生物序列集成式分析平台的研制及其应用

应用生物信息学基础理论 ,以信息技术为手段 ,开发了方便高效的生物序列分析平台。该系统可进行核酸及蛋白质序列统计、性质分析、PCR引物设计、联配及同源性分析等。使用该系统设计PCR引物 ,克隆了灰葡萄孢霉菌 3-羟 - 3-甲基戊二酰辅酶A还原酶序列片段 ,并进行同源性分析 ,表明该系统操作简便、分析结果可靠。

马铃薯生物信息研究平台序列分析模块的开发与应用

研究开发了马铃薯生物信息研究平台的子系统——马铃薯生物信息序列分析模块。该模块采用MATLAB7.0与C#混合编程的方案实现,即将编写的.m文件用combuilder做成COM组件,然后在C#中调用COM组件实现该功能模块。主要介绍了马铃薯生物信息研究平台序列分析模块的实现与应用,包括统计密码子、画出碱基分布密度图、查找序列ORF、相似序列搜索等。实验表明,该功能模块同目前已有的相关软件相比,使用更方便,能获得更好的分析结果。

截形苜蓿生物数据分析平台的构建与应用

为更有效地利用截形苜蓿(M.truncatula)的表达序列标签和其他公共数据,加快对截形苜蓿功能基因的研究步伐,构建了“M.trunca tula Home”生物数据分析平台,并以此为中心,整合了专门为截形苜蓿定制的电子克隆系统。该数据分析平台具有序列基本信息查询、电子克隆系统、试验一致性序列动态分类查询的功能。进一步利用“M.truncatula Home”生物数据分析平台大规模预测了截形苜蓿盐胁迫相关基因,从截形苜蓿的36878条试验一致性序列中预测出650条与耐盐相关的序列,为进一步克隆截形苜蓿耐盐相关功能基因奠定了基础。