM细胞中miR-429表达显著降低(P<0.01),p38MAPK/NF-κB信号通路蛋白表达显著降低(P<0.01),细胞凋亡蛋白Bcl-2相关X蛋白(Bax)、Bcl-2相关K蛋白(Bak)表达量降低(均P<0.01)。结论:circ-SLAIN2在急性心肌炎患者血清中低表达,过表达circ-SLAIN2通过负向调节miR-429表达,增强心肌细胞的活性并抑制细胞的凋亡。

环状RNA circ_0020123靶向调控微小RNA-145影响胰腺癌细胞SW-1990增殖、侵袭与转移实验研究

目的:探讨环状RNA circ_0020123靶向调控微小RNA(miR)-145对胰腺癌细胞SW-1990增殖、侵袭与转移的影响。方法:选择胰腺癌细胞株SW-1990,分为si-NC组、si-circ_0020123组、si-circ_0020123+anti-miR-145组,进行细胞转染。采用MTT法检测细胞增殖能力。采用Transwell侵袭实验检测细胞侵袭与迁移能力。采用反转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测circ_0020123和miR-145相对表达量。采用Western blot检测基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、磷酸化腺苷酸活化蛋白激酶(p-AMPK)。采用双荧光素酶报告实验分析circ_0020123与miR-145的靶向作用。结果:与si-NC组比较,si-circ_0020123组和si-circ_0020123+anti-miR-145组细胞增殖、侵袭及迁移能力明显降低(均P<0.05)。与si-circ_0020123组比较,si-circ_0020123+anti-miR-145组细胞增殖、侵袭及迁移能力明显升高(均P<0.05)。与si-NC组比较,si-circ_0020123组和si-circ_0020123+anti-miR-145组细胞凋亡率升高(均P<0.05)。与si-circ_0020123组比较,si-circ_0020123+anti-miR-145组细胞凋亡率明显降低(P<0.05)。与miR-NC组比较,miR-145组circ_0020123-WT荧光素酶活性降低(P<0.05)。与si-NC组比较,si-circ_0020123组和si-circ_0020123+anti-miR-145组细胞MMP-9、Bcl-2表达水平降低,p-AMPK表达水平升高(均P<0.05)。与si-circ_0020123组比较,si-circ_0020123+anti-miR-145组细胞MMP-9、Bcl-2表达水平升高,p-AMPK表达水平降低(均P<0.05)。结论:circ_0020123通过靶向miR-145可抑制胰腺癌细胞的增殖、侵袭与转移,而沉默miR-145可逆转上述作用。

图自动编码器上二阶段融合实现的环状RNA-疾病关联预测

大部分现有的用于预测环状RNA(circRNA)与疾病之间关联关系的计算模型通常使用circRNA和疾病相关数据等生物学知识,配合已知的circRNA-疾病关联信息对来挖掘出潜在的关联信息。然而这些模型受已知关联构成的网络稀疏性、负样本过少等固有问题的影响,导致预测性能不佳。因此,在图自动编码器基础上引入归纳式矩阵补全及自注意力机制进行二阶段融合,以实现circRNA-疾病关联预测,由此构建的模型叫GIS-CDA(Graph auto-encoder combining Inductive matrix complementation and Self-attention mechanism for predicting Circ RNA-Disease Association)。首先,计算circRNA集成和疾病集成的相似性,并利用图自动编码器学习circRNA和疾病的潜在特征,以获得低维表征;接着,将学习到的特征输入归纳式矩阵补全,以提高节点之间的相似性和依赖性;然后,将circRNA特征矩阵和疾病特征矩阵整合为circRNA-疾病特征矩阵,以增强预测的稳定性和精确性;最后,引入自注意力机制,从特征矩阵中提取重要特征,并减少对其他生物信息的依赖。五折交叉和十折交叉验证的结果显示:GIS-CDA获得的平均接收者操作特征曲线下面积(AUROC)值分别为0.9303和0.9393,前者比基于KATZ测度的人类circRNA-疾病关联预测模型(KATZHCDA)、基于深度矩阵分解方法的circRNA-疾病关联(DMFCDA)预测模型、RWR(Random Walk with Restart)和基于加速归纳式矩阵补全的circRNA-疾病关联(SIMCCDA)预测模型分别高出了13.19、35.73、13.28和5.01个百分点;GIS-CDA的精确率-召回率曲线下面积(AUPR)值分别为0.2271和0.2340,前者比上述对比模型分别高出了21.72、22.43、21.96和13.86个百分点。此外,在circRNADisease、circ2Disease和circ R2Disease数据集上的消融实验和案例研究进一步验证了GIS-CDA在预测circRNA-疾病的潜在关联方面具有较好的性能。

