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DNA提纯方法对6种甘蔗亚族植物RAPD的影响
被引量:
23
1
作者
范源洪
蔡青
+1 位作者
宿兵
张亚平
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
1999年第1期1-7,共7页
甘蔗植物组织内的多酚类、色素类等物质是干扰RAPD扩增反应的主要成分。本研究以CTAB法和SDS法为基础,着重对抗氧化剂(PVP等)、酶(蛋白酶K、RNaseA)和酚抽提等因素对提取DNA的质量及其RAPD的影响进行...
甘蔗植物组织内的多酚类、色素类等物质是干扰RAPD扩增反应的主要成分。本研究以CTAB法和SDS法为基础,着重对抗氧化剂(PVP等)、酶(蛋白酶K、RNaseA)和酚抽提等因素对提取DNA的质量及其RAPD的影响进行了比较筛选。结果表明:①甘蔗DNA提取质量和纯度与RNaseA、抗氧化剂等处理直接相关,蛋白酶K、CTAB和SDS的处理无明显差异;②对于甘蔗RAPD反应,模板DNA中含有一定量的RNA和蛋白质,其扩增产物无明显差异,但模板DNA的降解程度和含有酚类、色素等是干扰甘蔗RAPD反应的主要因子。进一步分析讨论了甘蔗RAPD扩增的有效的DNA提纯方法和影响因子。
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关键词
DNA提纯
甘蔗亚族
RAPD
甘蔗
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职称材料
甘蔗亚族的地理分布
被引量:
3
2
作者
于慧
赵南先
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期29-35,共7页
对甘蔗亚族植物在世界的分布状况和在中国的分布特点进行了讨论,通过分析甘蔗亚族各属种的分布区类型,认为亚洲东南部为甘蔗亚族的分布中心和多样性中心,同时对甘蔗亚族起源作了推测。
关键词
甘蔗亚族
地理分布
禾本科
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职称材料
禾本科甘蔗亚族一新属
被引量:
5
3
作者
孙必兴
王松
《云南植物研究》
CSCD
1997年第3期239-240,共2页
80年代初期,我们在云南采到5号标本,解剖观察认为是甘蔗亚族(Saccharinae)植物。再进一步查对,要把它放入这个亚族中的任何一属均觉不妥。故另立新属与新种。本新属与芒属(Miscanthus)似有亲缘关系。
关键词
禾本科
甘蔗亚族
新属
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职称材料
中国甘蔗亚族几个容易混淆物种的订正
4
作者
刘艳春
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期734-739,744,共7页
通过标本研究和野外考察发现:被鉴定为二色金茅和滇南金茅的国产标本实际均为四脉金茅,且二色金茅和滇南金茅在国内无分布,国内各植物志中该名称下的类群应归入四脉金茅。另发表一新组合E.quadrinervis var.latifolia(Rendle)Y.C.Liu&am...
通过标本研究和野外考察发现:被鉴定为二色金茅和滇南金茅的国产标本实际均为四脉金茅,且二色金茅和滇南金茅在国内无分布,国内各植物志中该名称下的类群应归入四脉金茅。另发表一新组合E.quadrinervis var.latifolia(Rendle)Y.C.Liu&H.Peng.;国内各植物志和各大标本馆在描述和鉴定Microstegium ciliatum时,常与M.fasciculatum混淆,并在各种场合错误引证;在此澄清二者真正的区别。
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关键词
甘蔗亚族
禾本科
分类
订正
新组合
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职称材料
基于rDNA-ITS序列探讨甘蔗近缘属种的系统进化关系
被引量:
8
5
作者
刘新龙
苏火生
+4 位作者
马丽
陆鑫
应雄美
蔡青
范源洪
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第11期1853-1863,共11页
以狼尾草属(PennisetumRich.)的象草(P.purpureum)为外群体,依据rDNA-ITS序列探讨了甘蔗亚族(Saccharinae)内与甘蔗植物分类关系较近的8属37种120份材料的系统进化关系,结果表明,ITS1序列长度为200~208bp,变异位点91个,简约信息位...
