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分子生物学软件在动物医学研究中的应用 被引量:2
1
作者 董长贵 何桂梅 董长宝 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2006年第12期68-70,共3页
关键词 分子生物学软件 动物医学 应用软件 WINDOWS操作系统 科研工作者 计算机语言 研究人员 基础学科
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生物学软件在线粒体DNA序列多态性分析中的应用 被引量:4
2
作者 李彬彬 黄培春 钟复光 《生物信息学》 2010年第2期153-155,共3页
对线粒体DNA(mtDNA)序列进行多态性分析,将有利于从母系遗传的角度研究各人群的源流、迁移以及亲缘关系等情况。探讨利用Internet共享生物学软件对各种生物样本mtDNA高变区进行序列比对分析及多态性分析,结果显示DNAstar、ClustalX、Dn... 对线粒体DNA(mtDNA)序列进行多态性分析,将有利于从母系遗传的角度研究各人群的源流、迁移以及亲缘关系等情况。探讨利用Internet共享生物学软件对各种生物样本mtDNA高变区进行序列比对分析及多态性分析,结果显示DNAstar、ClustalX、DnaSP以及Mega等软件操作简便、易于判读、结果准确可靠,可广泛应用于人类学、系统发育学以及法医鉴定等领域的研究。 展开更多
关键词 生物学软件 线粒体DNA 多态性
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食管癌DNA聚合酶β基因突变研究中分子生物学软件的应用
3
作者 刘栋 赵国强 +4 位作者 赵勤 杨洪艳 金戈 赵继敏 董子明 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2003年第4期488-490,共3页
目的 :尝试应用分子生物学软件研究DNA聚合酶 β基因突变后 ,其编码蛋白、酶结构功能的改变。 方法 :应用DNASIS、OMIGA、SWISS PORT等分子生物学软件对前期实验中检测到的DNA聚合酶 β基因的某些突变进行推测、评价。结果 :核酸一级结... 目的 :尝试应用分子生物学软件研究DNA聚合酶 β基因突变后 ,其编码蛋白、酶结构功能的改变。 方法 :应用DNASIS、OMIGA、SWISS PORT等分子生物学软件对前期实验中检测到的DNA聚合酶 β基因的某些突变进行推测、评价。结果 :核酸一级结构的改变直接导致了相应蛋白一级结构、空间结构的改变。结论 :可利用计算机模拟蛋白质空间结构进而推测其功能 ,但对被研究对象功能。 展开更多
关键词 食管癌 DNA聚合酶Β 基因突变 分子生物学软件 应用
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基于Linux系统生物学软件应用环境的构建
4
作者 于向鸿 王佳 《农业网络信息》 2010年第12期37-39,共3页
生物学软件是生物科学研究当中不可缺少的应用工具,很多种生物学软件都运行在开放的Linux操作系统上,AndLinux是一个基于Windows的Ubuntu Linux系统。介绍了AndLinux的安装和使用,以及Linux系统下一些常用的生物学软件包。
关键词 AndLinux 操作系统 生物学软件
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生物学分析软件MVSP的介绍与使用 被引量:3
5
作者 姚榕 方彦 《湖北农业科学》 北大核心 2012年第11期2357-2360,共4页
MVSP是一款简单易学的统计分析软件,具有计算准确、操作方便等优点,目前已被应用在多个领域中。通过实例介绍了应用该软件进行主成分分析、聚类分析和多样性指数计算等生物学上常用分析的操作方法。
关键词 生物学软件 MVSP 使用
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一款基于Linux系统的分子生物学实验设计软件的实现
6
作者 甘泉 刘曼西 《计算机与数字工程》 2007年第8期149-150,共2页
利用C语言编写一个基于Linux的分子生物学实验设计软件。该软件具有友好的可视化界面,操作简易,通过直观的图形和文字显示整个实验的过程。同时,也详细描述该软件的实现思路和办法。
关键词 分子生物学软件 实验设计 LINUX
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计算机科学在分子生物学中的应用 被引量:3
7
作者 严明 李越 尹光琳 《现代科学仪器》 2000年第4期15-17,共3页
计算机科学的发展给分子生物学的研究提供了很大的便利。本文介绍了计算机在生物学实验的各个阶段中的应用。
关键词 生物学软件 生物学站点 分子生物学 计算机科学
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mtDNA测序结果与Anderson标准序列的比对——ClustalX等共享软件在法医物证学上的应用 被引量:1
8
作者 李莉 林源 +2 位作者 柳燕 曾而良 李成涛 《中国司法鉴定》 2003年第1期27-31,共5页
目的 对多个样本的线粒体DNA(mtDNA)高变区测序结果与Anderson标准序列进行比对分析。方法 利用ABI测序仪测定生物学样本的mtDNA高变区序列,得到测序结果文件,通过Chromas、 SeqVerter软件将之转换为aln文件,用ClustalX软件与Anderson... 目的 对多个样本的线粒体DNA(mtDNA)高变区测序结果与Anderson标准序列进行比对分析。方法 利用ABI测序仪测定生物学样本的mtDNA高变区序列,得到测序结果文件,通过Chromas、 SeqVerter软件将之转换为aln文件,用ClustalX软件与Anderson标准序列(txt文件)进行比对,确定突变点的碱基排列次序和位置。结果Chromas、SeqVerter和ClustalX软件界面友好,操作简便,可以方便地用于多个样本DNA序列的比较,结果直观,易于判读。结论 运用Chromas、SeqVerter和ClustalX等共享软件,可成功地对多个样本的mtDNA高变区序列进行比对分析。 展开更多
