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二倍体和四倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达及其与DNA甲基化的相关性
被引量:
2
1
作者
张曼曼
高泽霞
+3 位作者
冯兵
罗双双
曹文怡
周小云
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期9-16,共8页
为探讨胰岛素样生长因子结合蛋白-1(IGFBP-1)基因在二倍体和四倍体泥鳅之间的表达差异及其与DNA甲基化的相关性,克隆二倍体、四倍体泥鳅的CDS序列和启动子序列,并分别采用qRT-PCR和亚硫酸氢盐测序技术(BSP)分析IGFBP-1在二倍体、四倍体...
为探讨胰岛素样生长因子结合蛋白-1(IGFBP-1)基因在二倍体和四倍体泥鳅之间的表达差异及其与DNA甲基化的相关性,克隆二倍体、四倍体泥鳅的CDS序列和启动子序列,并分别采用qRT-PCR和亚硫酸氢盐测序技术(BSP)分析IGFBP-1在二倍体、四倍体泥鳅中的表达水平及启动子区和第一外显子区的甲基化水平。结果显示,泥鳅的IGFBP-1基因CDS序列长789bp,编码262个氨基酸,二倍体、四倍体泥鳅间有5bp的差异,但氨基酸序列完全相同。在二倍体、四倍体中分别克隆得到2341bp和2331bp的启动子序列,倍性间的序列相似度达99%,启动子序列中包含典型元件TATA-box,以及SP1、CREB、C/EBP、POU2F2、GATA-2/3/4和SRY等转录因子结合位点。泥鳅的IGFBP-1基因主要在肝脏中表达,且四倍体泥鳅肝脏中IGFBP-1的表达水平显著高于二倍体(P<0.01)。四倍体泥鳅IGFBP-1基因启动子及第一外显子区的甲基化水平均比二倍体低,其中四倍体肝脏中的甲基化水平显著低于二倍体(P<0.01)。综合分析研究结果表明,在IGFBP-1基因主要表达的肝脏组织中,其mRNA表达水平与DNA甲基化水平呈负相关,启动子区较高的甲基化可能抑制了二倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达。
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关键词
泥鳅
二
倍
体
四
倍
体
IGFBP-1
DNA甲基
化
生物多倍化
多倍
体鱼类
表型变异
基因表达变异
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职称材料
题名
二倍体和四倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达及其与DNA甲基化的相关性
被引量:
2
1
作者
张曼曼
高泽霞
冯兵
罗双双
曹文怡
周小云
机构
华中农业大学水产学院/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期9-16,共8页
基金
国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项(2018YFD0900205)
文摘
为探讨胰岛素样生长因子结合蛋白-1(IGFBP-1)基因在二倍体和四倍体泥鳅之间的表达差异及其与DNA甲基化的相关性,克隆二倍体、四倍体泥鳅的CDS序列和启动子序列,并分别采用qRT-PCR和亚硫酸氢盐测序技术(BSP)分析IGFBP-1在二倍体、四倍体泥鳅中的表达水平及启动子区和第一外显子区的甲基化水平。结果显示,泥鳅的IGFBP-1基因CDS序列长789bp,编码262个氨基酸,二倍体、四倍体泥鳅间有5bp的差异,但氨基酸序列完全相同。在二倍体、四倍体中分别克隆得到2341bp和2331bp的启动子序列,倍性间的序列相似度达99%,启动子序列中包含典型元件TATA-box,以及SP1、CREB、C/EBP、POU2F2、GATA-2/3/4和SRY等转录因子结合位点。泥鳅的IGFBP-1基因主要在肝脏中表达,且四倍体泥鳅肝脏中IGFBP-1的表达水平显著高于二倍体(P<0.01)。四倍体泥鳅IGFBP-1基因启动子及第一外显子区的甲基化水平均比二倍体低,其中四倍体肝脏中的甲基化水平显著低于二倍体(P<0.01)。综合分析研究结果表明,在IGFBP-1基因主要表达的肝脏组织中,其mRNA表达水平与DNA甲基化水平呈负相关,启动子区较高的甲基化可能抑制了二倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达。
关键词
泥鳅
二
倍
体
四
倍
体
IGFBP-1
DNA甲基
化
生物多倍化
多倍
体鱼类
表型变异
基因表达变异
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
diploid
tetraploid
insulin-like growth factors binding protein-1( IGFBP-1)
DNA methylation
biopolyploid
polyploid fish
phenotypic variation
gene expression variation
分类号
Q959.468 [生物学—动物学]
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作者
出处
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1
二倍体和四倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达及其与DNA甲基化的相关性
张曼曼
高泽霞
冯兵
罗双双
曹文怡
周小云
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
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