环状RNA SAMD8调控miR-223-3p/RHOB表达抑制胰腺导管腺癌进程的分子机制

目的探讨环状RNA SAMD8(circ-SAMD8)在胰腺导管腺癌(PDAC)进展中的潜在机制。方法基于Microarray数据(GSE79634)分析PDAC组织中circRNAs的表达谱。通过实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证circ-SAMD8(hsa_circ_0006148)在PDAC组织和细胞(CFPAC-1和PANC-1)中的表达。采用生物信息学分析预测circ-SAMD8的靶微小RNA(miRNA)及其下游mRNA,并采用双荧光素酶报告基因实验进行鉴定。采用MTT法和集落形成法检测PDAC细胞的增殖能力。采用免疫印迹法(Western blot)检测抗凋亡蛋白Bcl-2和促凋亡蛋白Bax的表达水平。采用流式细胞术检测凋亡细胞百分比。结果circ-SAMD8在PDAC组织和细胞中的表达水平低于癌旁组织和正常细胞,差异有统计学意义(P<0.05)。过表达circ-SAMD8能有效促进PDAC细胞凋亡,抑制PDAC细胞增殖。双荧光素酶报告基因实验显示,miR-223-3p是circ-SAMD8的一个潜在相互作用分子,miR-223-3p的下游mRNA靶点是RHOB。miR-223-3p在PDAC组织和细胞中异常过表达,并伴有RHOB低表达。在转染miR-223-3p模拟物或sh-circ-SAMD8的PDAC细胞中,RHOB表达显著降低,增殖能力增强,凋亡率降低。结论circ-SAMD8通过海绵化miR-223-3p,调控下游RHOB的表达,有效抑制PDAC的发生发展。

环状RNA_0003028靶向微小RNA-498调控生殖器形成抑制基因-1/p53信号通路对人肝癌细胞系Huh7的影响

目的探讨环状RNA(circ)_0003028对人肝癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响及分子机制。方法人肝癌细胞系Huh7分为小干扰RNA(si)-NC组、si-circ_0003028组、微小RNA(miR)-NC组、miR-498模似物(mimics)组、si-circ_0003028+anti-miR-NC组、si-circ_0003028+anti-miR-498组;Real-time PCR检测肝癌组织及各组细胞中circ_0003028和miR-498表达水平;MTT检测细胞增殖;Transwell检测细胞迁移和侵袭数;Western blotting检测蛋白表达;双荧光素酶报告实验检测circ_0003028和miR-498的靶向调控关系。结果肝癌组织中circ_0003028表达水平升高(0.98±0.02 vs 1.36±0.01),miR-498表达水平降低(0.98±0.02 vs 0.63±0.02)(P<0.05)。抑制circ_0003028表达或miR-498过表达后,Huh7细胞中Ki-67(0.85±0.02 vs 0.41±0.02或0.95±0.11 vs 0.37±0.02)、基质金属蛋白酶(MMP)-2(0.71±0.02 vs 0.43±0.03或0.83±0.02 vs 0.41±0.03)、MMP-9(0.74±0.02 vs 0.37±0.02或0.78±0.02 vs 0.39±0.02)蛋白表达水平降低,细胞活性(1.53±0.03 vs 1.05±0.02或1.68±0.02 vs 1.11±0.02)降低;迁移(111.40±2.12 vs 77.22±2.38或108.90±2.30 vs 78.44±1.46)和侵袭(87.89±2.18 vs 49.78±1.98或80.22±1.79 vs 38.22±1.52)细胞数减少,生殖器形成抑制基因-1(SMG-1)(0.76±0.02 vs 1.39±0.02或0.79±0.02 vs 1.39±0.02)、p53(0.77±0.02 vs 1.24±0.03或0.82±0.03 vs 1.45±0.03)、p53-ser15(0.78±0.03 vs 1.50±0.02或0.82±0.02 vs 1.49±0.04)蛋白表达水平升高(P<0.05)。Circ_0003028靶向调控miR-498,沉默miR-498逆转了抑制circ_0003028表达对Huh7细胞增殖、迁移和侵袭的影响。结论抑制circ_0003028表达通过靶向miR-498影响SMG-1/p53信号通路而抑制人肝癌细胞增殖、迁移和侵袭。