关键词 mtDNA测序结果 Anderson标准序列 法医学 生物学软件 Chromas SeqVerter ClustalX
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网络环境中生物科研信息资源的利用 被引量:3
9
作者 代宁 陈龙 《现代图书情报技术》 CSSCI 北大核心 2002年第2期50-52,55,共4页
充分利用好网络生物科研信息资源是当代生物学研究者的必备素质。本文就如何充分利用计算机网络这一强有力的工具 ,通过 Internet搜索引擎、生物学数据库、生物学工具软件和生物学信息组等以最方便的方式、最快捷的手段获取到所需要的... 充分利用好网络生物科研信息资源是当代生物学研究者的必备素质。本文就如何充分利用计算机网络这一强有力的工具 ,通过 Internet搜索引擎、生物学数据库、生物学工具软件和生物学信息组等以最方便的方式、最快捷的手段获取到所需要的生物科研信息资源的优点和技巧作了简要的介绍和讨论。 展开更多
关键词 网络信息资源 生物信息资源 搜索引擎 生物学数据库 生物学工具软件
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日本血吸虫谷胱甘肽硫转移酶原核表达载体的构建及序列分析 被引量:1
10
作者 方桂杰 乔宪凤 《江西农业学报》 CAS 2010年第11期8-10,14,共4页
为构建带有组氨酸标签(his-tag)的日本血吸虫谷胱甘肽硫转移酶(sjGST)表达载体。以载有sjGST基因的载体PGEX-KG为模板,PCR扩增sjGST基因,并在进行酶切和基因测序后将其克隆到pET28a载体上。运用生物学软件与具有代表性的血吸虫GST基因... 为构建带有组氨酸标签(his-tag)的日本血吸虫谷胱甘肽硫转移酶(sjGST)表达载体。以载有sjGST基因的载体PGEX-KG为模板,PCR扩增sjGST基因,并在进行酶切和基因测序后将其克隆到pET28a载体上。运用生物学软件与具有代表性的血吸虫GST基因进行比对并对可能的表达产物进行分析。结果表明,PCR产物与3种sjGST基因有99%的同源性。重组载体构建成功。 展开更多
关键词 日本血吸虫 谷胱甘肽硫转移酶 原核 表达载体的构建 序列分析 SCHISTOSOMA JAPONICUM Sequence Analysis 基因测序 重组载体构建 组氨酸标签 生物学软件 表达产物 PCR产物 HIS-TAG GST基因 同源性 代表性 pET28a 模板 酶切
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副猪嗜血杆菌tbpB基因的PCR-RFLP分型
11
作者 李淑芳 龚玉梅 +3 位作者 侯娜 赵成全 赵兴绪 张培君 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第7期56-61,共6页
本研究应用生物学软件Vector NTI对副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,Hps)的转铁结合蛋白tbpB进行基因分型研究,通过选择AluⅠ、AvaⅡ和RsaⅠ3种限制性内切酶对15株Hps标准株和12株分离株的tbpB基因进行RFLP分析。经过生物学软件Vecto... 本研究应用生物学软件Vector NTI对副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,Hps)的转铁结合蛋白tbpB进行基因分型研究,通过选择AluⅠ、AvaⅡ和RsaⅠ3种限制性内切酶对15株Hps标准株和12株分离株的tbpB基因进行RFLP分析。经过生物学软件Vector NTI精确分型,标准株得到了11个基因型,其中基因型Ⅰ(AAA)包括血清型1、3和15,Ⅱ(BBB)包括血清型2、9和11;分离株的分型产生了10种基因型,其中6种为新的基因型。这一结果证实了Hps流行株的多样性,说明该方法对于猪革拉泽氏病流行病学规律的研究具有实用意义,同时,需要对更多的分离株做进一步的研究。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 tbpB基因 PCR—RFLP 生物学软件Vector NTI
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DNA查找和分析程序SeqFinder的设计与开发
12
作者 杨发青 谢超 钱令嘉 《医学情报工作》 2002年第1期17-17,25,共2页
DNA查找和分析程序SeqFinder是用Borland C++Builder开发的Win32中文程序,具有DNA序列查找、氨基酸序列推导、cDNA互补序列转换等功能,笔者对其功能和实现进行阐述。
关键词 分子生物学软件 BORLANDC++BUILDER DNA序列查找 氨基酸序列推导 SeqFinder
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限制性酶切位点查找程序ResFinder的设计与开发
13
作者 杨发青 钱令嘉 《医学信息(医学与计算机应用)》 2001年第11期735-736,共2页
限制性酶切位点查找程序 Rse Finder是用 Borland C++Bulider开发的 Win32中文程序 ,其可自动快速查找出已知DNA序列中 10 0种以上的限制性酶切点 ,标明其在序列中的位置 ,为相关分子生物学研究提供方便。本文对其功能和实现进行阐述。
关键词 限制性酶切位点 分子生物学软件 BORLAND C++ BUILDER 设计 开发
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Visual BASIC编程在核酸序列分析中的应用研究初探 被引量:1
14
