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青藏高原特有植物甘青蒿的全长转录组分析
1
作者
余静雅
夏铭泽
张发起
《中国野生植物资源》
CSCD
2023年第12期17-24,共8页
为深入挖掘甘青蒿功能基因和补充蒿属植物基因资源,采用基于三代牛津纳米孔测序技术(ONT)对甘青蒿叶片进行全长转录组测序,利用生物信息学手段对其进行分析。结果得到了15.66 Gb数据,18634条非冗余全长转录本,并鉴定出4358条新转录本。...
为深入挖掘甘青蒿功能基因和补充蒿属植物基因资源,采用基于三代牛津纳米孔测序技术(ONT)对甘青蒿叶片进行全长转录组测序,利用生物信息学手段对其进行分析。结果得到了15.66 Gb数据,18634条非冗余全长转录本,并鉴定出4358条新转录本。通过与数据库比对,2184条新转录本及29154个转录因子得到注释。分析萜类化合物生物合成途径,发现9个候选基因,其中hdr、MCS和CTI12_AA199400基因可能是甘青蒿萜类化合物生物合成的关键基因;ctcad3、CTI12_AA295060基因和部分转录因子可能参与甘青蒿的非生物胁迫抗性。本研究可为甘青蒿功能基因挖掘和生物资源利用提供数据基础。
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关键词
甘青蒿
全长转录组
三代牛津纳米孔测序
功能注释
萜类化合物
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职称材料
甘青蒿中两个倍半萜内酯α-亚甲基γ-内酯圆二色谱的研究
被引量:
1
2
作者
严泽群
马万山
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第5期401-402,共2页
目的 研究甘青蒿的化学成分 ,并鉴定其构型。方法 用圆二色谱仪研究了 2个化合物的绝对构型。结果 从甘青蒿中分得 2个化合物 :4α-羟基愈创木型 - 2 ,10 (14) ,11(13) -三烯 - 12 ,6α-内酯 ( ) ,2β-羟基愈创木型 - 3,10(14) ,11(1...
目的 研究甘青蒿的化学成分 ,并鉴定其构型。方法 用圆二色谱仪研究了 2个化合物的绝对构型。结果 从甘青蒿中分得 2个化合物 :4α-羟基愈创木型 - 2 ,10 (14) ,11(13) -三烯 - 12 ,6α-内酯 ( ) ,2β-羟基愈创木型 - 3,10(14) ,11(13) -三烯 - 12 ,6 α-内酯 ( )。结论 化合物 和 均是在 6位以反式稠合方式使 C环与
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关键词
甘青蒿
倍半萜内酯
圆二色谱
Cotton效应
α-亚甲基γ-内酯
中药
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职称材料
题名
青藏高原特有植物甘青蒿的全长转录组分析
1
作者
余静雅
夏铭泽
张发起
机构
中国科学院西北高原生物研究所高原生物适应与进化重点实验室
中国科学院大学生命科学学院
出处
《中国野生植物资源》
CSCD
2023年第12期17-24,共8页
基金
青海省基础研究计划项目(2019-ZJ-7042)。
文摘
为深入挖掘甘青蒿功能基因和补充蒿属植物基因资源,采用基于三代牛津纳米孔测序技术(ONT)对甘青蒿叶片进行全长转录组测序,利用生物信息学手段对其进行分析。结果得到了15.66 Gb数据,18634条非冗余全长转录本,并鉴定出4358条新转录本。通过与数据库比对,2184条新转录本及29154个转录因子得到注释。分析萜类化合物生物合成途径,发现9个候选基因,其中hdr、MCS和CTI12_AA199400基因可能是甘青蒿萜类化合物生物合成的关键基因;ctcad3、CTI12_AA295060基因和部分转录因子可能参与甘青蒿的非生物胁迫抗性。本研究可为甘青蒿功能基因挖掘和生物资源利用提供数据基础。
关键词
甘青蒿
全长转录组
三代牛津纳米孔测序
功能注释
萜类化合物
Keywords
Artemisia tangutica
Full-length transcriptome
ONT
Function annotation
Terpenoid
分类号
Q949 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
甘青蒿中两个倍半萜内酯α-亚甲基γ-内酯圆二色谱的研究
被引量:
1
2
作者
严泽群
马万山
机构
河南省信阳师范学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第5期401-402,共2页
文摘
目的 研究甘青蒿的化学成分 ,并鉴定其构型。方法 用圆二色谱仪研究了 2个化合物的绝对构型。结果 从甘青蒿中分得 2个化合物 :4α-羟基愈创木型 - 2 ,10 (14) ,11(13) -三烯 - 12 ,6α-内酯 ( ) ,2β-羟基愈创木型 - 3,10(14) ,11(13) -三烯 - 12 ,6 α-内酯 ( )。结论 化合物 和 均是在 6位以反式稠合方式使 C环与
关键词
甘青蒿
倍半萜内酯
圆二色谱
Cotton效应
α-亚甲基γ-内酯
中药
Keywords
Artemisia tangutica Pamp
sesquiterpene lactones
circular dichroism spectrum (CD spectrum)
Cotton effect
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
青藏高原特有植物甘青蒿的全长转录组分析
余静雅
夏铭泽
张发起
《中国野生植物资源》
CSCD
2023
0
下载PDF
职称材料
2
甘青蒿中两个倍半萜内酯α-亚甲基γ-内酯圆二色谱的研究
严泽群
马万山
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2001
1
下载PDF
职称材料
已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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