21种广东省珍稀保护药用植物的DNA条形码分析

目的研究广东省珍稀濒危药用植物和国家重点保护药用植物的DNA条形码,构建条形码数据库,为广东省珍稀保护药用植物分子鉴定提供依据。方法野外采集目标植物叶片,硅胶干燥保存。采取试剂盒法提取样品基因组DNA,扩增ITS2、psbA-trnH、ITS、matK、rbcL、ycf1等6种DNA条形码,Sanger法进行双向测序。对双向拼接后的序列进行测序成功率、序列特征和BLAST鉴定情况统计。结果共搜集广东省珍稀保护药用植物21种182份,经测序获得条形码543条,各条形码在全部样品中的测序成功率比较:psbA-trnH>rbcL>ITS2>matK>ycf1>ITS,在物种水平的BLAST鉴定成功率比较:psbA-trnH>ITS>ycf1>matK>ITS2>rbcL。同时统计各条形码在蕨类、裸子及被子植物等不同分类阶元中的相应数据。结论综合测序成功率和BLAST鉴定成功率的结果,psbA-trnH条形码表现最好,为最适用于鉴定广东省珍稀保护药用植物的DNA条形码。同时,该研究构建了广东省珍稀保护药用植物DNA条形码数据库,为这些物种的分子鉴定奠定基础。