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油茶甘油二酯激酶基因(CoDGK3)的克隆与表达分析
1
作者
江南
张维利
+2 位作者
李捷宇
刘奇龙
刘敏
《食品与生物技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期1090-1095,共6页
以油茶转录组数据为基础,采用RT-PCR和RACE技术,根据Unigene序列设计油茶甘油二酯激酶基因(Co DGK)RACE引物,分离克隆了DGK基因全长c DNA序列,命名为Co DGK3(Gene Bank登录号:KM068056),基因全长1 568 bp,开放阅读框1 455 bp,编码485个...
以油茶转录组数据为基础,采用RT-PCR和RACE技术,根据Unigene序列设计油茶甘油二酯激酶基因(Co DGK)RACE引物,分离克隆了DGK基因全长c DNA序列,命名为Co DGK3(Gene Bank登录号:KM068056),基因全长1 568 bp,开放阅读框1 455 bp,编码485个氨基酸;氨基酸同源比对及序列分析表明油茶与其它物种的DGK氨基酸序列具有较高的相似性,其中与麻风树和毛果杨相似性最高,达到78%;利用生物学软件对蛋白质进行生物信息学分析,获得其结构特点及理化性质;分析转录组数据中DGK相关的Unigene序列RTKM值和对Co DGK3基因实施实时荧光定量PCR,结果表明Co DGK3在油茶种子发育各时期表达量变化差异不大,并且发现转录组数据分析和实时荧光定量分析的结果变化规律一致,证明了转录组测序的有效性。
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关键词
油茶
甘油二酯激酶基因
克隆
生物信息学分析
基因
表达
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职称材料
题名
油茶甘油二酯激酶基因(CoDGK3)的克隆与表达分析
1
作者
江南
张维利
李捷宇
刘奇龙
刘敏
机构
湖南工业大学包装与材料工程学院
中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室/经济林育种与栽培国家林业局重点实验室
出处
《食品与生物技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期1090-1095,共6页
基金
湖南省科技计划项目(2012NK3065)
文摘
以油茶转录组数据为基础,采用RT-PCR和RACE技术,根据Unigene序列设计油茶甘油二酯激酶基因(Co DGK)RACE引物,分离克隆了DGK基因全长c DNA序列,命名为Co DGK3(Gene Bank登录号:KM068056),基因全长1 568 bp,开放阅读框1 455 bp,编码485个氨基酸;氨基酸同源比对及序列分析表明油茶与其它物种的DGK氨基酸序列具有较高的相似性,其中与麻风树和毛果杨相似性最高,达到78%;利用生物学软件对蛋白质进行生物信息学分析,获得其结构特点及理化性质;分析转录组数据中DGK相关的Unigene序列RTKM值和对Co DGK3基因实施实时荧光定量PCR,结果表明Co DGK3在油茶种子发育各时期表达量变化差异不大,并且发现转录组数据分析和实时荧光定量分析的结果变化规律一致,证明了转录组测序的有效性。
关键词
油茶
甘油二酯激酶基因
克隆
生物信息学分析
基因
表达
Keywords
Camellia oleifera
diacylglycerol kinase
cloning
bioinformatics analysis
gene expression
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
油茶甘油二酯激酶基因(CoDGK3)的克隆与表达分析
江南
张维利
李捷宇
刘奇龙
刘敏
《食品与生物技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
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