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几种常用生物分析软件的特点及其使用简介 被引量:4
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作者 韦荣编 邱高峰 张源 《生物技术通报》 CAS CSCD 2003年第3期30-34,共5页
基于代表性、实用性的原则选择了RAPDistance ,PHYLIP ,MEGA ,TREECON ,AMOVA ,DIPLO MO和MAPMAKER等 7种系统发育及遗传图谱构建方面的免费共享生物分析软件 ,简要介绍了它们各自的特点、功能、使用及获得的方法。以期这些软件对于从... 基于代表性、实用性的原则选择了RAPDistance ,PHYLIP ,MEGA ,TREECON ,AMOVA ,DIPLO MO和MAPMAKER等 7种系统发育及遗传图谱构建方面的免费共享生物分析软件 ,简要介绍了它们各自的特点、功能、使用及获得的方法。以期这些软件对于从事生物技术研究的人员具有一定的指导性 ,可操作性。 展开更多
关键词 生物分析软件 特点 使用简介 系统发育 遗传图谱构建 生物信息学
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基于Cytoscape等生物信息学分析软件预测荜茇明碱抗肿瘤靶基因 被引量:6
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作者 滕文静 李洪霖 李雁 《广州中医药大学学报》 CAS 2017年第5期785-789,共5页
荜茇明碱是从胡椒科植物中分离出的天然生物碱(酰胺类),具有多种药理作用。通过收集总结近20年来有关荜茇明碱的研究文献,总结其作用靶点,将明确的作用靶点提交到Cytoscape、Bingo等生物信息学分析软件中进行下一步文本挖掘,以预测其可... 荜茇明碱是从胡椒科植物中分离出的天然生物碱(酰胺类),具有多种药理作用。通过收集总结近20年来有关荜茇明碱的研究文献,总结其作用靶点,将明确的作用靶点提交到Cytoscape、Bingo等生物信息学分析软件中进行下一步文本挖掘,以预测其可能的生物学功能及相关靶基因。分析结果显示荜茇明碱对多种实体肿瘤及血液病均具有抑制作用,其作用机制主要包括血管生成转移、活性氧簇(ROS)、DNA损伤、诱导细胞凋亡、阻止细胞周期、逆转肿瘤细胞耐药6个方面。通过采用Cytoscape、Bingo等软件进行深入文献挖掘后发现,其抗肿瘤潜能主要涉及78个基因,包含4个主要的分子模块,其潜在靶基因指向可能与核酸变化以及细胞压力处理过程有关。以上分析结果将为荜茇明碱抗肿瘤作用的进一步研究提供新的研究方向。 展开更多
关键词 荜茇明碱 抗肿瘤 靶基因预测 细胞凋亡 生物信息学分析软件
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利用SSR标记分析东北野生菰遗传多样性和遗传结构 被引量:6
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作者 苏晓娜 王惠梅 +7 位作者 黄雪雯 谢小燕 张孝天 牛恋 董琳 江绍琳 吴建利 江绍玫 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期579-589,共11页
菰属(Zizania Trucz.)为水稻的近缘属,保留了大量驯化作物所丢失的优异性状,是扩大和丰富育种基因库的理想材料。从24对菰SSR分子标记中筛选出7对标记,对来自东北三省的5个居群,共计98个野生菰样本进行了遗传多样性和遗传结构分析。同时... 菰属(Zizania Trucz.)为水稻的近缘属,保留了大量驯化作物所丢失的优异性状,是扩大和丰富育种基因库的理想材料。从24对菰SSR分子标记中筛选出7对标记,对来自东北三省的5个居群,共计98个野生菰样本进行了遗传多样性和遗传结构分析。同时,详细阐述了POPGENE、STRUCTURE、ARLEQUIN、MEGA及MVSP等统计分析软件的数据录入格式、软件操作方法,为相关领域的研究者提供完整可操作的参考依据。各软件分析结果表明:东北地区野生菰具有较为丰富的遗传多样性(PPB=71.88%、Ao=1.719、Ae=1.332、He=0.201、I=0.313,Gst=0.543);各野生菰居群间的遗传相似性系数和遗传距离分别介于0.605 5~0.955 6和0.045 4~0.501 6;东北地区野生菰的遗传变异主要存在于居群间;5个野生菰居群的遗传结构可以大致分为3组,5个居群不存在明显的亲缘地理关系。该研究结果不仅有助于加深对我国东北地区野生菰资源遗传多样性和遗传结构的认识,同时也为东北野生菰种质资源保护提供一定理论依据。 展开更多
关键词 野生菰 SSR标记 生物统计分析软件 遗传多样性 遗传结构
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An innovative trigeneration system using biogas as renewable energy 被引量:1
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作者 Grazia Leonzio 《Chinese Journal of Chemical Engineering》 SCIE EI CAS CSCD 2018年第5期1179-1191,共13页
One of the ways to decrease the global primary energy consumption and the corresponding greenhouse gas emissions is the application of the combined cooling, heating and power generation technologies, known as trigener... One of the ways to decrease the global primary energy consumption and the corresponding greenhouse gas emissions is the application of the combined cooling, heating and power generation technologies, known as trigeneration system. In this research an innovative trigeneration system, composed by an absorption heat pump, a mechanical compression heat pump, a steam plant, and a heat recovery plant is developed. The low tem- perature heat produced by absorption chiller is sent to a mechanical compression heat pump, that receives pro- cess water at low temperature from the heat recovery plant and bring it to higher temperatures. The trigeneration system is fed by biogas, a renewable energy. A design and a simulation of the system are developed by ChemCad 6.3 software. The plant produces 925 kW of electrical energy, 2523 kW of thermal energy and 473 kW of cooling energy, by the combustion of 3280 kW of biogas. Primary energy rate (P.E.R.) is equal 1.04 and a sensitivity analysis is carried out to evaluate the effect of cooling capacity, produced electrical energy and process water temperature. The first has a negative effect, while other parameters have a positive effect on P.E.R. Compared to a cogeneration system, the tdgeneration plant produces the 28% higher of power and the 40% lower of carbon dioxide emissions. An economic analysis shows that the plant is economically feasible only consid- ering economic incentives obtained by the use of heat pumps and steam plant at high efficiency. Saving 6431 t.a-1 corresponding to 658000 EUR.a-1 of incentives, the plant has a net present value (N.P.V.) and a pay back period (P.B.P.) respectively equal to 371000 EUR and 4 year. Future works should optimize the process considering cost and energetic efficiency as the two objective functions. 展开更多
关键词 Trigeneration system BIOGAS Energy efficiency Process simulation Heat pumps Environmental analysis
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