作者 葛威 鲍大鹏 +1 位作者 董战峰 施铮 《生物信息学》 2004年第4期42-46,共5页
利用可视化的编程语言VisualBASIC编写了一个简易实用的核酸序列分析程序 ,能够自动实现对已知核酸序列的分子质量、Tm值、碱基组成的测定、各种核酸序列的转换和氨基酸序列的推导。同时也详细描述了核酸序列自动分析各功能实现的Visual... 利用可视化的编程语言VisualBASIC编写了一个简易实用的核酸序列分析程序 ,能够自动实现对已知核酸序列的分子质量、Tm值、碱基组成的测定、各种核酸序列的转换和氨基酸序列的推导。同时也详细描述了核酸序列自动分析各功能实现的VisualBASIC语言编程过程。 展开更多
关键词 分子生物学软件 VISUAL BASIC编程 核酸序列分析
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ABO亚型Bw分子机制与临床输血研究 被引量:1
15
作者 邓刚 黄丹丹 +4 位作者 郭雯玉 许德义 杜勇 马幼丽 张哲 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第S1期138-138,共1页
目的研究ABO血型系统中Bw亚型的分子机制,并探讨Bw亚型在临床输血中的相关问题。方法我们对1位ABO血型正反定型不符的无偿献血者及其家人的血型,通过应用血清学鉴定,PCR-SSP,ABO基因直接测序及TA克隆进行单倍体分析等方法对该家系的血... 目的研究ABO血型系统中Bw亚型的分子机制,并探讨Bw亚型在临床输血中的相关问题。方法我们对1位ABO血型正反定型不符的无偿献血者及其家人的血型,通过应用血清学鉴定,PCR-SSP,ABO基因直接测序及TA克隆进行单倍体分析等方法对该家系的血型分子机制进行了相关研究,应用相关生物学软件对该突变位点引起的酶结构和功能的变化进行了分析,对该突变氨基酸在不同物种中的保守性进行了比较。同时对该献血者以往3次所献的血用到临床的输血情况进行了回顾性调查。结果我们在该家系中发现了3例比较少见的Bw亚型, 展开更多
关键词 ABO 输血研究 输血情况 正反定型 血清学鉴定 血型系统 直接测序 生物学软件 酶结构 保守性
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Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitope of GH Protein from Acipenser sinensis 被引量:3
16
作者 刘红艳 杨东 +1 位作者 张繁荣 余来宁 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第2期46-48,58,共4页
[ Objective] The aim was to predict the secondary structure and B cell epitope of growth hormone (GH) protein from Acipenser sinensis. [Method] With the amino acid sequence of GH protein from A. sinensis as the base... [ Objective] The aim was to predict the secondary structure and B cell epitope of growth hormone (GH) protein from Acipenser sinensis. [Method] With the amino acid sequence of GH protein from A. sinensis as the base, the secondary structure of GH protein from A. sinensis was predicted by the method of Gamier-Robson, Chou-Fasman and Karpius-Schulz, and its cell epitope was predicted by the method of Kyte- Doolittle, Emini and Jameson-Wolf. [Result] The sections of 18 -23, 55 -55, 67 -73, 83 -86,112 -114,151 -157 and 209 -211 in the N terminal of GH protein molecule had softer structure and these sections could sway or fold to produce more complex tertiary structure. The sections of 19 -23, 51 -71,84 -95, 128 -139, 164 -176 and 189 -195 in the N terminal of GH protein could be the epitope of B cell and there were flexible regions in these sections or near these sections of GH protein molecule. So the dominant regions could be in these sections or near these sections. [ Conclusion] The research provided the basis for the preparation of monoctonal antibody of GH protein from A. sinensis and provided the reference for the discussion for the molecular regulation mechanism of A. sinensis. 展开更多
关键词 Acipenser sinensis GH protein Secondary structure Cell epitope
