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基于ITS2序列的球兰属植物种间鉴定研究
被引量:
2
1
作者
夏艺萌
尹杰
+4 位作者
曾丽珊
王艳鸽
詹若挺
林颖
张桂芳
《中药材》
CAS
北大核心
2023年第3期603-609,共7页
目的:利用ITS2序列对球兰属植物进行DNA分子鉴定,为其物种鉴定和遗传多样性研究寻求新路径。方法:提取80份球兰样品的DNA,通过PCR扩增ITS2序列并测序,预测其ITS2二级结构。运用MEGA6.0等软件构建邻接(NJ)系统发育树,计算各类别遗传距离...
目的:利用ITS2序列对球兰属植物进行DNA分子鉴定,为其物种鉴定和遗传多样性研究寻求新路径。方法:提取80份球兰样品的DNA,通过PCR扩增ITS2序列并测序,预测其ITS2二级结构。运用MEGA6.0等软件构建邻接(NJ)系统发育树,计算各类别遗传距离。通过叶片形态学特征对其聚类结果进行验证。结果:80份球兰属植物ITS2序列长度约为250 bp,样品CG含量在60.44%~72.88%之间,平均CG含量为68.12%。种内恒定位点数为32,变异位点数为217。NJ系统发育树中80份样品可聚类为11类。序列总体平均遗传距离为0.171,对80份球兰样品的鉴别成功率约为81.25%,结合ITS2序列二级结构可直观地将大部分球兰属植物区分。基于ITS2序列的NJ进化树可阐述球兰属植物的种间关系,聚为一类的球兰属植物叶片颜色和叶形较为相似,也在一定程度上验证了聚类树构建的合理性。结论:ITS2序列可作为解决球兰属植物物种鉴定难题的有效方法。
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关键词
球兰属植物
ITS2序列
DNA条形码
分子鉴定
下载PDF
职称材料
题名
基于ITS2序列的球兰属植物种间鉴定研究
被引量:
2
1
作者
夏艺萌
尹杰
曾丽珊
王艳鸽
詹若挺
林颖
张桂芳
机构
广州中医药大学中药学院
岭南中药资源教育部重点实验室
华中科技大学同济医学院药学院
出处
《中药材》
CAS
北大核心
2023年第3期603-609,共7页
基金
国家中医药管理局全国中药资源普查项目(GZY-KJS-2018-004)
广东省省级乡村振兴战略专项(2020KJ148)
广东省普通高校“服务乡村振兴计划”重点领域专项(2019KZDZX2017)
文摘
目的:利用ITS2序列对球兰属植物进行DNA分子鉴定,为其物种鉴定和遗传多样性研究寻求新路径。方法:提取80份球兰样品的DNA,通过PCR扩增ITS2序列并测序,预测其ITS2二级结构。运用MEGA6.0等软件构建邻接(NJ)系统发育树,计算各类别遗传距离。通过叶片形态学特征对其聚类结果进行验证。结果:80份球兰属植物ITS2序列长度约为250 bp,样品CG含量在60.44%~72.88%之间,平均CG含量为68.12%。种内恒定位点数为32,变异位点数为217。NJ系统发育树中80份样品可聚类为11类。序列总体平均遗传距离为0.171,对80份球兰样品的鉴别成功率约为81.25%,结合ITS2序列二级结构可直观地将大部分球兰属植物区分。基于ITS2序列的NJ进化树可阐述球兰属植物的种间关系,聚为一类的球兰属植物叶片颜色和叶形较为相似,也在一定程度上验证了聚类树构建的合理性。结论:ITS2序列可作为解决球兰属植物物种鉴定难题的有效方法。
关键词
球兰属植物
ITS2序列
DNA条形码
分子鉴定
Keywords
Hoya plants
ITS2 sequence
DNA barcoding
Molecular identification
分类号
R282.71 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于ITS2序列的球兰属植物种间鉴定研究
夏艺萌
尹杰
曾丽珊
王艳鸽
詹若挺
林颖
张桂芳
《中药材》
CAS
北大核心
2023
2
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