环状RNA-0007478在急性心肌梗死患者中的预测价值

目的探讨环状RNA-0007478在急性心肌梗死(AMI)患者中的变化情况及其在冠状动脉狭窄严重程度中的预测价值。方法选择2018年7月至12月在温州医科大学附属第一医院行冠状动脉造影(CAG)的患者131例,根据患者症状、心电图及CAG结果将患者分为AMI组72例、不稳定型心绞痛(UAP)组28例和对照组31例。提取患者血液单个核细胞RNA,利用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测所有患者的环状RNA-0007478相对表达量,并通过Gensini评分系统评估所有患者冠状动脉狭窄严重程度。结果与对照组和UAP组相比,AMI组患者的环状RNA-0007478相对表达量水平均增高(均P<0.01)。在AMI组的亚组分析中,心肌梗死发病持续时间<8~12 h、<12~24 h者环状RNA-0007478的相对表达量均高于对照组(均P<0.05);病变位于血管近端者环状RNA-0007478基因的相对表达量高于病变位于血管远端者(P<0.01)。通过Pearson相关性分析发现,环状RNA-0007478的相对表达量与Gensini评分呈正相关(r=0.4934,P<0.01)。采用多因素回归分析发现,环状RNA-0007478的相对表达量是冠状动脉病变严重程度的独立危险因素(P<0.01)。在ROC曲线中,环状RNA-0007478的相对表达量预测AMI发生的灵敏度为0.7966,特异度为0.7778,曲线下面积为0.866。结论环状RNA-0007478可以作为一种预测冠状动脉闭塞导致AMI的新型生物标志物。

