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题名边际核函数在生物序列分类中的应用
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作者
黄正华
王士同
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机构
江南大学信息学院
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出处
《计算机应用与软件》
CSCD
北大核心
2008年第5期161-162,198,共3页
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文摘
在核方法的基础上,介绍了一种自潜变量生成模型构造核函数的新方法;并专门探讨了结合生物序列的自身特点,按照该方法提取了几个边际核函数;随后将它们应用于具体的gyrB(旋转酶B亚单位)氨基酸序列分类实验中,实验结果表明边际核具有良好的识别效果及极佳的推广能力,也肯定了此种核构造方法的先进性。
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关键词
核设计
边际核
Fisher核
生物序列分类
隐马尔可夫模型
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Keywords
Kernel design Marginalized kernels Fisher kernel Biological sequences classification HMM
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分类号
TP311.12
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
Q959.4
[生物学—动物学]
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题名基于距离量度的边际核设计及应用
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作者
黄正华
王士同
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机构
江南大学信息学院
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出处
《计算机工程与设计》
CSCD
北大核心
2007年第14期3501-3503,3507,共4页
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文摘
很多情况下,研究者掌握了一些分类数据的生成信息,这些信息能够为核函数提供有价值的分类特征。已有大量结合生成模型构造核函数的研究,边际核是其中较新的研究成果。以边际核理论为基础,在边际核特征空间中引入特征向量之间的距离作为相似性的量度,构造了基于距离量度的边际核函数。随后将它和原边际核均应用于具体的(旋转酶B亚单位)氨基酸序列分类实验中,实验结果表明:基于距离量度的边际核拥有比原边际核更佳的识别效率,且也具备一定的推广能力。
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关键词
核设计
边际核
核特征空间
生物序列分类
隐马尔可夫模型
欧氏距离
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Keywords
kernel design
marginalized kernels
kernel space
biological sequence classification
HMM
euclidean distance
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分类号
TP181
[自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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