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EMBOSS和EMBnet 被引量:3
17
作者 罗静初 《生物信息学》 2021年第4期223-231,共9页
笔者撰写的“EMBOSS软件包序列分析程序实例”一文,已经在《生物信息学》期刊2021年第19卷第1期发表。此文介绍欧洲分子生物学开放软件包(European Molecular Biology Open Software Suite,EMBOSS)。EMBOSS是欧洲分子生物学网络组织(Eur... 笔者撰写的“EMBOSS软件包序列分析程序实例”一文,已经在《生物信息学》期刊2021年第19卷第1期发表。此文介绍欧洲分子生物学开放软件包(European Molecular Biology Open Software Suite,EMBOSS)。EMBOSS是欧洲分子生物学网络组织(European Molecular Biology Network,EMBnet)于上世纪九十年代末启动的以欧洲国家为主的国际合作项目,是生物信息学领域中较早投入使用的大型开源软件包。本文基于笔者亲身经历,回顾EMBOSS项目的来龙去脉,讲述EMBnet三十多年来的发展历程,及其对生物信息开发、服务和教育培训等方面的贡献,从某个侧面为读者特别是年轻读者展示生物信息学发展早期的一段历史。 展开更多
关键词 生物信息学 生物信息学软件 欧洲分子生物学开放软件包EMBOSS 欧洲分子生物学网络组织EMBnet
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科技人才招聘
18
《科技导报》 CAS CSCD 2008年第20期113-116,共4页
华中科技大学华中科技大学船舶与海洋工程学院面向海内外诚聘优秀人才。
关键词 电子信箱 岗位 电子邮件 电子函件 应聘者 人才招聘 学位 个人简历 生物学软件
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科学出版社生命科学编辑部新书推介
19
《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期28-28,共1页
生物信息学方法指南 S.米塞诺,S.A.克拉维茨著欧阳红生等译 2005年3月出版7-03-014465-1/Q.1498定价:58.00 计算机在管理生物学日益增长的海量数据方面起到了不可估量的作用,并推进了现代生物学的快速发展。本书详细 介绍了一些重要生... 生物信息学方法指南 S.米塞诺,S.A.克拉维茨著欧阳红生等译 2005年3月出版7-03-014465-1/Q.1498定价:58.00 计算机在管理生物学日益增长的海量数据方面起到了不可估量的作用,并推进了现代生物学的快速发展。本书详细 介绍了一些重要生物学软件和数据库的使用,同时提供了一些实用的技巧和最新研究进展。全书分为五部分,包括序列分 析软件包、分子生物学软件、网络信息资源、计算机和分子生物学的关系、生物信息学教学与最新文献跟踪。内容全面,实用 性较强,可帮助生物信息学人员对该学科有更深入地了解。本书可作为大专院校、科研机构的分子生物学、生物信息学等 相关专业的研究生、科研和教学人员的参考书。 展开更多
关键词 分子生物学软件 编辑部 新书推介 出版社 文化机构 DNA 分子生物学实验 生物信息学
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Cryo-electron microscopy for structural biology:current status and future perspectives 被引量:3
20
作者 WANG HongWei 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2015年第8期750-756,共7页
Recently, significant technical breakthroughs in both hardware equipment and software algorithms have enabled cryo-electron microscopy(cryo-EM) to become one of the most important techniques in biological structural a... Recently, significant technical breakthroughs in both hardware equipment and software algorithms have enabled cryo-electron microscopy(cryo-EM) to become one of the most important techniques in biological structural analysis. The technical aspects of cryo-EM define its unique advantages and the direction of development. As a rapidly emerging field, cryo-EM has benefitted from highly interdisciplinary research efforts. Here we review the current status of cryo-EM in the context of structural biology and discuss the technical challenges. It may eventually merge structural and cell biology at multiple scales. 展开更多
关键词 cryo-electron microscopy structural biology cell biology three-dimensional reconstruction
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