以狼尾草属(PennisetumRich.)的象草(P.purpureum)为外群体,依据rDNA-ITS序列探讨了甘蔗亚族(Saccharinae)内与甘蔗植物分类关系较近的8属37种120份材料的系统进化关系,结果表明,ITS1序列长度为200~208bp,变异位点91个,简约信息位点70个,GC含量为60.4%~69.1%;ITS2序列长度为215~220bp,变异位点93个,简约信息位点68个,GC含量为66.1%~73.4%;5.8sDNA序列长度为164bp,变异位点18个,简约信息位点9个,GC含量为54.1%~58.0%;根据变异位点,简约信息位点占总位点的比例可以看出,ITS序列比5.8sDNA序列变异程度高,其中ITS1序列又较ITS2序列变异丰富。属种间遗传距离表明芒属(Miscanthus)和荻属(Triarrhena)与甘蔗属(Saccharum)的亲缘关系最近,其次为蔗茅属(Erianthus)和河八王属(Narenga);而莠竹属(Microstegium)、大油芒属(Spodiopogon)、白茅属(Imperata)与甘蔗属亲缘关系较远。根据甘蔗近缘属种的NJ和MP系统发育关系,支持将斑茅(E.arundinaceus)归入蔗茅属,荻属归入芒属的观点;河八王属的河八王(N.porphyrocoma)与滇蔗茅(E.rockii)亲缘关系较近,而与同属的金猫尾(N.fallax)亲缘关系较远;蔗茅属和芒属属种系统进化关系较其他属种复杂;有4份材料被发现鉴定有误,不应用于后续研究。
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关键词
甘蔗
ITS
系统进化
甘蔗亚族
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职称材料
题名
DNA提纯方法对6种甘蔗亚族植物RAPD的影响
被引量:
23
1
作者
范源洪
蔡青
宿兵
张亚平
机构
云南省农科院甘蔗研究所
中国科学院昆明动物所细胞与分子进化开放实验室
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
1999年第1期1-7,共7页
基金
云南省自然科学基金
文摘
甘蔗植物组织内的多酚类、色素类等物质是干扰RAPD扩增反应的主要成分。本研究以CTAB法和SDS法为基础,着重对抗氧化剂(PVP等)、酶(蛋白酶K、RNaseA)和酚抽提等因素对提取DNA的质量及其RAPD的影响进行了比较筛选。结果表明:①甘蔗DNA提取质量和纯度与RNaseA、抗氧化剂等处理直接相关,蛋白酶K、CTAB和SDS的处理无明显差异;②对于甘蔗RAPD反应,模板DNA中含有一定量的RNA和蛋白质,其扩增产物无明显差异,但模板DNA的降解程度和含有酚类、色素等是干扰甘蔗RAPD反应的主要因子。进一步分析讨论了甘蔗RAPD扩增的有效的DNA提纯方法和影响因子。
关键词
DNA提纯
甘蔗亚族
RAPD
甘蔗
Keywords
DNA extraction
sugarcane( saccharinae )
RAPD
分类号
S566.103.2 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
甘蔗亚族的地理分布
被引量:
3
2
作者
于慧
赵南先
机构
中国科学院华南植物园
出处
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期29-35,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(39670061)
中国科学院"九五"资源环境重点资助项目(KZ952-S2-112)
中国科学院生物特别项目(STZ-00-20)
文摘
对甘蔗亚族植物在世界的分布状况和在中国的分布特点进行了讨论,通过分析甘蔗亚族各属种的分布区类型,认为亚洲东南部为甘蔗亚族的分布中心和多样性中心,同时对甘蔗亚族起源作了推测。
关键词
甘蔗亚族
地理分布
禾本科
Keywords
Saccharinae
Geographical distribution
Gramineae
分类号
Q948 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
禾本科甘蔗亚族一新属
被引量:
5
3
作者
孙必兴
王松
机构
云南大学生物系
出处
《云南植物研究》
CSCD
1997年第3期239-240,共2页
文摘
80年代初期,我们在云南采到5号标本,解剖观察认为是甘蔗亚族(Saccharinae)植物。再进一步查对,要把它放入这个亚族中的任何一属均觉不妥。故另立新属与新种。本新属与芒属(Miscanthus)似有亲缘关系。
关键词
禾本科
甘蔗亚族
新属
Keywords
Saccharinae, Rubimons, R. paniculatus
分类号
Q949.714.2 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