环状RNA叉头框蛋白O3靶向微小RNA-122-5p对结直肠癌细胞恶性生物学行为的影响

目的探讨环状RNA叉头框蛋白O3(circFOXO3)靶向微小RNA(miRNA)-122-5p对结直肠癌细胞恶性生物学行为的影响。方法(1)选取38例结直肠癌患者结直肠癌组织、癌旁组织,采用实时定量PCR法检测结直肠癌组织、癌旁组织中circFOXO3、miRNA-122-5p的表达水平,并分析结直肠癌组织中circFOXO3与miRNA-122-5p表达水平的相关性。(2)取人结直肠癌细胞HCT116分为6组并给予相应干预,包括si-NC组(转染si-NC)、si-circFOXO3组(转染si-circFOXO3)、miRNA-NC组(转染miRNA-122-5p-NC)、miRNA-122-5p组(转染miRNA-122-5p模拟物)、si-circFOXO3+抗miRNA-NC组(共转染si-circFOXO3与抗miRNA-122-5p-NC)、si-circFOXO3+抗miRNA-122-5p组(共转染si-circFOXO3与抗miRNA-122-5p)。分别采用细胞计数法、平板克隆形成实验、Transwell小室实验检测人结直肠癌细胞HCT116的增殖、克隆形成、迁移及侵袭能力,采用蛋白质印迹法检测基质金属蛋白酶(MMP)-2、MMP-9蛋白表达水平。(3)通过生物信息学数据库starBase预测circFOXO3的靶基因,通过双荧光素酶报告基因实验检测circFOXO3与miRNA-122-5p的靶向关系。结果(1)与癌旁组织相比,结直肠癌组织中的circFOXO3表达水平升高,miRNA-122-5p表达水平降低,结直肠癌组织中的circFOXO3与miRNA-122-5p表达水平呈负相关(均P<0.05)。(2)与si-NC组比较,si-circFOXO3组的miRNA-122-5p表达水平升高,细胞活力降低,克隆形成数、迁移及侵袭细胞数减少,MMP-2、MMP-9蛋白表达水平降低(均P<0.05)。与miRNA-NC组比较,miRNA-122-5p组的细胞活力降低,克隆形成数、迁移及侵袭细胞数均减少,MMP-2、MMP-9蛋白表达水平降低(均P<0.05)。与si-circFOXO3+抗miRNA-NC组比较,si-circFOXO3+抗miRNA-122-5p组的细胞活力升高,克隆形成数、迁移及侵袭细胞数均增多,MMP-2、MMP-9蛋白表达水平升高(均P<0.05)。(3)circFOXO3与miRNA-122-5p存在结合位点,转染miRNA-122-5p模拟物可明显降低野生型载体WT-circFOXO3的荧光素酶活性(P<0.05),而对突变型载体MUT-circFOXO3的荧光素酶活性无明显影响(P>0.05)。结论干扰circFOXO3的表达可通过靶向调控miRNA-122-5p从而抑制结直肠癌细胞增殖、克隆形成、迁移及侵袭能力。

环状RNA-1565对前列腺癌PC-3细胞生物学行为的影响及其机制

目的观察环状RNA(circRNA)-1565对前列腺癌PC-3细胞生物学行为的影响,并探讨其可能的机制。方法将PC-3细胞分为观察组和对照组,分别转染circRNA-1565 siRNA(si445)和阴性对照siRNA。两组转染24 h,分别检测其培养0~4 d细胞增殖、克隆形成、凋亡、侵袭及迁移能力。免疫共沉淀实验筛选与circRNA-1565结合的miRNA分别为miR-21和miR-153,采用双荧光素酶报告基因实验观察circRNA-1565对miR-21和miR-153的调控作用。将PC-3细胞分为si445组、si445+miR-21 inhibitor组、si445+miR-153 inhibitor组、阴性对照组,分别转染si445、si445+miR-21 inhibitor、si445+miR-153 inhibitor及阴性对照siRNA,并检测细胞侵袭、迁移能力。采用Western blotting法检测si445组、si445+miR-153 inhibitor组、阴性对照组细胞磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、磷酸酶和张力蛋白同源物(PTEN)、蜗牛家族转录抑制子1(SNAIL1)蛋白表达。结果观察组与对照组不同时间点细胞增殖OD值、克隆形成个数、细胞凋亡率比较差异均无统计学意义(P均>0.05),观察组进入下室的细胞个数、细胞移动距离均低于对照组(P均<0.05)。双荧光素酶报告基因结果显示,circRNA-1565可以分别与miR-21及miR-153直接结合。与阴性对照组比较,其余三组进入下室的细胞个数、细胞移动距离均降低,且si445组、si445+miR-21 inhibitor组降低更明显(P均<0.05)。si445组、si445+miR-21 inhibitor组进入下室的细胞个数、细胞移动距离比较P均>0.05。si445组、si445+miR-153 inhibitor组、阴性对照组细胞PI3K蛋白相对表达量依次升高(P均<0.05),三组细胞PTEN和SNAIL1蛋白相对表达量比较P均>0.05。结论circRNA-1565可促进前列腺癌PC-3细胞侵袭和迁移,其机制可能与竞争性结合miR-153并沉默其下游靶蛋白PI3K表达有关。

