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进化与大数据导向生物信息学在天然产物研究中的发展及应用 被引量:2
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作者 张凡忠 相长君 张骊駻 《合成生物学》 CSCD 2023年第4期629-650,共22页
自然界亿万年的进化孕育出了丰富的天然产物资源,进而为药物研发提供了巨大的分子宝库。进化导向生物信息学方法在微生物天然产物研究中发挥着越来越重要的作用。微生物基因组数据的快速增长为生物合成基因簇的大数据分析以及进化分析... 自然界亿万年的进化孕育出了丰富的天然产物资源,进而为药物研发提供了巨大的分子宝库。进化导向生物信息学方法在微生物天然产物研究中发挥着越来越重要的作用。微生物基因组数据的快速增长为生物合成基因簇的大数据分析以及进化分析提供了新机遇,不仅让我们对天然产物全景图有了更清晰的认识,还能够揭示天然产物的进化规律,利用进化分析方法和大数据资源挖掘新型的药物先导天然产物,理解生物合成酶,甚至设计改造生物合成体系创造非天然分子。本文综述了近年来进化和大数据导向生物信息学应用于天然产物研究中的相关进展,强调了进化与大数据在生物合成酶的功能预测、进化机理、基因挖掘以及生物合成改造方面的应用,最后分析了目前面临的问题并对未来发展趋势进行了展望。 展开更多
关键词 天然产物 进化 基因挖掘 生物合成改造 生物信息学
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Enzyme engineering in microbial biosynthesis of terpenoids:progress and perspectives
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作者 Amna Bibi SU Liqiu +1 位作者 DAI Zongjie WANG Qinhong 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期2473-2488,共16页
Terpenoids,known for their structural and functional diversity,are highly valued,especially in food,cosmetics,and cleaning products.Microbial biosynthesis has emerged as a sustainable and environmentally friendly appr... Terpenoids,known for their structural and functional diversity,are highly valued,especially in food,cosmetics,and cleaning products.Microbial biosynthesis has emerged as a sustainable and environmentally friendly approach for the production of terpenoids.However,the natural enzymes involved in the synthesis of terpenoids have problems such as low activity,poor specificity,and insufficient stability,which limit the biosynthesis efficiency.Enzyme engineering plays a pivotal role in the microbial synthesis of terpenoids.By modifying the structures and functions of key enzymes,researchers have significantly improved the catalytic activity,specificity,and stability of enzymes related to terpenoid synthesis,providing strong support for the sustainable production of terpenoids.This article reviews the strategies for the modification of key enzymes in microbial synthesis of terpenoids,including improving enzyme activity and stability,changing specificity,and promoting mass transfer through multi-enzyme collaboration.Additionally,this article looks forward to the challenges and development directions of enzyme engineering in the microbial synthesis of terpenoids. 展开更多
关键词 TERPENOIDS microbial synthesis enzyme engineering enzyme modification terpene synthases
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