中国甘蔗亚族几个容易混淆物种的订正
4
作者
刘艳春
机构
中国科学院上海辰山植物科学研究中心
中国科学院昆明植物研究所
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期734-739,744,共7页
基金
国家自然科学基金(31100147)
上海市绿化市容管理局攻关课题(F122414)
文摘
通过标本研究和野外考察发现:被鉴定为二色金茅和滇南金茅的国产标本实际均为四脉金茅,且二色金茅和滇南金茅在国内无分布,国内各植物志中该名称下的类群应归入四脉金茅。另发表一新组合E.quadrinervis var.latifolia(Rendle)Y.C.Liu&H.Peng.;国内各植物志和各大标本馆在描述和鉴定Microstegium ciliatum时,常与M.fasciculatum混淆,并在各种场合错误引证;在此澄清二者真正的区别。
关键词
甘蔗亚族
禾本科
分类
订正
新组合
Keywords
Saccharinae
Poaceae
taxonomy
revision
new combination
分类号
Q949.71 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
基于rDNA-ITS序列探讨甘蔗近缘属种的系统进化关系
被引量:
8
5
作者
刘新龙
苏火生
马丽
陆鑫
应雄美
蔡青
范源洪
机构
云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第11期1853-1863,共11页
基金
云南省应用基础研究计划重点项目(2006C0013Z)
国家科技基础条件平台工作项目子专题(2007DKA21002-11)资助
文摘
以狼尾草属(PennisetumRich.)的象草(P.purpureum)为外群体,依据rDNA-ITS序列探讨了甘蔗亚族(Saccharinae)内与甘蔗植物分类关系较近的8属37种120份材料的系统进化关系,结果表明,ITS1序列长度为200~208bp,变异位点91个,简约信息位点70个,GC含量为60.4%~69.1%;ITS2序列长度为215~220bp,变异位点93个,简约信息位点68个,GC含量为66.1%~73.4%;5.8sDNA序列长度为164bp,变异位点18个,简约信息位点9个,GC含量为54.1%~58.0%;根据变异位点,简约信息位点占总位点的比例可以看出,ITS序列比5.8sDNA序列变异程度高,其中ITS1序列又较ITS2序列变异丰富。属种间遗传距离表明芒属(Miscanthus)和荻属(Triarrhena)与甘蔗属(Saccharum)的亲缘关系最近,其次为蔗茅属(Erianthus)和河八王属(Narenga);而莠竹属(Microstegium)、大油芒属(Spodiopogon)、白茅属(Imperata)与甘蔗属亲缘关系较远。根据甘蔗近缘属种的NJ和MP系统发育关系,支持将斑茅(E.arundinaceus)归入蔗茅属,荻属归入芒属的观点;河八王属的河八王(N.porphyrocoma)与滇蔗茅(E.rockii)亲缘关系较近,而与同属的金猫尾(N.fallax)亲缘关系较远;蔗茅属和芒属属种系统进化关系较其他属种复杂;有4份材料被发现鉴定有误,不应用于后续研究。
关键词
甘蔗
ITS
系统进化
甘蔗亚族
Keywords
Sugarcane
ITS
Phylogeny
Saccharinae
分类号
S566.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
DNA提纯方法对6种甘蔗亚族植物RAPD的影响
范源洪
蔡青
宿兵
张亚平
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
1999
23
下载PDF
职称材料
2
甘蔗亚族的地理分布
于慧
赵南先
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
3
下载PDF
职称材料
3
禾本科甘蔗亚族一新属
孙必兴
王松
《云南植物研究》
CSCD
1997
5
下载PDF
职称材料
4
中国甘蔗亚族几个容易混淆物种的订正
刘艳春
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
下载PDF
职称材料
5
基于rDNA-ITS序列探讨甘蔗近缘属种的系统进化关系
刘新龙
苏火生
马丽
陆鑫
应雄美
蔡青
范源洪
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
8
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职称材料
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