环状RNA-SCAF8通过miR-93-5p/TXNIP通路促进血管内皮细胞焦亡

目的:探究环状RNA(circRNA)-SR相关CTD相关因子8(SCAF8)在高糖环境下对血管内皮细胞焦亡发挥的作用及机制。方法:将来源于人脐静脉内皮细胞分为正常对照组、高糖对照组分别置于5、33 mmol/L葡萄糖浓度的细胞培养基培养,RNA对照组、circRNA-SCAF8抑制组、微RNA(miR)-93-5p过表达组和miR-93-5p抑制组分别在高糖环境下加入无功能siRNA、circRNA-SCAF8抑制分子、miR-93-5p过表达分子和miR-93-5p抑制剂。采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)法、流式细胞术和Hoechst 33342/碘化丙啶双荧光染色法检测细胞存活率和焦亡率,采用蛋白质印迹法和酶联免疫吸附法检测凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、胱天蛋白酶1(caspase-1)、Gasdermin D蛋白(GSDMD)、NOD样受体家族蛋白3(NLRP-3)、硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)、IL-18和IL-1β等焦亡相关因子表达,采用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测circRNA-SCAF8、miR-93-5p和TXNIP的基因表达,采用荧光原位杂交法定位circRNA-SCAF8和miR-93-5p,采用双荧光素酶实验验证miR-93-5p与上下游分子的靶向调控关系。结果:与RNA对照组比较,circRNASCAF8抑制组和miR-93-5p过表达组细胞存活率升高(均P<0.01),细胞焦亡率降低(均P<0.01),TXNIP、NLRP-3、caspase-1、GSDMD、ASC、IL-18和IL-1β等焦亡相关因子的表达量显著减少(均P<0.05);抑制circRNA-SCAF8后miR-93-5p的表达量显著增加(P<0.01),过表达miR-93-5p后circRNA-SCAF8的表达有降低趋势,但差异无统计学意义(P>0.05)。miR-93-5p通过与circRNA-SCAF8的3'UTR区结合下调circRNA-SCAF8表达,miR-93-5p通过与TXNIP的3'UTR区结合下调TXNIP表达。circRNA-SCAF8和miR-93-5p均位于细胞质中,在细胞中高度关联。qRT-PCR结果显示,过表达或抑制miR-93-5p后,TXNIP的相对表达量较RNA对照组分别增加或减少(均P<0.05),证明miR-93-5p可调控TXNIP基因表达。结论:circRNASCAF8/miR-93-5p/TXNIP通路可能参与调控高糖环境下血管内皮细胞焦亡。

环状RNA-胞裂蛋白2/miR-150-5p/聚腺苷二磷酸核糖聚合酶-1分子轴在重症急性胰腺炎中的作用及机制研究

目的探讨环状RNA(circRNA)-胞裂蛋白2(SEPT2)/miR-150-5p/聚腺苷二磷酸核糖聚合酶-1(PARP-1)分子轴在重症急性胰腺炎(SAP)中的作用及机制。方法选取2019年12月至2021年12月赣南医学院第一附属医院收治的46例SAP患者作为重症组;并选取本院同期收治的41例轻症急性胰腺炎(MAP)患者作为轻症组;另选取本院同期35名健康体检者作为对照组。3组均采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)法测定血清circRNA-SEPT2、miR-150-5p、PARP-1基因表达量,采用急性生理和慢性健康评分系统Ⅱ(APACHEⅡ)评估病情严重程度;采用重组慢病毒包装合成有效感染序列sh-SEPT2(干扰组)与过表达序列oe-SEPT2(过表达组)建立动物模型,采用酶联免疫吸附试验测定大鼠生化指标[白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-18(IL-18)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、D乳酸及二胺氧化酶(DAO)],采用RT-PCR及Western blot法检测大鼠circRNA-SEPT2、miR-150-5p、PARP-1及细胞凋亡相关基因半胱氨酸蛋白酶(Caspase)-3、Caspase-9 mRNA表达。比较3组circRNA-SEPT2、miR-150-5p、PARP-1基因表达量及APACHEⅡ评分,采用Pearson相关性分析SAP患者PARP-1与circRNA-SEPT2、miR-150-5p及APACHEⅡ评分的相关性;比较干扰组与过表达组大鼠苏木精-伊红染色法(HE)结果、肠黏膜损伤评分、炎症因子水平及cir-cRNA-SEPT2、miR-150-5p、PARP-1和Caspase-3、Caspase-9 mRNA表达量。结果重症组circRNA-SEPT2、miR-150-5p、PARP-1基因表达量及APACHEⅡ评分均高于轻症组和对照组,且轻症组高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关性结果显示,SAP患者PARP-1与circRNA-SEPT2、miR-150-5p及APACHEⅡ评分均呈正相关(r>0,P<0.05)。干扰组HE染色下胰岛细胞界限清晰,胰岛丰富,胞浆丰富,形态完整;过表达组大鼠胰岛细胞界限不清,胰岛数量较少,细胞形态不规则,细胞体积较大,边缘不齐;干扰组胰腺损伤评分为(2.58±0.16)分,低于过表达组的(3.95±0.53)分,差异有统计学意义(P<0.05)。干扰组IL-1β、IL-18、TNF-α、D乳酸及DAO水平均低于过表达组,差异有统计学意义(P<0.05)。干扰组大鼠circRNA-SEPT2、miR-150-5p、PARP-1 mRNA表达及细胞凋亡相关基因Caspase-3、Caspase-9 mRNA表达量均低于过表达组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论PARP-1通过靶向作用于circRNA-SEPT2/miR-150-5p参与SAP的发生与发展,抑制circRNA-SEPT2表达,可减轻SAP肠黏膜屏障损伤,能为SAP治疗提供新的靶点。

过表达环状RNA-103809调节乳腺癌细胞氧化应激和免疫

目的探究过表达环状RNA-103809(circRNA-103809)对乳腺癌细胞氧化应激和免疫的调节。方法将pc DNA空质粒、circ RNA-103809过表达质粒转染乳腺癌细胞MCF-7,分别作阴性对照组和circ103809组,另设置空白对照组。q RT-PCR检测各组细胞中circ103809的表达,克隆形成实验检测细胞生长,生化试剂盒检测氧化应激标记物超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)和谷胱甘肽(GSH),流式细胞术检测线粒体膜电位的变化,Western blot检测细胞中增殖相关蛋白Ki67、p21、增殖细胞核抗原(PCNA)、B淋巴细胞瘤-2基因(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、细胞增殖基因c-Myc的表达,酶联免疫吸附法(ELISA)和qRT-PCR检测炎症因子白细胞介素(IL-6、IL-10)和诱导型一氧化氮合酶(i NOS),免疫荧光检测p65的含量。结果与空白对照组和阴性对照组相比,circ103809组细胞中绿色荧光信号增强,circ103809的相对表达量、p21蛋白相对表达量、GSH和MDA含量、Bax/Bcl-2水平、IL-10表达明显升高,细胞集落形成率、Ki67、PCNA、c-Myc蛋白相对表达量、SOD含量、IL-6、i NOS表达及p65入核阳性率明显降低(P<0.05)。结论过表达circRNA-103809可抑制乳腺癌细胞MCF-7的增殖,可能与促进氧化应激水平、减轻炎症反应有关。

环状RNA丝氨酸/苏氨酸蛋白扰动样激酶1和微小RNA-214在缺血性脑卒中病人中的表达及意义

目的 探究环状RNA丝氨酸/苏氨酸蛋白扰动样激酶1(Circ TLK1)和微小RNA(miR)-214在缺血性脑卒中(IS)病人中的表达及意义。方法 选取2019年4月至2021年4月在广元市中心医院治疗的97例IS病人为观察组,根据美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分将IS病人分为轻度组33例、中度组45例、重度组19例,另选取85例健康体检者为健康组。采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测所有病人血清Circ TLK1和miR-214水平。对IS病人进行90 d的预后随访,按照改良Rankin量表(mRS)分为预后良好组和预后不良组,分析并比较不同预后病人的临床指标。多因素logistic回归分析IS病人预后不良的影响因素。受试者操作特征曲线(ROC曲线)分析Circ TLK1和miR-214对IS病人预后的预测价值。结果与健康组相比,观察组血清Circ TLK1[(1.83±0.22)比(1.03±0.12)]和miR-214[(2.64±0.49)比(1.07±0.13)]均显著性上调(P<0.05)。与轻度组相比,中度组和重度组病人血清Circ TLK1和miR-214均显著性上调,与中度组相比,重度组病人血清Circ TLK1和miR-214水平显著上升(P<0.05)。观察组病人90 d预后随访结果显示,预后良好组病人63例,预后不良组病人34例。两组病人同型半胱氨酸(Hcy)、三酰甘油、梗死体积、发病到住院的时间、入院时NIHSS评分、Circ TLK1、miR-214水平之间差异有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示,入院时NIHSS评分高、发病到住院的时间长、Circ TLK1、miR-214高水平是IS病人预后不良的独立危险因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,Circ TLK1和miR-214对IS病人预后评估价值的曲线下面积(AUC)分别为0.86、0.83,灵敏度分别为91.20%、67.60%,特异度分别为74.60%、90.50%。结论 Circ TLK1和miR-214在IS病人血清中呈高表达,二者是IS病人预后不良的独立危险因素,对病人的预后具有一定的评估价值。

环状RNA MAPK4通过吸附miR-125a-3p对神经胶质瘤细胞生物学行为的影响

目的 探讨环状RNA MAPK4(circ-MAPK4)对神经胶质瘤细胞生物学行为的影响。方法 使用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)检测人神经胶质瘤细胞株(U138、U373、U87、A172、U251)和人正常性星形胶质细胞(HA1800)中circ-MAPK4、微小RNA-125a-3p(miR-125a-3p)表达水平,将U138细胞分为circ-MAPK4低表达组(si-circMAPK4组)、阴性对照组(si-NC组)、无转染组(control组),si-circMAPK4组、si-NC组U138细胞分别转染circ-MAPK4 siRNA及其阴性对照siRNA-NC,control组细胞不做转染处理;采用circNet、StarBase分析预测circ-MAPK4与miR-125a-3p的靶向关系并使用荧光素酶实验进行验证;将si-circMAPK4组U138细胞分为circ-MAPK4+miR-inhibitor组、circ-MAPK4+NC-inhibitor组2个亚组并完成相关转染,采用CCK-8法检测U138细胞活力、细胞集落实验检测细胞克隆形成率、Transwell检测细胞侵入细胞数目、流式细胞法检测细胞凋亡率,Western blot检测细胞增殖蛋白(Ki67、cycD)、侵袭蛋白(E-cadherin、N-cadherin、Vimentin)、凋亡蛋白(Ceaved-caspase3/caspase3)表达水平。结果 与HA1800细胞比较,U138、U373、U87和A172细胞的circ-MAPK4表达水平升高(P<0.05),miR-125a-3p表达水平下降(P<0.05);荧光素酶实验结果显示circ-MAPK4-mut/miR-125a-3p mimics、circ-MAPK4-mut/NC-mimics、circ-MAPK4-WT/NC-mimics细胞的荧光素酶相对活性均高于circ-MAPK4-WT/miR-125a-3p mimics细胞(F=437.659,P<0.001);与si-NC组比较,si-circMAPK4组细胞活力、克隆形成率、细胞侵入细胞数目、Ki67、cycD、N-cadherin和Vimentin蛋白表达降低(P<0.05),而细胞凋亡率、Ceaved-caspase3/caspase3和E-cadherin蛋白表达升高(P<0.05);与circ-MAPK4+NC-inhibitor组比较,circ-MAPK4+miR-inhibitor组细胞活力、克隆形成率、细胞侵入细胞数目、Ki67、cycD、N-cadherin和Vimentin蛋白表达升高(P<0.05),细胞凋亡率、Ceaved-caspase3/caspase3和E-cadherin蛋白表达降低(P<0.05)。结论 circ-MAPK4低表达能减弱人神经胶质瘤细胞U138细胞增殖和侵袭能力,促进细胞凋亡,可能与吸附miR-125a-3p作用有关。